220 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_1629 on replicon NC_012791
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012791  Vapar_1629  fatty acid hydroxylase  100 
 
 		 324 aa  645    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0812703  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1804  hypothetical protein  68.92 
 
 		 320 aa  465  9.999999999999999e-131  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000255396 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1439  hypothetical protein  69.11 
 
 		 328 aa  466  9.999999999999999e-131  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2783  hypothetical protein  67.48 
 
 		 321 aa  448  1e-125  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00292274 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5005  fatty acid hydroxylase  66.77 
 
 		 326 aa  438  9.999999999999999e-123  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3157  hypothetical protein  65.24 
 
 		 331 aa  418  1e-116  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1106  fatty acid hydroxylase  66.26 
 
 		 332 aa  410  1e-113  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1186  hypothetical protein  65.35 
 
 		 332 aa  407  1.0000000000000001e-112  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.502028 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2079  hypothetical protein  63.61 
 
 		 324 aa  397  1e-109  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.768511  normal  0.410732 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2066  hypothetical protein  57.83 
 
 		 331 aa  379  1e-104  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1174  fatty acid hydroxylase  57.54 
 
 		 324 aa  380  1e-104  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2062  transmembrane protein  56.39 
 
 		 324 aa  363  2e-99  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1082  fatty acid hydroxylase  56.92 
 
 		 324 aa  358  5e-98  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.853948  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1254  hypothetical protein  56.62 
 
 		 324 aa  357  9.999999999999999e-98  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.757696  normal  0.605 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1840  hypothetical protein  52.23 
 
 		 329 aa  332  4e-90  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.194533  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2774  hypothetical protein  51.91 
 
 		 329 aa  329  3e-89  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2639  hypothetical protein  51.91 
 
 		 329 aa  329  3e-89  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.173058  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2695  hypothetical protein  51.91 
 
 		 329 aa  329  3e-89  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.231759  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1118  fatty acid hydroxylase  50.62 
 
 		 325 aa  328  7e-89  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.325858  normal  0.912027 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2619  fatty acid hydroxylase  48.92 
 
 		 332 aa  328  9e-89  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.010312  normal  0.695137 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5462  sterol desaturase-like  50.94 
 
 		 324 aa  326  4.0000000000000003e-88  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2257  hypothetical protein  51.59 
 
 		 329 aa  325  7e-88  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.648004  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3063  hypothetical protein  51.59 
 
 		 329 aa  325  7e-88  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00223094  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1528  hypothetical protein  51.59 
 
 		 329 aa  325  7e-88  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0526335  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2190  sterol desaturase-like protein  50.62 
 
 		 324 aa  323  2e-87  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2063  fatty acid hydroxylase  50.31 
 
 		 324 aa  323  4e-87  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.589022  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5924  sterol desaturase-like  50 
 
 		 324 aa  320  1.9999999999999998e-86  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2171  fatty acid hydroxylase  49.69 
 
 		 324 aa  320  1.9999999999999998e-86  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.689731 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2153  sterol desaturase-like protein  50 
 
 		 324 aa  320  1.9999999999999998e-86  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.135202  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1485  fatty acid hydroxylase  49.22 
 
 		 327 aa  311  7.999999999999999e-84  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.12734  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1517  hypothetical protein  50 
 
 		 332 aa  309  2.9999999999999997e-83  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.012017  normal  0.130505 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1258  putative transmembrane protein  42.59 
 
 		 323 aa  269  5e-71  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.205212  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0075  fatty acid hydroxylase  40.68 
 
 		 324 aa  225  9e-58  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00145627 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2845  sterol desaturase-like protein  40.06 
 
 		 308 aa  221  9.999999999999999e-57  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.448688  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0001  hypothetical protein  37.37 
 
 		 297 aa  166  2.9999999999999998e-40  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.840453 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2296  fatty acid hydroxylase  37 
 
 		 374 aa  161  1e-38  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00152596 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11823  probable transmembrane protein  29.39 
 
 		 291 aa  93.6  4e-18  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7771  fatty acid hydroxylase  29.5 
 
 		 284 aa  83.6  0.000000000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.186795  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1960  sterol desaturase-related protein  27.96 
 
 		 283 aa  77.4  0.0000000000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.342543  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2704  sterol desaturase  31.36 
 
 		 386 aa  76.3  0.0000000000007  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0242  hypothetical protein  28.41 
 
 		 325 aa  76.3  0.0000000000007  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4620  fatty acid hydroxylase  28.03 
 
 		 288 aa  75.9  0.0000000000009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.405841 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1644  fatty acid hydroxylase  33.15 
 
 		 295 aa  74.7  0.000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.118454 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3919  hypothetical protein  25.2 
 
 		 273 aa  73.6  0.000000000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0425418  normal  0.393251 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3816  sterol desaturase  28.4 
 
 		 380 aa  72.8  0.000000000007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1248  fatty acid hydroxylase  33.13 
 
 		 281 aa  72.4  0.000000000009  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05005  probable transmembrane protein  29.15 
 
 		 256 aa  71.6  0.00000000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2023  sterol desaturase-like protein  32.16 
 
 		 322 aa  72.4  0.00000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.188564 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7012  fatty acid hydroxylase  32.65 
 
 		 321 aa  72.4  0.00000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2098  sterol desaturase  27.87 
 
