18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VIBHAR_07078 on replicon NC_009784
Organism: Vibrio harveyi ATCC BAA-1116



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009784  VIBHAR_07078  hypothetical protein  100 
 
 		 103 aa  201  4e-51  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002889  Rhs family protein  49.45 
 
 		 2416 aa  93.6  8e-19  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02048  hypothetical protein  40 
 
 		 583 aa  59.3  0.00000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0198  YD repeat-containing protein  44 
 
 		 3333 aa  58.5  0.00000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00448474 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2031  YD repeat-containing protein  40 
 
 		 2402 aa  58.2  0.00000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.063176 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0197  Rhs family protein-like protein  32.18 
 
 		 2413 aa  56.6  0.0000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1124  YD repeat-containing protein  38.27 
 
 		 2401 aa  56.6  0.0000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1180  YD repeat-containing protein  38.27 
 
 		 2437 aa  56.6  0.0000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.265366 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3898  YD repeat-containing protein  38.27 
 
 		 2283 aa  56.6  0.0000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0053  YD repeat protein  47.83 
 
 		 2075 aa  56.2  0.0000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.192291  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3249  Rhs family protein-like  38.55 
 
 		 2513 aa  54.7  0.0000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.139311 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0160  YD repeat protein  40.26 
 
 		 2165 aa  53.1  0.000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3020  hypothetical protein  34.94 
 
 		 2762 aa  52  0.000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.664598  normal  0.0507807 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1558  YD repeat-containing protein  42.86 
 
 		 3320 aa  46.2  0.0001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0137  Integrins alpha chain  35.14 
 
 		 2497 aa  45.4  0.0003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2155  Rhs family protein-like protein  41.18 
 
 		 2698 aa  44.7  0.0005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.471338 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1703  YD repeat-/RHS repeat-containing protein  42.86 
 
 		 2094 aa  42.4  0.002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2165  YD repeat-containing protein  37.31 
 
 		 2448 aa  42  0.003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>