147 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shel_14100 on replicon NC_013165
Organism: Slackia heliotrinireducens DSM 20476



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004578  PSPTO_0037  helicase domain protein  41.11 
 
 		 1636 aa  1215    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.527167  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_14100  predicted helicase  100 
 
 		 1847 aa  3828    Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.605074  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0380  DEAD/DEAH box helicase-like  43.24 
 
 		 1301 aa  744    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.145583  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3143  helicase domain-containing protein  43.34 
 
 		 1063 aa  859    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.833808  n/a   
 
 
-
 
NC_008507  LACR_E6  superfamily II DNA/RNA helicase  39.09 
 
 		 1560 aa  1069    Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4323  type III restriction enzyme, res subunit  43.12 
 
 		 1613 aa  1261    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2642  type III restriction protein res subunit  41.42 
 
 		 1632 aa  1184    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0578  type III restriction enzyme, res subunit  44.55 
 
 		 1609 aa  1322    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0102  adenine specific DNA methyltransferase, putative  42.59 
 
 		 1615 aa  1235    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.675246  hitchhiker  0.0000128241 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1937  superfamily II DNA/RNA helicase  34.65 
 
 		 1024 aa  529  1e-148  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00156892  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2194  superfamily II DNA/RNA helicase  34.99 
 
 		 1021 aa  525  1e-147  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1662  adenine specific DNA methyltransferase  33.76 
 
 		 1005 aa  481  1e-134  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3139  helicase domain-containing protein  37.59 
 
 		 576 aa  377  1e-102  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_00521  hypothetical protein  33.01 
 
 		 1341 aa  327  2e-87  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_00371  hypothetical protein  33.28 
 
 		 977 aa  311  1.0000000000000001e-82  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_00541  hypothetical protein  31.72 
 
 		 921 aa  283  3e-74  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0378  helicase domain-containing protein  36.07 
 
 		 475 aa  280  1e-73  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0602  helicase, putative  29.44 
 
 		 1004 aa  271  8e-71  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5507  type III restriction enzyme, res subunit  40.41 
 
 		 301 aa  198  1e-48  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000769547 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0752  hypothetical protein  39.15 
 
 		 250 aa  194  1e-47  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0748  hypothetical protein  38.91 
 
 		 252 aa  186  4.0000000000000006e-45  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.0000000117718 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5505  helicase-associated  32.4 
 
 		 871 aa  169  5.9999999999999996e-40  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000739697 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1350  hypothetical protein  41.8 
 
 		 221 aa  149  7.0000000000000006e-34  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.588656  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3195  adenine specific DNA methyltransferase  24.96 
 
 		 1125 aa  137  1.9999999999999998e-30  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  unclonable  0.000607783  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1765  hypothetical protein  25.88 
 
 		 1098 aa  124  9.999999999999999e-27  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1196  adenine specific DNA methyltransferase  22.87 
 
 		 1059 aa  123  3.9999999999999996e-26  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  unclonable  0.0000965363  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0310  D12 class N6 adenine-specific DNA methyltransferase, putative  22.44 
 
 		 1116 aa  117  2.0000000000000002e-24  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0925  adenine specific DNA methyltransferase  23.16 
 
 		 1049 aa  115  7.000000000000001e-24  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  decreased coverage  0.00490448  normal  0.369503 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0340  adenine specific DNA methyltransferase  24.09 
 
 		 1064 aa  112  7.000000000000001e-23  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.0570393 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0066  hypothetical protein  34.52 
 
 		 165 aa  108  1e-21  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0499  D12 class N6 adenine-specific DNA methyltransferase, putative  22.02 
 
 		 1047 aa  91.3  2e-16  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3803  helicase-like protein  26.33 
 
 		 1176 aa  79.7  0.0000000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.230182  hitchhiker  0.00335378 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2721  putative DNA methyltransferase  23.62 
 
 		 1121 aa  76.3  0.000000000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0964  helicase domain-containing protein  41.38 
 
