More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VEA_001701 on replicon NC_013456
Organism: Vibrio sp. Ex25



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009457  VC0395_A2132  hypothetical protein  81.62 
 
 		 421 aa  668    Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001701  ABC-type antimicrobial peptide transport system permease component  100 
 
 		 419 aa  853    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00772  hypothetical protein  94.51 
 
 		 419 aa  788    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0426  predicted permease  70.64 
 
 		 419 aa  624  1e-177  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11290  putative permease  58.99 
 
 		 421 aa  501  1e-141  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3865  hypothetical protein  57.31 
 
 		 421 aa  492  9.999999999999999e-139  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4471  hypothetical protein  55.88 
 
 		 421 aa  486  1e-136  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5027  hypothetical protein  56.12 
 
 		 421 aa  483  1e-135  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.685434 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0681  permease, putative  55.64 
 
 		 421 aa  479  1e-134  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1037  putative lipoprotein  58.75 
 
 		 421 aa  480  1e-134  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.967071  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0506  hypothetical protein  56.23 
 
 		 421 aa  474  1e-132  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0682613  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0541  hypothetical protein  55.99 
 
 		 421 aa  473  1e-132  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0551  hypothetical protein  56.23 
 
 		 421 aa  473  1e-132  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.706049 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06630  ABC efflux transporter, permease protein  56.48 
 
 		 421 aa  461  1e-129  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.949424  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0559  hypothetical protein  56.48 
 
 		 421 aa  462  1e-129  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.641992 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1563  protein of unknown function DUF214  48.81 
 
 		 420 aa  426  1e-118  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1971  putative ABC transport system permease protein  46.93 
 
 		 414 aa  407  1.0000000000000001e-112  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0307  hypothetical protein  49.27 
 
 		 410 aa  405  1.0000000000000001e-112  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.682528  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3394  hypothetical protein  47 
 
 		 421 aa  397  1e-109  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.453261  normal  0.276031 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1825  hypothetical protein  46.1 
 
 		 424 aa  392  1e-108  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0704  hypothetical protein  47.97 
 
 		 423 aa  384  1e-105  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.185236  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2157  protein of unknown function DUF214  47.09 
 
 		 417 aa  382  1e-105  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.710607 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1812  putative permease  46.81 
 
 		 412 aa  381  1e-104  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.971161  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3557  hypothetical protein  45.19 
 
 		 425 aa  366  1e-100  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.159864 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3432  hypothetical protein  46.59 
 
 		 425 aa  367  1e-100  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03782  putative permease  39.59 
 
 		 446 aa  339  7e-92  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3493  protein of unknown function DUF214  48.73 
 
 		 431 aa  335  5.999999999999999e-91  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1965  protein of unknown function DUF214  28.82 
 
 		 449 aa  180  4.999999999999999e-44  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.103284  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5020  protein of unknown function DUF214  27.79 
 
 		 418 aa  164  2.0000000000000002e-39  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3618  protein of unknown function DUF214  24.94 
 
 		 414 aa  152  7e-36  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.198201  normal  0.648782 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1147  hypothetical protein  28.72 
 
 		 400 aa  152  8.999999999999999e-36  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1679  hypothetical protein  27.81 
 
 		 400 aa  144  4e-33  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1446  protein of unknown function DUF214  27.07 
 
 		 398 aa  142  9.999999999999999e-33  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.577785  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2811  hypothetical protein  26.95 
 
 		 422 aa  132  1.0000000000000001e-29  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.597769  normal  0.679954 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1199  hypothetical protein  36.07 
 
 		 468 aa  107  3e-22  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0215661  normal  0.10586 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6458  hypothetical protein  25.34 
 
 		 443 aa  100  6e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.450145 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3903  protein of unknown function DUF214  27.78 
 
 		 420 aa  97.4  4e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.171972 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0608  permease component protein  25.18 
 
 		 425 aa  97.1  6e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4227  protein of unknown function DUF214  26.12 
 
 		 435 aa  94.7  2e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0571689 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3159  protein of unknown function DUF214  24.34 
 
 		 399 aa  93.6  6e-18  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3303  hypothetical protein  24.34 
 
 		 399 aa  93.2  7e-18  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.49953 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1292  hypothetical protein  25.49 
 
 		 420 aa  85.1  0.000000000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4111  protein of unknown function DUF214  24.88 
 
 		 449 aa  76.6  0.0000000000008  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.962193  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3917  hypothetical protein  30.1 
 
 		 472 aa  73.9  0.000000000004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.578149  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7003  protein of unknown function DUF214  21.87 
 
 		 423 aa  72  0.00000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00437024  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3108  hypothetical protein  25.96 
 
 		 385 aa  71.6  0.00000000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000183101  normal  0.613969 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0412  hypothetical protein  28.21 
 
 		 394 aa  69.3  0.0000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00341518 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0677  ABC transporter, permease protein, putative  29.29 
 
 		 387 aa  64.7  0.000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.297561  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3466  hypothetical protein  26.1 
 
 		 399 aa  62.4  0.00000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1870  protein of unknown function DUF214  29.44 
 
