More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swol_0176 on replicon NC_008346
Organism: Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009253  Dred_2953  acriflavin resistance protein  34.91 
 
 		 1038 aa  644    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.133437  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1732  acriflavin resistance protein  40.1 
 
 		 1027 aa  655    Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3179  acriflavin resistance protein  37.68 
 
 		 1023 aa  655    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.000000434633  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05050  acriflavin resistance protein  45.26 
 
 		 1011 aa  886    Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00000211109  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1939  acriflavin resistance protein  43.6 
 
 		 1044 aa  890    Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2950  acriflavin resistance protein  44.27 
 
 		 1044 aa  867    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2369  acriflavin resistance protein  47.67 
 
 		 1050 aa  948    Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000403174 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2099  acriflavin resistance protein  46.15 
 
 		 1043 aa  879    Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4520  acriflavin resistance protein  41.63 
 
 		 1043 aa  822    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1937  acriflavin resistance protein  40.62 
 
 		 1034 aa  785    Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.256217  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1942  acriflavin resistance protein  40.81 
 
 		 1040 aa  740    Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.211904  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0176  acriflavin resistance protein  100 
 
 		 1034 aa  2078    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6213  acriflavin resistance protein  35.17 
 
 		 1055 aa  633  1e-180  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.717195  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2518  acriflavin resistance protein  35.13 
 
 		 1041 aa  633  1e-180  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00118511  normal  0.514323 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2024  acriflavin resistance protein  36.18 
 
 		 1058 aa  634  1e-180  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.000109059  normal  0.508224 
 
 
-
 
NC_002950  PG0540  AcrB/AcrD/AcrF family protein  35.54 
 
 		 1049 aa  626  1e-178  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2382  acriflavin resistance protein  35.16 
 
 		 1083 aa  628  1e-178  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0965  AcrB/AcrD/AcrF family protein  36.05 
 
 		 1024 aa  624  1e-177  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00708155  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1648  acriflavin resistance protein  34.42 
 
 		 1082 aa  624  1e-177  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0641  acriflavin resistance protein  34.89 
 
 		 1041 aa  625  1e-177  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2359  acriflavin resistance protein  39.09 
 
 		 1028 aa  622  1e-176  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.995142  normal  0.101465 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2664  outer membrane efflux protein  34.3 
 
 		 1496 aa  620  1e-176  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0165  acriflavin resistance protein  33.72 
 
 		 1032 aa  615  9.999999999999999e-175  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1876  acriflavin resistance protein  36.41 
 
 		 1017 aa  615  9.999999999999999e-175  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1420  AcrB/AcrD/AcrF family protein  35.43 
 
 		 1081 aa  615  9.999999999999999e-175  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1579  acriflavin resistance protein  35.51 
 
 		 1046 aa  611  1e-173  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1924  AcrB/AcrD/AcrF family protein  35.5 
 
 		 1091 aa  607  9.999999999999999e-173  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0752  acriflavin resistance protein  33.65 
 
 		 1071 aa  606  9.999999999999999e-173  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0815  acriflavin resistance protein  33.56 
 
 		 1036 aa  606  9.999999999999999e-173  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1350  acriflavin resistance protein  37.45 
 
 		 1024 aa  607  9.999999999999999e-173  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0568344 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2522  acriflavin resistance protein  35.38 
 
 		 1085 aa  602  1.0000000000000001e-171  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1829  acriflavin resistance protein  35.38 
 
 		 1085 aa  602  1.0000000000000001e-171  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00817457  normal  0.578454 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2515  acriflavin resistance protein  35.28 
 
 		 1085 aa  601  1e-170  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0795793  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2635  acriflavin resistance protein  35.28 
 
 		 1085 aa  601  1e-170  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1829  acriflavin resistance protein  34.17 
 
 		 1086 aa  601  1e-170  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0794172  normal  0.266022 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2276  acriflavin resistance protein  35.22 
 
 		 1083 aa  600  1e-170  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.440839  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1637  acriflavin resistance protein  32.92 
 
 		 1173 aa  602  1e-170  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1613  acriflavin resistance protein  34.17 
 
 		 1041 aa  598  1e-169  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1667  acriflavin resistance protein  32.87 
 
 		 1095 aa  597  1e-169  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.954276 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2821  acriflavin resistance protein  33.95 
 
 		 1087 aa  596  1e-169  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.000195255  normal  0.2689 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1628  acriflavin resistance protein  35 
 
 		 1087 aa  597  1e-169  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1703  acriflavin resistance protein  34.98 
 
 		 1087 aa  597  1e-169  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1703  acriflavin resistance protein  35 
 
 		 1087 aa  597  1e-169  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1675  acriflavin resistance protein  34.23 
 
 		 1034 aa  592  1e-168  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.640028  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4004  acriflavin resistance protein  33.33 
 
 		 1470 aa  594  1e-168  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1780  acriflavin resistance protein  34.23 
 
 		 1102 aa  595  1e-168  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01076  AcrB/AcrD/AcrF family protein  34.09 
 
 		 1122 aa  593  1e-168  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0237  acriflavin resistance protein  35.09 
 
 		 1054 aa  591  1e-167  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2193  acriflavin resistance protein  34.11 
 
 		 1095 aa  591  1e-167  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0248  acriflavin resistance protein  34.99 
 
 		 1054 aa  590  1e-167  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2523  acriflavin resistance protein  36.29 
 
 		 1026 aa  591  1e-167  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.199891 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2809  cation efflux protein  34.4 
 
