More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swol_1550 on replicon NC_008346
Organism: Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010320  Teth514_1830  helicase domain-containing protein  40.67 
 
 		 1053 aa  736    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1109  helicase/SNF2 domain-containing protein  46.01 
 
 		 1075 aa  963    Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2177  helicase domain protein  51.34 
 
 		 1081 aa  1140    Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0362  helicase domain protein  53.83 
 
 		 1083 aa  1230    Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00230549 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0152  helicase domain-containing protein  47.31 
 
 		 1075 aa  993    Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0594133  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2911  helicase domain protein  46.7 
 
 		 1112 aa  975    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0768227  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1396  helicase domain protein  49.21 
 
 		 1065 aa  1026    Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4597  helicase domain protein  47.74 
 
 		 1069 aa  996    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1748  DEAD/DEAH box helicase-like  51.43 
 
 		 1067 aa  1153    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4207  helicase domain-containing protein  47.04 
 
 		 1077 aa  985    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.124797  normal  0.095515 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0580  helicase-like  48.84 
 
 		 1071 aa  1008    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.254655  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5225  helicase domain protein  45.15 
 
 		 1074 aa  919    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.786499  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0521  helicase-like protein  53.49 
 
 		 1089 aa  1177    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.036679  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1126  helicase domain protein  46.35 
 
 		 1064 aa  959    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0541  helicase-like  45.96 
 
 		 1090 aa  971    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.137746  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1550  DEAD/DEAH box helicase-like protein  100 
 
 		 1085 aa  2228    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2252  helicase domain-containing protein  45.23 
 
 		 1075 aa  931    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1519  helicase domain protein  44.81 
 
 		 1078 aa  913    Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  decreased coverage  0.00298818  hitchhiker  0.00000196773 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0783  helicase domain-containing protein  46.93 
 
 		 1077 aa  1004    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.105121 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0240  helicase domain-containing protein  47.61 
 
 		 1072 aa  1019    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0799  helicase domain protein  42.84 
 
 		 1077 aa  895    Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.356327  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2490  helicase DEAD/DEAH box  44.45 
 
 		 1087 aa  931    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0540271  normal  0.0731117 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1146  helicase domain protein  45.33 
 
 		 1082 aa  958    Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0937503 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0157  helicase domain-containing protein  46.41 
 
 		 1078 aa  1005    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000046471 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1203  hypothetical protein  38.18 
 
 		 1065 aa  709    Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.666944  normal  0.0115575 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3488  type III restriction enzyme, res subunit  43.27 
 
 		 696 aa  544  1e-153  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.325873  normal  0.223098 
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3437  helicase domain protein  27.49 
 
 		 1124 aa  285  4.0000000000000003e-75  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2539  helicase domain-containing protein  28.72 
 
 		 1131 aa  273  1e-71  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0445  helicase domain-containing protein  26.63 
 
 		 1016 aa  258  6e-67  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.26899 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0298  helicase domain-containing protein  30 
 
 		 1128 aa  247  9e-64  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.189592  normal  0.0770021 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0034  helicase domain protein  25.88 
 
 		 1153 aa  243  2e-62  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6770  helicase domain-containing protein  26.94 
 
 		 1143 aa  228  5.0000000000000005e-58  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.652865  normal  1 
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4501  helicase domain protein  26.71 
 
 		 1086 aa  223  1.9999999999999999e-56  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.304192 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2251  helicase domain-containing protein  29.03 
 
 		 1100 aa  215  2.9999999999999995e-54  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.788605  normal  1 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5516  helicase domain-containing protein  29.17 
 
 		 853 aa  212  3e-53  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.276964  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0490  helicase domain protein  26.45 
 
 		 1052 aa  209  2e-52  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1425  helicase domain protein  26.95 
 
 		 1051 aa  192  2e-47  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1479  helicase domain-containing protein  29.05 
 
 		 1140 aa  192  4e-47  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3669  helicase domain-containing protein  28.01 
 
 		 1109 aa  184  5.0000000000000004e-45  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1535  helicase domain-containing protein  26.1 
 
 		 1086 aa  183  2e-44  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1602  helicase domain-containing protein  27.51 
 
 		 1080 aa  183  2e-44  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.602122  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0861  Snf2/Rad54 family helicase  26.91 
 
 		 1160 aa  168  4e-40  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0001848 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1947  helicase domain protein  23.95 
 
 		 1099 aa  167  6.9999999999999995e-40  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3414  helicase domain protein  24.72 
 
 		 1127 aa  164  8.000000000000001e-39  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0411  helicase domain-containing protein  24.04 
 
 		 1086 aa  157  1e-36  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3971  helicase domain protein  24.44 
 
 		 1060 aa  155  5e-36  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00406642  normal  0.666286 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2557  helicase domain protein  24.01 
 
 		 1117 aa  151  5e-35  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.231387  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1670  helicase domain protein  25.19 
 
 		 1109 aa  144  9.999999999999999e-33  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014214  Mesil_3644  helicase domain protein  24.4 
 
 		 1125 aa  132  3e-29  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3323  helicase domain protein  29.13 
 
