More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sde_3737 on replicon NC_007912
Organism: Saccharophagus degradans 2-40



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007912  Sde_3737  NADH dehydrogenase  100 
 
 		 221 aa  465  9.999999999999999e-131  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0408  nitroreductase  53.88 
 
 		 223 aa  265  2.9999999999999995e-70  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.341785  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0222  putative nitroreductase  46.4 
 
 		 229 aa  207  1e-52  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7105  nitroreductase  45.29 
 
 		 229 aa  202  3e-51  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0573  nitroreductase family protein  43.32 
 
 		 228 aa  202  3e-51  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1203  nitroreductase  46.15 
 
 		 231 aa  199  3e-50  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000186245  normal  0.254827 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2908  nitroreductase  45.62 
 
 		 239 aa  199  3.9999999999999996e-50  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3352  nitroreductase  44.55 
 
 		 233 aa  194  1e-48  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1938  nitroreductase  41.26 
 
 		 235 aa  193  2e-48  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.255877  hitchhiker  0.00446173 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1610  nitroreductase  41.89 
 
 		 235 aa  190  1e-47  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.367755  normal  0.918275 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3085  nitroreductase  41.78 
 
 		 258 aa  189  2.9999999999999997e-47  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.0000834764  normal  0.027265 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6301  nitroreductase  45.37 
 
 		 245 aa  188  5.999999999999999e-47  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.540366  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1410  nitroreductase  42.48 
 
 		 231 aa  188  5.999999999999999e-47  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5783  nitroreductase  43.24 
 
 		 254 aa  187  9e-47  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1615  nitroreductase  40.71 
 
 		 257 aa  187  9e-47  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  0.00251246  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3047  nitroreductase  44.8 
 
 		 239 aa  187  1e-46  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.496767  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2073  nitroreductase  44.24 
 
 		 242 aa  187  1e-46  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6027  nitroreductase  43.24 
 
 		 254 aa  187  1e-46  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0926  nitroreductase  44.49 
 
 		 223 aa  187  1e-46  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5940  nitroreductase  44.59 
 
 		 237 aa  186  2e-46  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.118292  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2436  nitroreductase  44.34 
 
 		 242 aa  186  2e-46  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3050  nitroreductase  44.34 
 
 		 242 aa  186  2e-46  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.908871  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4912  nitroreductase  44.55 
 
 		 247 aa  185  5e-46  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3657  nitrobenzoate reductase, putative  43.24 
 
 		 224 aa  185  6e-46  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.583331  normal  0.143139 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3069  nitroreductase  44.34 
 
 		 242 aa  185  6e-46  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.394271 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6397  nitroreductase  43.44 
 
 		 242 aa  184  8e-46  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2142  nitroreductase  41.78 
 
 		 236 aa  184  1.0000000000000001e-45  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.000000385966  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0345  nitroreductase  42.59 
 
 		 228 aa  183  2.0000000000000003e-45  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.196416  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6222  nitroreductase  42.79 
 
 		 246 aa  182  4.0000000000000006e-45  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2263  nitroreductase  42.13 
 
 		 224 aa  180  1e-44  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00513133 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0682  nitroreductase  42.79 
 
 		 249 aa  180  1e-44  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00504715  normal  0.337771 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1608  oxidoreductase protein  40.36 
 
 		 235 aa  180  2e-44  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.000515625  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47250  Nitroreductase  42.73 
 
 		 224 aa  178  4.999999999999999e-44  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1481  nitroreductase  43.26 
 
 		 236 aa  177  2e-43  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2969  nitroreductase  39.72 
 
 		 235 aa  170  2e-41  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.788882  normal  0.0360376 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2012  nitroreductase  39.27 
 
 		 223 aa  166  4e-40  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.142493  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3982  nitroreductase  38.36 
 
 		 233 aa  164  9e-40  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3607  nitroreductase  39.55 
 
 		 223 aa  158  8e-38  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.127181  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2388  nitroreductase  36.32 
 
 		 226 aa  157  1e-37  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6984  nitroreductase  37.79 
 
 		 229 aa  157  1e-37  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.795076  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1917  nitroreductase  38.91 
 
 		 225 aa  157  1e-37  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.805688  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3999  nitroreductase  37.67 
 
 		 223 aa  155  4e-37  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2041  nitroreductase  33.03 
 
 		 220 aa  155  4e-37  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.505491  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8469  nitroreductase  41.12 
 
 		 240 aa  155  5.0000000000000005e-37  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0519  nitroreductase  35.59 
 
 		 225 aa  155  5.0000000000000005e-37  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  decreased coverage  0.000999564  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5454  nitroreductase  37.39 
 
 		 221 aa  154  7e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.111331  normal  0.0192138 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5185  nitroreductase  37.61 
 
 		 221 aa  154  8e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0863183  normal  0.13215 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2316  nitroreductase  41.31 
 
 		 232 aa  153  2e-36  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.999623  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4604  nitroreductase  35.94 
 
