281 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene YpAngola_A2566 on replicon NC_010159
Organism: Yersinia pestis Angola



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009997  Sbal195_0604  YD repeat-containing protein  76.52 
 
 
954 aa  1058    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.244718 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0610  YD repeat protein  76.52 
 
 
954 aa  1058    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1823  putative toxin protein  72.79 
 
 
994 aa  1070    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0293647  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0408  putative insecticidal toxin complex protein  51.89 
 
 
910 aa  636    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0160  TccC4  49.46 
 
 
952 aa  686    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.189077  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0603  YD repeat-containing protein  66.08 
 
 
962 aa  978    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.0731118 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0609  YD repeat protein  66.08 
 
 
958 aa  979    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2566  hypothetical protein  100 
 
 
980 aa  2021    Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00381829  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0382  YD repeat-containing protein  74.75 
 
 
852 aa  1005    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.835506  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0578  YD repeat-containing protein  66.08 
 
 
962 aa  978    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0579  YD repeat-containing protein  76.52 
 
 
954 aa  1058    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0406  putative insecticidal toxin complex protein  51.15 
 
 
929 aa  634  1e-180  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0473  YD repeat-containing protein  51.44 
 
 
952 aa  635  1e-180  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0589964  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0407  putative insecticidal toxin complex protein  51.31 
 
 
921 aa  631  1e-179  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0409  putative insecticial toxin complex protein  51.45 
 
 
958 aa  631  1e-179  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1189  RHS repeat family protein  52.31 
 
 
952 aa  626  1e-178  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.667138  hitchhiker  0.0000780044 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0162  TccC3  44.64 
 
 
989 aa  549  1e-155  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1870  Rhs family protein-like protein  99.59 
 
 
334 aa  491  1e-137  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0949212  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0159  insecticidal toxin complex protein TcdB2  41.57 
 
 
2417 aa  457  1e-127  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.163635  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0177  insecticidal toxin complex protein TcdB2  41.57 
 
 
2458 aa  455  1.0000000000000001e-126  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4340  insecticidal toxin protein, putative  42.12 
 
 
940 aa  447  1.0000000000000001e-124  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0586  YD repeat-containing protein  39.22 
 
 
956 aa  433  1e-120  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.178715 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1051  YD repeat-containing protein  41.04 
 
 
927 aa  435  1e-120  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4033  YD repeat-containing protein  40.92 
 
 
939 aa  433  1e-120  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.195324 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4037  YD repeat-containing protein  40.03 
 
 
955 aa  429  1e-118  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.0688366 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4344  insecticidal toxin protein, putative  40 
 
 
886 aa  421  1e-116  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4032  YD repeat-containing protein  39.37 
 
 
920 aa  418  9.999999999999999e-116  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.0529613 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1231  insecticidal toxin protein, putative  39.94 
 
 
922 aa  405  1e-111  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.644961  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4038  YD repeat-containing protein  40.06 
 
 
881 aa  404  1e-111  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.23853 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2412  YD repeat-containing protein  37.68 
 
 
923 aa  385  1e-105  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.394725  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4455  insecticidal toxin protein, putative  36.05 
 
 
944 aa  337  5.999999999999999e-91  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4456  insecticidal toxin protein, putative  35.71 
 
 
891 aa  333  8e-90  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.859155  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0998  YD repeat-containing protein  33.58 
 
 
2558 aa  330  8e-89  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0948  insecticidal toxin protein, putative  35.43 
 
 
942 aa  329  2.0000000000000001e-88  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.920867  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0947  insecticidal toxin protein, putative  34.81 
 
 
893 aa  316  9.999999999999999e-85  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.81125  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4454  insecticidal toxin protein, putative  34.54 
 
 
928 aa  311  4e-83  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.543889  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2868  YD repeat protein  33.09 
 
 
2554 aa  310  1.0000000000000001e-82  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2155  Rhs family protein-like protein  34.4 
 
 
2698 aa  252  3e-65  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.471338 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1414  hypothetical protein  30.98 
 
 
2534 aa  239  1e-61  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.733329 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5746  YD repeat protein  30.03 
 
 
2652 aa  229  1e-58  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1893  YD repeat protein  30.54 
 
 
2510 aa  222  3e-56  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.111399 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1894  YD repeat protein  32.06 
 
 
2443 aa  214  4.9999999999999996e-54  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.179364 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2269  YD repeat protein  27.79 
 
 
2479 aa  210  8e-53  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0582  hypothetical protein  31.08 
 
 
371 aa  126  2e-27  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.846716  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2009  hypothetical protein  31.42 
 
 
302 aa  126  2e-27  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0886  hypothetical protein  31.08 
 
 
358 aa  126  3e-27  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1916  hypothetical protein  31.08 
 
 
302 aa  125  3e-27  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1853  hypothetical protein  31.08 
 
 
302 aa  125  4e-27  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0434  hypothetical protein  31.08 
 
 
371 aa  124  7e-27  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.648831  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1558  YD repeat-containing protein  26.01 
 
