More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VC0395_A0158 on replicon NC_009457
Organism: Vibrio cholerae O395



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002978  WD1320  multidrug resistance protein D  37.63 
 
 		 1024 aa  790    Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4620  AcrB/AcrD/AcrF family protein  57.99 
 
 		 1052 aa  1222    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0469  acriflavin resistance protein  37.76 
 
 		 1038 aa  777    Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2742  acriflavin resistance protein  48.8 
 
 		 1041 aa  942    Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1679  acriflavin resistance protein  50.44 
 
 		 1048 aa  993    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.906292  normal  0.699127 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0869  acriflavin resistance protein  58.13 
 
 		 1038 aa  1162    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0434774  normal  1 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0192  AcrB/AcrD/AcrF family transporter  35.12 
 
 		 1025 aa  654    Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.958952  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0561  AcrB/AcrD/AcrF family protein  37.22 
 
 		 1032 aa  774    Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.38553  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002594  putative multidrug resistance protein  81.09 
 
 		 1034 aa  1669    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.018875  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2569  integral membrane protein, putative multidrug resistance protein  75.36 
 
 		 1042 aa  1632    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0974879  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2050  acriflavin resistance protein  48.4 
 
 		 1069 aa  1012    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.440026  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0619  acriflavin resistance protein  58.56 
 
 		 1045 aa  1198    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3332  acriflavin resistance protein  42.64 
 
 		 1057 aa  846    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0158  putative multidrug resistance protein  100 
 
 		 1039 aa  2093    Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0453777  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0170  acriflavin resistance protein  43.86 
 
 		 1068 aa  901    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.644504 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03414  hypothetical protein  82.07 
 
 		 1044 aa  1692    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2625  acriflavin resistance protein  42.86 
 
 		 1067 aa  795    Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2510  acriflavin resistance protein  44.72 
 
 		 1033 aa  851    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.00600549  normal  0.198744 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1215  acriflavin resistance protein  34.58 
 
 		 1092 aa  559  1e-158  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.735499  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2196  acriflavin resistance protein  36.15 
 
 		 1335 aa  537  1e-151  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1782  acriflavin resistance protein  34.2 
 
 		 1043 aa  538  1e-151  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.849886  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3431  acriflavin resistance protein  29.96 
 
 		 1143 aa  456  1.0000000000000001e-126  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.204539  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2513  cation/multidrug efflux pump  28.67 
 
 		 1134 aa  449  1e-125  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.422561  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01960  multidrug resistance protein, putative  31.35 
 
 		 1165 aa  446  1e-123  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1162  acriflavin resistance protein  44.31 
 
 		 1189 aa  442  9.999999999999999e-123  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0987  acriflavin resistance protein  44.24 
 
 		 1267 aa  432  1e-119  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.869665  normal  0.972102 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1477  acriflavin resistance protein  29.02 
 
 		 1124 aa  426  1e-117  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.415294  normal  0.236417 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5504  acriflavin resistance protein  28.55 
 
 		 1146 aa  424  1e-117  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.39476  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1907  acriflavin resistance protein  25.9 
 
 		 1038 aa  357  8.999999999999999e-97  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05050  acriflavin resistance protein  28.28 
 
 		 1011 aa  354  4e-96  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00000211109  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1579  acriflavin resistance protein  26.19 
 
 		 1046 aa  349  2e-94  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2369  acriflavin resistance protein  27.28 
 
 		 1050 aa  348  3e-94  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000403174 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1939  acriflavin resistance protein  26.7 
 
 		 1044 aa  345  4e-93  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3296  acriflavin resistance protein  26.48 
 
 		 1006 aa  338  2.9999999999999997e-91  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0229109  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2099  acriflavin resistance protein  27.3 
 
 		 1043 aa  333  1e-89  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0879  acriflavin resistance protein  39.55 
 
 		 1290 aa  326  1e-87  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1002  acriflavin resistance protein  26.2 
 
 		 1028 aa  324  6e-87  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.507874  normal  0.0489892 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1942  acriflavin resistance protein  25.95 
 
 		 1040 aa  322  3e-86  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.211904  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2953  acriflavin resistance protein  26.67 
 
 		 1038 aa  321  3.9999999999999996e-86  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.133437  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4520  acriflavin resistance protein  25.76 
 
 		 1043 aa  319  1e-85  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3981  acriflavin resistance protein  25.62 
 
 		 1014 aa  319  2e-85  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6213  acriflavin resistance protein  27.53 
 
 		 1055 aa  318  2e-85  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.717195  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0763  acriflavin resistance protein  25.72 
 
 		 1039 aa  319  2e-85  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2950  acriflavin resistance protein  26.2 
 
 		 1044 aa  317  6e-85  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_5032  AcrB/AcrD/AcrF family protein  25.64 
 
 		 1024 aa  314  6.999999999999999e-84  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1025  acriflavin resistance protein  27.95 
 
 		 1050 aa  313  1e-83  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0165  acriflavin resistance protein  25.29 
 
 		 1032 aa  309  1.0000000000000001e-82  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1925  acriflavin resistance protein  25.07 
 
 		 1020 aa  306  1.0000000000000001e-81  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.553474  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0965  AcrB/AcrD/AcrF family protein  26.96 
 
 		 1024 aa  305  2.0000000000000002e-81  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00708155  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2480  acriflavin resistance protein  26.4 
 
 		 1028 aa  303  1e-80  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3179  acriflavin resistance protein  25.48 
 
 		 1023 aa  303  1e-80  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.000000434633  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0960  acriflavin resistance protein  26.27 
 
