More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spea_2115 on replicon NC_009901
Organism: Shewanella pealeana ATCC 700345



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009901  Spea_2115  major facilitator transporter  100 
 
 		 451 aa  901    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.740368  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2122  major facilitator transporter  35.52 
 
 		 461 aa  253  5.000000000000001e-66  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1729  major facilitator transporter  31.14 
 
 		 453 aa  201  1.9999999999999998e-50  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3455  major facilitator transporter  33.02 
 
 		 430 aa  200  5e-50  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0508  major facilitator transporter  31.52 
 
 		 438 aa  185  1.0000000000000001e-45  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0836573  normal  0.693468 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0045  major facilitator transporter  28.86 
 
 		 444 aa  185  2.0000000000000003e-45  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0327786  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3856  major facilitator transporter  31.92 
 
 		 405 aa  170  4e-41  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.437041  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2934  major facilitator transporter  30.41 
 
 		 441 aa  170  4e-41  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.14658  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02423  major facilitator family transporter  30.99 
 
 		 440 aa  170  5e-41  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.796992  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0227  major facilitator transporter  31.32 
 
 		 438 aa  168  2e-40  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.358089  normal  0.545029 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0903  major facilitator transporter  28.89 
 
 		 440 aa  167  4e-40  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0333563  normal  0.084831 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3250  major facilitator transporter  29.52 
 
 		 433 aa  164  3e-39  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.613026 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5128  major facilitator transporter  32.69 
 
 		 418 aa  164  4.0000000000000004e-39  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.221032  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1905  major facilitator transporter  29.11 
 
 		 426 aa  162  9e-39  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1938  major facilitator transporter  27.8 
 
 		 443 aa  160  3e-38  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.829808  normal  0.641646 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3438  major facilitator transporter  29.64 
 
 		 506 aa  150  5e-35  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.356572  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2022  major facilitator superfamily MFS_1  29.93 
 
 		 440 aa  150  5e-35  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5071  major facilitator transporter  28.61 
 
 		 470 aa  147  3e-34  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.844572  normal  0.14779 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3528  major facilitator transporter  28.61 
 
 		 468 aa  147  5e-34  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.168718 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2493  major facilitator transporter  28.11 
 
 		 465 aa  147  5e-34  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0270873  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2687  major facilitator transporter  27.25 
 
 		 472 aa  146  7.0000000000000006e-34  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5358  major facilitator transporter  28.36 
 
 		 465 aa  145  1e-33  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.12885  normal  0.601812 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3898  major facilitator transporter  27.86 
 
 		 467 aa  144  4e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.547341  normal  0.242029 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3622  major facilitator transporter  27.86 
 
 		 467 aa  144  4e-33  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.416218  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1874  major facilitator superfamily MFS_1  25.43 
 
 		 435 aa  142  9.999999999999999e-33  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.20349 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1078  major facilitator transporter  29.46 
 
 		 443 aa  142  9.999999999999999e-33  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.564459 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5303  MFS family transporter  29.4 
 
 		 457 aa  141  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61560  putative MFS transporter  29.4 
 
 		 457 aa  142  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.167083 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2862  major facilitator transporter  27.02 
 
 		 448 aa  142  1.9999999999999998e-32  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.114949  normal  0.0171068 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5424  major facilitator superfamily MFS_1  27.5 
 
 		 471 aa  140  3e-32  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1535  major facilitator transporter  29.19 
 
 		 449 aa  137  4e-31  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0332  major facilitator superfamily transporter phthalate permease  26.68 
 
 		 475 aa  136  7.000000000000001e-31  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.444017  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2012  major facilitator superfamily MFS_1  29.38 
 
 		 413 aa  136  8e-31  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000197881 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1728  major facilitator transporter  27.31 
 
 		 461 aa  134  3e-30  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3192  major facilitator transporter  33.33 
 
 		 442 aa  134  3.9999999999999996e-30  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.010233 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0360  major facilitator transporter  35.81 
 
 		 578 aa  134  5e-30  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.826159 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0887  major facilitator transporter  27.49 
 
 		 416 aa  133  7.999999999999999e-30  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.160597  normal  1 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4705  major facilitator superfamily MFS_1  27.34 
 
 		 434 aa  131  2.0000000000000002e-29  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0828035 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4299  major facilitator transporter  28.34 
 
 		 413 aa  131  2.0000000000000002e-29  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.881294  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4014  major facilitator transporter  24.94 
 
 		 438 aa  130  3e-29  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.242843  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0737  major facilitator transporter  29.44 
 
 		 437 aa  130  6e-29  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.175922 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2215  major facilitator superfamily MFS_1  28.3 
 
 		 413 aa  129  1.0000000000000001e-28  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0909109  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3479  major facilitator transporter  32.22 
 
 		 450 aa  128  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1976  major facilitator transporter  28.64 
 
 		 454 aa  128  2.0000000000000002e-28  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1254  general substrate transporter  31.62 
 
 		 449 aa  127  3e-28  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4105  major facilitator family transporter  32.61 
 
 		 479 aa  126  8.000000000000001e-28  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004632  PSPTO_B0010  major facilitator family transporter  31.79 
 
 		 471 aa  125  1e-27  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4429  major facilitator transporter  27.03 
 
 		 453 aa  125  1e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1562  major facilitator transporter  27.98 
 
