More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_3079 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009511  Swit_3079  beta-lactamase  100 
 
 		 373 aa  756    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.597951  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2803  beta-lactamase  43.55 
 
 		 368 aa  272  7e-72  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  hitchhiker  0.00599204  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0571  beta-lactamase  39.84 
 
 		 406 aa  253  3e-66  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0050  beta-lactamase  40 
 
 		 383 aa  233  3e-60  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2666  beta-lactamase  37.43 
 
 		 390 aa  227  3e-58  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00146634  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4375  beta-lactamase  41.91 
 
 		 363 aa  226  6e-58  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4393  beta-lactamase  40.06 
 
 		 392 aa  223  4e-57  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.662219 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50820  esterase  38.38 
 
 		 392 aa  222  9.999999999999999e-57  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00808433 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4333  esterase  38.1 
 
 		 381 aa  220  3.9999999999999997e-56  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.277959  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4621  beta-lactamase  38.57 
 
 		 375 aa  216  4e-55  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.989492 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1227  Beta-lactamase  38.78 
 
 		 381 aa  216  7e-55  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1127  beta-lactamase  38.89 
 
 		 381 aa  211  2e-53  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0013499 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0868  beta-lactamase  38.1 
 
 		 407 aa  209  5e-53  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1163  beta-lactamase  38.89 
 
 		 422 aa  209  9e-53  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1434  beta-lactamase  38.16 
 
 		 381 aa  208  1e-52  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.908777 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3855  Beta-lactamase  36.49 
 
 		 382 aa  207  2e-52  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.026011  normal  0.421452 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4288  beta-lactamase  38.06 
 
 		 381 aa  206  4e-52  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2050  beta-lactamase  36.14 
 
 		 414 aa  206  4e-52  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1148  beta-lactamase  38.06 
 
 		 381 aa  206  6e-52  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.295491  normal  0.227659 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4119  carboxylesterase  37.4 
 
 		 382 aa  204  1e-51  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.780125  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1655  beta-lactamase  38.4 
 
 		 415 aa  202  7e-51  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_19470  Carboxylesterase EstC  38.12 
 
 		 383 aa  198  1.0000000000000001e-49  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5383  beta-lactamase  35.13 
 
 		 390 aa  194  2e-48  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.994545  hitchhiker  0.00195175 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5550  beta-lactamase  38.91 
 
 		 364 aa  192  1e-47  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.432624  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1384  beta-lactamase  34.67 
 
 		 408 aa  190  4e-47  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12488  esterase/lipase lipP  37.06 
 
 		 394 aa  189  5.999999999999999e-47  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4403  carboxylesterase  38.23 
 
 		 380 aa  187  2e-46  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.12783  normal  0.0117181 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3595  beta-lactamase  36.04 
 
 		 397 aa  184  2.0000000000000003e-45  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3668  beta-lactamase  36.04 
 
 		 397 aa  184  2.0000000000000003e-45  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.935784 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07085  beta-lactamase (AFU_orthologue; AFUA_5G09790)  33.33 
 
 		 737 aa  183  3e-45  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3600  beta-lactamase  35.53 
 
 		 397 aa  181  2e-44  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0635885  normal  0.972653 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0164  beta-lactamase  35.66 
 
 		 373 aa  181  2e-44  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.105868  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2295  Beta-lactamase  38.07 
 
 		 415 aa  180  2.9999999999999997e-44  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4193  beta-lactamase  31.87 
 
 		 377 aa  175  9.999999999999999e-43  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1577  beta-lactamase  36.67 
 
 		 415 aa  174  1.9999999999999998e-42  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08528  beta-lactamase (AFU_orthologue; AFUA_5G09790)  30.79 
 
 		 402 aa  174  2.9999999999999996e-42  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.234552 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2880  beta-lactamase  34.38 
 
 		 379 aa  173  3.9999999999999995e-42  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.912429 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11527  esterase lipL  34.68 
 
 		 428 aa  167  4e-40  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.160563 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6892  beta-lactamase  35.65 
 
 		 388 aa  165  1.0000000000000001e-39  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11952  lipase lipD  32.16 
 
 		 446 aa  165  1.0000000000000001e-39  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3097  beta-lactamase  38.18 
 
 		 377 aa  164  3e-39  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1998  beta-lactamase  42.51 
 
 		 409 aa  157  3e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2765  beta-lactamase  34.52 
 
 		 430 aa  155  1e-36  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.737297  normal  0.79762 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3647  beta-lactamase  33.42 
 
 		 430 aa  151  2e-35  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0367  beta-lactamase  34.12 
 
 		 380 aa  150  3e-35  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.219007  normal  0.709022 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2148  beta-lactamase  33.88 
 
 		 378 aa  148  2.0000000000000003e-34  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0217937  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16190  penicillin-binding protein, beta-lactamase class C  33.62 
 
 		 367 aa  143  6e-33  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2099  beta-lactamase  33.68 
 
 		 384 aa  139  7e-32  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.303658 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3120  beta-lactamase  31.86 
 
 		 431 aa  131  2.0000000000000002e-29  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.468026  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3181  beta-lactamase  31.86 
 
