113 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BURPS1710b_A1336 on replicon NC_007435
Organism: Burkholderia pseudomallei 1710b



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007435  BURPS1710b_A1336  ATP-dependent DNA ligase  100 
 
 		 152 aa  300  6.000000000000001e-81  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2988  DNA ligase, ATP-dependent  98.68 
 
 		 1163 aa  300  6.000000000000001e-81  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3112  DNA ligase D  92.76 
 
 		 1157 aa  275  1e-73  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0919454  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1346  ATP dependent DNA ligase  65.13 
 
 		 936 aa  186  1e-46  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.893044  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6483  ATP dependent DNA ligase  65.13 
 
 		 936 aa  186  1e-46  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0603382  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6073  DNA ligase D  63.16 
 
 		 927 aa  181  3e-45  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0510863 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5476  DNA ligase D  65.13 
 
 		 927 aa  179  9.000000000000001e-45  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00388357 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5610  ATP dependent DNA ligase  62.5 
 
 		 932 aa  175  2e-43  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.706105 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0981  DNA ligase D  58.33 
 
 		 954 aa  170  5e-42  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6340  DNA ligase D  59.87 
 
 		 949 aa  166  1e-40  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.15116 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1858  DNA ligase D  57.14 
 
 		 940 aa  165  2e-40  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.170046  normal  0.216644 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2328  putative ATP-dependent DNA ligase  57.24 
 
 		 1001 aa  163  8e-40  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0455665  normal  0.455767 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5079  ATP-dependent DNA ligase  54 
 
 		 901 aa  151  2.9999999999999998e-36  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.795218  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0501  DNA ligase D  53.95 
 
 		 863 aa  150  5.9999999999999996e-36  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.535245  normal  0.0602088 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3260  ATP-dependent DNA ligase  53.64 
 
 		 833 aa  149  1e-35  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2097  ATP-dependent DNA ligase  70.59 
 
 		 848 aa  149  1e-35  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.64367  normal  0.288543 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2501  ATP-dependent DNA ligase  53.64 
 
 		 833 aa  149  1e-35  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2635  ATP-dependent DNA ligase  53.64 
 
 		 833 aa  148  3e-35  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.232561  normal  0.576376 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0488  DNA ligase D  53.29 
 
 		 867 aa  147  4e-35  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.160576  normal  0.373477 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2651  ATP-dependent DNA ligase  73.91 
 
 		 832 aa  146  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.819142  normal  0.570676 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3173  ATP-dependent DNA ligase  68.27 
 
 		 847 aa  144  3e-34  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3464  DNA ligase, ATP-dependent, putative  82.05 
 
 		 851 aa  143  7.0000000000000006e-34  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3245  ATP-dependent DNA ligase  51.97 
 
 		 866 aa  143  7.0000000000000006e-34  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.833216  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3003  ATP-dependent DNA ligase  72.45 
 
 		 882 aa  143  7.0000000000000006e-34  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0636525  normal  0.554248 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3217  ATP-dependent DNA ligase  66.06 
 
 		 837 aa  143  9e-34  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.311781 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_36910  ATP-dependent DNA ligase  67.62 
 
 		 840 aa  142  1e-33  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0564843  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2977  DNA ligase D  50.34 
 
 		 845 aa  138  3e-32  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.246159 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1177  ATP-dependent DNA ligase  45.27 
 
 		 853 aa  137  6e-32  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.601183  n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0011  ATP-dependent DNA ligase  65.91 
 
 		 864 aa  134  5e-31  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0339968 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0128  DNA ligase D  63 
 
 		 871 aa  133  9e-31  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4424  ATP-dependent DNA ligase  73.08 
 
 		 825 aa  132  1.9999999999999998e-30  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0379748  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0353  ATP-dependent DNA ligase  47.3 
 
 		 913 aa  131  3.9999999999999996e-30  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.344654 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3452  ATP dependent DNA ligase  72.94 
 