 		 1047 aa  302  2e-80  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0752  acriflavin resistance protein  25.07 
 
 		 1071 aa  302  3e-80  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0540  AcrB/AcrD/AcrF family protein  24.81 
 
 		 1049 aa  301  5e-80  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0745  AcrB/AcrD/AcrF family protein  26.81 
 
 		 1027 aa  301  5e-80  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01735  RND family efflux transporter  26.34 
 
 		 1035 aa  301  6e-80  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2783  acriflavin resistance protein  27.34 
 
 		 1045 aa  300  9e-80  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0544081  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0308  acriflavin resistance protein  27.7 
 
 		 1050 aa  300  1e-79  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.514616  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2392  acriflavin resistance protein  26.21 
 
 		 1028 aa  299  2e-79  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.430925  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4004  acriflavin resistance protein  25.48 
 
 		 1470 aa  299  2e-79  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1419  AcrB/AcrD/AcrF family protein  26.34 
 
 		 1019 aa  299  2e-79  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.446935 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0176  acriflavin resistance protein  25.24 
 
 		 1034 aa  298  3e-79  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3931  acriflavin resistance protein  25.59 
 
 		 1026 aa  298  5e-79  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.415531  normal  0.145125 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2518  acriflavin resistance protein  25.09 
 
 		 1041 aa  298  5e-79  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00118511  normal  0.514323 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1937  acriflavin resistance protein  24.98 
 
 		 1034 aa  297  8e-79  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.256217  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2235  acriflavin resistance protein  26.52 
 
 		 1022 aa  296  1e-78  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1210  acriflavin resistance protein  27.74 
 
 		 1074 aa  296  1e-78  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.154202  normal  0.271752 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1183  acriflavin resistance protein  27.74 
 
 		 1038 aa  295  3e-78  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.317348  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2688  acriflavin resistance protein  27.41 
 
 		 1044 aa  295  3e-78  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.405984  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1738  acriflavin resistance protein  27.9 
 
 		 1038 aa  295  4e-78  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0669  AcrB/AcrD/AcrF family cation efflux protein  26.14 
 
 		 1052 aa  294  5e-78  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2349  acriflavin resistance protein  24.38 
 
 		 1070 aa  294  7e-78  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.253914  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2294  acriflavin resistance protein  27.02 
 
 		 1012 aa  294  7e-78  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2664  outer membrane efflux protein  25.19 
 
 		 1496 aa  293  1e-77  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3926  AcrB/AcrD/AcrF family protein  26.45 
 
 		 1029 aa  293  1e-77  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.831264  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0559  acriflavin resistance protein  25.53 
 
 		 1062 aa  293  1e-77  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0108  acriflavin resistance protein  25.47 
 
 		 1033 aa  293  1e-77  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.153145  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2131  AcrB/AcrD/AcrF family protein  25.6 
 
 		 1024 aa  291  3e-77  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1648  acriflavin resistance protein  27.07 
 
 		 1082 aa  291  3e-77  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0507  acriflavin resistance protein  26.73 
 
 		 1020 aa  291  4e-77  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.433089  normal  0.988199 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2337  acriflavin resistance protein  25.45 
 
 		 1031 aa  291  5.0000000000000004e-77  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0120926  hitchhiker  0.000298899 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2409  acriflavin resistance protein  25.38 
 
 		 1031 aa  291  5.0000000000000004e-77  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.677885  normal  0.0307662 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1037  acriflavin resistance protein  26.14 
 
 		 1036 aa  291  6e-77  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0971  NolG efflux transporter  25.38 
 
 		 1036 aa  290  7e-77  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2427  acriflavin resistance protein  26.81 
 
 		 1019 aa  290  9e-77  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000179675 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1659  acriflavin resistance protein  25.35 
 
 		 1031 aa  290  1e-76  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.178159  normal  0.998047 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2378  acriflavin resistance protein  28.24 
 
 		 1038 aa  289  2e-76  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1882  AcrB/AcrD/AcrF family protein  25.19 
 
 		 1031 aa  288  4e-76  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1383  acriflavin resistance protein  25.29 
 
 		 1014 aa  288  4e-76  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  unclonable  0.00000000121579  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2180  acriflavin resistance protein  24.62 
 
 		 1030 aa  288  4e-76  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.000146343  normal  0.137669 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0238  acriflavin resistance protein  26.42 
 
 		 1067 aa  288  5e-76  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1983  acriflavin resistance protein  24.77 
 
 		 1034 aa  287  5.999999999999999e-76  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.000463224  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0815  acriflavin resistance protein  25.38 
 
 		 1036 aa  287  7e-76  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1420  AcrB/AcrD/AcrF family protein  27.31 
 
 		 1081 aa  286  1.0000000000000001e-75  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2563  AcrB/AcrD/AcrF family protein  25.83 
 
 		 1019 aa  286  2.0000000000000002e-75  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0304  acriflavin resistance protein  26.63 
 
 		 1028 aa  285  2.0000000000000002e-75  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.99394  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1613  acriflavin resistance protein  24.88 
 
 		 1041 aa  285  2.0000000000000002e-75  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2664  acriflavin resistance protein  24.95 
 
 		 1031 aa  286  2.0000000000000002e-75  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.192826  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1797  acriflavin resistance protein  24.86 
 
 		 1031 aa  286  2.0000000000000002e-75  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0223723  hitchhiker  0.000000350495 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2549  acriflavin resistance protein  24.78 
 
 		 1031 aa  285  3.0000000000000004e-75  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0932297  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>