189 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_2706 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_2706  TPR repeat-containing protein  100 
 
 		 928 aa  1912    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.332396  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0283  TPR repeat-containing protein  25.93 
 
 		 854 aa  173  1e-41  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3307  Tetratricopeptide domain protein  25.88 
 
 		 909 aa  144  5e-33  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.106188 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1271  hypothetical protein  25.35 
 
 		 884 aa  127  9e-28  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2752  Tetratricopeptide TPR_4  28.23 
 
 		 893 aa  123  1.9999999999999998e-26  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1586  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  22.31 
 
 		 1162 aa  119  3e-25  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.206624 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1562  TPR repeat-containing protein  22.31 
 
 		 1162 aa  118  3.9999999999999997e-25  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2533  TPR repeat-containing protein  30.45 
 
 		 1025 aa  103  2e-20  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0790  TPR repeat-containing protein  26.36 
 
 		 916 aa  97.8  8e-19  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.601667 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0857  hypothetical protein  30.39 
 
 		 532 aa  91.7  5e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0698719  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2671  tetratricopeptide TPR_2  26.76 
 
 		 828 aa  90.1  2e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.290452  normal  0.798665 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0502  Tetratricopeptide domain protein  26.45 
 
 		 717 aa  89  4e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2811  tetratricopeptide TPR_2  26.28 
 
 		 782 aa  89  4e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0319314  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0864  TPR repeat-containing protein  26.56 
 
 		 1060 aa  88.6  5e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0863  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  26.36 
 
 		 991 aa  88.2  6e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0054  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  27.94 
 
 		 968 aa  88.2  6e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.317983  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4825  tetratricopeptide TPR_3  38.62 
 
 		 1009 aa  84.7  0.000000000000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.137513 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3262  tetratricopeptide TPR_2  28.66 
 
 		 919 aa  84.3  0.000000000000009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.857288  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0529  tetratricopeptide TPR_2  24.26 
 
 		 1266 aa  84  0.00000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.696941 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0528  TPR repeat-containing protein  29.86 
 
 		 1409 aa  82.8  0.00000000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.987709  decreased coverage  0.00608589 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3830  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  26.65 
 
 		 3537 aa  81.6  0.00000000000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3497  peptidase-like  27.12 
 
 		 1328 aa  80.9  0.0000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3903  tetratricopeptide TPR_2  30.17 
 
 		 809 aa  79.3  0.0000000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0570  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  26.83 
 
 		 3535 aa  78.2  0.0000000000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0572  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  26.83 
 
 		 3419 aa  78.2  0.0000000000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0573  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  26.52 
 
 		 3298 aa  76.3  0.000000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2809  tetratricopeptide TPR_2  25.55 
 
 		 985 aa  75.5  0.000000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  unclonable  0.00683217  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4189  hypothetical protein  36.75 
 
 		 1246 aa  75.1  0.000000000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4095  TPR repeat-containing protein  25.56 
 
 		 729 aa  74.7  0.000000000008  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000736734 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0607  tetratricopeptide TPR_2  27.93 
 
 		 957 aa  74.3  0.00000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.21285 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2597  hypothetical protein  22.91 
 
 		 1238 aa  73.6  0.00000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0183256  normal  0.576788 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0977  TPR repeat-containing protein  24.09 
 
 		 1215 aa  73.2  0.00000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.153699  normal  0.773463 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2979  TPR repeat-containing protein  27.36 
 
 		 1054 aa  72.8  0.00000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.864707  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0963  hypothetical protein  25.84 
 
 		 1550 aa  72  0.00000000005  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.424465 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0007  TPR repeat-containing protein  28.38 
 
 		 822 aa  71.6  0.00000000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.286469  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1534  TPR repeat-containing protein  22.54 
 
 		 868 aa  71.6  0.00000000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0446  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  22.82 
 
 		 2741 aa  70.1  0.0000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5804  TPR repeat-containing protein  32.14 
 
 		 796 aa  70.5  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1756  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  32.11 
 
 		 854 aa  69.7  0.0000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.760103 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0462  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  22.47 
 
 		 2741 aa  68.9  0.0000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1768  TPR repeat-containing protein  38.83 
 
 		 923 aa  68.6  0.0000000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.706396 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1214  TPR repeat-containing protein  24.77 
 
 		 1365 aa  68.2  0.0000000007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7004  hypothetical protein  28.52 
 
 		 1051 aa  67.4  0.000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.244252  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1504  TPR repeat-containing protein  22.19 
 
 		 1313 aa  66.2  0.000000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0380  tetratricopeptide region  27.95 
 
 		 960 aa  67  0.000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0966  hypothetical protein  27.18 
 
 		 2145 aa  65.5  0.000000004  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.360119 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1975  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  27.11 
 
 		 3299 aa  65.1  0.000000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3141  hypothetical protein  28.29 
 
 		 192 aa  64.7  0.000000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3507  protein prenyltransferase, alpha subunit  29.12 
 
 		 1007 aa  64.7  0.000000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.223985 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1707  TPR repeat-containing protein  36.52 
 
 		 846 aa  64.3  0.00000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4183  tetratricopeptide TPR_4  29.52 
 
