More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Arth_3756 on replicon NC_008541
Organism: Arthrobacter sp. FB24



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008541  Arth_3756  beta-lactamase  100 
 
 		 378 aa  754    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0759  putative beta-lactamase class C penicillin binding protein  29.1 
 
 		 498 aa  105  1e-21  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.445171  normal  0.118882 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3274  beta-lactamase  28.49 
 
 		 524 aa  103  7e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.847415 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9203  beta-lactamase  30.68 
 
 		 635 aa  97.1  5e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.606578 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0335  hypothetical protein  36.32 
 
 		 533 aa  96.3  8e-19  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1164  beta-lactamase  33.49 
 
 		 501 aa  96.3  9e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.255434 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1507  Beta-lactamase  27.58 
 
 		 595 aa  95.1  2e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0201  beta-lactamase  28.11 
 
 		 530 aa  94.4  3e-18  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.494145 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4636  beta-lactamase  31.94 
 
 		 496 aa  92.4  1e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2602  beta-lactamase  30 
 
 		 778 aa  92.4  1e-17  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0973  beta-lactamase  27.85 
 
 		 514 aa  92.4  1e-17  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2459  beta-lactamase  29.09 
 
 		 466 aa  91.3  2e-17  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0116  beta-lactamase  27 
 
 		 453 aa  90.9  3e-17  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4110  beta-lactamase  27.95 
 
 		 379 aa  91.3  3e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8144  beta-lactamase  37.5 
 
 		 674 aa  90.9  4e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.977782 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2539  beta-lactamase  26.49 
 
 		 567 aa  90.1  5e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.470437  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4152  beta-lactamase  27.07 
 
 		 378 aa  90.1  6e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0848463  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1465  beta-lactamase  28.49 
 
 		 657 aa  89.7  7e-17  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.16455  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0925  beta-lactamase  31.32 
 
 		 966 aa  89.7  8e-17  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0097  beta-lactamase  27.86 
 
 		 601 aa  89.7  8e-17  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1783  cyclic peptide transporter  26.37 
 
 		 1055 aa  89.4  9e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0903267  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4174  beta-lactamase  27.51 
 
 		 378 aa  89.4  9e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000652338  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4519  beta-lactamase  34.63 
 
 		 451 aa  88.2  2e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.302372  normal  0.700128 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0831  beta-lactamase  31.02 
 
 		 422 aa  88.6  2e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.146809  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1364  beta-lactamase  28.17 
 
 		 574 aa  88.2  2e-16  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.185265  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1086  beta-lactamase  27.07 
 
 		 378 aa  88.2  2e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3549  beta-lactamase  29.13 
 
 		 400 aa  88.2  2e-16  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6025  beta-lactamase  28.46 
 
 		 460 aa  87.4  4e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.565651 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3606  beta-lactamase  27.47 
 
 		 419 aa  86.7  6e-16  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.000041879  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4191  beta-lactamase  29.79 
 
 		 386 aa  86.7  7e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.249358 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2525  beta-lactamase  30.26 
 
 		 377 aa  85.5  0.000000000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1818  beta-lactamase  29.4 
 
 		 513 aa  84.7  0.000000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0253  beta-lactamase  28.52 
 
 		 395 aa  84.7  0.000000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2768  beta-lactamase  27.78 
 
 		 483 aa  84.7  0.000000000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6777  beta-lactamase  27.6 
 
 		 446 aa  84.7  0.000000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1946  Beta-lactamase  24.72 
 
 		 588 aa  84.7  0.000000000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.220663 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3830  beta-lactamase  32.97 
 
 		 658 aa  84.7  0.000000000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.223137  normal  0.372687 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1896  beta-lactamase  32.88 
 
 		 425 aa  84.3  0.000000000000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.227365  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1710  beta-lactamase  29.25 
 
 		 463 aa  84  0.000000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.903063 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1874  beta-lactamase  26.57 
 
 		 379 aa  84  0.000000000000005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00999528 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4689  beta-lactamase  30.23 
 
 		 374 aa  83.2  0.000000000000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0791767  normal  0.116144 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33850  penicillin-binding protein, beta-lactamase class C  33.07 
 
 		 453 aa  83.6  0.000000000000006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5771  beta-lactamase  31.72 
 
 		 711 aa  83.2  0.000000000000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.636545  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5985  beta-lactamase  28.71 
 
 		 342 aa  83.6  0.000000000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3062  beta-lactamase  28.5 
 
 		 614 aa  83.2  0.000000000000007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.367625  hitchhiker  0.002383 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0999  beta-lactamase  26.22 
 
 		 367 aa  83.2  0.000000000000007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0117018 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4308  beta-lactamase  26.8 
 
 		 650 aa  82.8  0.000000000000008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.805936  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0154  beta-lactamase  23.8 
 
 		 526 aa  82.8  0.000000000000009  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2991  beta-lactamase  32.98 
 
 		 475 aa  82.4  0.00000000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3507  penicillin-binding protein, putative  28.19 
 
 		 375 aa  81.3  0.00000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1234  beta-lactamase  27.47 
 
 		 519 aa  81.6  0.00000000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.565811  normal  0.301621 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0723  beta-lactamase  23.73 
 
