71 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amuc_0106 on replicon NC_010655
Organism: Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010655  Amuc_0106  beta-lactamase  100 
 
 
378 aa  790    Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0571  beta-lactamase  31.85 
 
 
406 aa  184  3e-45  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4393  beta-lactamase  32.13 
 
 
392 aa  167  2.9999999999999998e-40  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.662219 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1384  beta-lactamase  30.5 
 
 
408 aa  155  9e-37  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2666  beta-lactamase  28.79 
 
 
390 aa  152  1e-35  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00146634  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1655  beta-lactamase  33.07 
 
 
415 aa  144  2e-33  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1434  beta-lactamase  30.21 
 
 
381 aa  144  3e-33  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.908777 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4333  esterase  30.91 
 
 
381 aa  144  3e-33  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.277959  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50820  esterase  30.13 
 
 
392 aa  144  3e-33  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00808433 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4403  carboxylesterase  29.92 
 
 
380 aa  141  1.9999999999999998e-32  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.12783  normal  0.0117181 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_19470  Carboxylesterase EstC  30.31 
 
 
383 aa  139  6e-32  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4621  beta-lactamase  29.97 
 
 
375 aa  138  1e-31  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.989492 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4193  beta-lactamase  28.8 
 
 
377 aa  137  3.0000000000000003e-31  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1227  Beta-lactamase  29.84 
 
 
381 aa  135  9e-31  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1163  beta-lactamase  29.63 
 
 
422 aa  135  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1148  beta-lactamase  29.43 
 
 
381 aa  134  3e-30  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.295491  normal  0.227659 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2803  beta-lactamase  28.16 
 
 
368 aa  134  3e-30  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  hitchhiker  0.00599204  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1127  beta-lactamase  29.37 
 
 
381 aa  133  6e-30  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0013499 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4288  beta-lactamase  29.1 
 
 
381 aa  132  6.999999999999999e-30  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3079  beta-lactamase  29.97 
 
 
373 aa  132  7.999999999999999e-30  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.597951  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3855  Beta-lactamase  28.23 
 
 
382 aa  132  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.026011  normal  0.421452 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4119  carboxylesterase  28.42 
 
 
382 aa  132  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.780125  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2050  beta-lactamase  29.58 
 
 
414 aa  131  2.0000000000000002e-29  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08528  beta-lactamase (AFU_orthologue; AFUA_5G09790)  26.18 
 
 
402 aa  127  2.0000000000000002e-28  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.234552 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1998  beta-lactamase  28.29 
 
 
409 aa  124  2e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1577  beta-lactamase  33.24 
 
 
415 aa  121  1.9999999999999998e-26  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2880  beta-lactamase  29.18 
 
 
379 aa  120  3e-26  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.912429 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0868  beta-lactamase  28.79 
 
 
407 aa  120  4.9999999999999996e-26  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2148  beta-lactamase  30.03 
 
 
378 aa  119  9e-26  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0217937  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2295  Beta-lactamase  32.8 
 
 
415 aa  119  9.999999999999999e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1895  beta-lactamase  29.51 
 
 
369 aa  113  4.0000000000000004e-24  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000574027 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3595  beta-lactamase  32.49 
 
 
397 aa  113  6e-24  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3668  beta-lactamase  32.49 
 
 
397 aa  113  6e-24  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.935784 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3310  beta-lactamase  29.1 
 
 
382 aa  112  1.0000000000000001e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.146111  normal  0.517695 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3600  beta-lactamase  32.13 
 
 
397 aa  111  2.0000000000000002e-23  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0635885  normal  0.972653 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0164  beta-lactamase  26.79 
 
 
373 aa  110  5e-23  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.105868  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16190  penicillin-binding protein, beta-lactamase class C  26.72 
 
 
367 aa  106  6e-22  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3355  beta-lactamase  28.61 
 
 
395 aa  105  1e-21  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00303958  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11952  lipase lipD  28.23 
 
 
446 aa  103  5e-21  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12488  esterase/lipase lipP  30.51 
 
 
394 aa  102  1e-20  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0050  beta-lactamase  24.8 
 
 
383 aa  99.4  8e-20  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07085  beta-lactamase (AFU_orthologue; AFUA_5G09790)  27.27 
 
 
737 aa  97.1  5e-19  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2765  beta-lactamase  27.5 
 
 
430 aa  96.3  7e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.737297  normal  0.79762 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3647  beta-lactamase  27.79 
 
 
430 aa  90.9  3e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11527  esterase lipL  26.24 
 
 
428 aa  89.4  9e-17  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.160563 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5383  beta-lactamase  28.86 
 
 
390 aa  87  4e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.994545  hitchhiker  0.00195175 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5550  beta-lactamase  26.1 
 
 
364 aa  85.5  0.000000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.432624  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2099  beta-lactamase  24.93 
 
 
384 aa  84.7  0.000000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.303658 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4375  beta-lactamase  27.39 
 
 
363 aa  82.8  0.000000000000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3120  beta-lactamase  25.68 
 
 
431 aa  82  0.00000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.468026  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3181  beta-lactamase  25.68 
 
 
431 aa  82  0.00000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0616495  normal  0.23112 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3131  beta-lactamase  25.68 
 
 
431 aa  80.9  0.00000000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.141589  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3097  beta-lactamase  26.37 
 
 
377 aa  80.1  0.00000000000006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6892  beta-lactamase  24.18 
 
 
388 aa  74.3  0.000000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1266  beta-lactamase  28.14 
 
 
364 aa  63.5  0.000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.270012  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0367  beta-lactamase  22.14 
 
 
380 aa  57.4  0.0000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.219007  normal  0.709022 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0097  beta-lactamase  24.84 
 
 
428 aa  55.8  0.000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.734776  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1238  beta-lactamase  24.53 
 
 
361 aa  51.6  0.00002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.0242548 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1067  beta-lactamase  24.78 
 
 
355 aa  48.1  0.0002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.279878 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5757  beta-lactamase  24.85 
 
 
363 aa  47  0.0005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0307926 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0502  penicillin-binding protein  21.13 
 
 
412 aa  45.8  0.001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0473  penicillin-binding protein  21.13 
 
 
421 aa  46.2  0.001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2921  beta-lactamase class C-like protein  20.11 
 
 
451 aa  45.1  0.002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.154271 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2525  beta-lactamase  21.43 
 
 
377 aa  44.7  0.002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5272  beta-lactamase  26.32 
 
 
427 aa  45.1  0.002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5564  beta-lactamase  26.32 
 
 
427 aa  45.1  0.002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5183  beta-lactamase  26.32 
 
 
427 aa  45.1  0.002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0831  beta-lactamase  18.67 
 
 
422 aa  44.7  0.003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.146809  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0483  putative penicillin-binding protein  20.66 
 
 
412 aa  44.3  0.003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0412  beta-lactamase (penicillin-binding protein) (penicillinase)  20.66 
 
 
422 aa  44.3  0.004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0416  beta-lactamase (penicillin-binding protein) (penicillinase)  20.66 
 
 
421 aa  43.9  0.004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0430511  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>