More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbd_2751 on replicon NC_007404
Organism: Thiobacillus denitrificans ATCC 25259



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007404  Tbd_2751  transmembrane protein  100 
 
 		 283 aa  557  1e-158  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3302  polysaccharide deacetylase  62.27 
 
 		 272 aa  318  9e-86  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.229858  normal  0.446106 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1373  polysaccharide deacetylase  62.6 
 
 		 267 aa  310  2e-83  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00379023 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2684  polysaccharide deacetylase  58.84 
 
 		 294 aa  293  2e-78  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.569149 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0316  polysaccharide deacetylase  57.66 
 
 		 287 aa  289  3e-77  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0777924  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6095  polysaccharide deacetylase  62.6 
 
 		 297 aa  286  2e-76  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.233371  normal  0.603331 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0304  polysaccharide deacetylase  56.32 
 
 		 287 aa  287  2e-76  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2151  polysaccharide deacetylase  59.21 
 
 		 294 aa  283  2.0000000000000002e-75  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.342073  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2765  polysaccharide deacetylase  59.21 
 
 		 294 aa  283  2.0000000000000002e-75  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.468013  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5979  polysaccharide deacetylase  59.7 
 
 		 285 aa  281  8.000000000000001e-75  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.185285  normal  0.666429 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4179  polysaccharide deacetylase  55.89 
 
 		 266 aa  280  1e-74  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3983  polysaccharide deacetylase  54.92 
 
 		 284 aa  278  8e-74  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2215  putative transmembrane protein  59.93 
 
 		 288 aa  274  1.0000000000000001e-72  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.814206  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0428  hypothetical protein  59.92 
 
 		 287 aa  272  4.0000000000000004e-72  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.249302  normal  0.885456 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4706  polysaccharide deacetylase  55.19 
 
 		 286 aa  266  2.9999999999999995e-70  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0236101 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2817  polysaccharide deacetylase  59.44 
 
 		 300 aa  261  1e-68  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3928  polysaccharide deacetylase  53.17 
 
 		 289 aa  255  6e-67  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.284883  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1323  polysaccharide deacetylase family protein  57.47 
 
 		 300 aa  252  5.000000000000001e-66  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.202061  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2675  polysaccharide deacetylase  57.03 
 
 		 280 aa  244  9.999999999999999e-64  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0615547  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0920  polysaccharide deacetylase family protein  59.32 
 
 		 270 aa  238  5.999999999999999e-62  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0930  polysaccharide deacetylase  47.23 
 
 		 246 aa  200  1.9999999999999998e-50  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0787  polysaccharide deacetylase family protein  47.23 
 
 		 349 aa  201  1.9999999999999998e-50  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.29381  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1557  acetylxylan esterase  39.67 
 
 		 275 aa  149  4e-35  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.956674  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1497  polysaccharide deacetylase  39.26 
 
 		 275 aa  146  3e-34  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.507826  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3369  polysaccharide deacetylase  38.67 
 
 		 259 aa  143  3e-33  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.792887  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02423  acetylxylan esterase  43.2 
 
 		 260 aa  139  3.9999999999999997e-32  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1987  polysaccharide deacetylase  41.83 
 
 		 256 aa  137  2e-31  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2113  GlcNAc deacetylase-related protein carbohydrate esterase family 4 protein  30.67 
 
 		 259 aa  134  1.9999999999999998e-30  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.228742  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2417  polysaccharide deacetylase  46.79 
 
 		 280 aa  122  9.999999999999999e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.108367  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0643  polysaccharide deacetylase  35.35 
 
 		 425 aa  121  1.9999999999999998e-26  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1086  polysaccharide deacetylase  30.36 
 
 		 261 aa  120  3e-26  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03855  polysaccharide deacetylase, putative  32.26 
 
 		 258 aa  118  9.999999999999999e-26  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1541  polysaccharide deacetylase  45.51 
 
 		 280 aa  117  1.9999999999999998e-25  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0577624  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1446  polysaccharide deacetylase  46.79 
 
 		 280 aa  113  3e-24  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.781341  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0991  polysaccharide deacetylase family protein  32.64 
 
 		 244 aa  112  6e-24  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_959  glycosyl transferase  31.22 
 
 		 479 aa  112  7.000000000000001e-24  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1449  polysaccharide deacetylase family sporulation protein PdaB  29.74 
 
 		 251 aa  112  8.000000000000001e-24  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1257  polysaccharide deacetylase  40.11 
 
 		 235 aa  112  1.0000000000000001e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3726  putative polysaccharide deacetylase  31.86 
 
 		 220 aa  111  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.577927  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1141  glycosyl transferase/polysaccharide deacetylase family protein  29.31 
 
 		 481 aa  110  3e-23  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.226715  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3410  polysaccharide deacetylase  31.86 
 
 		 213 aa  110  3e-23  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.76502  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3371  polysaccharide deacetylase  31.86 
 
 		 213 aa  110  3e-23  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3679  polysaccharide deacetylase  31.86 
 
 		 213 aa  110  3e-23  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3304  sporulation polysaccharide deacetylase PdaB  30.77 
 
 		 241 aa  110  4.0000000000000004e-23  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3321  polysaccharide deacetylase  31.86 
 
 		 213 aa  109  5e-23  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3629  putative polysaccharide deacetylase  31.86 
 
 		 241 aa  109  5e-23  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.197208 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0970  polysaccharide deacetylase  29.36 
 
 		 479 aa  109  6e-23  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.064586  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0647  polysaccharide deacetylase  38.27 
 
 		 204 aa  109  6e-23  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3452  chitin deacetylase  31.75 
 
