More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xcel_3219 on replicon NC_013530
Organism: Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013530  Xcel_3219  transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 		 215 aa  424  1e-118  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5987  transcriptional regulator, TetR family  38.67 
 
 		 204 aa  105  4e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2461  TetR family transcriptional regulator  35.23 
 
 		 234 aa  92  6e-18  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.460998  normal  0.536684 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3035  transcriptional regulator, TetR family  38.92 
 
 		 219 aa  90.1  2e-17  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.514093  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4193  TetR family transcriptional regulator  36.46 
 
 		 200 aa  89.4  4e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1116  TetR family transcriptional regulator  39.05 
 
 		 209 aa  87  2e-16  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.863597  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1428  TetR family transcriptional regulator  34.25 
 
 		 204 aa  86.7  3e-16  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.530378  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2291  transcriptional regulator, TetR family  44.53 
 
 		 205 aa  85.9  4e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.857741  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1264  TetR family transcriptional regulator  37.42 
 
 		 206 aa  85.5  5e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.599329  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1969  TetR family transcriptional regulator  43.8 
 
 		 205 aa  83.2  0.000000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0320964 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2327  TetR family transcriptional regulator  31.84 
 
 		 199 aa  82  0.000000000000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.194102 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5045  TetR family transcriptional regulator  41.67 
 
 		 206 aa  80.5  0.00000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.906168  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5815  TetR family transcriptional regulator  41.67 
 
 		 206 aa  80.5  0.00000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2460  TetR family transcriptional regulator  29.95 
 
 		 201 aa  80.5  0.00000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.315446  normal  0.37249 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4364  TetR family transcriptional regulator  42.42 
 
 		 206 aa  79.3  0.00000000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15710  transcriptional regulator  37.11 
 
 		 221 aa  79.3  0.00000000000004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.274511  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3354  transcriptional regulator, TetR family  32.16 
 
 		 210 aa  77.8  0.0000000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.216649  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3938  transcriptional regulator, TetR family  31.58 
 
 		 231 aa  75.9  0.0000000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  hitchhiker  0.00284915  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0483  transcriptional regulator, TetR family  36.88 
 
 		 226 aa  73.9  0.000000000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2996  TetR family transcriptional regulator  31.45 
 
 		 237 aa  73.6  0.000000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2373  TetR family transcriptional regulator  31.03 
 
 		 205 aa  73.9  0.000000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4804  TetR family transcriptional regulator  33.97 
 
 		 210 aa  73.2  0.000000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0360919  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3524  TetR family transcriptional regulator  41.67 
 
 		 187 aa  71.6  0.000000000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6268  TetR family transcriptional regulator  50.7 
 
 		 182 aa  71.6  0.000000000009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.700387  normal  0.409486 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4194  TetR family transcriptional regulator  30.22 
 
 		 201 aa  71.2  0.00000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3021  regulatory protein, TetR  32.53 
 
 		 205 aa  70.9  0.00000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.84883  normal  0.636371 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6341  TetR family transcriptional regulator  57.38 
 
 		 206 aa  70.5  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0497044  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1738  TetR family transcriptional regulator  57.38 
 
 		 206 aa  70.5  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1751  TetR family transcriptional regulator  57.38 
 
 		 206 aa  70.5  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0955  TetR family transcriptional regulator  36.24 
 
 		 212 aa  69.3  0.00000000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2294  TetR family regulatory protein  36.24 
 
 		 206 aa  69.3  0.00000000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2161  TetR family transcriptional regulator  36.24 
 
 		 206 aa  69.3  0.00000000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.720901  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3995  transcriptional regulator, TetR family  40.28 
 
 		 197 aa  68.9  0.00000000005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.200757  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2102  TetR family transcriptional regulator  36.24 
 
 		 206 aa  69.3  0.00000000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.526616  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1225  TetR family transcriptional regulator  31.87 
 
 		 208 aa  68.6  0.00000000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.657492  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4321  TetR family transcriptional regulator  32.84 
 
 		 199 aa  68.6  0.00000000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.675467  normal  0.0583361 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9154  putative transcriptional regulator, TetR family  36.89 
 
 		 226 aa  67.4  0.0000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.231214  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22310  transcriptional regulator, tetR family  37.25 
 
 		 202 aa  67.4  0.0000000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3734  TetR family transcriptional regulator  51.56 
 
 		 202 aa  67.4  0.0000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0165853  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2257  TetR family transcriptional regulator  32.53 
 
 		 202 aa  67  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.92818  normal  0.36633 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3722  TetR family transcriptional regulator  51.56 
 
 		 202 aa  67.4  0.0000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.869277  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3716  TetR family transcriptional regulator  31.84 
 
 		 199 aa  67.4  0.0000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3795  TetR family transcriptional regulator  51.56 
 
 		 202 aa  67.4  0.0000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.796114  normal  0.124585 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3703  TetR family transcriptional regulator  31.84 
 
 		 199 aa  66.6  0.0000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3776  TetR family transcriptional regulator  31.84 
 
 		 199 aa  66.6  0.0000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.450606 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0397  transcriptional regulator, TetR family  34.01 
 
 		 211 aa  65.9  0.0000000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0669765  normal  0.062689 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2431  TetR family transcriptional regulator  29.52 
 
 		 214 aa  64.3  0.000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0857946 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0402  transcriptional regulator, TetR family  36.54 
 
 		 219 aa  64.7  0.000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.67084  normal  0.0771341 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1521  TetR family transcriptional regulator  65.96 
 
 		 206 aa  64.7  0.000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.375612 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0412  TetR family transcriptional regulator  52.31 
 