 
3320 aa  106  2e-21  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1560  YD repeat-containing protein  25.84 
 
 
1126 aa  106  2e-21  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1373  integrins alpha chain  24.77 
 
 
1976 aa  87.8  0.000000000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2050  YD repeat-containing protein  48.45 
 
 
1935 aa  82.4  0.00000000000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.149487  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20520  hypothetical protein  23.96 
 
 
903 aa  80.5  0.0000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000061545  normal  0.488224 
 
 
-
 
NC_002936  DET1472  NHL/RHS/YD repeat-containing protein  23.97 
 
 
1834 aa  76.6  0.000000000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1472  YD repeat-containing protein  26.92 
 
 
1600 aa  76.3  0.000000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.059879  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4802  hypothetical protein  25.17 
 
 
2017 aa  75.1  0.000000000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.772458  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2251  YD repeat protein  24.32 
 
 
1577 aa  73.6  0.00000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.37026  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5681  RHS protein  22.56 
 
 
1609 aa  73.6  0.00000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7436  Rhs family protein-like protein  25.55 
 
 
2076 aa  73.2  0.00000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1452  YD repeat protein  40.37 
 
 
1464 aa  72.8  0.00000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2298  YD repeat protein  24.79 
 
 
1338 aa  72.4  0.00000000004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2022  YD repeat-containing protein  30.88 
 
 
1488 aa  71.2  0.00000000008  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.904557  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2020  YD repeat-containing protein  30.88 
 
 
1140 aa  70.9  0.0000000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2437  YD repeat-containing protein  23.21 
 
 
690 aa  70.9  0.0000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0188  YD repeat-containing protein  24.89 
 
 
1147 aa  70.1  0.0000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.336651  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4992  YD repeat-containing protein  29.17 
 
 
451 aa  69.3  0.0000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2925  YD repeat protein  37.6 
 
 
3456 aa  68.2  0.0000000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS02969  putative RHS-related protein  38.83 
 
 
1710 aa  67.8  0.000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.00316448  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1458  hypothetical protein  34.65 
 
 
391 aa  67.8  0.000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2443  YD repeat-containing protein  22.84 
 
 
927 aa  67  0.000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3399  hypothetical protein  23.26 
 
 
2096 aa  67  0.000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.664853  normal  0.744074 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02052  hypothetical protein  23.68 
 
 
1854 aa  66.6  0.000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3503  YD repeat protein  23.64 
 
 
2145 aa  66.2  0.000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2902  YD repeat protein  22.26 
 
 
1271 aa  66.2  0.000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.729617  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3459  YD repeat-containing protein  24.63 
 
 
3193 aa  66.2  0.000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1938  YD repeat protein  28.68 
 
 
678 aa  65.9  0.000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3108  rhs-related protein  29.36 
 
 
1385 aa  65.1  0.000000007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.93941 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0982  hypothetical protein  30.88 
 
 
284 aa  64.7  0.000000008  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.859705 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4990  YD repeat-containing protein  28.29 
 
 
867 aa  63.9  0.00000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2699  YD repeat protein  36.04 
 
 
1892 aa  64.3  0.00000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.499088  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3178  type VI secretion system Vgr family protein  25.34 
 
 
1981 aa  63.9  0.00000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.568675 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4405  hypothetical protein  36.36 
 
 
298 aa  63.9  0.00000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4180  hypothetical protein  36.36 
 
 
316 aa  64.3  0.00000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2613  YD repeat-containing protein  28.31 
 
 
866 aa  64.3  0.00000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.315185 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4266  hypothetical protein  36.36 
 
 
298 aa  63.9  0.00000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_07080  hypothetical protein  25.62 
 
 
2428 aa  63.9  0.00000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4988  YD repeat-containing protein  28.37 
 
 
480 aa  63.5  0.00000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007615  Nmul_B2808  peptidase C39, bacteriocin processing  25.94 
 
 
1599 aa  63.5  0.00000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0384  YD repeat-containing protein  37.27 
 
 
1550 aa  63.5  0.00000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.223676  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1373  YD repeat-containing protein  23.58 
 
 
1917 aa  62.8  0.00000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4986  YD repeat-containing protein  28 
 
 
1409 aa  62.4  0.00000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3881  YD repeat-containing protein  27.06 
 
 
1386 aa  62  0.00000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2520  YD repeat-containing protein  26.84 
 
 
1411 aa  62.4  0.00000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0521301  normal  0.492732 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1826  Rhs family protein  23.66 
 
 
1429 aa  61.6  0.00000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.831768  normal  0.546607 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2434  RHS protein  21.86 
 
 
1348 aa  61.6  0.00000006  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3233  YD repeat protein  24.75 
 
 
1639 aa  61.2  0.00000008  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.471244  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0353  YD repeat-containing protein  23.87 
 
 
1547 aa  61.2  0.00000009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_32830  hypothetical protein  23.24 
 
 
889 aa  60.5  0.0000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000050197  hitchhiker  0.0000345173 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0331  Rhs family protein  24.23 
 
 
1568 aa  60.8  0.0000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>