 		 373 aa  108  8.000000000000001e-23  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.203782  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1591  putative polysaccharide deacetylase  31.37 
 
 		 241 aa  107  2e-22  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0184011 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1868  polysaccharide deacetylase  37.25 
 
 		 258 aa  106  5e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1295  polysaccharide deacetylase  30.1 
 
 		 305 aa  105  6e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0475838  normal  0.758896 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2798  polysaccharide deacetylase  27.72 
 
 		 321 aa  105  6e-22  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.133593 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3637  polysaccharide deacetylase, putative  30.39 
 
 		 244 aa  104  1e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3642  putative polysaccharide deacetylase  30.39 
 
 		 217 aa  105  1e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2266  sporulation polysaccharide deacetylase PdaB  33.7 
 
 		 241 aa  103  2e-21  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.33444  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0771  polysaccharide deacetylase  30.81 
 
 		 299 aa  104  2e-21  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1762  polysaccharide deacetylase  30.99 
 
 		 243 aa  103  3e-21  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6669  polysaccharide deacetylase  35.6 
 
 		 240 aa  103  4e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.422259  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4717  polysaccharide deacetylase  36.48 
 
 		 285 aa  102  7e-21  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5206  polysaccharide deacetylase  38.34 
 
 		 259 aa  102  8e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0262209  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0797  polysaccharide deacetylase  29.72 
 
 		 301 aa  101  1e-20  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0108437  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3117  polysaccharide deacetylase  27.69 
 
 		 387 aa  101  1e-20  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0342085  normal  0.78437 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1912  polysaccharide deacetylase  34.86 
 
 		 232 aa  101  1e-20  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3023  polysaccharide deacetylase  31.66 
 
 		 1120 aa  100  3e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0650  polysaccharide deacetylase  33.03 
 
 		 233 aa  100  3e-20  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1031  polysaccharide deacetylase  36.69 
 
 		 430 aa  99  7e-20  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.90284  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2673  polysaccharide deacetylase  32.18 
 
 		 413 aa  98.6  1e-19  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0653115  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0824  polysaccharide deacetylase family protein  27.6 
 
 		 417 aa  97.8  2e-19  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00745261  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0633  polysaccharide deacetylase  28.87 
 
 		 247 aa  97.1  3e-19  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.256712 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1800  polysaccharide deacetylase  29.41 
 
 		 372 aa  96.7  4e-19  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.358756  normal  0.150786 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1917  polysaccharide deacetylase  33.33 
 
 		 250 aa  95.9  6e-19  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0652  polysaccharide deacetylase  27.92 
 
 		 302 aa  95.9  7e-19  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.249248  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0200  polysaccharide deacetylase  28.96 
 
 		 240 aa  94.4  2e-18  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2789  xylanase/chitin deacetylase  34.55 
 
 		 244 aa  94.7  2e-18  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3879  polysaccharide deacetylase  38.32 
 
 		 289 aa  94.7  2e-18  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0662  xylanase/chitin deacetylase-like protein  37.13 
 
 		 468 aa  94  3e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2787  polysaccharide deacetylase  37.65 
 
 		 404 aa  93.6  3e-18  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06440  polysaccharide deacetylase  28.8 
 
 		 405 aa  93.6  4e-18  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.467697  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6265  polysaccharide deacetylase  31.32 
 
 		 229 aa  93.2  5e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.249412 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1081  polysaccharide deacetylase  30.5 
 
 		 242 aa  93.2  5e-18  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0739  polysaccharide deacetylase  30.61 
 
 		 324 aa  92.8  6e-18  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.000000774609  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1224  polysaccharide deacetylase  32.46 
 
 		 392 aa  92.4  8e-18  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.533397  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01375  polysaccharide deacetylase  31.53 
 
 		 218 aa  91.7  1e-17  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2833  polysaccharide deacetylase  34.22 
 
 		 227 aa  91.7  1e-17  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.163356  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2712  polysaccharide deacetylase  29.85 
 
 		 204 aa  92  1e-17  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1550  polysaccharide deacetylase  35.71 
 
 		 244 aa  92  1e-17  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0260353  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1069  polysaccharide deacetylase  30.49 
 
 		 247 aa  92  1e-17  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.364826  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6465  polysaccharide deacetylase  30.3 
 
 		 219 aa  91.3  2e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1462  polysaccharide deacetylase  29.82 
 
 		 255 aa  90.9  2e-17  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4797  polysaccharide deacetylase  26.64 
 
 		 277 aa  90.5  2e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2057  polysaccharide deacetylase  35.03 
 
 		 252 aa  90.5  2e-17  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.129437  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2064  polysaccharide deacetylase  25.24 
 
 		 368 aa  90.5  3e-17  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  unclonable  0.0000000000028992  hitchhiker  0.000502846 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4749  polysaccharide deacetylase  30.29 
 
 		 240 aa  90.5  3e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0757693 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0628  polysaccharide deacetylase  33.66 
 
 		 268 aa  90.1  3e-17  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0237416 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3051  polysaccharide deacetylase  24.9 
 
 		 264 aa  90.1  4e-17  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4627  polysaccharide deacetylase  30.82 
 
 		 283 aa  89.4  6e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0474117  hitchhiker  0.00736578 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1037  polysaccharide deacetylase  35.33 
 
 		 269 aa  89.4  6e-17  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.0742911 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1829  polysaccharide deacetylase  26.32 
 
 		 300 aa  89.4  6e-17  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000000043926  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2404  polysaccharide deacetylase  26.04 
 
 		 221 aa  89  7e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.256857  normal  0.336364 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>