298 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VEA_002889 on replicon NC_013456
Organism: Vibrio sp. Ex25



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009784  VIBHAR_07080  hypothetical protein  37.41 
 
 		 2428 aa  1431    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002889  Rhs family protein  100 
 
 		 2416 aa  5010    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02052  hypothetical protein  30.95 
 
 		 1854 aa  435  1e-120  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3020  hypothetical protein  30.42 
 
 		 2762 aa  196  4e-48  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.664598  normal  0.0507807 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0137  Integrins alpha chain  30.07 
 
 		 2497 aa  190  4e-46  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0201  hypothetical protein  31.12 
 
 		 722 aa  187  2.0000000000000003e-45  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3249  Rhs family protein-like  32.72 
 
 		 2513 aa  179  6e-43  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.139311 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0197  Rhs family protein-like protein  32.51 
 
 		 2413 aa  178  9e-43  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0198  YD repeat-containing protein  29.59 
 
 		 3333 aa  158  1e-36  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00448474 
 
 
-
 
NC_002936  DET1472  NHL/RHS/YD repeat-containing protein  31.01 
 
 		 1834 aa  155  1e-35  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2165  YD repeat-containing protein  27.15 
 
 		 2448 aa  150  3e-34  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4802  hypothetical protein  24.33 
 
 		 2017 aa  145  9.999999999999999e-33  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.772458  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3898  YD repeat-containing protein  28.86 
 
 		 2283 aa  142  7e-32  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1124  YD repeat-containing protein  28.61 
 
 		 2401 aa  140  2e-31  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1180  YD repeat-containing protein  27.91 
 
 		 2437 aa  140  3.0000000000000003e-31  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.265366 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1703  YD repeat-/RHS repeat-containing protein  25.99 
 
 		 2094 aa  139  6.0000000000000005e-31  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1237  YD repeat-containing protein  31.35 
 
 		 628 aa  138  9.999999999999999e-31  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1689  YD repeat-/RHS repeat-containing protein  33.71 
 
 		 482 aa  136  5e-30  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2031  YD repeat-containing protein  27.54 
 
 		 2402 aa  135  9e-30  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.063176 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1682  YD repeat-containing protein  33.46 
 
 		 474 aa  134  2.0000000000000002e-29  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2167  YD repeat-containing protein  30.26 
 
 		 622 aa  133  4.0000000000000003e-29  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0160  YD repeat protein  26.13 
 
 		 2165 aa  132  6e-29  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0053  YD repeat protein  27.48 
 
 		 2075 aa  124  1.9999999999999998e-26  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.192291  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2902  YD repeat protein  23.6 
 
 		 1271 aa  119  6e-25  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.729617  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1158  YD repeat-containing protein  28.07 
 
 		 1517 aa  109  6e-22  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0480723  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1441  hypothetical protein  25.64 
 
 		 2138 aa  97.1  4e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2224  YD repeat-containing protein  38.61 
 
 		 2494 aa  95.1  1e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_07078  hypothetical protein  49.45 
 
 		 103 aa  93.2  5e-17  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2323  hypothetical protein  40.83 
 
 		 554 aa  90.9  3e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02048  hypothetical protein  30.95 
 
 		 583 aa  88.2  0.000000000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3503  YD repeat protein  26.53 
 
 		 2145 aa  86.3  0.000000000000008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0044  hypothetical protein  25.49 
 
 		 2117 aa  80.5  0.0000000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1373  integrins alpha chain  27.38 
 
 		 1976 aa  80.5  0.0000000000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1458  hypothetical protein  33.33 
 
 		 391 aa  80.1  0.0000000000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0346  YD repeat-containing protein  23.33 
 
 		 2035 aa  80.1  0.0000000000005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0084  YD repeat-containing protein  25.77 
 
 		 1352 aa  79.3  0.0000000000009  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0177  hypothetical protein  39.09 
 
 		 232 aa  78.6  0.000000000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3399  hypothetical protein  24.04 
 
 		 2096 aa  77.8  0.000000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.664853  normal  0.744074 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4266  hypothetical protein  37.8 
 
 		 298 aa  76.3  0.000000000006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4405  hypothetical protein  37.8 
 
 		 298 aa  76.3  0.000000000006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4869  YD repeat protein  23.36 
 
 		 2290 aa  76.6  0.000000000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4180  hypothetical protein  37.8 
 
 		 316 aa  76.6  0.000000000006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3052  YD repeat-containing protein  25.06 
 
 		 2942 aa  75.5  0.00000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1512  YD repeat protein  23.5 
 
 		 2059 aa  75.9  0.00000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00384432 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5751  YD repeat protein  23.38 
 
 		 2035 aa  75.5  0.00000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2925  YD repeat protein  23.99 
 
 		 3456 aa  73.2  0.00000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3077  hypothetical protein  32.93 
 
 		 299 aa  73.2  0.00000000006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0133  hypothetical protein  36.07 
 
 		 520 aa  72.4  0.00000000009  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.800968  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1130  wall-associated protein  24.4 
 
 		 2225 aa  72  0.0000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.490053  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5510  YD repeat-containing protein  22.41 
 
 		 1390 aa  71.2  0.0000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.162905  normal  0.931179 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3445  wall-associated protein  23.29 
 