 		 450 aa  124  3e-27  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.384388  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3636  major facilitator transporter  28.76 
 
 		 432 aa  122  9.999999999999999e-27  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2014  major facilitator transporter  26.15 
 
 		 459 aa  118  1.9999999999999998e-25  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.317421  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0816  major facilitator transporter  37.23 
 
 		 536 aa  117  3e-25  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.973467  decreased coverage  0.000368786 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0585  major facilitator transporter  31 
 
 		 542 aa  115  1.0000000000000001e-24  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.895306  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2470  major facilitator transporter  29.81 
 
 		 440 aa  116  1.0000000000000001e-24  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3989  major facilitator superfamily transporter  27.98 
 
 		 426 aa  114  2.0000000000000002e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4101  major facilitator superfamily MFS_1  27.65 
 
 		 426 aa  115  2.0000000000000002e-24  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4600  major facilitator transporter  25.78 
 
 		 442 aa  114  3e-24  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.578788  normal  0.252114 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3077  major facilitator transporter  26.79 
 
 		 441 aa  114  3e-24  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.163799  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2011  major facilitator transporter  27.69 
 
 		 446 aa  114  4.0000000000000004e-24  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8303  major facilitator superfamily MFS_1  29.55 
 
 		 478 aa  113  6e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4131  major facilitator superfamily MFS_1  27.46 
 
 		 426 aa  112  2.0000000000000002e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2674  major facilitator transporter  25.58 
 
 		 426 aa  111  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2647  major facilitator transporter  23.76 
 
 		 464 aa  111  3e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0800  major facilitator transporter  34.17 
 
 		 533 aa  111  3e-23  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1930  major facilitator transporter  27.16 
 
 		 451 aa  110  5e-23  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.604582 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2760  major facilitator transporter  26.29 
 
 		 456 aa  109  1e-22  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.937042 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0918  major facilitator transporter  25.36 
 
 		 433 aa  108  2e-22  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.12874  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3221  major facilitator transporter  27.93 
 
 		 416 aa  108  2e-22  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00772282 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2817  major facilitator transporter  24.87 
 
 		 426 aa  108  3e-22  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.850013  normal  0.439964 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7588  major facilitator transporter  25.37 
 
 		 490 aa  107  4e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0477  major facilitator transporter  26.18 
 
 		 443 aa  107  5e-22  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.727479 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2172  major facilitator transporter  26.48 
 
 		 452 aa  105  1e-21  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.072779 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0710  major facilitator transporter  32.99 
 
 		 454 aa  104  3e-21  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00331318 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1023  major facilitator transporter  24.94 
 
 		 448 aa  103  5e-21  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0669812 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1834  major facilitator transporter  25.49 
 
 		 418 aa  103  6e-21  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.711974  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1479  major facilitator transporter  24.94 
 
 		 405 aa  103  6e-21  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  0.675029 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4329  major facilitator transporter  25.66 
 
 		 457 aa  103  7e-21  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.87285 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0609  major facilitator transporter  28.76 
 
 		 472 aa  103  9e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0802156 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6128  major facilitator transporter  27.62 
 
 		 461 aa  102  1e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.328412  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6228  major facilitator transporter  28.5 
 
 		 450 aa  102  2e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7350  major facilitator transporter  23.95 
 
 		 464 aa  99  2e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.25449  normal  0.921964 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0776  major facilitator transporter  24.69 
 
 		 447 aa  98.2  2e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5791  major facilitator transporter  24.49 
 
 		 454 aa  98.2  3e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.601008  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4301  major facilitator transporter  30.04 
 
 		 461 aa  97.8  3e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5424  major facilitator family transporter  35.46 
 
 		 198 aa  97.1  5e-19  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.18135  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3193  major facilitator superfamily transporter  26.25 
 
 		 424 aa  97.4  5e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.326975 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3136  major facilitator transporter  30.18 
 
 		 530 aa  97.1  6e-19  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.797097  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3077  major facilitator transporter  26.92 
 
 		 456 aa  97.1  7e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.374174  normal  0.0107759 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0685  major facilitator transporter  28.52 
 
 		 438 aa  96.7  8e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2211  major facilitator superfamily MFS_1  29.11 
 
 		 413 aa  95.9  1e-18  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.895405  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7178  major facilitator transporter  25.46 
 
 		 441 aa  95.5  2e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.888458 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3439  major facilitator transporter  26.14 
 
 		 424 aa  95.1  2e-18  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.681123  normal  0.892025 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0383  major facilitator transporter  24.9 
 
 		 457 aa  93.2  1e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.754825 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0236  major facilitator transporter  25.86 
 
 		 446 aa  92.8  1e-17  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4352  major facilitator transporter  25.43 
 
 		 453 aa  91.7  2e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1735  major facilitator transporter  24.35 
 
 		 443 aa  92  2e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.320526  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4127  major facilitator superfamily MFS_1  25 
 
 		 432 aa  92  2e-17  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.560354  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04810  major facilitator superfamily MFS_1  24.87 
 
 		 423 aa  90.9  4e-17  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.332463  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02171  transport transmembrane protein  27.27 
 
 		 448 aa  90.1  8e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.115532  normal  0.0335477 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4086  major facilitator transporter  27.27 
 
 		 433 aa  89.7  9e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0463716  normal  0.690757 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>