More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Maqu_0097 on replicon NC_008740
Organism: Marinobacter aquaeolei VT8



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008740  Maqu_0097  beta-lactamase  100 
 
 
428 aa  889    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.734776  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5564  beta-lactamase  35.42 
 
 
427 aa  251  1e-65  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5183  beta-lactamase  35.42 
 
 
427 aa  251  1e-65  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5272  beta-lactamase  35.42 
 
 
427 aa  251  1e-65  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13809  lipase lipE  36.88 
 
 
415 aa  251  2e-65  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0420294  normal  0.302132 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2265  beta-lactamase  36.34 
 
 
417 aa  239  6.999999999999999e-62  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.205356  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1067  beta-lactamase  35.38 
 
 
355 aa  213  4.9999999999999996e-54  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.279878 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5757  beta-lactamase  34.68 
 
 
363 aa  213  7e-54  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0307926 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3097  beta-lactamase  30.23 
 
 
377 aa  135  1.9999999999999998e-30  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2666  beta-lactamase  28.65 
 
 
390 aa  122  1.9999999999999998e-26  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00146634  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4288  beta-lactamase  29.49 
 
 
381 aa  120  4.9999999999999996e-26  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11527  esterase lipL  29.17 
 
 
428 aa  120  7e-26  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.160563 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3855  Beta-lactamase  27.42 
 
 
382 aa  117  3.9999999999999997e-25  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.026011  normal  0.421452 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1163  beta-lactamase  29.46 
 
 
422 aa  117  5e-25  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1148  beta-lactamase  29.19 
 
 
381 aa  116  6.9999999999999995e-25  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.295491  normal  0.227659 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11952  lipase lipD  28.65 
 
 
446 aa  116  7.999999999999999e-25  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1127  beta-lactamase  29.46 
 
 
381 aa  115  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0013499 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1227  Beta-lactamase  29.57 
 
 
381 aa  115  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0571  beta-lactamase  30.39 
 
 
406 aa  114  3e-24  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1266  beta-lactamase  29.45 
 
 
364 aa  114  5e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.270012  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4119  carboxylesterase  27.15 
 
 
382 aa  113  8.000000000000001e-24  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.780125  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3079  beta-lactamase  30.45 
 
 
373 aa  112  1.0000000000000001e-23  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.597951  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2171  beta-lactamase  24.79 
 
 
380 aa  110  3e-23  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4333  esterase  27.2 
 
 
381 aa  110  5e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.277959  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4621  beta-lactamase  26.78 
 
 
375 aa  108  2e-22  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.989492 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50820  esterase  27.47 
 
 
392 aa  108  2e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00808433 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2765  beta-lactamase  31.61 
 
 
430 aa  108  2e-22  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.737297  normal  0.79762 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1434  beta-lactamase  27.4 
 
 
381 aa  108  3e-22  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.908777 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4393  beta-lactamase  30.67 
 
 
392 aa  107  4e-22  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.662219 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4193  beta-lactamase  26.82 
 
 
377 aa  106  7e-22  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3120  beta-lactamase  27.83 
 
 
431 aa  106  8e-22  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.468026  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3181  beta-lactamase  27.83 
 
 
431 aa  106  8e-22  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0616495  normal  0.23112 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3131  beta-lactamase  27.83 
 
 
431 aa  105  1e-21  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.141589  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6892  beta-lactamase  25.78 
 
 
388 aa  103  4e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3647  beta-lactamase  28.3 
 
 
430 aa  101  2e-20  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0367  beta-lactamase  25.47 
 
 
380 aa  100  4e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.219007  normal  0.709022 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0050  beta-lactamase  27.18 
 
 
383 aa  100  6e-20  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0660  beta-lactamase  27.91 
 
 
395 aa  99.8  1e-19  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.775643  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_19470  Carboxylesterase EstC  26.61 
 
 
383 aa  98.2  2e-19  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1998  beta-lactamase  26.42 
 
 
409 aa  97.1  6e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1384  beta-lactamase  25.97 
 
 
408 aa  96.3  9e-19  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3595  beta-lactamase  30.22 
 
 
397 aa  96.3  9e-19  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3668  beta-lactamase  30.22 
 
 
397 aa  96.3  9e-19  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.935784 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3600  beta-lactamase  30.22 
 
 
397 aa  96.3  1e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0635885  normal  0.972653 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2148  beta-lactamase  27.91 
 
 
378 aa  95.1  2e-18  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0217937  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0624  beta-lactamase  27.7 
 
 
370 aa  94.7  3e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.540607  normal  0.110236 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16190  penicillin-binding protein, beta-lactamase class C  27.63 
 
 
367 aa  94  5e-18  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5550  beta-lactamase  31.25 
 
 
364 aa  93.6  6e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.432624  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1874  beta-lactamase  25 
 
 
379 aa  92.8  1e-17  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00999528 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5348  beta-lactamase  25.62 
 
 
414 aa  92.4  1e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.635001  normal  0.0848814 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1697  beta-lactamase  27.02 
 
