More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shel_19990 on replicon NC_013165
Organism: Slackia heliotrinireducens DSM 20476



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013165  Shel_19990  small-conductance mechanosensitive channel  100 
 
 		 264 aa  527  1e-149  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2569  MscS Mechanosensitive ion channel  47.73 
 
 		 321 aa  243  1.9999999999999999e-63  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1106  small-conductance mechanosensitive channel  33.47 
 
 		 265 aa  145  7.0000000000000006e-34  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_08200  small-conductance mechanosensitive channel  40.09 
 
 		 257 aa  145  1e-33  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.335106 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0383  MscS Mechanosensitive ion channel  33.61 
 
 		 260 aa  110  2.0000000000000002e-23  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2357  hypothetical protein  36.52 
 
 		 348 aa  104  2e-21  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.116724  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1124  MscS Mechanosensitive ion channel  33.1 
 
 		 345 aa  83.2  0.000000000000004  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.745547  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0617  MscS mechanosensitive ion channel  29.1 
 
 		 338 aa  80.9  0.00000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.210835  normal  0.752053 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1210  MscS mechanosensitive ion channel  40 
 
 		 344 aa  80.9  0.00000000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.224237  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1895  MscS Mechanosensitive ion channel  36.73 
 
 		 348 aa  80.1  0.00000000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000167428  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1649  MscS Mechanosensitive ion channel  25.9 
 
 		 256 aa  76.6  0.0000000000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1752  MscS Mechanosensitive ion channel  37.5 
 
 		 356 aa  74.3  0.000000000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1647  MscS Mechanosensitive ion channel  27.09 
 
 		 429 aa  72.4  0.000000000008  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1856  hypothetical protein  31.76 
 
 		 281 aa  70.9  0.00000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.130527  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3246  MscS mechanosensitive ion channel  29.33 
 
 		 381 aa  70.5  0.00000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00298811  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2332  MscS Mechanosensitive ion channel  29.21 
 
 		 362 aa  70.5  0.00000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2295  mechanosensitive ion channel family protein  31.33 
 
 		 289 aa  70.1  0.00000000004  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0207  MscS Mechanosensitive ion channel  27.65 
 
 		 283 aa  69.7  0.00000000005  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2594  MscS mechanosensitive ion channel  34.09 
 
 		 388 aa  69.3  0.00000000006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2568  MscS mechanosensitive ion channel  29.41 
 
 		 358 aa  69.3  0.00000000006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1153  MscS Mechanosensitive ion channel  35.24 
 
 		 352 aa  69.3  0.00000000006  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2696  MscS Mechanosensitive ion channel  27.17 
 
 		 369 aa  69.3  0.00000000007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.415509  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2985  hypothetical protein  32.93 
 
 		 351 aa  68.9  0.00000000008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0299284  normal  0.0305677 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1546  cyclic nucleotide-regulated small mechanosensitive ion channel  29.08 
 
 		 479 aa  68.6  0.00000000009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.514924  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II1036  putative mechanosensitive ion channel protein  28.67 
 
 		 534 aa  68.6  0.0000000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0951  MscS Mechanosensitive ion channel  25.71 
 
 		 341 aa  67.4  0.0000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1250  MscS mechanosensitive ion channel  33.98 
 
 		 361 aa  67.8  0.0000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.00000000000414305  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3521  MscS mechanosensitive ion channel  31.69 
 
 		 547 aa  67  0.0000000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03115  MscS Mechanosensitive ion channel  30.6 
 
 		 378 aa  66.2  0.0000000005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0773  MscS mechanosensitive ion channel  29.93 
 
 		 401 aa  66.2  0.0000000005  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002898  small-conductance mechanosensitive channel  29.38 
 
 		 532 aa  65.9  0.0000000006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.341732  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4007  MscS mechanosensitive ion channel  35.25 
 
 		 376 aa  65.9  0.0000000006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0987654  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4427  MscS Mechanosensitive ion channel  38.54 
 
