246 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plim_2171 on replicon NC_014148
Organism: Planctomyces limnophilus DSM 3776



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014148  Plim_2171  beta-lactamase  100 
 
 		 380 aa  774    Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3097  beta-lactamase  28.53 
 
 		 377 aa  118  1.9999999999999998e-25  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5757  beta-lactamase  25.82 
 
 		 363 aa  113  7.000000000000001e-24  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0307926 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0097  beta-lactamase  24.79 
 
 		 428 aa  110  3e-23  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.734776  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5183  beta-lactamase  24.87 
 
 		 427 aa  109  9.000000000000001e-23  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5272  beta-lactamase  24.87 
 
 		 427 aa  109  9.000000000000001e-23  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2265  beta-lactamase  26.42 
 
 		 417 aa  108  1e-22  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.205356  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5564  beta-lactamase  24.8 
 
 		 427 aa  107  2e-22  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1067  beta-lactamase  25.75 
 
 		 355 aa  107  3e-22  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.279878 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1266  beta-lactamase  25.71 
 
 		 364 aa  107  4e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.270012  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13809  lipase lipE  27.01 
 
 		 415 aa  105  2e-21  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0420294  normal  0.302132 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1227  Beta-lactamase  26.77 
 
 		 381 aa  88.2  2e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3079  beta-lactamase  23.24 
 
 		 373 aa  88.6  2e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.597951  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1577  beta-lactamase  27.46 
 
 		 415 aa  86.7  6e-16  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4621  beta-lactamase  24.64 
 
 		 375 aa  86.7  6e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.989492 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0297  beta-lactamase  25.54 
 
 		 417 aa  85.5  0.000000000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.834567  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0571  beta-lactamase  25.42 
 
 		 406 aa  84.3  0.000000000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1434  beta-lactamase  26.35 
 
 		 381 aa  84.7  0.000000000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.908777 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50820  esterase  24.52 
 
 		 392 aa  83.2  0.000000000000007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00808433 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3855  Beta-lactamase  23.92 
 
 		 382 aa  82.8  0.000000000000008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.026011  normal  0.421452 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2880  beta-lactamase  29 
 
 		 379 aa  83.2  0.000000000000008  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.912429 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1655  beta-lactamase  26.53 
 
 		 415 aa  81.6  0.00000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3647  beta-lactamase  26.54 
 
 		 430 aa  80.9  0.00000000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_19470  Carboxylesterase EstC  26.22 
 
 		 383 aa  80.1  0.00000000000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4119  carboxylesterase  25.4 
 
 		 382 aa  78.6  0.0000000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.780125  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3310  beta-lactamase  25.22 
 
 		 382 aa  78.2  0.0000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.146111  normal  0.517695 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4333  esterase  23.71 
 
 		 381 aa  78.6  0.0000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.277959  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2148  beta-lactamase  24.39 
 
 		 378 aa  78.2  0.0000000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0217937  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4403  carboxylesterase  25.07 
 
 		 380 aa  77  0.0000000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.12783  normal  0.0117181 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4288  beta-lactamase  25.72 
 
 		 381 aa  75.5  0.000000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4393  beta-lactamase  26.58 
 
 		 392 aa  75.9  0.000000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.662219 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0050  beta-lactamase  24.18 
 
 		 383 aa  75.1  0.000000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1386  beta-lactamase  26.99 
 
 		 453 aa  75.5  0.000000000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  unclonable  0.000000000523067  unclonable  0.000000000545429 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1148  beta-lactamase  25.89 
 
 		 381 aa  75.1  0.000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.295491  normal  0.227659 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11527  esterase lipL  24.29 
 
 		 428 aa  73.2  0.000000000006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.160563 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2295  Beta-lactamase  26.53 
 
 		 415 aa  73.2  0.000000000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1127  beta-lactamase  26.2 
 
 		 381 aa  72  0.00000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0013499 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0868  beta-lactamase  23.2 
 
 		 407 aa  72.8  0.00000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1163  beta-lactamase  26.03 
 
 		 422 aa  72.4  0.00000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2765  beta-lactamase  24.69 
 
 		 430 aa  71.6  0.00000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.737297  normal  0.79762 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6892  beta-lactamase  24.18 
 
 		 388 aa  71.6  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4193  beta-lactamase  23.81 
 
 		 377 aa  71.2  0.00000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1713  beta-lactamase  27.12 
 
 		 347 aa  70.9  0.00000000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1998  beta-lactamase  27.96 
 
 		 409 aa  68.2  0.0000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3120  beta-lactamase  25.46 
 
 		 431 aa  68.6  0.0000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.468026  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2803  beta-lactamase  25.81 
 
 		 368 aa  68.2  0.0000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  hitchhiker  0.00599204  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3181  beta-lactamase  25.46 
 
 		 431 aa  68.6  0.0000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0616495  normal  0.23112 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1895  beta-lactamase  24.22 
 
 		 369 aa  68.2  0.0000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000574027 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35970  penicillin-binding protein, beta-lactamase class C  24.28 
 
 		 582 aa  67.4  0.0000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.796833  normal  0.223324 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3131  beta-lactamase  25.47 
 
 		 431 aa  67.8  0.0000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.141589  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5550  beta-lactamase  23.7 
 