 		 241 aa  151  7e-36  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.278026  normal  0.441291 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1213  nitroreductase  37.1 
 
 		 221 aa  150  2e-35  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.718567 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3603  nitroreductase  41.18 
 
 		 232 aa  149  4e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0181645  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1543  nitroreductase  40.38 
 
 		 232 aa  148  6e-35  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.973718  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7115  hypothetical protein  38.6 
 
 		 215 aa  146  3e-34  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0966  nitroreductase  38.57 
 
 		 219 aa  145  6e-34  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.247672  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1048  nitroreductase  37.96 
 
 		 219 aa  144  7.0000000000000006e-34  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.043093 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1690  nitroreductase  36.07 
 
 		 230 aa  144  8.000000000000001e-34  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2199  nitroreductase  37.85 
 
 		 231 aa  142  4e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.396094  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2312  nitroreductase  37.22 
 
 		 220 aa  142  5e-33  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.501363  normal  0.270967 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5013  nitroreductase  33.94 
 
 		 222 aa  142  5e-33  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4924  nitroreductase  33.94 
 
 		 222 aa  142  5e-33  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0170  nitroreductase  33.33 
 
 		 221 aa  140  9.999999999999999e-33  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.834926  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5417  nitroreductase  35.29 
 
 		 226 aa  140  1.9999999999999998e-32  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5306  nitroreductase  33.49 
 
 		 222 aa  139  3e-32  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0200  nitroreductase  37.32 
 
 		 225 aa  137  1e-31  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.878675  normal  0.802011 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1911  nitroreductase  36.07 
 
 		 232 aa  134  9.999999999999999e-31  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5984  nitroreductase  35.47 
 
 		 228 aa  129  3e-29  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0282838  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5533  nitroreductase  34.42 
 
 		 230 aa  125  6e-28  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4839  nitroreductase  33.33 
 
 		 238 aa  124  1e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0536307  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4473  nitroreductase  34.25 
 
 		 225 aa  120  1.9999999999999998e-26  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3698  nitroreductase  31.63 
 
 		 231 aa  120  1.9999999999999998e-26  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2168  nitroreductase  28.64 
 
 		 224 aa  115  6e-25  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1036  nitroreductase  31.25 
 
 		 241 aa  115  6.9999999999999995e-25  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0710283 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6296  nitroreductase  33.33 
 
 		 228 aa  114  8.999999999999998e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.214758  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1408  nitroreductase  30.8 
 
 		 217 aa  107  1e-22  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1973  nitroreductase  28.44 
 
 		 244 aa  105  4e-22  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3141  nitroreductase  28.12 
 
 		 237 aa  104  9e-22  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7293  nitroreductase  29.38 
 
 		 228 aa  104  1e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.367017 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01216  putative oxidoreductase  29.28 
 
 		 223 aa  103  2e-21  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.711869  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2473  nitroreductase  27.68 
 
 		 235 aa  99.8  3e-20  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0563773  normal  0.616707 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3631  nitroreductase  28.14 
 
 		 225 aa  95.5  5e-19  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1327  nitroreductase family protein  28.44 
 
 		 270 aa  93.6  2e-18  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0563  p-nitrobenzoate reductase  27.57 
 
 		 218 aa  93.6  2e-18  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.000325568  hitchhiker  0.0000528283 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1796  nitroreductase  28.51 
 
 		 227 aa  92.8  4e-18  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.539857  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2325  nitroreductase  29 
 
 		 234 aa  91.3  1e-17  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.278176  normal  0.241368 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0723  p-nitrobenzoate reductase  28.12 
 
 		 221 aa  88.2  8e-17  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0055643  normal  0.275976 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0024  hypothetical protein  27.19 
 
 		 225 aa  87  2e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.369937  normal  0.267873 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0556  nitroreductase  31.68 
 
 		 345 aa  83.6  0.000000000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1205  nitroreductase  26.36 
 
 		 229 aa  84  0.000000000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3154  nitroreductase  28.14 
 
 		 225 aa  80.9  0.00000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.297718  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1474  nitroreductase  30.43 
 
 		 334 aa  75.1  0.0000000000007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1834  nitroreductase  27.8 
 
 		 190 aa  71.2  0.00000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000154259  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1207  nitroreductase  50.91 
 
 		 165 aa  70.5  0.00000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0777981  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2684  nitroreductase  26.82 
 
 		 178 aa  68.2  0.00000000009  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0019  nitroreductase  27.86 
 
 		 196 aa  67.4  0.0000000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0921  nitroreductase  30.95 
 
 		 204 aa  65.5  0.0000000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000239248  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0973  nitroreductase  29.38 
 
 		 348 aa  65.5  0.0000000006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0116  nitroreductase  26.57 
 
 		 252 aa  63.5  0.000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1448  nitroreductase  28.51 
 
 		 170 aa  63.5  0.000000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0908  nitroreductase  25.74 
 
 		 168 aa  63.2  0.000000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0372  nitroreductase  28.57 
 
 		 178 aa  62.8  0.000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>