122 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smon_0896 on replicon NC_013515
Organism: Streptobacillus moniliformis DSM 12112



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013515  Smon_0896  Conjugal transfer protein TrbG/VirB9/CagX  100 
 
 
282 aa  563  1.0000000000000001e-159  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1187  Conjugal transfer protein TrbG/VirB9/CagX  80.52 
 
 
231 aa  382  1e-105  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1903  P-type conjugative transfer protein TrbG  30.99 
 
 
330 aa  111  1.0000000000000001e-23  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.11675  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1324  P-type conjugative transfer protein TrbG  31.92 
 
 
329 aa  110  2.0000000000000002e-23  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.141371  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2576  conjugal transfer lipoprotein TrbG  31.6 
 
 
334 aa  108  1e-22  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.515987  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3498  P-type conjugative transfer protein TrbG  31.13 
 
 
330 aa  106  3e-22  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4202  conjugal transfer protein TrbG/VirB9/CagX  31.92 
 
 
337 aa  107  3e-22  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.250287  normal  0.746968 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2012  conjugal transfer protein TrbG/VirB9/CagX  31.13 
 
 
334 aa  106  4e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.62042  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1842  P-type conjugative transfer protein TrbG  28.64 
 
 
339 aa  106  5e-22  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.254623  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1290  conjugal transfer protein TrbG/VirB9/CagX  30.66 
 
 
330 aa  105  9e-22  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2358  P-type conjugative transfer protein TrbG  31.13 
 
 
333 aa  105  9e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.104041  normal  0.534378 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35640  P-type conjugative transfer protein TrbG  30.66 
 
 
298 aa  104  1e-21  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0847602  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3698  conjugal transfer protein TrbG/VirB9/CagX  30.99 
 
 
330 aa  104  2e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.72562  n/a   
 
 
-
 
NC_011061  Paes_2354  P-type conjugative transfer protein TrbG  30.66 
 
 
312 aa  104  2e-21  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.557351  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_30860  TrbG-like protein  31.6 
 
 
329 aa  103  4e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000570551  unclonable  3.4703699999999997e-22 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0430  P-type conjugative transfer protein TrbG  31.13 
 
 
329 aa  103  5e-21  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.127006  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2652  P-type conjugative transfer protein TrbG  30.66 
 
 
331 aa  102  6e-21  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.190943  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1147  P-type conjugative transfer protein TrbG  29.77 
 
 
293 aa  102  7e-21  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0959  P-type conjugative transfer protein TrbG  27.76 
 
 
333 aa  102  8e-21  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1558  conjugal transfer protein TrbG/VirB9/CagX  30.52 
 
 
333 aa  101  2e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00584064  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0734  conjugal transfer protein TrbG/VirB9/CagX  30.99 
 
 
334 aa  101  2e-20  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.515891  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2034  P-type conjugative transfer protein TrbG  28.09 
 
 
327 aa  100  2e-20  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.466977  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0169  P-type conjugative transfer protein TrbG  30.28 
 
 
278 aa  100  3e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.227252  normal  0.244243 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2691  P-type conjugative transfer protein TrbG  30.66 
 
 
333 aa  99.8  4e-20  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.239793  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1349  conjugal transfer protein TrbG/VirB9/CagX  29.58 
 
 
330 aa  99  9e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00000992515  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2903  conjugal transfer protein TrbG/VirB9/CagX  30.66 
 
 
326 aa  98.2  1e-19  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.369885  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1507  conjugal transfer protein trbG  29.84 
 
 
327 aa  98.6  1e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.642267  normal  0.552151 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2832  P-type conjugative transfer protein TrbG  30.63 
 
 
357 aa  96.7  4e-19  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.471623  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3533  conjugal transfer protein TrbG/VirB9/CagX  29.73 
 
 
346 aa  95.1  1e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.567814 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2316  conjugal transfer protein TrbG/VirB9/CagX  29.52 
 
 
318 aa  95.5  1e-18  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.012474  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0148  conjugal transfer protein TrbG/VirB9/CagX  25.73 
 
 
334 aa  94.7  2e-18  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.51257  normal 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5215  P-type conjugative transfer protein TrbG  25.68 
 
 
355 aa  94.4  2e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3893  conjugal transfer protein TrbG/VirB9/CagX  29.82 
 
 
334 aa  94  3e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.913527  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1005  P-type conjugative transfer protein TrbG  28.7 
 