 		 212 aa  64.3  0.000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.417244  normal  0.216002 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5812  TetR family transcriptional regulator  45.95 
 
 		 188 aa  63.5  0.000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0159111 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1659  TetR family transcriptional regulator  65.96 
 
 		 206 aa  63.5  0.000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1659  TetR family transcriptional regulator  63.27 
 
 		 206 aa  63.9  0.000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2110  transcriptional regulator, TetR family  35.96 
 
 		 200 aa  63.2  0.000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0942807  normal  0.362877 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_28480  transcriptional regulator  56.14 
 
 		 326 aa  63.2  0.000000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.552525 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5034  TetR family transcriptional regulator  63.27 
 
 		 206 aa  62.8  0.000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.553825 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5280  TetR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 175 aa  62  0.000000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1632  transcriptional regulator, TetR family  56.14 
 
 		 239 aa  62  0.000000006  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1467  transcriptional regulator, TetR family  39.62 
 
 		 217 aa  61.2  0.00000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6828  TetR family transcriptional regulator  36.8 
 
 		 225 aa  61.6  0.00000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.196798  normal  0.216852 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2120  transcriptional regulator, TetR family  29.5 
 
 		 198 aa  60.8  0.00000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1052  TetR family transcriptional regulator  39.81 
 
 		 215 aa  60.5  0.00000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.857726  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3736  TetR family transcriptional regulator  28.97 
 
 		 200 aa  59.7  0.00000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.042499  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3724  TetR family transcriptional regulator  28.97 
 
 		 200 aa  60.1  0.00000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.29601  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3797  TetR family transcriptional regulator  28.97 
 
 		 200 aa  60.1  0.00000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.388195  normal  0.0386626 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3810  TetR family transcriptional regulator  41.38 
 
 		 191 aa  59.3  0.00000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4572  TetR family transcriptional regulator  49.23 
 
 		 208 aa  59.3  0.00000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.270475 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1623  transcriptional regulator, TetR family  31.85 
 
 		 205 aa  59.3  0.00000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51850  Transcriptional regulatory protein, TetR family  47.95 
 
 		 186 aa  58.9  0.00000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2290  TetR family transcriptional regulator  61.7 
 
 		 206 aa  58.9  0.00000006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.721121  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4587  transcriptional regulator, TetR family  54.17 
 
 		 199 aa  58.5  0.00000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.358268  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4343  transcriptional regulator, TetR family  34.46 
 
 		 225 aa  58.5  0.00000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0349599  decreased coverage  0.000000750918 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6912  TetR family transcriptional regulator  54.55 
 
 		 236 aa  58.5  0.00000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.830717  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4931  TetR family transcriptional regulator  41.43 
 
 		 497 aa  58.2  0.00000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.475051  normal  0.080695 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2948  TetR family transcriptional regulator  32 
 
 		 191 aa  58.2  0.00000009  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0281  transcriptional regulator, TetR family  45.45 
 
 		 218 aa  58.2  0.0000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.645912  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3347  regulatory protein, TetR  42.65 
 
 		 205 aa  57.8  0.0000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.235212  normal  0.0210246 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0686  transcriptional regulator, TetR family  30.86 
 
 		 247 aa  57.4  0.0000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6328  transcriptional regulator, TetR family  41.56 
 
 		 199 aa  57  0.0000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.00138827  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6345  transcriptional regulator, TetR family  39.51 
 
 		 241 aa  57  0.0000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3576  TetR-like virulence regulator  42.65 
 
 		 207 aa  57  0.0000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5790  transcriptional regulator, TetR family  46.67 
 
 		 220 aa  57  0.0000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0399068 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2067  TetR family transcriptional regulator  53.7 
 
 		 216 aa  57  0.0000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3330  TetR family transcriptional regulator  34.66 
 
 		 225 aa  57.4  0.0000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.648103  normal  0.907597 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22500  transcriptional regulator, TetR family  33.09 
 
 		 199 aa  56.6  0.0000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.589103  normal  0.921764 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0652  Transcriptional regulator protein  42.86 
 
 		 196 aa  57  0.0000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3066  TetR family transcriptional regulator  33.07 
 
 		 190 aa  57.4  0.0000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.122558 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4014  transcriptional regulator, TetR family  33.9 
 
 		 225 aa  56.2  0.0000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2816  hypothetical protein  46.88 
 
 		 222 aa  56.2  0.0000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0366008  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4724  regulatory protein, TetR  42.62 
 
 		 191 aa  56.6  0.0000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3715  TetR family transcriptional regulator  57.41 
 
 		 208 aa  56.6  0.0000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.158333 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0138  TetR family transcriptional regulator  42.42 
 
 		 218 aa  56.6  0.0000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_24090  transcriptional regulator  50.94 
 
 		 209 aa  56.6  0.0000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4037  TetR family transcriptional regulator  37.14 
 
 		 446 aa  55.8  0.0000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.755951  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6768  transcriptional regulator, TetR family  44.62 
 
 		 221 aa  56.2  0.0000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.357314  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_28270  transcriptional regulator  49.06 
 
 		 205 aa  56.2  0.0000004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.188874 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6562  TetR family transcriptional regulator  44.62 
 
 		 210 aa  56.2  0.0000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.67895  normal  0.0476005 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0068  TetR family transcriptional regulator  36 
 
 		 193 aa  55.8  0.0000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1550  transcriptional regulator, TetR family  40.28 
 
 		 201 aa  55.8  0.0000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01577  hypothetical protein  28.85 
 
 		 196 aa  55.8  0.0000005  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.98021  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>