 		 1153 aa  122  3e-26  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000535173 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2162  helicase-like protein  22.53 
 
 		 1065 aa  119  1.9999999999999998e-25  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4903  type III restriction enzyme, res subunit  25.41 
 
 		 963 aa  109  3e-22  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.891445  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0503  helicase domain-containing protein  24.1 
 
 		 1147 aa  100  1e-19  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0933  DEAD/DEAH box helicase  23.98 
 
 		 932 aa  95.1  7e-18  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.599756  normal  0.787262 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0816  helicase domain-containing protein  25.04 
 
 		 933 aa  88.2  8e-16  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0970467  normal  0.111384 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0183  helicase domain-containing protein  33.33 
 
 		 1122 aa  87.4  0.000000000000001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.482568  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1540  helicase domain protein  26.44 
 
 		 1187 aa  82.4  0.00000000000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0100683  unclonable  0.000000000869975 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4171  helicase domain-containing protein  36.03 
 
 		 947 aa  82  0.00000000000005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2718  helicase domain-containing protein  25.68 
 
 		 1170 aa  82.4  0.00000000000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00349209 
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3286  helicase domain protein  22.76 
 
 		 988 aa  82.4  0.00000000000005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3352  hypothetical protein  35 
 
 		 919 aa  80.9  0.0000000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.14559  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2010  hypothetical protein  23.37 
 
 		 1144 aa  81.3  0.0000000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2075  hypothetical protein  23.37 
 
 		 835 aa  80.9  0.0000000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.989433  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0811  helicase-like protein  31.43 
 
 		 1201 aa  79.3  0.0000000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0827  helicase domain-containing protein  31.43 
 
 		 1201 aa  79.3  0.0000000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1596  helicase domain-containing protein  27.72 
 
 		 1137 aa  78.6  0.0000000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1325  SNF2-related helicase  24.26 
 
 		 1082 aa  79  0.0000000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1123  helicase domain protein  26.74 
 
 		 966 aa  79  0.0000000000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0214668  normal  0.0288722 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0985  helicase domain-containing protein  31.38 
 
 		 813 aa  78.6  0.0000000000006  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.033377  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0900  putative helicase  31.34 
 
 		 560 aa  77.8  0.0000000000009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3187  helicase domain protein  29.59 
 
 		 969 aa  77.8  0.0000000000009  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5359  helicase domain protein  28.41 
 
 		 1049 aa  77.4  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.111464 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4248  putative helicase  31.19 
 
 		 560 aa  77  0.000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4306  helicase, putative  32.96 
 
 		 560 aa  77  0.000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4132  helicase  31.19 
 
 		 560 aa  77  0.000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3972  SNF2 family helicase  31.19 
 
 		 560 aa  77  0.000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3982  SNF2 family helicase  31.19 
 
 		 560 aa  77  0.000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1123  helicase domain protein  25.44 
 
 		 1169 aa  77  0.000000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4340  putative helicase  31.19 
 
 		 560 aa  77  0.000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.486196  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4450  helicase  31.19 
 
 		 560 aa  77  0.000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.982586  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4359  putative helicase  31.19 
 
 		 560 aa  77  0.000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2916  SNF2-related protein  34.03 
 
 		 560 aa  77  0.000000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0213  SNF2-related protein  34.04 
 
 		 554 aa  76.3  0.000000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1234  helicase domain protein  27.62 
 
 		 1170 aa  76.3  0.000000000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0795356  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1544  helicase-like protein  28.09 
 
 		 933 aa  75.9  0.000000000004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0633  helicase domain-containing protein  24.92 
 
 		 1169 aa  75.9  0.000000000004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0387  helicase domain protein  25.87 
 
 		 584 aa  75.5  0.000000000005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.358987  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0637  helicase domain protein  26.14 
 
 		 1168 aa  75.5  0.000000000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2362  SNF2-related protein  33.11 
 
 		 555 aa  75.5  0.000000000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1492  helicase domain protein  25.84 
 
 		 969 aa  75.1  0.000000000006  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4083  non-specific serine/threonine protein kinase  30.2 
 
 		 560 aa  75.5  0.000000000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0640  helicase-like  30.3 
 
 		 972 aa  74.7  0.000000000008  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.060382 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0063  Type III restriction enzyme, res subunit  23.82 
 
 		 962 aa  74.7  0.000000000009  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0288  helicase domain protein  31.18 
 
 		 1037 aa  74.7  0.00000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3989  helicase domain-containing protein  27.2 
 
 		 1145 aa  74.3  0.00000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.164502 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1086  helicase-like  29.23 
 
 		 829 aa  74.7  0.00000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0513  helicase domain-containing protein  33.1 
 
 		 942 aa  73.9  0.00000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2756  helicase domain protein  27.62 
 
 		 584 aa  74.3  0.00000000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2324  helicase domain protein  33.54 
 
 		 1095 aa  73.9  0.00000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0826  helicase domain-containing protein  30.54 
 
 		 1136 aa  73.2  0.00000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>