 		 1050 aa  586  1e-166  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.354726  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2817  acriflavin resistance protein  33.81 
 
 		 1053 aa  582  1.0000000000000001e-165  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0226  acriflavin resistance protein  34.99 
 
 		 1054 aa  584  1.0000000000000001e-165  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.38584  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1842  acriflavin resistance protein  31.97 
 
 		 1058 aa  584  1.0000000000000001e-165  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.844387  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0652  acriflavin resistance protein  36.5 
 
 		 1027 aa  584  1.0000000000000001e-165  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.653108  normal  0.0388492 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2827  acriflavin resistance protein  34.26 
 
 		 1041 aa  582  1e-164  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2109  acriflavin resistance protein  34.64 
 
 		 1044 aa  582  1e-164  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6179  acriflavin resistance protein  32.37 
 
 		 1065 aa  581  1e-164  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.160015  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1268  acriflavin resistance protein  32.95 
 
 		 1058 aa  579  1.0000000000000001e-163  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4164  acriflavin resistance protein  34.23 
 
 		 1040 aa  579  1.0000000000000001e-163  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0666932  normal  0.648782 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1907  acriflavin resistance protein  33.89 
 
 		 1051 aa  578  1.0000000000000001e-163  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0495674  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0763  acriflavin resistance protein  33.33 
 
 		 1039 aa  577  1.0000000000000001e-163  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1025  acriflavin resistance protein  35.68 
 
 		 1050 aa  573  1.0000000000000001e-162  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2664  acriflavin resistance protein  33.56 
 
 		 1039 aa  575  1.0000000000000001e-162  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0971  NolG efflux transporter  33.46 
 
 		 1036 aa  575  1.0000000000000001e-162  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1043  nodulation protein precursor  31.6 
 
 		 1069 aa  572  1e-161  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4494  acriflavin resistance protein  34.95 
 
 		 1049 aa  572  1e-161  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.45729 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0238  acriflavin resistance protein  34.23 
 
 		 1067 aa  565  1.0000000000000001e-159  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1045  acriflavin resistance protein  33.97 
 
 		 1046 aa  564  1.0000000000000001e-159  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.061236  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2480  acriflavin resistance protein  33.63 
 
 		 1028 aa  560  1e-158  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2349  acriflavin resistance protein  31.1 
 
 		 1070 aa  561  1e-158  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.253914  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3708  acriflavin resistance protein  32.75 
 
 		 1063 aa  560  1e-158  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0608  acriflavin resistance protein  32.4 
 
 		 1059 aa  558  1e-157  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0300308  normal  0.48397 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2392  acriflavin resistance protein  33.63 
 
 		 1028 aa  558  1e-157  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.430925  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2558  acriflavin resistance protein  32.29 
 
 		 1048 aa  558  1e-157  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.181919  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1907  acriflavin resistance protein  32.73 
 
 		 1038 aa  556  1e-157  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2601  acriflavin resistance protein  32.15 
 
 		 1066 aa  558  1e-157  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3717  acriflavin resistance protein  33.53 
 
 		 1055 aa  556  1e-157  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.530646  normal  0.0294121 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2982  acriflavin resistance protein  33.92 
 
 		 1028 aa  549  1e-154  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.05054  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3955  acriflavin resistance protein  31.99 
 
 		 1075 aa  543  1e-153  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.542775  normal  0.203686 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0160  acriflavin resistance protein  32.53 
 
 		 1033 aa  545  1e-153  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0960  acriflavin resistance protein  33.59 
 
 		 1047 aa  542  9.999999999999999e-153  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3296  acriflavin resistance protein  32.46 
 
 		 1006 aa  526  1e-148  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0229109  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2783  acriflavin resistance protein  32.58 
 
 		 1045 aa  521  1e-146  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0544081  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1476  acriflavin resistance protein  33.5 
 
 		 1028 aa  520  1e-146  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.30053  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0354  acriflavin resistance protein  32.46 
 
 		 1101 aa  520  1e-146  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.00649102  unclonable  0.0000000737583 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4303  acriflavin resistance protein  31.19 
 
 		 1177 aa  513  1e-144  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.763591  normal  0.628382 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4170  acriflavin resistance protein  31.52 
 
 		 1171 aa  513  1e-144  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  unclonable  0.00460578  normal  0.0104573 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1782  acriflavin resistance protein  33.17 
 
 		 1043 aa  512  1e-143  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.849886  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0559  acriflavin resistance protein  31.06 
 
 		 1062 aa  512  1e-143  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2688  acriflavin resistance protein  32.97 
 
 		 1044 aa  509  9.999999999999999e-143  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.405984  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1183  acriflavin resistance protein  32 
 
 		 1038 aa  505  1e-141  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.317348  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0122  acriflavin resistance protein  30.56 
 
 		 1073 aa  501  1e-140  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.00495446  hitchhiker  0.00000000019698 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1383  acriflavin resistance protein  32.2 
 
 		 1022 aa  500  1e-140  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2399  acriflavin resistance protein  30.46 
 
 		 1032 aa  502  1e-140  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.774253  normal  0.772443 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2131  AcrB/AcrD/AcrF family protein  30.11 
 
 		 1024 aa  499  1e-139  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2083  RND superfamily multidrug efflux system protein  30.25 
 
 		 1036 aa  495  9.999999999999999e-139  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.334854  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2296  putative integral membrane efflux protein  34.48 
 
 		 1064 aa  494  9.999999999999999e-139  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1892  acriflavin resistance protein  30.98 
 
 		 1031 aa  495  9.999999999999999e-139  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>