 		 364 aa  67.4  0.0000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.432624  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0660  beta-lactamase  26.29 
 
 		 395 aa  66.6  0.0000000006  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.775643  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2099  beta-lactamase  24.54 
 
 		 384 aa  66.2  0.0000000008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.303658 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08528  beta-lactamase (AFU_orthologue; AFUA_5G09790)  22.43 
 
 		 402 aa  65.5  0.000000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.234552 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11952  lipase lipD  24.35 
 
 		 446 aa  65.5  0.000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1954  hypothetical protein  24.3 
 
 		 388 aa  65.5  0.000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00026733 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4657  beta-lactamase  24.2 
 
 		 485 aa  65.1  0.000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5383  beta-lactamase  24.07 
 
 		 390 aa  64.7  0.000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.994545  hitchhiker  0.00195175 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12488  esterase/lipase lipP  28.65 
 
 		 394 aa  63.9  0.000000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4375  beta-lactamase  27.3 
 
 		 363 aa  63.5  0.000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2666  beta-lactamase  22.12 
 
 		 390 aa  63.5  0.000000006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00146634  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0164  beta-lactamase  25.49 
 
 		 373 aa  63.2  0.000000007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.105868  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1384  beta-lactamase  24.93 
 
 		 408 aa  63.2  0.000000007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1874  beta-lactamase  22.25 
 
 		 379 aa  63.2  0.000000008  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00999528 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3511  beta-lactamase  23.61 
 
 		 364 aa  62.4  0.00000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.700919  normal  1 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07085  beta-lactamase (AFU_orthologue; AFUA_5G09790)  24.78 
 
 		 737 aa  61.6  0.00000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0439  D-alanyl-D-alanine carboxypeptidease, putative  25.26 
 
 		 381 aa  62  0.00000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.737656  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0270  beta-lactamase  25 
 
 		 717 aa  60.1  0.00000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1252  beta-lactamase  30.7 
 
 		 389 aa  58.9  0.0000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0579433 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6088  beta-lactamase  23.8 
 
 		 406 aa  58.5  0.0000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.496561  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3595  beta-lactamase  32.84 
 
 		 397 aa  58.2  0.0000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3668  beta-lactamase  32.84 
 
 		 397 aa  58.2  0.0000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.935784 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4649  Beta-lactamase  23.04 
 
 		 418 aa  57.8  0.0000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6025  beta-lactamase  25.61 
 
 		 460 aa  57.8  0.0000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.565651 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0624  beta-lactamase  22.04 
 
 		 370 aa  57.4  0.0000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.540607  normal  0.110236 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3600  beta-lactamase  32.09 
 
 		 397 aa  57  0.0000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0635885  normal  0.972653 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6049  Beta-lactamase  24.48 
 
 		 419 aa  56.6  0.0000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0954  Beta-lactamase  25.47 
 
 		 416 aa  56.6  0.0000007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5786  beta-lactamase family protein  22.87 
 
 		 420 aa  56.6  0.0000008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0584533 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5491  beta-lactamase  22.84 
 
 		 407 aa  55.5  0.000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.442272  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1797  beta-lactamase  23.94 
 
 		 391 aa  55.8  0.000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0148599  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2294  penicillin-binding protein, putative  27.06 
 
 		 434 aa  55.5  0.000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.272122  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl600  putative beta-lactamase  18.83 
 
 		 369 aa  54.7  0.000002  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3177  Beta-lactamase class C and other penicillin binding protein-like protein  24.26 
 
 		 484 aa  55.1  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.075148  normal  0.866618 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1979  beta-lactamase  23.71 
 
 		 398 aa  55.5  0.000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.663801  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2589  beta-lactamase  23.71 
 
 		 398 aa  55.5  0.000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.224311  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3355  beta-lactamase  23.76 
 
 		 395 aa  55.5  0.000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00303958  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6467  Beta-lactamase class C and other penicillin binding protein-like protein  23.66 
 
 		 551 aa  54.7  0.000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.341842  normal  0.0569151 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1697  beta-lactamase  23.45 
 
 		 381 aa  54.7  0.000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.570462  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2209  beta-lactamase  21.75 
 
 		 420 aa  54.3  0.000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.683727  normal  0.729907 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4191  beta-lactamase  21.52 
 
 		 386 aa  54.3  0.000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.249358 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0714  beta-lactamase  23.64 
 
 		 392 aa  54.3  0.000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0538  beta-lactamase  22.74 
 
 		 433 aa  54.3  0.000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0367  beta-lactamase  23.66 
 
 		 380 aa  54.3  0.000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.219007  normal  0.709022 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16190  penicillin-binding protein, beta-lactamase class C  23.37 
 
 		 367 aa  53.5  0.000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4402  beta-lactamase  22.94 
 
 		 405 aa  53.9  0.000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.254761  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1529  beta-lactamase  27.94 
 
 		 381 aa  53.5  0.000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.303701  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1364  beta-lactamase  25 
 
 		 574 aa  53.1  0.000007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.185265  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2050  beta-lactamase  20.41 
 
 		 414 aa  53.5  0.000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4257  beta-lactamase  23.97 
 
 		 464 aa  53.1  0.000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.240658 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>