 
381 aa  91.3  3e-17  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.570462  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35970  penicillin-binding protein, beta-lactamase class C  27.16 
 
 
582 aa  91.3  3e-17  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.796833  normal  0.223324 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2295  Beta-lactamase  28.93 
 
 
415 aa  90.5  5e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4403  carboxylesterase  24.92 
 
 
380 aa  90.1  6e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.12783  normal  0.0117181 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1740  beta-lactamase  24.86 
 
 
379 aa  90.1  7e-17  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0439  D-alanyl-D-alanine carboxypeptidease, putative  25.51 
 
 
381 aa  89.7  9e-17  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.737656  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1655  beta-lactamase  26.93 
 
 
415 aa  89.4  1e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3477  beta-lactamase  26.14 
 
 
409 aa  89.4  1e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.295738  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2615  hypothetical protein  29.26 
 
 
793 aa  89  1e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.377093  normal  0.895738 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1895  beta-lactamase  26.19 
 
 
369 aa  89.4  1e-16  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000574027 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2880  beta-lactamase  27.8 
 
 
379 aa  89.4  1e-16  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.912429 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1577  beta-lactamase  27.46 
 
 
415 aa  88.6  2e-16  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2255  beta-lactamase  23.82 
 
 
379 aa  87.8  3e-16  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.234898  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3511  beta-lactamase  28.62 
 
 
364 aa  87  5e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.700919  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12488  esterase/lipase lipP  36.3 
 
 
394 aa  87  5e-16  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6088  beta-lactamase  25.73 
 
 
406 aa  87  5e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.496561  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0270  beta-lactamase  28.38 
 
 
717 aa  86.7  8e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3205  beta-lactamase  25.31 
 
 
407 aa  86.7  8e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2687  beta-lactamase  26.72 
 
 
381 aa  86.7  8e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000287138 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0868  beta-lactamase  26.28 
 
 
407 aa  86.3  9e-16  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07085  beta-lactamase (AFU_orthologue; AFUA_5G09790)  26.17 
 
 
737 aa  85.9  0.000000000000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2265  beta-lactamase  25.56 
 
 
407 aa  85.9  0.000000000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.120111  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1364  beta-lactamase  27.27 
 
 
574 aa  86.3  0.000000000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.185265  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1797  beta-lactamase  26.95 
 
 
391 aa  85.5  0.000000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0148599  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0627  beta-lactamase  30.08 
 
 
566 aa  85.5  0.000000000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2099  beta-lactamase  33.33 
 
 
384 aa  85.5  0.000000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.303658 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2189  beta-lactamase  26.01 
 
 
402 aa  84.7  0.000000000000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.13371  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0954  Beta-lactamase  25.83 
 
 
416 aa  84  0.000000000000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2803  beta-lactamase  28.57 
 
 
368 aa  84.3  0.000000000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  hitchhiker  0.00599204  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5383  beta-lactamase  26.57 
 
 
390 aa  84.3  0.000000000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.994545  hitchhiker  0.00195175 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1830  beta-lactamase  26.38 
 
 
452 aa  84  0.000000000000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.162579  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1529  beta-lactamase  26.23 
 
 
381 aa  84  0.000000000000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.303701  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2172  beta-lactamase  26.38 
 
 
428 aa  83.6  0.000000000000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.65714  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3606  beta-lactamase  22.94 
 
 
419 aa  81.3  0.00000000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.000041879  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2487  beta-lactamase  27.33 
 
 
408 aa  80.9  0.00000000000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5097  beta-lactamase family penicillin binding protein  26.46 
 
 
411 aa  80.1  0.00000000000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3355  beta-lactamase  27.33 
 
 
395 aa  79.7  0.00000000000009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00303958  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0297  beta-lactamase  23.47 
 
 
417 aa  79.3  0.0000000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.834567  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1386  beta-lactamase  30.61 
 
 
453 aa  78.6  0.0000000000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  unclonable  0.000000000523067  unclonable  0.000000000545429 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0831  beta-lactamase  24.3 
 
 
445 aa  78.6  0.0000000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.23283  normal  0.655791 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3256  beta-lactamase  23.14 
 
 
420 aa  79  0.0000000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.748817  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0870  beta-lactamase  25.23 
 
 
410 aa  78.6  0.0000000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.487192  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0714  beta-lactamase  26.87 
 
 
392 aa  77.8  0.0000000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2402  beta-lactamase  25 
 
 
401 aa  77.4  0.0000000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.475057 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0925  beta-lactamase, putative  30.04 
 
 
790 aa  77.4  0.0000000000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5491  beta-lactamase  25.07 
 
 
407 aa  77.8  0.0000000000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.442272  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4865  beta-lactamase  24.82 
 
 
405 aa  77.4  0.0000000000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00560097 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3006  beta-lactamase  27.53 
 
 
423 aa  77.4  0.0000000000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2704  beta-lactamase  23.56 
 
 
424 aa  77.4  0.0000000000005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.431746  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2408  beta-lactamase  25 
 
 
401 aa  77  0.0000000000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.234051  normal  0.364058 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>