 		 534 aa  130  3.9999999999999996e-30  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0779  ATP dependent DNA ligase  65.17 
 
 		 608 aa  130  6e-30  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.991922  normal  0.120219 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2523  ATP-dependent DNA ligase  64.58 
 
 		 837 aa  130  6e-30  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000543878 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1150  ATP dependent DNA ligase  47.3 
 
 		 845 aa  129  1.0000000000000001e-29  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2519  ATP-dependent DNA ligase  52.59 
 
 		 939 aa  129  1.0000000000000001e-29  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0109  DNA ligase D  65.59 
 
 		 872 aa  129  1.0000000000000001e-29  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0363186 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2247  ATP-dependent DNA ligase  60.2 
 
 		 846 aa  128  3e-29  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0884  ATP dependent DNA ligase  68.18 
 
 		 726 aa  128  3e-29  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.911309  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0935  DNA ligase D, 3'-phosphoesterase domain protein  72.5 
 
 		 789 aa  128  3e-29  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0727399  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5341  ATP-dependent DNA ligase  47.3 
 
 		 881 aa  128  3e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0581605 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3303  ATP dependent DNA ligase  56.7 
 
 		 855 aa  127  4.0000000000000003e-29  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.300283  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4315  DNA ligase D  74.67 
 
 		 834 aa  127  4.0000000000000003e-29  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2135  DNA ligase D  59.6 
 
 		 815 aa  127  4.0000000000000003e-29  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0939  DNA ligase D  76 
 
 		 847 aa  127  5.0000000000000004e-29  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4339  ATP-dependent DNA ligase  46.26 
 
 		 871 aa  127  7.000000000000001e-29  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0275716 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_754  hypothetical protein  61.22 
 
 		 184 aa  127  8.000000000000001e-29  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.903751  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0769  hypothetical protein  61.22 
 
 		 184 aa  126  1.0000000000000001e-28  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2239  DNA ligase D  44.22 
 
 		 856 aa  126  1.0000000000000001e-28  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.839838 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0998  DNA ligase D  72 
 
 		 861 aa  125  1.0000000000000001e-28  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2179  hypothetical protein  73.68 
 
 		 197 aa  125  2.0000000000000002e-28  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.930875  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0932  DNA ligase D, 3'-phosphoesterase domain protein  73.33 
 
 		 737 aa  125  2.0000000000000002e-28  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.819515  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1702  DNA ligase D  60.87 
 
 		 877 aa  125  2.0000000000000002e-28  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.170827  hitchhiker  0.00786599 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5705  ATP-dependent DNA ligase  45.27 
 
 		 883 aa  124  3e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0817  DNA ligase D, 3'-phosphoesterase domain protein  71.05 
 
 		 522 aa  124  4.0000000000000003e-28  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.138014  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1660  ATP-dependent DNA ligase  58.16 
 
 		 847 aa  124  5e-28  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.600549  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7647  DNA polymerase LigD, polymerase domain protein  69.74 
 
 		 544 aa  124  6e-28  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3907  ATP-dependent DNA ligase  69.23 
 
 		 900 aa  123  8.000000000000001e-28  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.989644  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0365  DNA ligase D  61.46 
 
 		 902 aa  123  8.000000000000001e-28  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.215692 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1769  ATP-dependent DNA ligase  70.67 
 
 		 918 aa  123  1e-27  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.242945 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4171  ATP-dependent DNA ligase  45.33 
 
 		 914 aa  122  2e-27  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.497319  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5638  ATP-dependent DNA ligase  70.67 
 
 		 882 aa  122  2e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0850  hypothetical protein  69.74 
 
 		 183 aa  121  3e-27  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.000581551  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1670  DNA primase-like  44.67 
 
 		 527 aa  121  3e-27  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.447053  hitchhiker  0.00316977 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4365  ATP-dependent DNA ligase  44.59 
 