 		 349 aa  65.9  0.0000000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0238849  normal  0.125106 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1093  MscS Mechanosensitive ion channel  27.23 
 
 		 389 aa  65.9  0.0000000007  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.464677  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03062  hypothetical protein  29.81 
 
 		 563 aa  65.5  0.0000000008  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2171  MscS mechanosensitive ion channel  38.24 
 
 		 374 aa  65.5  0.0000000009  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.920192  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1146  MscS mechanosensitive ion channel  29.09 
 
 		 366 aa  65.1  0.000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.779955  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0767  small-conductance mechanosensitive ion channel  29.93 
 
 		 401 aa  65.1  0.000000001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.967765  normal  0.366005 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1247  MscS Mechanosensitive ion channel  30.99 
 
 		 370 aa  64.7  0.000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2393  MscS Mechanosensitive ion channel  29.61 
 
 		 408 aa  64.7  0.000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3016  MscS mechanosensitive ion channel  34.69 
 
 		 426 aa  65.1  0.000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3357  MscS Mechanosensitive ion channel  35.25 
 
 		 376 aa  64.7  0.000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2451  small-conductance mechanosensitive channel  32.41 
 
 		 380 aa  64.7  0.000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0015  MscS mechanosensitive ion channel  28.14 
 
 		 287 aa  65.1  0.000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0691  MscS Mechanosensitive ion channel  34.71 
 
 		 362 aa  65.1  0.000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4932  MscS Mechanosensitive ion channel  35.11 
 
 		 400 aa  64.7  0.000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3360  hypothetical protein  39.22 
 
 		 374 aa  64.3  0.000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3649  mechanosensitive ion channel family protein  36.08 
 
 		 374 aa  64.7  0.000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.158368  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4608  MscS mechanosensitive ion channel  34.71 
 
 		 386 aa  64.7  0.000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.247282  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1822  MscS mechanosensitive ion channel  36.08 
 
 		 374 aa  64.3  0.000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.00396347  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2398  MscS mechanosensitive ion channel  39.22 
 
 		 374 aa  64.3  0.000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0108  MscS mechanosensitive ion channel  32.59 
 
 		 291 aa  64.3  0.000000002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1888  MscS Mechanosensitive ion channel  29.55 
 
 		 362 aa  64.3  0.000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3719  MscS mechanosensitive ion channel  30.46 
 
 		 538 aa  63.9  0.000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00173633  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1701  phosphoglycerate mutase  28.5 
 
 		 310 aa  63.5  0.000000003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2740  MscS mechanosensitive ion channel  30.99 
 
 		 288 aa  63.9  0.000000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1066  MscS Mechanosensitive ion channel  30.95 
 
 		 261 aa  62.8  0.000000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0514  MscS Mechanosensitive ion channel  25.33 
 
 		 288 aa  63.2  0.000000005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2065  MscS mechanosensitive ion channel  39.39 
 
 		 359 aa  62.8  0.000000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0613  MscS mechanosensitive ion channel  31.16 
 
 		 547 aa  62.8  0.000000006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000873032  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0227  MscS mechanosensitive ion channel  24.81 
 
 		 268 aa  62.8  0.000000006  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0390  MscS mechanosensitive ion channel  28.57 
 
 		 274 aa  62.4  0.000000007  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.855015  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4194  MscS mechanosensitive ion channel  32.65 
 
 		 562 aa  62.4  0.000000007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.674763 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3145  mechanosensitive ion channel  29.25 
 
 		 544 aa  62  0.000000008  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.187903  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0172  MscS mechanosensitive ion channel  35.58 
 
 		 375 aa  62  0.000000009  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0430239  normal  0.753414 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0226  cyclic nucleotide-regulated small mechanosensitive ion channel  29.94 
 
 		 473 aa  62  0.000000009  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.512445  normal  0.203081 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4338  MscS mechanosensitive ion channel  30.43 
 