 		 944 aa  64.3  0.00000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000166941 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3775  TPR repeat-containing protein  32.69 
 
 		 937 aa  64.3  0.00000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3695  Sel1 domain-containing protein  31.58 
 
 		 1475 aa  64.3  0.00000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.909134 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4871  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  26.2 
 
 		 636 aa  63.2  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0788  TPR repeat-containing protein  23.32 
 
 		 1101 aa  63.2  0.00000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  unclonable  0.000957174  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2730  TPR repeat-containing adenylate/guanylate cyclase  23.21 
 
 		 1429 aa  63.5  0.00000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.225426  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1366  hypothetical protein  24.32 
 
 		 825 aa  62.8  0.00000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4137  TPR repeat-containing protein  27.81 
 
 		 868 aa  62.8  0.00000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00000228127  decreased coverage  0.0057951 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2488  Tetratricopeptide domain protein  28.34 
 
 		 950 aa  62.4  0.00000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0438  signal transduction histidine kinase-like protein  26.45 
 
 		 755 aa  62.4  0.00000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.128515  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4462  hypothetical protein  29.41 
 
 		 853 aa  62  0.00000005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.60042  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4247  TPR repeat-containing protein  28.42 
 
 		 1055 aa  61.6  0.00000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0363  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  26.54 
 
 		 1772 aa  61.6  0.00000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.387099 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1102  tetratricopeptide TPR_2  35.4 
 
 		 1507 aa  61.6  0.00000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4362  tetratricopeptide TPR_2  21.51 
 
 		 725 aa  61.6  0.00000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.714509 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3620  Tetratricopeptide domain protein  31.51 
 
 		 950 aa  61.6  0.00000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3223  hypothetical protein  31.49 
 
 		 447 aa  61.2  0.00000009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.758214  normal  0.108052 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1804  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  24.92 
 
 		 1186 aa  60.5  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1300  TPR repeat-containing protein  25.37 
 
 		 878 aa  60.1  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0820  hypothetical protein  24.73 
 
 		 1212 aa  60.1  0.0000002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.826533 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3057  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  31.61 
 
 		 904 aa  59.3  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.249484 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3265  hypothetical protein  29.81 
 
 		 845 aa  59.3  0.0000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.463161  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3637  TPR repeat-containing protein  22.94 
 
 		 1285 aa  59.7  0.0000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_03421  hypothetical protein  29.17 
 
 		 418 aa  58.5  0.0000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.634587 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3488  tetratricopeptide region  26.67 
 
 		 840 aa  57.4  0.000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1376  TPR repeat-containing protein  21.24 
 
 		 1261 aa  57.8  0.000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0670144  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0791  TPR repeat-containing protein  23.53 
 
 		 1063 aa  57  0.000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0118647  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3130  TPR repeat-containing protein  27.07 
 
 		 408 aa  57.4  0.000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000180384 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0229  tetratricopeptide TPR_3  22.16 
 
 		 689 aa  57  0.000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1066  diguanylate cyclase and serine/threonine protein kinase with TPR repeats  22.12 
 
 		 609 aa  56.6  0.000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.94417  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3695  Tetratricopeptide TPR_4  22.19 
 
 		 1914 aa  57  0.000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.174493 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1328  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  25.91 
 
 		 810 aa  56.6  0.000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.929548  normal  0.0143336 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2707  glycosyl transferase family protein  22.61 
 
 		 1486 aa  55.8  0.000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.228337 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2565  TPR repeat-containing protein  26.74 
 
 		 851 aa  55.5  0.000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0158  hypothetical protein  28.83 
 
 		 1142 aa  55.8  0.000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0765  tetratricopeptide TPR_2  21.4 
 
 		 1180 aa  55.5  0.000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.82828  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2859  sulfotransferase  24.89 
 
 		 832 aa  55.5  0.000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.398491 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4460  TPR repeat-containing protein  22.03 
 
 		 1247 aa  55.8  0.000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0317978  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0409  TPR repeat-containing protein  25.5 
 
 		 851 aa  55.5  0.000005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.613133  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1265  hypothetical protein  32.84 
 
 		 553 aa  55.5  0.000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0292259  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1546  TPR repeat-containing protein  30.24 
 
 		 1779 aa  54.3  0.00001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.362162  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0256  TPR repeat-containing protein  23.92 
 
 		 1298 aa  53.1  0.00002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.636433  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0475  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  20.72 
 
 		 1279 aa  52.8  0.00003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.894605  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2256  TPR repeat-containing adenylate/guanylate cyclase  24.29 
 
 		 1295 aa  52.8  0.00003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0415  histidine kinase  36.47 
 
 		 600 aa  52.4  0.00004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011691  PHATRDRAFT_49558  predicted protein  22.5 
 
 		 1106 aa  52  0.00005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.022156  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0054  TPR repeat-containing protein  26.44 
 
 		 885 aa  52  0.00005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.494605 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1300  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  24.41 
 
 		 771 aa  52  0.00005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5642  Tetratricopeptide TPR_4  26.62 
 
 		 725 aa  52  0.00005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00884597 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2636  transcriptional regulator, SARP family  25.27 
 
 		 928 aa  52  0.00005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.1023  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>