More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssol_1206 on replicon CP001800
Organism: Sulfolobus solfataricus 98/2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001800  Ssol_1206  translation initiation factor aIF-2  100 
 
 		 600 aa  1179    Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.142011  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0030  translation initiation factor IF-2  70.18 
 
 		 597 aa  848    Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.0331491 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0499  translation initiation factor IF-2  50.08 
 
 		 601 aa  601  1e-170  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.116589  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1600  translation initiation factor IF-2  47.7 
 
 		 588 aa  548  1e-155  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0942  translation initiation factor aIF-2  48.82 
 
 		 578 aa  544  1e-153  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0631  translation initiation factor IF-2  46.68 
 
 		 589 aa  540  9.999999999999999e-153  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.39875  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0628  translation initiation factor IF-2  46.42 
 
 		 592 aa  539  9.999999999999999e-153  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0638  translation initiation factor IF-2  46.1 
 
 		 592 aa  537  1e-151  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3384  translation initiation factor IF-2  46.64 
 
 		 591 aa  527  1e-148  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.0000114381  normal  0.0283403 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0457  translation initiation factor IF-2  46.48 
 
 		 594 aa  527  1e-148  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.202965 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1302  translation initiation factor IF-2  45.83 
 
 		 602 aa  514  1e-144  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0223  translation initiation factor IF-2  44.52 
 
 		 591 aa  508  9.999999999999999e-143  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0201203  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0901  translation initiation factor IF-2  43.48 
 
 		 598 aa  503  1e-141  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1520  translation initiation factor IF-2  44.22 
 
 		 589 aa  501  1e-140  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.537265  normal  0.628449 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2294  translation initiation factor IF-2  42.31 
 
 		 591 aa  497  1e-139  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2489  translation initiation factor IF-2  43.12 
 
 		 604 aa  496  1e-139  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0229  translation initiation factor IF-2  42.23 
 
 		 593 aa  497  1e-139  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0669  translation initiation factor IF-2  42.95 
 
 		 598 aa  493  9.999999999999999e-139  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0339  translation initiation factor IF-2  41.82 
 
 		 593 aa  492  9.999999999999999e-139  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.618473 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1389  translation initiation factor IF-2  42.95 
 
 		 598 aa  491  1e-137  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0461  translation initiation factor IF-2  42.55 
 
 		 593 aa  491  1e-137  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0535363  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1287  translation initiation factor IF-2  42.78 
 
 		 598 aa  488  1e-136  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.492003 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2060  translation initiation factor IF-2  41.25 
 
 		 597 aa  475  1e-132  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.280189  normal  0.136093 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1296  translation initiation factor IF-2  42.78 
 
 		 598 aa  466  9.999999999999999e-131  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0755  translation initiation factor aIF-2  39.9 
 
 		 599 aa  468  9.999999999999999e-131  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2715  translation initiation factor aIF-2  40.33 
 
 		 607 aa  468  9.999999999999999e-131  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1312  translation initiation factor IF-2  41.41 
 
 		 604 aa  456  1e-127  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.662538  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2679  translation initiation factor IF-2  41.97 
 
 		 602 aa  453  1.0000000000000001e-126  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006684  CNB01090  GTPase, putative  36.95 
 
 		 1228 aa  386  1e-106  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.560658  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_04038  mitochondrial translation initiation factor IF-2, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G03970)  37.29 
 
 		 1072 aa  370  1e-101  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011695  PHATRDRAFT_16603  predicted protein  35.08 
 
 		 599 aa  358  9.999999999999999e-98  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.212191  n/a   
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_48964  predicted protein  35.06 
 
 		 623 aa  355  1e-96  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.241447  normal  0.306586 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_82202  predicted protein  35.26 
 
 		 997 aa  331  2e-89  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.236958  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0151  translation initiation factor IF-2  32.15 
 
 		 690 aa  178  3e-43  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.000351563  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0153  translation initiation factor IF-2  31.94 
 
 		 693 aa  178  3e-43  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000770227  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1208  translation initiation factor IF-2  33.9 
 
 		 658 aa  169  1e-40  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000392009  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1934  translation initiation factor IF-2  29.47 
 
 		 571 aa  163  7e-39  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.0000776037  hitchhiker  0.0000000112049 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1662  translation initiation factor IF-2  30.44 
 
 		 822 aa  156  9e-37  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.775404  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1411  translation initiation factor 2  30.04 
 
 		 689 aa  155  2.9999999999999998e-36  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0069  translation initiation factor IF-2  27.82 
 
 		 908 aa  154  4e-36  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  decreased coverage  0.00377162  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1645  translation initiation factor IF-2  31.62 
 
 		 692 aa  154  5e-36  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0509218  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0074  translation initiation factor IF-2  27.64 
 
 		 908 aa  154  7e-36  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0422922  normal  0.247669 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1865  translation initiation factor IF-2  30.95 
 
 		 692 aa  153  8e-36  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00943635  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1012  translation initiation factor IF-2  31.62 
 
 		 854 aa  152  1e-35  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  decreased coverage  0.000000897592  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0910  translation initiation factor IF-2  30.02 
 
 		 656 aa  152  1e-35  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3393  translation initiation factor IF-2  28.87 
 
 		 992 aa  153  1e-35  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.718402 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2710  translation initiation factor IF-2  28.87 
 
 		 992 aa  153  1e-35  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1228  translation initiation factor IF-2  30.29 
 
 		 962 aa  151  3e-35  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.00145036  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1315  translation initiation factor IF-2  29.9 
 
 		 868 aa  150  5e-35  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1473  translation initiation factor IF-2  26.98 
 