 		 511 aa  81.3  0.00000000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00000618645  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0343  beta-lactamase  32.54 
 
 		 482 aa  81.6  0.00000000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2209  beta-lactamase  28.79 
 
 		 420 aa  81.6  0.00000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.683727  normal  0.729907 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01828  beta-lactamase precursor  30.6 
 
 		 366 aa  81.6  0.00000000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.284204  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3742  beta-lactamase  36.6 
 
 		 478 aa  81.3  0.00000000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.877046  normal  0.0540026 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2440  beta-lactamase  27.47 
 
 		 422 aa  81.6  0.00000000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2389  cyclic peptide transporter  27.56 
 
 		 1032 aa  81.3  0.00000000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0812  beta-lactamase  26.47 
 
 		 408 aa  80.9  0.00000000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.623448  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2616  beta-lactamase  22.28 
 
 		 353 aa  81.3  0.00000000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4159  beta-lactamase  23.32 
 
 		 544 aa  81.3  0.00000000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0453527  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0925  beta-lactamase, putative  28.49 
 
 		 790 aa  80.9  0.00000000000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3197  beta-lactamase  28.13 
 
 		 417 aa  80.5  0.00000000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.27684  normal  0.21357 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3518  putative penicillin-binding protein  28.19 
 
 		 377 aa  80.5  0.00000000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0622  beta-lactamase  28.41 
 
 		 377 aa  80.5  0.00000000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.357585  normal  0.0394741 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2553  beta-lactamase  30.48 
 
 		 478 aa  80.5  0.00000000000005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2775  beta-lactamase  34.5 
 
 		 472 aa  80.1  0.00000000000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.987091 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1905  beta-lactamase class C and other penicillin binding proteins  32.61 
 
 		 389 aa  80.5  0.00000000000005  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  decreased coverage  0.0068252  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2953  beta-lactamase  29.47 
 
 		 513 aa  80.5  0.00000000000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3872  beta-lactamase  27.12 
 
 		 375 aa  80.5  0.00000000000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1755  beta-lactamase  30.03 
 
 		 450 aa  80.1  0.00000000000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0471  beta-lactamase  29.3 
 
 		 616 aa  80.1  0.00000000000006  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0439  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  32.66 
 
 		 392 aa  80.1  0.00000000000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.919528 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0863  beta-lactamase  35.47 
 
 		 363 aa  80.1  0.00000000000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5607  hypothetical protein  27.71 
 
 		 784 aa  80.1  0.00000000000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04833  beta-lactamase  27.1 
 
 		 529 aa  80.1  0.00000000000007  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2923  beta-lactamase  26.26 
 
 		 356 aa  79.7  0.00000000000008  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2288  beta-lactamase  27.73 
 
 		 424 aa  79.3  0.0000000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.637416 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1520  Beta-lactamase  23.39 
 
 		 537 aa  79  0.0000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000638983  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2717  beta-lactamase  31.03 
 
 		 470 aa  79  0.0000000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0708  beta-lactamase  32 
 
 		 396 aa  78.6  0.0000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0410275  normal  0.41428 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5348  beta-lactamase  27.4 
 
 		 414 aa  78.6  0.0000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.635001  normal  0.0848814 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0477  D-alanyl-D-alanine carboxypeptidease, putative  25.61 
 
 		 385 aa  78.2  0.0000000000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.765713  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3256  beta-lactamase  27.16 
 
 		 420 aa  78.2  0.0000000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.748817  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2189  beta-lactamase  29.37 
 
 		 402 aa  78.6  0.0000000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.13371  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2815  putative beta-lactamase  28.42 
 
 		 424 aa  78.2  0.0000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.211765  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_3047  beta-lactamase  32.8 
 
 		 464 aa  78.2  0.0000000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3208  beta-lactamase  29.41 
 
 		 377 aa  77.4  0.0000000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0230735  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2198  beta-lactamase  28.74 
 
 		 543 aa  77.8  0.0000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.176904  normal  0.0317754 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2742  beta-lactamase  26.8 
 
 		 376 aa  77.4  0.0000000000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0750006  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2997  beta-lactamase  29.26 
 
 		 513 aa  77.4  0.0000000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0467  beta-lactamase  33.5 
 
 		 637 aa  77.4  0.0000000000004  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0579  beta-lactamase  28.57 
 
 		 395 aa  77.4  0.0000000000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.521189  normal  0.351765 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1671  beta-lactamase  31.02 
 
 		 633 aa  77  0.0000000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.214913 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2704  beta-lactamase  26.83 
 
 		 424 aa  77.4  0.0000000000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.431746  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2255  beta-lactamase  26.98 
 
 		 379 aa  77  0.0000000000005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.234898  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1867  beta-lactamase  28.4 
 
 		 517 aa  77  0.0000000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0109165  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1832  beta-lactamase  27.72 
 
 		 446 aa  77  0.0000000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.29245  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1750  beta-lactamase  28.19 
 
 		 375 aa  77  0.0000000000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.339251  normal  0.99151 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0634  beta-lactamase  30.98 
 
 		 661 aa  77  0.0000000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.232968 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>