 		 84 aa  75.5  0.000000000009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.317266  normal  0.503328 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1102  putative DNA methyltransferase  23.38 
 
 		 1100 aa  74.7  0.00000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.822518  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1255  DEAD/DEAH box helicase  22.15 
 
 		 811 aa  67  0.000000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.171092  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2313  type III restriction protein res subunit  24.18 
 
 		 706 aa  66.6  0.000000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010507  Mrad2831_6521  type III restriction protein res subunit  26.32 
 
 		 462 aa  65.9  0.000000008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1920  type III restriction enzyme, res subunit  25.71 
 
 		 946 aa  64.7  0.00000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2052  type III restriction protein res subunit  20.97 
 
 		 489 aa  62.8  0.00000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2026  type III restriction protein res subunit  21.17 
 
 		 489 aa  62.8  0.00000007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2683  type III restriction enzyme, res subunit  22.92 
 
 		 1149 aa  62.4  0.00000008  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0219186  normal  0.206239 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2125  Type III restriction enzyme, res subunit  22.6 
 
 		 842 aa  62  0.0000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1686  type III restriction enzyme, res subunit  23.97 
 
 		 698 aa  60.8  0.0000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.025526  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0902  Type I site-specific restriction-modification system, R (restriction) subunit related helicase  23.5 
 
 		 1113 aa  60.1  0.0000004  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.164801  hitchhiker  0.00000563993 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5510  putative DNA methyltransferase  22.32 
 
 		 555 aa  60.1  0.0000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.113009  normal  0.19164 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1030  type III restriction enzyme, res subunit  24.43 
 
 		 893 aa  59.7  0.0000006  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0182402  normal  0.455384 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1350  type III restriction protein res subunit  23.38 
 
 		 967 aa  59.3  0.0000006  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.810752  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2475  type III restriction protein res subunit  23.45 
 
 		 475 aa  59.3  0.0000007  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0815969  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1359  helicase, putative  24.34 
 
 		 1041 aa  58.9  0.0000008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2695  helicase, C-terminal:Type III restriction enzyme, res subunit:DEAD/DEAH box helicase, N-terminal  24.7 
 
 		 504 aa  58.2  0.000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.089972  hitchhiker  0.000356695 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1942  type III restriction enzyme, res subunit  23.01 
 
 		 469 aa  58.5  0.000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.823738  normal  0.0282791 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_11440  DNA/RNA helicase, superfamily II  23.86 
 
 		 974 aa  58.9  0.000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.000321567  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0388  type III restriction protein res subunit  25.06 
 
 		 907 aa  58.5  0.000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000267171 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2593  type III restriction protein res subunit  21.15 
 
 		 493 aa  58.2  0.000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2941  type III restriction protein res subunit  22.98 
 
 		 815 aa  57.8  0.000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3225  EcoEI R domain-containing protein  22.65 
 
 		 815 aa  58.2  0.000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.376811  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1575  type I restriction-modification system, R subunit  22.49 
 
 		 760 aa  57.8  0.000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4190  type III restriction protein res subunit  24.21 
 
 		 1233 aa  57.8  0.000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8756  type III restriction enzyme, res subunit  20.55 
 
 		 1028 aa  57.8  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.999301  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1475  type I restriction-modification system, R subunit  24.45 
 
 		 761 aa  57.4  0.000002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0357  type III restriction protein res subunit  23.13 
 
 		 1053 aa  57  0.000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0344  type I restriction-modification system, R subunit  21.72 
 
 		 770 aa  56.6  0.000004  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  decreased coverage  0.00000108762  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0035  superfamily II DNA/RNA helicase  22.52 
 
 		 949 aa  56.6  0.000004  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0259774  normal  1 
 
 
-
 
NC_009974  Haur_5278  type III restriction protein res subunit  25.55 
 
 		 899 aa  56.6  0.000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0226  type III restriction protein res subunit  22.49 
 
 		 760 aa  56.6  0.000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2990  EcoEI R domain protein  24.62 
 