 		 398 aa  62  0.00000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3762  protein of unknown function DUF214  30.07 
 
 		 452 aa  62  0.00000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1412  hypothetical protein  24.83 
 
 		 400 aa  60.8  0.00000004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1564  hypothetical protein  23.62 
 
 		 397 aa  60.5  0.00000005  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01130  putative ABC transporter  25.49 
 
 		 414 aa  60.8  0.00000005  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.95272  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0790  putative ABC transporter permease protein  26.55 
 
 		 371 aa  60.1  0.00000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.119405 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1640  hypothetical protein  23.73 
 
 		 408 aa  60.1  0.00000008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0166  hypothetical protein  26.28 
 
 		 395 aa  59.7  0.0000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1942  protein of unknown function DUF214  27.97 
 
 		 443 aa  59.3  0.0000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0817  ABC-type transport system, permease component  24.4 
 
 		 400 aa  58.9  0.0000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0198  hypothetical protein  23.93 
 
 		 411 aa  58.9  0.0000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.146044  normal  0.294126 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1541  hypothetical protein  24.7 
 
 		 415 aa  59.3  0.0000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.0147258 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7809  protein of unknown function DUF214  31.36 
 
 		 775 aa  58.9  0.0000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3235  hypothetical protein  27.6 
 
 		 408 aa  59.3  0.0000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1127  hypothetical protein  26.8 
 
 		 409 aa  58.2  0.0000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_5042  ABC transporter, permease protein, putative  24.38 
 
 		 415 aa  57.8  0.0000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_07028  efflux ABC transporter ATP-binding/permease  26.24 
 
 		 422 aa  57.4  0.0000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3734  hypothetical protein  26.18 
 
 		 412 aa  57  0.0000006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.637974  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1371  protein of unknown function DUF214  26.73 
 
 		 386 aa  57  0.0000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.381039  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0266  hypothetical protein  25.11 
 
 		 414 aa  57  0.0000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.17241  normal  0.0445989 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3782  ABC transporter related  33.61 
 
 		 654 aa  56.6  0.0000008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.972642  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4210  efflux ABC transporter ATP-binding protein  25.4 
 
 		 654 aa  56.6  0.0000009  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.875938  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2006  hypothetical protein  25.28 
 
 		 395 aa  55.8  0.000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.151013  normal  0.929725 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2043  hypothetical protein  23.8 
 
 		 403 aa  55.8  0.000001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4455  protein of unknown function DUF214  31.65 
 
 		 395 aa  56.2  0.000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0049  hypothetical protein  23.05 
 
 		 397 aa  56.2  0.000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4848  hypothetical protein  29.92 
 
 		 413 aa  55.8  0.000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0956312  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6004  hypothetical protein  23.61 
 
 		 405 aa  55.8  0.000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1604  hypothetical protein  25.52 
 
 		 443 aa  56.2  0.000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1856  hypothetical protein  22.22 
 
 		 657 aa  55.1  0.000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.804501  normal  0.550352 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5639  hypothetical protein  23.61 
 
 		 387 aa  55.5  0.000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1376  ABC transporter related  21.36 
 
 		 643 aa  55.1  0.000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.726226  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0371  hypothetical protein  27.56 
 
 		 414 aa  55.5  0.000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2932  hypothetical protein  25.18 
 
 		 390 aa  54.7  0.000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.0000965565  normal  0.65467 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2159  macrolide ABC efflux protein  23.77 
 
 		 656 aa  54.3  0.000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.103755  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0392  protein of unknown function DUF214  26.8 
 
 		 409 aa  54.3  0.000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.056313 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3036  hypothetical protein  27.49 
 
 		 409 aa  54.3  0.000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000134447  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2148  hypothetical protein  22.51 
 
 		 408 aa  54.3  0.000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0327906 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0086  hypothetical protein  28.82 
 
 		 438 aa  53.1  0.000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0277  protein of unknown function DUF214  21.77 
 
 		 431 aa  53.1  0.000009  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1087  hypothetical protein  26.61 
 
 		 414 aa  53.1  0.000009  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2187  ABC transporter, permease protein  29.82 
 
 		 839 aa  52.4  0.00001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.424379  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0390  protein of unknown function DUF214  21.1 
 
 		 406 aa  52.4  0.00001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3916  hypothetical protein  23.75 
 
 		 402 aa  52.8  0.00001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3474  protein of unknown function DUF214  27.76 
 
 		 399 aa  52.8  0.00001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000978  ABC-type transport system involved in lipoprotein release permease component  24.91 
 
 		 422 aa  52.8  0.00001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1668  hypothetical protein  21.47 
 
 		 414 aa  52.8  0.00001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2497  hypothetical protein  27.48 
 
 		 422 aa  52.4  0.00001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.536779  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4309  protein of unknown function DUF214  22.57 
 
 		 420 aa  52.8  0.00001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.965223  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4156  ABC transporter, inner membrane subunit  22.1 
 
 		 420 aa  52  0.00002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3283  ABC transporter related  32.77 
 
 		 666 aa  52  0.00002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.477638  normal  0.90811 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>