 
328 aa  93.6  4e-18  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0691  P-type conjugative transfer protein TrbG  28.84 
 
 
338 aa  93.2  5e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2344  P-type conjugative transfer protein TrbG  30.14 
 
 
348 aa  92.8  6e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4172  conjugal transfer protein TrbG/VirB9/CagX  28.82 
 
 
269 aa  92.4  7e-18  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.403674  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3859  conjugal transfer protein TrbG/VirB9/CagX  28.04 
 
 
328 aa  91.7  1e-17  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0174658  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2275  P-type conjugative transfer protein TrbG  24.54 
 
 
266 aa  91.7  1e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.210021  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3372  putative conjugal transfer protein trbG  27.39 
 
 
315 aa  90.9  2e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.207123  normal  0.974636 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3220  P-type conjugative transfer protein TrbG  28.24 
 
 
342 aa  91.3  2e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  decreased coverage  0.000858475  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1712  P-type conjugative transfer protein TrbG  26.5 
 
 
314 aa  90.9  2e-17  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000000367277  normal 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5368  P-type conjugative transfer protein TrbG  27.78 
 
 
345 aa  90.5  3e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.151828  normal  0.266795 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3992  P-type conjugative transfer protein TrbG  29.58 
 
 
350 aa  89  7e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0363697  normal  0.115635 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3835  P-type conjugative transfer protein TrbG  28.44 
 
 
341 aa  89  8e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.805097  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3094  P-type conjugative transfer protein TrbG  28.3 
 
 
355 aa  89  9e-17  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0310  conjugal transfer protein TrbG/VirB9/CagX  28.44 
 
 
343 aa  88.6  1e-16  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2996  P-type conjugative transfer protein TrbG  28.77 
 
 
347 aa  88.6  1e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.646322 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3202  conjugal transfer protein TrbG/VirB9/CagX  26.82 
 
 
347 aa  87.8  2e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.243978  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0603  P-type conjugative transfer protein TrbG  28.77 
 
 
350 aa  87.4  2e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1476  conjugal transfer protein TrbG/VirB9/CagX  27.31 
 
 
342 aa  87  3e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.278158  normal 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5236  conjugal transfer protein TrbG/VirB9/CagX  25 
 
 
290 aa  86.7  5e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.385034  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1186  P-type conjugative transfer protein TrbG  26.76 
 
 
326 aa  85.9  7e-16  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3549  P-type conjugative transfer protein TrbG  26.76 
 
 
326 aa  85.9  7e-16  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011986  Avi_9813  type IV secretion protein AvhB9  28.8 
 
 
269 aa  85.9  7e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2606  conjugal transfer protein TrbG/VirB9/CagX  26.29 
 
 
337 aa  85.5  9e-16  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0501  conjugal transfer protein TrbG/VirB9/CagX  27.91 
 
 
326 aa  85.5  0.000000000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0741964  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7749  putative conjugal transfer protein trbG  27.93 
 
 
298 aa  84.3  0.000000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.359845  normal  0.0621057 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3699  P-type conjugative transfer protein TrbG  25.79 
 
 
338 aa  84  0.000000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2092  conjugal transfer protein TrbG/VirB9/CagX  28.51 
 
 
339 aa  83.6  0.000000000000004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.277798  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0741  P-type conjugative transfer protein TrbG  30.26 
 
 
341 aa  83.2  0.000000000000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.9588 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2478  conjugal transfer protein TrbG/VirB9/CagX  23.88 
 
 
283 aa  82.4  0.000000000000007  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.197669  normal  0.278704 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2886  P-type conjugative transfer protein TrbG  30.26 
 
 
341 aa  82.4  0.000000000000008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.361608  normal  0.174381 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4557  conjugal transfer protein TrbG/VirB9/CagX  26.64 
 
 
269 aa  82  0.00000000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.630159  n/a   
 
 
-
 
NC_007337  Reut_D6507  conjugal transfer protein TrbG  29.74 
 
 
299 aa  79.3  0.00000000000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0761422  n/a   
 
 
-
 
NC_008385  Bamb_6630  conjugal transfer protein TrbG  29.74 
 
 
299 aa  79.3  0.00000000000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008766  Ajs_4269  conjugal transfer protein TrbG  29.74 
 
 
299 aa  79.7  0.00000000000006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.166546  normal  0.0145862 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7448  putative conjugal transfer protein trbG  26.39 
 
