176 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swoo_1439 on replicon NC_010506
Organism: Shewanella woodyi ATCC 51908



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010506  Swoo_1439  serine/threonine protein kinase  100 
 
 		 475 aa  973    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2938  serine/threonine protein kinase  57.85 
 
 		 459 aa  525  1e-148  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0539  serine/threonine protein kinase  58.1 
 
 		 447 aa  519  1e-146  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.652684 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4016  hypothetical protein  57.45 
 
 		 447 aa  515  1.0000000000000001e-145  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3413  serine/threonine protein kinase  57.58 
 
 		 447 aa  515  1.0000000000000001e-145  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.287341 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3583  serine/threonine protein kinase  57.2 
 
 		 453 aa  512  1e-144  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0653  protein kinase  55.7 
 
 		 451 aa  500  1e-140  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0649  serine/threonine protein kinase  55.7 
 
 		 451 aa  498  1e-139  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3256  protein kinase  54.78 
 
 		 446 aa  498  1e-139  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0626  protein kinase  55.27 
 
 		 451 aa  497  1e-139  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3736  protein kinase  55.05 
 
 		 451 aa  493  9.999999999999999e-139  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1090  serine/threonine protein kinase  54.24 
 
 		 441 aa  481  1e-135  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1652  protein kinase  49.09 
 
 		 490 aa  439  9.999999999999999e-123  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0364974  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1369  protein kinase  51.07 
 
 		 413 aa  415  9.999999999999999e-116  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00197629 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003060  serine/threonine protein kinase  50.8 
 
 		 412 aa  412  1e-114  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.673161  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0149  leucine-rich repeat-containing protein  49.65 
 
 		 436 aa  408  1.0000000000000001e-112  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0557  Serine/threonine protein kinase  48.92 
 
 		 445 aa  407  1.0000000000000001e-112  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0251  hypothetical protein  50.12 
 
 		 396 aa  407  1.0000000000000001e-112  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  decreased coverage  0.00111835  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4131  serine/threonine protein kinase  47.3 
 
 		 445 aa  402  1e-111  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1973  serine/threonine protein kinase  49.88 
 
 		 421 aa  400  9.999999999999999e-111  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02794  hypothetical protein  51.33 
 
 		 414 aa  401  9.999999999999999e-111  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2351  serine/threonine protein kinase  50.24 
 
 		 414 aa  396  1e-109  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00102293 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3380  serine/threonine protein kinase  45.92 
 
 		 437 aa  390  1e-107  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.367519  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4987  serine/threonine protein kinase  45.92 
 
 		 437 aa  390  1e-107  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.815598  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3638  serine/threonine protein kinase  46.32 
 
 		 460 aa  389  1e-107  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1854  serine/threonine protein kinase  45.92 
 
 		 440 aa  388  1e-106  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.13717 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2142  serine/threonine protein kinase  44.97 
 
 		 439 aa  387  1e-106  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.733899  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5300  serine/threonine protein kinase  45.92 
 
 		 437 aa  383  1e-105  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0570551 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3676  Serine/threonine protein kinase  46 
 
 		 437 aa  384  1e-105  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0691  serine/threonine protein kinase  45.24 
 
 		 441 aa  385  1e-105  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4929  serine/threonine protein kinase  45.24 
 
 		 471 aa  383  1e-105  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_32300  putative kinase  45.7 
 
 		 499 aa  385  1e-105  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4737  serine/threonine protein kinase  46.19 
 
 		 436 aa  384  1e-105  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4410  serine/threonine protein kinase  44.85 
 
 		 469 aa  377  1e-103  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.071312 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23420  protein kinase  45.73 
 
 		 438 aa  377  1e-103  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.394978  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2737  leucine-rich repeat-containing protein kinase  45.45 
 
 		 440 aa  375  1e-102  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3027  leucine-rich repeat-containing protein kinase  44.76 
 
 		 434 aa  364  2e-99  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.176048 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3161  protein kinase, putative  44.09 
 
 		 446 aa  355  1e-96  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0155369  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0085  serine/threonine protein kinase  41.7 
 
 		 464 aa  353  4e-96  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00708032 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2471  serine/threonine protein kinase  45.08 
 
 		 450 aa  347  3e-94  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  hitchhiker  0.00766304  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3274  serine/threonine protein kinase  42.67 
 
 		 444 aa  335  1e-90  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.470678  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3080  serine/threonine protein kinase  42.15 
 
 		 473 aa  330  4e-89  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.102721  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3397  serine/threonine protein kinase  42.15 
 
 		 444 aa  324  2e-87  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0650479  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0814  serine/threonine protein kinase  39.35 
 
 		 432 aa  321  9.999999999999999e-87  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.825478  normal  0.301688 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4670  serine/threonine protein kinase  42.62 
 
 		 439 aa  315  9.999999999999999e-85  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2798  serine/threonine protein kinase  40.86 
 
 		 437 aa  304  2.0000000000000002e-81  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.424689  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_28825  predicted protein  35.85 
 
 		 484 aa  238  1e-61  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.664736  n/a   
 
 
-
 
NC_011683  PHATRDRAFT_47992  predicted protein  34.26 
 
 		 432 aa  208  1e-52  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  hitchhiker  0.00155367  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4612  hypothetical protein  38.1 
 
 		 416 aa  101  3e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.19236 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2057  leucine-rich repeat protein  37.62 
 
 		 482 aa  99  2e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.723392  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3798  small GTP-binding protein  40.24 
 
 		 1041 aa  97.1  6e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3344  hypothetical protein  40.45 
 
 		 892 aa  94.4  4e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.952611  hitchhiker  0.00915052 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2066  leucine-rich repeat protein  38.92 
 
