More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spro_0636 on replicon NC_009832
Organism: Serratia proteamaculans 568



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009832  Spro_0636  beta-lactam binding protein AmpH  100 
 
 		 380 aa  781    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.259822  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2758  beta-lactam binding protein AmpH  75.21 
 
 		 388 aa  553  1e-156  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000277431  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1447  beta-lactam binding protein AmpH  75.21 
 
 		 383 aa  552  1e-156  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.000414942  normal  0.794569 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2836  beta-lactam binding protein AmpH  75.21 
 
 		 388 aa  553  1e-156  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0417  beta-lactam binding protein AmpH  66.67 
 
 		 385 aa  503  1e-141  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.144637 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0429  beta-lactam binding protein AmpH  66.4 
 
 		 385 aa  501  1e-141  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.524845 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0411  beta-lactam binding protein AmpH  66.4 
 
 		 385 aa  501  1e-141  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0409  beta-lactam binding protein AmpH  66.4 
 
 		 385 aa  502  1e-141  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.225371  hitchhiker  0.000170283 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0471  beta-lactam binding protein AmpH  66.4 
 
 		 385 aa  500  1e-140  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.598882  normal  0.181498 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3233  beta-lactamase  64.57 
 
 		 385 aa  490  1e-137  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0439  beta-lactam binding protein AmpH  64.57 
 
 		 385 aa  490  1e-137  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0398  beta-lactam binding protein AmpH  64.57 
 
 		 385 aa  490  1e-137  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.447104  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0448  beta-lactam binding protein AmpH  64.57 
 
 		 385 aa  490  1e-137  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0404  beta-lactam binding protein AmpH  64.57 
 
 		 385 aa  490  1e-137  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0293  beta-lactam binding protein AmpH  64.57 
 
 		 385 aa  490  1e-137  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3256  beta-lactam binding protein AmpH  64.57 
 
 		 385 aa  490  1e-137  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.896265  normal  0.574239 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00323  beta-lactamase/D-alanine carboxypeptidase  64.3 
 
 		 385 aa  486  1e-136  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00327  hypothetical protein  64.3 
 
 		 385 aa  486  1e-136  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0844  beta-lactam binding protein AmpH  63.1 
 
 		 388 aa  469  1.0000000000000001e-131  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0659143 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0928  beta-lactam binding protein AmpH  43.32 
 
 		 373 aa  281  2e-74  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.033671 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6651  beta-lactam binding protein AmpH  42.44 
 
 		 369 aa  273  5.000000000000001e-72  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.448296  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0601  beta-lactam binding protein AmpH  32.81 
 
 		 381 aa  187  2e-46  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2143  beta-lactamase  29.9 
 
 		 401 aa  123  6e-27  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.559529  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1795  beta-lactamase  28.02 
 
 		 494 aa  118  1.9999999999999998e-25  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.478102  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1507  Beta-lactamase  26.75 
 
 		 595 aa  112  1.0000000000000001e-23  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0500  beta-lactamase  29.55 
 
 		 487 aa  107  3e-22  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2252  beta-lactamase  31.12 
 
 		 460 aa  104  2e-21  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.119961  normal  0.0203286 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2207  beta-lactamase  25.96 
 
 		 404 aa  103  5e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.124088  hitchhiker  0.00264676 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6777  beta-lactamase  24.1 
 
 		 446 aa  96.7  6e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2687  beta-lactamase  28.98 
 
 		 381 aa  95.9  1e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000287138 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1301  beta-lactamase  31.84 
 
 		 417 aa  94.4  3e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.207216  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3069  beta-lactamase  31.38 
 
 		 400 aa  92.8  8e-18  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.489639  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1364  beta-lactamase  26.91 
 
 		 574 aa  92.8  1e-17  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.185265  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0097  beta-lactamase  24.46 
 
 		 601 aa  92.8  1e-17  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1529  beta-lactamase  29.37 
 
 		 381 aa  90.9  3e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.303701  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1856  beta-lactamase  28.4 
 
 		 498 aa  90.5  5e-17  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0343  beta-lactamase  24.66 
 
 		 517 aa  89.7  7e-17  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.6779 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33850  penicillin-binding protein, beta-lactamase class C  31.05 
 
 		 453 aa  89.7  7e-17  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01195  penicillin-binding protein  23.46 
 
 		 559 aa  89  1e-16  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.119719  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1664  beta-lactamase  27.44 
 
 		 348 aa  88.2  2e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.15284 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5243  beta-lactamase  24.84 
 
 		 362 aa  88.6  2e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0759  putative beta-lactamase class C penicillin binding protein  26.53 
 
 		 498 aa  88.6  2e-16  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.445171  normal  0.118882 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0544  beta-lactamase  23.99 
 
 		 578 aa  87.8  3e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.129057 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2923  beta-lactamase  26.57 
 
 		 356 aa  87.8  3e-16  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0971  beta-lactamase  23.85 
 
 		 352 aa  87.4  4e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.596257  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1797  beta-lactamase  27.07 
 
 		 391 aa  87.4  4e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0148599  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2659  beta-lactamase  24.3 
 
 		 662 aa  87  5e-16  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4638  beta-lactamase  24.05 
 
 		 390 aa  87  5e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4671  alkaline D-peptidase, putative  25.58 
 
 		 330 aa  86.3  7e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.126225  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2793  beta-lactamase  27.03 
 
