200 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xcel_1430 on replicon NC_013530
Organism: Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013530  Xcel_1430  regulatory protein TetR  100 
 
 		 236 aa  447  1e-125  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8740  putative transcriptional regulator, TetR family  47.06 
 
 		 226 aa  90.9  1e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0808  transcriptional regulator, TetR family  35.48 
 
 		 222 aa  90.1  3e-17  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0735  regulatory protein, TetR  36.02 
 
 		 204 aa  83.6  0.000000000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6264  putative transcriptional regulator, TetR family  32.86 
 
 		 196 aa  70.9  0.00000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.085092 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1125  transcriptional regulator, TetR family  50.68 
 
 		 210 aa  67  0.0000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2624  transcriptional regulator, TetR family  42 
 
 		 210 aa  65.1  0.0000000008  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.465145  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2369  transcriptional regulator, TetR family  50.79 
 
 		 212 aa  60.8  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2419  transcriptional regulator, TetR family  50.79 
 
 		 212 aa  60.8  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.47163  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4369  TetR family transcriptional regulator  58.93 
 
 		 204 aa  59.7  0.00000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.645452 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0270  TetR family transcriptional regulator  46.43 
 
 		 192 aa  55.1  0.000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.522665  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1461  TetR family transcriptional regulator  46.88 
 
 		 197 aa  53.9  0.000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.0279876 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1971  transcriptional regulator, TetR family  51.67 
 
 		 196 aa  54.3  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0740  TetR family transcriptional regulator  52.46 
 
 		 205 aa  53.5  0.000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.891023  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0787  TetR family transcriptional regulator  47.27 
 
 		 192 aa  53.1  0.000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0101484 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2950  TetR family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 217 aa  52.4  0.000006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000171699 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4087  transcriptional regulator, TetR family  58.7 
 
 		 228 aa  51.2  0.00001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.98142 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1459  transcriptional regulator, TetR family  48.08 
 
 		 187 aa  50.4  0.00003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4272  TetR family transcriptional regulator  42.5 
 
 		 191 aa  50.1  0.00003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.814005 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0257  TetR family transcriptional regulator  41.05 
 
 		 201 aa  49.7  0.00004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.837987 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7871  transcriptional regulator, TetR family  44.44 
 
 		 212 aa  48.9  0.00007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.519364  normal  0.175428 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2757  transcriptional regulator, TetR family  40.32 
 
 		 179 aa  48.5  0.00009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.331612  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2374  TetR family transcriptional regulator  38.89 
 
 		 191 aa  48.5  0.00009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1770  transcriptional regulator, TetR family  46.03 
 
 		 203 aa  48.1  0.0001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23490  transcriptional regulator, tetR family  45.83 
 
 		 223 aa  47.8  0.0002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.411786  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1218  transcriptional regulator, TetR family  30.53 
 
 		 206 aa  47.4  0.0002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3562  transcriptional regulator, TetR family  37.5 
 
 		 237 aa  47  0.0002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.108326  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5643  TetR family transcriptional regulator  34.44 
 
 		 224 aa  47  0.0002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.240264  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0599  TetR family transcriptional regulator  49.12 
 
 		 200 aa  47.8  0.0002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.000153581  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25080  Transcriptional regulator, TetR family  49.06 
 
 		 191 aa  47.8  0.0002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3267  TetR family transcriptional regulator  45.28 
 
 		 188 aa  47.4  0.0002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3333  TetR family transcriptional regulator  45 
 
 		 201 aa  47.4  0.0002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4029  TetR family transcriptional regulator  29.81 
 
 		 196 aa  47.4  0.0002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05370  transcriptional regulator, TetR family  35.19 
 
 		 205 aa  47.4  0.0002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000643211  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0951  transcriptional regulator, TetR family  33.61 
 
 		 242 aa  47.4  0.0002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3704  TetR family transcriptional regulator  45.61 
 
 		 202 aa  47.4  0.0002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0455  TetR family transcriptional regulator  47.22 
 
 		 224 aa  47.4  0.0002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.366206  normal  0.106872 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2344  TetR family transcriptional regulator  45.61 
 
 		 195 aa  47  0.0002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.914652  normal  0.958906 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1039  TetR family transcriptional regulator  35.87 
 
 		 201 aa  47.4  0.0002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.747573 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1027  transcriptional regulator, TetR family  45 
 
 		 201 aa  47  0.0002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1933  AcrR family transcriptional regulator  29.22 
 
 		 243 aa  46.6  0.0003  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.189914  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1719  transcriptional regulator, TetR family  33.04 
 
 		 196 aa  46.6  0.0003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13530  transcriptional regulator, TetR family  35.82 
 
 		 186 aa  46.6  0.0003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00114254  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3394  transcriptional regulator, TetR family  38.46 
 
 		 220 aa  46.6  0.0003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.222962 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4533  TetR family transcriptional regulator  49.06 
 
 		 218 aa  46.6  0.0003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.505005  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5174  putative transcriptional regulator, TetR family  44.29 
 
 		 199 aa  46.6  0.0004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0107413  hitchhiker  0.00860579 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0970  transcriptional regulator, TetR family  41.3 
 
 		 203 aa  46.6  0.0004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1006  TetR family transcriptional regulator  48.98 
 
 		 189 aa  46.2  0.0004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0986  TetR family transcriptional regulator  34.04 
 