 		 508 aa  91.3  3e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2306  leucine-rich repeat-containing protein  37.08 
 
 		 863 aa  90.9  5e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.98495 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3999  small GTP-binding protein  34.97 
 
 		 937 aa  89.4  1e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4041  small GTP-binding protein  34.97 
 
 		 937 aa  88.2  3e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.668162  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4909  Miro domain protein  35.59 
 
 		 1015 aa  84.7  0.000000000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.903502 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7693  Phosphoprotein phosphatase  31.22 
 
 		 1263 aa  83.6  0.000000000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1493  small GTP-binding protein domain-containing protein  33.52 
 
 		 1107 aa  81.3  0.00000000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0991  hypothetical protein  34.83 
 
 		 354 aa  80.5  0.00000000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3253  small GTP-binding protein  37.01 
 
 		 867 aa  79  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09188  putative outermembrane protein  36.41 
 
 		 307 aa  77.4  0.0000000000005  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.885938  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2359  leucine-rich repeat-containing protein  37.86 
 
 		 296 aa  76.3  0.000000000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.260952  normal  0.0814823 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0938  hypothetical protein  37.29 
 
 		 713 aa  74.7  0.000000000004  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.102754  unclonable  0.000027622 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0461  small GTP-binding protein  34.71 
 
 		 761 aa  72.8  0.00000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.981237  normal  0.556808 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2449  hypothetical protein  34.25 
 
 		 886 aa  71.6  0.00000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0222  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5076  leucine-rich repeat-containing protein typical subtype  29.63 
 
 		 472 aa  70.5  0.00000000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.597323 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2074  leucine-rich repeat-containing protein typical subtype  30.52 
 
 		 305 aa  68.2  0.0000000003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009373  OSTLU_5174  predicted protein  34.78 
 
 		 242 aa  67.8  0.0000000004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1833  leucine-rich repeat-containing protein typical subtype  30.67 
 
 		 476 aa  67.4  0.0000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.113448  normal  0.602761 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0937  hypothetical protein  26.75 
 
 		 757 aa  65.1  0.000000003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.107315  hitchhiker  0.00034151 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0319  hypothetical protein  34.59 
 
 		 448 aa  65.1  0.000000003  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_67440  adenylate cyclase (ATP pyrophosphate-lyase) (Adenylyl cyclase)  25.87 
 
 		 1749 aa  64.3  0.000000005  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0875  POPC protein  29.76 
 
 		 1024 aa  62  0.00000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.287457  normal  0.0107238 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3035  leucine-rich protein  36.29 
 
 		 291 aa  61.2  0.00000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0118169  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1245  hypothetical protein  29.53 
 
 		 467 aa  60.1  0.00000009  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011694  PHATRDRAFT_2739  predicted protein  32.1 
 
 		 230 aa  60.1  0.00000009  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04435  cell morphogenesis protein Sog2, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G07260)  32.5 
 
 		 980 aa  59.3  0.0000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS05354  leucine-rich-repeat protein  30.81 
 
 		 648 aa  59.7  0.0000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.153202  normal  0.61314 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2056  hypothetical protein  30.95 
 
 		 559 aa  59.3  0.0000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.809448  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2369  leucine-rich repeat-containing protein  29.22 
 
 		 1395 aa  58.5  0.0000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3326  leucine-rich repeat-containing protein  34.38 
 
 		 1395 aa  58.5  0.0000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.902358 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4693  leucine-rich repeat-containing protein  34.07 
 
 		 528 aa  58.2  0.0000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3560  Protein of unknown function DUF1963  33.61 
 
 		 791 aa  56.6  0.0000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00826775  normal  0.0597462 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07005  conserved leucine-rich repeat protein (AFU_orthologue; AFUA_4G04440)  31.16 
 
 		 972 aa  56.6  0.000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006684  CNB04070  conserved hypothetical protein  39.56 
 
 		 1281 aa  56.2  0.000001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.217491  n/a   
 
 
-
 
NC_006692  CNG03670  adenylate cyclase, putative  26.75 
 
 		 1344 aa  56.2  0.000001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.338751  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1195  putative leucine rich repeat protein  25.79 
 
 		 204 aa  56.2  0.000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2592  invasion plasmid antigen  32.7 
 
 		 603 aa  55.1  0.000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1257  leucine-rich repeat protein  36.96 
 
 		 776 aa  55.1  0.000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03420  HpaF leucine rich hrp associated protein  32.74 
 
 		 478 aa  55.1  0.000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4099  leucine-rich repeat-containing protein  29.86 
 
 		 1611 aa  54.3  0.000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_62257  predicted protein  38.89 
 
 		 854 aa  53.9  0.000007  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.374999  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6144  leucine-rich repeat protein  25.89 
 
 		 528 aa  53.5  0.000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.268952  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2065  leucine-rich repeat protein  39.47 
 
 		 108 aa  53.1  0.000009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2774  leucine rich repeat domain-containing protein  31.43 
 
 		 375 aa  53.5  0.000009  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00259731 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03602  Glucose-repressible alcohol dehydrogenase transcriptional effector (EC 3.1.13.4)(Carbon catabolite repressor protein 4)(Cytoplasmic deadenylase) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q5B778]  39.22 
 
 		 675 aa  53.1  0.00001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05531  tubulin-specific chaperone, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G11870)  30.69 
 
 		 606 aa  52.8  0.00001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0949  leucine-rich repeat protein  29.59 
 
 		 755 aa  53.1  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.697592  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0744  leucine-rich repeat-containing protein  32.47 
 
 		 622 aa  53.1  0.00001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.559917  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>