 		 374 aa  71.6  0.00000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.520582  normal  0.627756 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1140  hypothetical protein  30 
 
 		 304 aa  70.9  0.00000000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.132577  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003512  sterol desaturase  28.92 
 
 		 273 aa  69.7  0.00000000006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7026  hypothetical protein  29.49 
 
 		 275 aa  69.7  0.00000000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0170073  normal  0.638792 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0347  fatty acid hydroxylase  26.37 
 
 		 293 aa  68.6  0.0000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02945  sterol desaturase-related protein  29.33 
 
 		 267 aa  68.9  0.0000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1104  sterol desaturase-related protein  29.94 
 
 		 278 aa  67.8  0.0000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0432208  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3537  fatty acid hydroxylase  28.69 
 
 		 376 aa  67.8  0.0000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.351469  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02255  hypothetical protein  25.98 
 
 		 281 aa  67.4  0.0000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6885  fatty acid hydroxylase  28.02 
 
 		 413 aa  67  0.0000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3994  fatty acid hydroxylase  30.77 
 
 		 256 aa  67  0.0000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000572359 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2774  putative transmembrane protein  27.97 
 
 		 376 aa  66.6  0.0000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.923206  normal  0.994499 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3509  sterol desaturase-like protein  27.92 
 
 		 426 aa  67  0.0000000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.804962  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1983  fatty acid hydroxylase  28.66 
 
 		 272 aa  65.5  0.000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0678  fatty acid hydroxylase  27.65 
 
 		 304 aa  64.3  0.000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.409553  normal  0.565503 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2963  putative sterol desaturase  30.87 
 
 		 270 aa  64.3  0.000000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1393  sterol desaturase  30.99 
 
 		 272 aa  63.9  0.000000004  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.015069  normal  0.782198 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1008  sterol desaturase family protein  25.11 
 
 		 305 aa  63.9  0.000000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1574  sterol desaturase, putative  25.81 
 
 		 264 aa  63.9  0.000000004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0147058  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0842  sterol desaturase family protein  25.11 
 
 		 305 aa  63.9  0.000000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.511589  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0847  sterol desaturase family protein  25.11 
 
 		 305 aa  63.9  0.000000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1012  hypothetical protein  30.43 
 
 		 337 aa  63.2  0.000000005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0697  hypothetical protein  28.74 
 
 		 321 aa  63.5  0.000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.937871 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3510  sterol desaturase  26.45 
 
 		 259 aa  63.2  0.000000005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.695011 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2540  fatty acid hydroxylase  25.76 
 
 		 304 aa  63.2  0.000000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.371452  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0776  sterol desaturase family protein  28.99 
 
 		 314 aa  62.8  0.000000007  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01793  putative C-5 sterol desaturase  25.29 
 
 		 265 aa  62.8  0.000000008  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.14977  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2009  sterol desaturase-like  28.48 
 
 		 304 aa  62.4  0.000000009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2649  fatty acid hydroxylase  28.48 
 
 		 304 aa  62.8  0.000000009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2620  sterol desaturase-like protein  28.48 
 
 		 304 aa  62.4  0.000000009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03346  sterol desaturase protein  28.57 
 
 		 270 aa  62.4  0.000000009  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5951  sterol desaturase-like  27.85 
 
 		 304 aa  62.4  0.00000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.462892 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0028  sterol desaturase  28.65 
 
 		 282 aa  62  0.00000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.178339  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3910  fatty acid hydroxylase  28.19 
 
 		 256 aa  62.4  0.00000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0633105  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2304  fatty acid hydroxylase  31.1 
 
 		 298 aa  62.4  0.00000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0427  sterol desaturase-like protein  27.71 
 
 		 295 aa  62.4  0.00000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.27499  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000349  sterol desaturase family protein  27.22 
 
 		 285 aa  61.2  0.00000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3269  fatty acid hydroxylase  28.14 
 
 		 320 aa  61.6  0.00000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3600  hypothetical protein  29.89 
 
 		 328 aa  61.6  0.00000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.306481  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0647  fatty acid hydroxylase  27.32 
 
 		 373 aa  60.8  0.00000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06161  C-5 sterol desaturase  27.98 
 
 		 271 aa  60.8  0.00000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2667  sterol desaturase-like protein  27.22 
 
 		 304 aa  60.8  0.00000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3388  hypothetical protein  29.8 
 
 		 255 aa  60.8  0.00000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0628245  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0624  putative transmembrane protein  27.32 
 
 		 374 aa  60.8  0.00000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0651  putative transmembrane protein  27.32 
 
 		 373 aa  60.8  0.00000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1138  sterol desaturase-like protein  28.74 
 
 		 304 aa  60.5  0.00000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.713792  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1390  membrane protein  27.54 
 
 		 267 aa  60.1  0.00000005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.104354  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3618  hypothetical protein  26.14 
 
 		 274 aa  59.7  0.00000006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.246292  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5280  fatty acid hydroxylase  26.59 
 
 		 431 aa  60.1  0.00000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5310  fatty acid hydroxylase  28.06 
 
 		 293 aa  60.1  0.00000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00000145361  normal  0.160912 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3738  putative transmembrane protein  27.32 
 
 		 301 aa  60.1  0.00000006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>