 		 533 aa  61.6  0.00000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2612  MscS mechanosensitive ion channel  31.78 
 
 		 273 aa  61.6  0.00000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4048  MscS mechanosensitive ion channel  29.55 
 
 		 569 aa  61.6  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.138882  normal  0.12233 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2229  MscS Mechanosensitive ion channel  30.93 
 
 		 400 aa  61.6  0.00000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.224666  normal  0.568068 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1770  MscS mechanosensitive ion channel  32.26 
 
 		 406 aa  61.2  0.00000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1853  MscS mechanosensitive ion channel  26.06 
 
 		 290 aa  60.8  0.00000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1350  hypothetical protein  32.69 
 
 		 292 aa  60.8  0.00000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.136839  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1916  MscS mechanosensitive ion channel  30.52 
 
 		 308 aa  60.8  0.00000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.944422 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1500  MscS mechanosensitive ion channel  36.78 
 
 		 614 aa  60.8  0.00000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.638706  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0247  mechanosensitive ion channel family protein  27.08 
 
 		 378 aa  61.2  0.00000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12461  transmembrane protein  30.3 
 
 		 481 aa  60.5  0.00000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0905  MscS Mechanosensitive ion channel  31.63 
 
 		 373 aa  60.5  0.00000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.285162  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4090  MscS mechanosensitive ion channel  29.61 
 
 		 349 aa  60.5  0.00000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3612  MscS Mechanosensitive ion channel  36.63 
 
 		 374 aa  60.1  0.00000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.649067 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1633  hypothetical protein  28.57 
 
 		 364 aa  60.1  0.00000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.246622  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0042  MscS Mechanosensitive ion channel  31.58 
 
 		 375 aa  59.7  0.00000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.634821  normal  0.103785 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01752  putative mechanosensitive channel protein (MscS family)  30.19 
 
 		 328 aa  60.1  0.00000004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.249612  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1797  mechanosensitive ion channel  27.27 
 
 		 561 aa  60.1  0.00000004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.433096  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4003  MscS mechanosensitive ion channel  27.82 
 
 		 362 aa  59.7  0.00000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0737574  normal  0.463755 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0707  MscS Mechanosensitive ion channel  31 
 
 		 344 aa  59.7  0.00000004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000854556  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2712  cyclic nucleotide-regulated small mechanosensitive ion channel  28.39 
 
 		 507 aa  60.1  0.00000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0470198  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0886  MscS mechanosensitive ion channel  24.86 
 
 		 259 aa  60.1  0.00000004  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.36483  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0883  MscS mechanosensitive ion channel  28 
 
 		 380 aa  60.1  0.00000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.199191 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4689  MscS Mechanosensitive ion channel  36.63 
 
 		 374 aa  60.1  0.00000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.106899 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0253  mechanosensitive ion channel family protein  26.39 
 
 		 378 aa  59.7  0.00000004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3200  MscS mechanosensitive ion channel  34.04 
 
 		 590 aa  59.7  0.00000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0940  MscS mechanosensitive ion channel  28.4 
 
 		 275 aa  59.3  0.00000006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.546965 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0057  MscS Mechanosensitive ion channel  32.14 
 
 		 421 aa  59.3  0.00000006  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.185804  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1801  MscS Mechanosensitive ion channel  34.74 
 
 		 335 aa  58.9  0.00000007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1852  MscS Mechanosensitive ion channel  26.79 
 
 		 344 aa  58.9  0.00000008  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.390235  normal  1 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0460  transporter, small conductance mechanosensitive ion channel (MscS) family protein  29.88 
 
 		 280 aa  58.9  0.00000008  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  decreased coverage  0.00313509  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1942  MscS mechanosensitive ion channel  38.64 
 
 		 360 aa  58.9  0.00000008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1784  mechanosensitive ion channel family protein  25.43 
 
 		 891 aa  58.9  0.00000008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2137  MscS mechanosensitive ion channel  38.64 
 
 		 288 aa  58.9  0.00000008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.857102  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>