 		 431 aa  131  2.0000000000000002e-29  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0616495  normal  0.23112 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3131  beta-lactamase  31.86 
 
 		 431 aa  129  6e-29  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.141589  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1067  beta-lactamase  31.4 
 
 		 355 aa  129  7.000000000000001e-29  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.279878 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5757  beta-lactamase  30.18 
 
 		 363 aa  126  6e-28  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0307926 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1895  beta-lactamase  30.83 
 
 		 369 aa  124  2e-27  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000574027 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3355  beta-lactamase  30.79 
 
 		 395 aa  123  5e-27  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00303958  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1266  beta-lactamase  29.06 
 
 		 364 aa  123  5e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.270012  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0097  beta-lactamase  30.45 
 
 		 428 aa  112  9e-24  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.734776  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13809  lipase lipE  29.26 
 
 		 415 aa  110  5e-23  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0420294  normal  0.302132 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0106  beta-lactamase  30.1 
 
 		 378 aa  108  1e-22  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2265  beta-lactamase  31 
 
 		 417 aa  108  2e-22  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.205356  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3310  beta-lactamase  30.54 
 
 		 382 aa  107  3e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.146111  normal  0.517695 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5183  beta-lactamase  27.83 
 
 		 427 aa  102  7e-21  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5272  beta-lactamase  27.83 
 
 		 427 aa  102  7e-21  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5564  beta-lactamase  27.83 
 
 		 427 aa  103  7e-21  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3511  beta-lactamase  30.14 
 
 		 364 aa  92  1e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.700919  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1386  beta-lactamase  29.71 
 
 		 453 aa  88.2  2e-16  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  unclonable  0.000000000523067  unclonable  0.000000000545429 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2171  beta-lactamase  23.24 
 
 		 380 aa  88.6  2e-16  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2525  beta-lactamase  27.16 
 
 		 377 aa  87.4  3e-16  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4406  hypothetical protein  33.71 
 
 		 796 aa  85.5  0.000000000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.343081  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0270  beta-lactamase  31.19 
 
 		 717 aa  85.5  0.000000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4539  hypothetical protein  33.71 
 
 		 796 aa  85.5  0.000000000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00469106 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1306  beta-lactamase protein  29.87 
 
 		 490 aa  82.8  0.000000000000008  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000704134  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0627  beta-lactamase  27.72 
 
 		 566 aa  81.3  0.00000000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2615  hypothetical protein  27.55 
 
 		 793 aa  80.9  0.00000000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.377093  normal  0.895738 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0624  beta-lactamase  28.04 
 
 		 370 aa  80.1  0.00000000000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.540607  normal  0.110236 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3257  beta-lactamase  30.09 
 
 		 430 aa  79.7  0.00000000000007  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1690  beta-lactamase  24.75 
 
 		 426 aa  79.3  0.0000000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35970  penicillin-binding protein, beta-lactamase class C  28.86 
 
 		 582 aa  79  0.0000000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.796833  normal  0.223324 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0954  Beta-lactamase  29.05 
 
 		 416 aa  79  0.0000000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1072  beta-lactamase  27.71 
 
 		 490 aa  77.8  0.0000000000003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0371318  normal  0.635304 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34700  putative beta lactamase  27.52 
 
 		 391 aa  76.6  0.0000000000007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00182422  normal  0.248771 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0714  beta-lactamase  26.87 
 
 		 392 aa  75.9  0.0000000000009  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2402  beta-lactamase  27.89 
 
 		 401 aa  74.7  0.000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.475057 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4865  beta-lactamase  27.19 
 
 		 405 aa  75.1  0.000000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00560097 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4601  beta-lactamase  26.55 
 
 		 427 aa  74.7  0.000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.850083  normal  0.239148 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4402  beta-lactamase  27.19 
 
 		 405 aa  75.1  0.000000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.254761  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3564  beta-lactamase  26.41 
 
 		 397 aa  75.5  0.000000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35880  Beta-lactamase-like protein  32.37 
 
 		 396 aa  73.9  0.000000000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.184718  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0500  beta-lactamase  24.58 
 
 		 487 aa  73.6  0.000000000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5607  hypothetical protein  35.16 
 
 		 784 aa  73.6  0.000000000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8721  Beta-lactamase class C and other penicillin binding protein-like protein  32.97 
 
 		 480 aa  72.8  0.000000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1830  beta-lactamase  27.8 
 
 		 452 aa  72.8  0.000000000009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.162579  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6088  beta-lactamase  27.87 
 
 		 406 aa  72.8  0.000000000009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.496561  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6218  hypothetical protein  34.5 
 
 		 792 aa  72  0.00000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4911  beta-lactamase  28.04 
 
 		 405 aa  72.8  0.00000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.366711  normal  0.312194 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3006  beta-lactamase  25.08 
 
 		 423 aa  72.4  0.00000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2172  beta-lactamase  27.8 
 
 		 428 aa  72.4  0.00000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.65714  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2361  beta-lactamase  27.49 
 
 		 401 aa  72.4  0.00000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.597204  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2408  beta-lactamase  27.49 
 
 		 401 aa  72.4  0.00000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.234051  normal  0.364058 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3750  beta-lactamase  27.93 
 
 		 397 aa  71.6  0.00000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.697979  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>