 		 579 aa  150  6e-35  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.147864  unclonable  0.00000476955 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0157  translation initiation factor IF-2  28.35 
 
 		 905 aa  150  6e-35  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1327  translation initiation factor IF-2  28.94 
 
 		 995 aa  150  7e-35  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0335521 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2028  translation initiation factor IF-2  30.17 
 
 		 966 aa  150  7e-35  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0609  translation initiation factor IF-2  28.93 
 
 		 711 aa  150  8e-35  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00000891187  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1370  translation initiation factor IF-2  28.94 
 
 		 999 aa  149  1.0000000000000001e-34  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.515442  normal  0.133918 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0900  translation initiation factor IF-2  29.41 
 
 		 882 aa  149  1.0000000000000001e-34  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.437883  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0059  translation initiation factor IF-2  29.62 
 
 		 997 aa  149  1.0000000000000001e-34  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1141  translation initiation factor IF-2  28.78 
 
 		 970 aa  149  2.0000000000000003e-34  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0110968 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1050  translation initiation factor 2  28.45 
 
 		 903 aa  149  2.0000000000000003e-34  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.000000107022  unclonable  0.0000000303018 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2815  translation initiation factor IF-2  28.6 
 
 		 883 aa  149  2.0000000000000003e-34  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2120  translation initiation factor IF-2  30.11 
 
 		 845 aa  148  3e-34  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0599462  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0779  translation initiation factor IF-2  28.6 
 
 		 837 aa  148  3e-34  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000679376  normal  0.0113763 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1864  translation initiation factor IF-2  27.23 
 
 		 876 aa  148  3e-34  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1227  translation initiation factor IF-2  27.32 
 
 		 920 aa  147  4.0000000000000006e-34  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0619631  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0814  translation initiation factor IF-2  30.69 
 
 		 882 aa  147  4.0000000000000006e-34  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  0.0318288 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3628  translation initiation factor IF-2  29.52 
 
 		 887 aa  147  7.0000000000000006e-34  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.206324 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1416  translation initiation factor IF-2  28.72 
 
 		 968 aa  147  8.000000000000001e-34  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.919668  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0391  translation initiation factor IF-2  27.94 
 
 		 875 aa  146  1e-33  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1441  translation initiation factor IF-2  29.11 
 
 		 685 aa  146  1e-33  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.155659  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0555  translation initiation factor IF-2  27.94 
 
 		 875 aa  146  1e-33  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.218131  normal  0.382755 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0433  translation initiation factor IF-2  28.85 
 
 		 829 aa  146  1e-33  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2047  translation initiation factor IF-2  27.96 
 
 		 739 aa  145  2e-33  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1027  translation initiation factor IF-2  27.03 
 
 		 854 aa  145  2e-33  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.295152  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1426  translation initiation factor IF-2  28.5 
 
 		 954 aa  145  2e-33  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000203462 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1003  translation initiation factor IF-2  28.52 
 
 		 853 aa  145  2e-33  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2031  translation initiation factor IF-2  30.09 
 
 		 979 aa  145  2e-33  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00715867 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1515  translation initiation factor IF-2  30.75 
 
 		 879 aa  145  2e-33  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.610025  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2594  translation initiation factor IF-2  28.19 
 
 		 848 aa  145  2e-33  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.914394 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1155  translation initiation factor IF-2  27.61 
 
 		 732 aa  144  3e-33  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000874472  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3074  translation initiation factor 2  30.32 
 
 		 843 aa  145  3e-33  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1236  translation initiation factor IF-2  30.09 
 
 		 601 aa  145  3e-33  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0135157  normal  1 
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0326  translation initiation factor IF-2  28.79 
 
 		 614 aa  145  3e-33  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1940  translation initiation factor IF-2  28.54 
 
 		 679 aa  144  4e-33  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.995818  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1658  translation initiation factor IF-2  28.54 
 
 		 679 aa  144  4e-33  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1211  translation initiation factor IF-2  27.92 
 
 		 951 aa  144  4e-33  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.186812  n/a   
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_33386  mitochondrial translation initiation factor 2  28.57 
 
 		 683 aa  144  5e-33  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.330812  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01303  translation initiation factor IF-2  27.75 
 
 		 904 aa  144  5e-33  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.273892  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0631  translation initiation factor IF2-2  28.4 
 
 		 880 aa  144  6e-33  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0961  translation initiation factor IF-2  28.35 
 
 		 882 aa  143  7e-33  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.875845  normal  0.117843 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1921  translation initiation factor IF-2  28.45 
 
 		 948 aa  143  9e-33  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0602032 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1093  translation initiation factor IF-2  27.78 
 
 		 917 aa  142  9.999999999999999e-33  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2489  translation initiation factor IF-2  28.21 
 
 		 956 aa  142  9.999999999999999e-33  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.872607  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0983  translation initiation factor IF-2  30.37 
 
 		 593 aa  142  1.9999999999999998e-32  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1210  translation initiation factor IF-2  28.1 
 
 		 964 aa  142  1.9999999999999998e-32  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4490  translation initiation factor IF-2  29.61 
 
 		 841 aa  142  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0593821  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4180  translation initiation factor IF-2  29.41 
 
 		 841 aa  142  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_118781  chloroplast translation initiation factor 2  27.54 
 
 		 1053 aa  142  1.9999999999999998e-32  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.106372 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1755  translation initiation factor IF-2  27.39 
 
 		 969 aa  142  1.9999999999999998e-32  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.718536  normal  0.0607148 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1117  translation initiation factor IF-2  28.13 
 
 		 964 aa  142  1.9999999999999998e-32  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.988321  normal  0.615167 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3727  translation initiation factor 2  28.7 
 
 		 949 aa  142  1.9999999999999998e-32  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>