 		 197 aa  46.2  0.0005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2983  TetR family transcriptional regulator  48.98 
 
 		 190 aa  45.8  0.0006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0520  transcriptional regulator, TetR family  37.74 
 
 		 197 aa  45.8  0.0006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.711752  normal  0.521102 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1731  transcriptional regulator, TetR family  42.17 
 
 		 196 aa  45.4  0.0007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0465827  normal  0.0150851 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0032  transcriptional regulator, TetR family  40.91 
 
 		 210 aa  45.4  0.0007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0987  TetR family transcriptional regulator  40.74 
 
 		 195 aa  45.4  0.0008  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.995143  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4951  TetR family transcriptional regulator  33.04 
 
 		 239 aa  45.4  0.0008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.717286  normal  0.572747 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0553  TetR family transcriptional regulator  39.13 
 
 		 233 aa  45.4  0.0008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0649  TetR family transcriptional regulator  39.19 
 
 		 231 aa  45.4  0.0008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.899851  normal  0.251562 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3474  transcriptional regulator of TetR family protein  35.21 
 
 		 191 aa  45.4  0.0008  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.486624 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8965  putative transcriptional regulator, TetR family  42.86 
 
 		 173 aa  45.4  0.0008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1052  TetR family transcriptional regulator  42.03 
 
 		 215 aa  45.4  0.0008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.857726  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2202  transcriptional regulator, TetR family  45.76 
 
 		 186 aa  45.1  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.243165 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2282  TetR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 217 aa  45.1  0.001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3641  TetR family transcriptional regulator  27.88 
 
 		 200 aa  45.1  0.001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.798229 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2557  transcriptional regulator, TetR family  39.06 
 
 		 217 aa  44.7  0.001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.15322e-23 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0439  transcriptional regulator, TetR family  47.06 
 
 		 205 aa  44.7  0.001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2165  transcriptional regulator, TetR family  46.94 
 
 		 188 aa  44.7  0.001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.289199  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0662  TetR family transcriptional regulator  30.7 
 
 		 205 aa  45.1  0.001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3459  TetR family transcriptional regulator  44 
 
 		 324 aa  45.1  0.001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000855252 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2856  TetR family transcriptional regulator  48.98 
 
 		 194 aa  44.7  0.001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.661308  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0881  regulatory protein TetR  45.31 
 
 		 219 aa  44.7  0.001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4729  TetR family transcriptional regulator  41.79 
 
 		 240 aa  44.7  0.001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3913  TetR family transcriptional regulator  34.38 
 
 		 239 aa  45.1  0.001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.20842  normal  0.141898 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0584  transcriptional regulator, TetR family  44.93 
 
 		 207 aa  44.7  0.001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0868  transcriptional regulator, TetR family  26.7 
 
 		 222 aa  45.1  0.001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000000486929  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13440  transcriptional regulator  45.71 
 
 		 188 aa  44.7  0.001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.651829 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2786  transcriptional regulator, TetR family  36.23 
 
 		 190 aa  45.1  0.001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.06199  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0522  TetR family transcriptional regulator  35.48 
 
 		 219 aa  45.1  0.001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000716  transcriptional regulator  34.38 
 
 		 175 aa  45.1  0.001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.421465  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2094  transcriptional regulator, TetR family  32.18 
 
 		 186 aa  44.7  0.001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000324065 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2353  TetR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 217 aa  45.1  0.001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.384863  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0458  transcriptional regulator, TetR family  47.06 
 
 		 205 aa  44.7  0.001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0928  transcriptional regulator, TetR family  37.37 
 
 		 184 aa  44.3  0.002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.312785  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3436  transcriptional regulator, TetR family  42.86 
 
 		 194 aa  44.3  0.002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.262135  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2545  TetR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 217 aa  44.3  0.002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0577985  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2366  TetR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 217 aa  44.3  0.002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.711286  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2324  TetR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 217 aa  44.3  0.002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.000190708  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2543  TetR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 217 aa  44.3  0.002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1759  transcriptional regulator, TetR family  44 
 
 		 217 aa  43.9  0.002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1236  TetR family transcriptional regulator  40.38 
 
 		 196 aa  43.9  0.002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.0369519 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2508  transcriptional regulator, TetR family  37.5 
 
 		 217 aa  44.3  0.002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0373  TetR family transcriptional regulator  43.4 
 
 		 188 aa  44.3  0.002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3252  TetR family transcriptional regulator  46.94 
 
 		 200 aa  43.9  0.002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0810  transcriptional regulator, TetR family  41.82 
 
 		 268 aa  44.3  0.002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2815  TetR family transcriptional regulator  40.79 
 
 		 242 aa  44.3  0.002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.106176  normal  0.623336 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4473  putative transcriptional regulator, TetR family  55.32 
 
 		 208 aa  43.9  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.446518  normal  0.220039 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1454  transcriptional regulator, TetR family  36.36 
 
 		 231 aa  44.3  0.002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.901974 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2815  transcriptional regulator, TetR family  37.5 
 
 		 217 aa  44.3  0.002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000266483 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1473  TetR family transcriptional regulator  44.23 
 
 		 187 aa  44.3  0.002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1965  TetR family transcriptional regulator  43.75 
 
 		 206 aa  43.9  0.002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0526053  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0184  TetR family transcriptional regulator  32.08 
 
 		 197 aa  43.9  0.002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>