 		 886 aa  121  3e-27  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2225  DNA ligase  46.26 
 
 		 213 aa  121  3e-27  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8017  ATP-dependent DNA ligase  43.71 
 
 		 893 aa  121  3e-27  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6329  ATP-dependent DNA ligase  47.3 
 
 		 895 aa  120  6e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0632091 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0647  DNA ligase D, 3'-phosphoesterase domain protein  56.44 
 
 		 146 aa  120  6e-27  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.0128093  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3685  ATP-dependent DNA ligase  69.33 
 
 		 911 aa  120  7e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.865038  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1736  ATP-dependent DNA ligase  70.67 
 
 		 888 aa  120  7e-27  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.946456 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1218  ATP dependent DNA ligase  57.43 
 
 		 846 aa  120  8e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.257773 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2837  ATP-dependent DNA ligase  57.73 
 
 		 896 aa  120  9e-27  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13060  DNA ligase D/DNA polymerase LigD  45.64 
 
 		 852 aa  120  9e-27  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1695  ATP dependent DNA ligase  59.14 
 
 		 843 aa  119  9.999999999999999e-27  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.616199  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3982  DNA ligase D  64.47 
 
 		 837 aa  119  1.9999999999999998e-26  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.242041 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1876  ATP-dependent DNA ligase  44.22 
 
 		 914 aa  118  3e-26  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.907588  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3490  ATP-dependent DNA ligase  42.76 
 
 		 930 aa  118  3e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.505494  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0201  DNA polymerase LigD, polymerase domain protein  57.43 
 
 		 778 aa  118  3e-26  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.173659  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2679  ATP-dependent DNA ligase  56.99 
 
 		 868 aa  117  3.9999999999999996e-26  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1337  ATP dependent DNA ligase  56.99 
 
 		 868 aa  117  3.9999999999999996e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.402102 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0026  DNA ligase D  72.37 
 
 		 825 aa  117  7e-26  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.282762  hitchhiker  0.00000000359668 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10956  ATP-dependent DNA ligase  68.42 
 
 		 759 aa  116  9e-26  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4915  ATP-dependent DNA ligase  62.79 
 
 		 763 aa  116  9.999999999999999e-26  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.735483  normal  0.531274 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4309  DNA polymerase LigD ligase subunit  67.11 
 
 		 603 aa  115  1.9999999999999998e-25  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2115  hypothetical protein  65.79 
 
 		 151 aa  115  3e-25  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0221889  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2233  DNA polymerase LigD, polymerase domain protein  63.41 
 
 		 858 aa  114  3e-25  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4532  DNA polymerase LigD, polymerase domain protein  67.11 
 
 		 797 aa  114  3.9999999999999997e-25  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.684574  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3330  DNA ligase D  44.3 
 
 		 896 aa  114  5e-25  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.580871  normal  0.138663 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0448  ATP-dependent DNA ligase  70 
 
 		 866 aa  113  1.0000000000000001e-24  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1828  ATP-dependent DNA ligase  65.79 
 
 		 766 aa  113  1.0000000000000001e-24  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2631  DNA ligase D  61.04 
 
 		 865 aa  113  1.0000000000000001e-24  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4303  DNA ligase D  55.21 
 
 		 817 aa  111  3e-24  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.400493 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1729  DNA ligase D  64.1 
 
 		 813 aa  111  4.0000000000000004e-24  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0256122  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0128  ATP-dependent DNA ligase  65.79 
 
 		 831 aa  110  5e-24  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_07110  ATP-dependent DNA ligase  64.47 
 
 		 847 aa  110  5e-24  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0568  DNA ligase D  40.4 
 
 		 818 aa  110  6e-24  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000109107  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1951  DNA ligase D  50 
 
 		 822 aa  109  1.0000000000000001e-23  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00524792  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4352  ATP-dependent DNA ligase  64.47 
 
 		 758 aa  109  2.0000000000000002e-23  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>