 		 510 aa  86.3  8e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.879811  normal  0.340954 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1164  beta-lactamase  31.53 
 
 		 501 aa  86.3  9e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.255434 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1755  beta-lactamase  28.53 
 
 		 450 aa  85.5  0.000000000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35970  penicillin-binding protein, beta-lactamase class C  31.4 
 
 		 582 aa  85.9  0.000000000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.796833  normal  0.223324 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0739  beta-lactamase  27.13 
 
 		 381 aa  85.5  0.000000000000001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0086  beta-lactamase  25.33 
 
 		 409 aa  85.9  0.000000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.057609 
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0089  beta-lactamase  25.33 
 
 		 409 aa  85.9  0.000000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0743599 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1520  Beta-lactamase  26 
 
 		 537 aa  85.1  0.000000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000638983  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3274  beta-lactamase  26.7 
 
 		 524 aa  84.7  0.000000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.847415 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1839  Beta-lactamase class C and other penicillin binding proteins-like protein  25.3 
 
 		 681 aa  85.1  0.000000000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000051234  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3511  beta-lactamase  28.69 
 
 		 364 aa  84.3  0.000000000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.700919  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1713  beta-lactamase  26.55 
 
 		 347 aa  84  0.000000000000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1055  beta-lactamase  25.75 
 
 		 547 aa  84  0.000000000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.427639  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0467  beta-lactamase  25.27 
 
 		 520 aa  83.6  0.000000000000006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1946  Beta-lactamase  24.61 
 
 		 588 aa  83.2  0.000000000000006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.220663 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4159  beta-lactamase  25.61 
 
 		 544 aa  83.6  0.000000000000006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0453527  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1234  beta-lactamase  25.94 
 
 		 519 aa  83.2  0.000000000000006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.565811  normal  0.301621 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0951  beta-lactamase  27.3 
 
 		 345 aa  83.2  0.000000000000007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0224352  decreased coverage  0.0053447 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1788  beta-lactamase  24.02 
 
 		 560 aa  83.2  0.000000000000008  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.358741  normal  0.761746 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0270  beta-lactamase  28.25 
 
 		 717 aa  82.8  0.000000000000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4152  beta-lactamase  25 
 
 		 378 aa  82.8  0.000000000000009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0848463  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3518  Beta-lactamase class C and other penicillin binding protein-like protein  31.37 
 
 		 508 aa  82  0.00000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0439  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  26.43 
 
 		 392 aa  82.4  0.00000000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.919528 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4637  beta-lactamase  22.41 
 
 		 491 aa  82  0.00000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2198  beta-lactamase  26.16 
 
 		 543 aa  81.3  0.00000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.176904  normal  0.0317754 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3749  beta-lactamase  29.05 
 
 		 401 aa  82  0.00000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0280744 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12878  beta-lactamase, putative  25.07 
 
 		 504 aa  80.9  0.00000000000003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0339  beta-lactamase  25.98 
 
 		 385 aa  81.3  0.00000000000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000286576 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0349  beta-lactamase  29.36 
 
 		 407 aa  80.9  0.00000000000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04833  beta-lactamase  25.19 
 
 		 529 aa  80.5  0.00000000000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3247  beta-lactamase  23.98 
 
 		 513 aa  80.5  0.00000000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0660544 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41280  putative beta-lactamase  22.97 
 
 		 610 aa  80.5  0.00000000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.607486 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3704  beta-lactamase  27.78 
 
 		 407 aa  80.5  0.00000000000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.136974  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1906  beta-lactamase  26.49 
 
 		 369 aa  80.5  0.00000000000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4058  beta-lactamase  24.57 
 
 		 405 aa  80.1  0.00000000000006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00809672  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3205  beta-lactamase  27.27 
 
 		 407 aa  79.7  0.00000000000008  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4174  beta-lactamase  25 
 
 		 378 aa  79.7  0.00000000000008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000652338  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4257  beta-lactamase  26.46 
 
 		 464 aa  79.3  0.00000000000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.240658 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1710  beta-lactamase  25.41 
 
 		 463 aa  79  0.0000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.903063 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2265  beta-lactamase  27.27 
 
 		 407 aa  79.3  0.0000000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.120111  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3702  beta-lactamase  24.12 
 
 		 430 aa  79  0.0000000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1929  beta-lactamase  26.96 
 
 		 407 aa  79.3  0.0000000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1712  beta-lactamase  23.76 
 
 		 477 aa  79  0.0000000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.419371  normal  0.191124 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2615  hypothetical protein  27.39 
 
 		 793 aa  79.3  0.0000000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.377093  normal  0.895738 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1086  beta-lactamase  24.58 
 
 		 378 aa  79  0.0000000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0622  beta-lactamase  25.37 
 
 		 377 aa  79  0.0000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.357585  normal  0.0394741 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4621  beta-lactamase  25.33 
 
 		 377 aa  78.2  0.0000000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0889352 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4110  beta-lactamase  24.58 
 
 		 379 aa  78.2  0.0000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7012  beta-lactamase  31.53 
 
 		 467 aa  78.6  0.0000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.858592 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5607  hypothetical protein  26.62 
 
 		 784 aa  78.6  0.0000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3500  beta-lactamase  21.53 
 
 		 600 aa  78.2  0.0000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.623073  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>