 		 875 aa  56.2  0.000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2034  type III restriction protein res subunit  23.97 
 
 		 813 aa  55.8  0.000007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0810  DEAD/DEAH box helicase-like  22.3 
 
 		 797 aa  55.8  0.000008  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.135985  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1637  Type I site-specific deoxyribonuclease  22.12 
 
 		 804 aa  55.8  0.000008  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  hitchhiker  0.000133951  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0150  type III restriction enzyme, res subunit  21.52 
 
 		 860 aa  55.1  0.00001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4932  type I restriction enzyme EcoKI subunit R  21.07 
 
 		 1169 aa  55.5  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0616  Type I site-specific deoxyribonuclease  19.73 
 
 		 783 aa  54.3  0.00002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17070  DNA/RNA helicase, superfamily II  23.32 
 
 		 1031 aa  53.9  0.00003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2499  DEAD/DEAH box helicase-like  22.62 
 
 		 793 aa  53.9  0.00003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0539678  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1537  type III restriction protein res subunit  21.36 
 
 		 776 aa  53.9  0.00003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2199  Type III restriction enzyme, res subunit  23.04 
 
 		 492 aa  53.5  0.00004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.216053 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1537  type III restriction enzyme, res subunit  23.3 
 
 		 732 aa  53.1  0.00004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3568  type III restriction protein res subunit  22.15 
 
 		 802 aa  53.5  0.00004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.427174  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl314  DNA repair DNA/RNA helicase  23.1 
 
 		 905 aa  53.1  0.00005  Mesoplasma florum L1  Bacteria  decreased coverage  4.84028e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_009043  PICST_88383  ATP-dependent DNA helicase  30.36 
 
 		 385 aa  53.1  0.00005  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3535  hypothetical protein  22.24 
 
 		 815 aa  53.1  0.00005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.115476  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03609  Type I site-specific restriction-modification system, R (restriction) subunit and related helicase  30.41 
 
 		 1141 aa  53.1  0.00005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0516  type I restriction-modification system R subunit (endonuclease)  22.88 
 
 		 1115 aa  52.4  0.00008  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1432  type III restriction protein, res subunit  23.01 
 
 		 1108 aa  52.4  0.00008  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0785  EcoEI R domain-containing protein  21.55 
 
 		 791 aa  52.4  0.00008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.519017  normal  0.352411 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04062  type I site-specific restriction-modification system, R (restriction) subunit  23.24 
 
 		 796 aa  52.4  0.00008  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0821  type III restriction protein res subunit  23.36 
 
 		 1042 aa  51.6  0.0001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0473136 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0197  type III restriction protein res subunit  30.52 
 
 		 1125 aa  51.6  0.0001  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000621753 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1258  type III restriction protein res subunit  23.25 
 
 		 787 aa  52  0.0001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.377183  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1193  EcoEI R domain protein  21.95 
 
 		 827 aa  52  0.0001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.325861  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2618  EcoEI R domain-containing protein  21.79 
 
 		 817 aa  51.2  0.0002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0707543 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3307  type III restriction protein res subunit  21.58 
 
 		 536 aa  51.2  0.0002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06707  DEAD/DEAH box helicase, putative (AFU_orthologue; AFUA_7G05530)  31.46 
 
 		 643 aa  50.4  0.0003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013206  Aaci_3020  type III restriction protein res subunit  40.3 
 
 		 581 aa  50.8  0.0003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2492  type III restriction protein res subunit  25 
 
 		 1066 aa  50.8  0.0003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.964  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0352  EcoEI R domain-containing protein  20.87 
 
 		 791 aa  50.8  0.0003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2481  type III restriction enzyme, res subunit  21.35 
 
 		 706 aa  50.4  0.0003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.839221  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0759  type III restriction protein res subunit  22.95 
 
 		 812 aa  50.4  0.0003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.535387  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1670  type I restriction enzyme EcoKI subunit R  22.01 
 
 		 1169 aa  50.4  0.0003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.225795  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>