 		 2178 aa  71.6  0.0000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.837931  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2907  hypothetical protein  30.11 
 
 		 340 aa  70.9  0.0000000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.621044 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3834  YD repeat-containing protein  24.84 
 
 		 1723 aa  70.5  0.0000000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.806398 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1230  YD repeat protein  25 
 
 		 2191 aa  70.1  0.0000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.249326 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1475  YD repeat-containing protein  26.48 
 
 		 2294 aa  69.7  0.0000000007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.705972 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1275  wall-associated protein, putative  23.33 
 
 		 2221 aa  69.3  0.0000000008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1054  YD repeat-containing protein  25.5 
 
 		 2286 aa  68.9  0.000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.740201  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33070  Rhs family protein  25.63 
 
 		 1140 aa  69.3  0.000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3459  YD repeat-containing protein  25.82 
 
 		 3193 aa  68.6  0.000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1178  putative wall-associated protein  22.76 
 
 		 2224 aa  68.2  0.000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.811104 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1201  wall associated protein, putative  22.56 
 
 		 2246 aa  68.2  0.000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.491377  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18610  YD repeat protein  24.02 
 
 		 2277 aa  68.6  0.000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1255  wall-associated protein  24.93 
 
 		 504 aa  68.2  0.000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1253  wall-associated protein  24.06 
 
 		 765 aa  68.2  0.000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2955  YD repeat-containing protein  26.5 
 
 		 1397 aa  67.4  0.000000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0234  YD repeat-containing protein  26.5 
 
 		 1411 aa  67.4  0.000000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0586  YD repeat-containing protein  24.69 
 
 		 956 aa  67.4  0.000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.178715 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1893  YD repeat protein  24.7 
 
 		 2510 aa  67.8  0.000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.111399 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0012  YD repeat protein  27.7 
 
 		 3027 aa  67.8  0.000000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04723  RhsD protein  29.17 
 
 		 920 aa  67  0.000000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.370413  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0120  YD repeat-containing protein  26.5 
 
 		 1377 aa  67.4  0.000000004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04849  RhsD protein  29.17 
 
 		 917 aa  66.6  0.000000005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0148662  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2936  YD repeat protein  23.47 
 
 		 1397 aa  66.2  0.000000008  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0941  YD repeat protein  23.02 
 
 		 1467 aa  66.2  0.000000008  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.125138  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6407  YD repeat protein  25.66 
 
 		 2194 aa  65.9  0.000000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.524494 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1022  wall-associated protein  22.72 
 
 		 2224 aa  65.9  0.000000009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1094  wall-associated protein  22.72 
 
 		 2224 aa  65.9  0.000000009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2167  YD repeat-containing protein  26.29 
 
 		 2003 aa  65.5  0.00000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.154621 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4797  rhs-related transmembrane protein, YD repeat protein  26.37 
 
 		 1626 aa  63.9  0.00000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32860  Rhs family protein  26.36 
 
 		 1259 aa  63.9  0.00000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.390343  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3796  YD repeat-containing protein  28.06 
 
 		 422 aa  63.5  0.00000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.982597  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4158  YD repeat-containing protein  25.42 
 
 		 1198 aa  63.5  0.00000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.529985 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1938  YD repeat protein  24.47 
 
 		 678 aa  63.5  0.00000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0507  FG-GAP/YD repeat-containing protein  22.67 
 
 		 2032 aa  63.2  0.00000006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.584165  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_32830  hypothetical protein  22.95 
 
 		 889 aa  63.2  0.00000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000050197  hitchhiker  0.0000345173 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03331  rhsB element core protein RshB  25.08 
 
 		 1411 aa  62.8  0.00000008  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0233  YD repeat protein  25.08 
 
 		 1411 aa  62.8  0.00000008  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03284  hypothetical protein  25.08 
 
 		 1411 aa  62.8  0.00000008  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1472  YD repeat-containing protein  26.29 
 
 		 1600 aa  62.8  0.00000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.059879  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3788  YD repeat-containing protein  29.27 
 
 		 1554 aa  62.8  0.00000009  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0253716  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20520  hypothetical protein  22.84 
 
 		 903 aa  62.8  0.00000009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000061545  normal  0.488224 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0115  YD repeat protein  25.08 
 
 		 1377 aa  62.4  0.0000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0548  RhsC protein  22.79 
 
 		 1308 aa  62.4  0.0000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2443  YD repeat-containing protein  22.91 
 
 		 927 aa  62  0.0000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4010  protein rhsA precursor  22.79 
 
 		 1388 aa  62.4  0.0000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3660  YD repeat-containing protein  25.86 
 
 		 2007 aa  62.4  0.0000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS05482  putative RHS-related transmembrane protein  26.09 
 
 		 1517 aa  61.6  0.0000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.489685  normal  0.876645 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4965  Rhs family protein  22.67 
 
 		 1409 aa  61.6  0.0000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.832182  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5395  RHS Repeat family protein  22.67 
 
 		 1394 aa  61.2  0.0000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.037802  normal  0.495388 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3519  YD repeat protein  24.94 
 
 		 1508 aa  61.6  0.0000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0534715  normal  0.146276 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>