 
328 aa  79.3  0.00000000000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1666  P-type conjugative transfer protein TrbG  27.91 
 
 
338 aa  79  0.00000000000008  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6399  P-type conjugative transfer protein VirB9  26.67 
 
 
269 aa  79  0.00000000000009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.474869  normal 
 
 
-
 
NC_011991  Avi_9650  conjugal transfer protein TrbG  28.02 
 
 
273 aa  78.2  0.0000000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0266012  n/a   
 
 
-
 
NC_013930  TK90_2825  Conjugal transfer protein TrbG/VirB9/CagX  23.37 
 
 
284 aa  75.9  0.0000000000008  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010579  XfasM23_2230  conjugal transfer protein TrbG  31.15 
 
 
296 aa  75.9  0.0000000000008  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.938965  n/a   
 
 
-
 
NC_009704  YpsIP31758_A0052  conjugal transfer protein TrbG  30.95 
 
 
295 aa  73.2  0.000000000005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4439  conjugal transfer protein TrbG/VirB9/CagX  27.75 
 
 
267 aa  70.9  0.00000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9259  conjugal transfer protein TrbG  28.96 
 
 
296 aa  70.9  0.00000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5384  conjugal transfer protein TrbG  28.99 
 
 
270 aa  70.9  0.00000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0585815 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4755  Conjugal transfer protein TrbG/VirB9/CagX  25.93 
 
 
255 aa  71.2  0.00000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.369632 
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8325  conjugal transfer protein TrbG  27.87 
 
 
284 aa  69.7  0.00000000006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  decreased coverage  0.000831167  n/a   
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4561  conjugal transfer protein TrbG  29.26 
 
 
279 aa  67.8  0.0000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.843427  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5490  conjugal transfer protein TrbG  28 
 
 
273 aa  67  0.0000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.26878  normal 
 
 
-
 
NC_009777  VIBHAR_p08207  conjugal transfer outer membrane protein TraH  29.05 
 
 
255 aa  67  0.0000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0210  type IV secretion system protein VirB9  26.11 
 
 
266 aa  65.5  0.000000001  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.332036  n/a   
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5456  conjugal transfer protein TrbG/VirB9/CagX  22.76 
 
 
268 aa  64.7  0.000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.0200156 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2510  conjugal transfer protein TrbG/VirB9/CagX  24.56 
 
 
260 aa  63.5  0.000000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.108506  normal  0.474909 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6212  Conjugal transfer protein TrbG/VirB9/CagX  27.23 
 
 
277 aa  61.6  0.00000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0737983 
 
 
-
 
NC_010000  Sbal195_4696  P-type conjugative transfer protein TrbG  26.01 
 
 
292 aa  61.2  0.00000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5192  Conjugal transfer protein TrbG/VirB9/CagX  29.17 
 
 
293 aa  60.8  0.00000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0164987  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1527  Conjugal transfer protein TrbG/VirB9/CagX  29.17 
 
 
293 aa  60.8  0.00000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007901  Rfer_4253  conjugal transfer protein TrbG/VirB9/CagX  25.81 
 
 
270 aa  60.1  0.00000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1760  putative type IV secretion system protein VirB9  22.9 
 
 
278 aa  57  0.0000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0566153  normal  0.26092 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2651  putative type IV secretion system protein VirB9  21.88 
 
 
278 aa  57.4  0.0000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0400031  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0168  Conjugal transfer protein TrbG/VirB9/CagX  21.74 
 
 
281 aa  57  0.0000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.313192 
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6300  conjugal transfer protein TrbG/VirB9/CagX  27.43 
 
 
303 aa  56.6  0.0000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4196  conjugal transfer protein TrbG/VirB9/CagX  20 
 
 
274 aa  56.2  0.0000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.258229  normal  0.907108 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0177  hypothetical protein  24.75 
 
 
250 aa  55.1  0.000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4340  conjugal transfer protein TrbG/VirB9/CagX  23.27 
 
 
285 aa  54.7  0.000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0413275  n/a   
 
 
-
 
NC_011351  ECH74115_A0014  conjugal transfer outer membrane protein TraH  24.57 
 
 
259 aa  55.1  0.000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4847  conjugal transfer protein TrbG/VirB9/CagX  19.05 
 
 
274 aa  54.7  0.000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5546  conjugal transfer protein TrbG/VirB9/CagX  25.11 
 
 
291 aa  54.7  0.000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0259324 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>