146 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SO_2195 on replicon NC_004347
Organism: Shewanella oneidensis MR-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004347  SO_2195  inter-alpha-trypsin inhibitor domain-containing protein  100 
 
 		 760 aa  1559    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2200  vault protein inter-alpha-trypsin subunit  82.88 
 
 		 759 aa  1239    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2277  vault protein inter-alpha-trypsin subunit  84.04 
 
 		 755 aa  1264    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0645539  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2410  vault protein inter-alpha-trypsin subunit  83.49 
 
 		 751 aa  1251    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.177672  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1843  vault protein inter-alpha-trypsin subunit  69.99 
 
 		 771 aa  1056    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.327396  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1739  cell wall anchor domain-containing protein  68.5 
 
 		 757 aa  1044    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.491148  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1829  vault protein inter-alpha-trypsin subunit  70.28 
 
 		 772 aa  1060    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0709098  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2516  cell wall anchor domain-containing protein  48.55 
 
 		 789 aa  640    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.27375  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1877  cell wall anchor domain-containing protein  70.12 
 
 		 771 aa  1061    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.581761  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2124  cell wall anchor domain-containing protein  50.66 
 
 		 739 aa  647    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0949935  normal  0.0697413 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2448  LPXTG-motif cell wall anchor domain protein  70.28 
 
 		 772 aa  1072    Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0017334  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2492  vault protein inter-alpha-trypsin subunit  47.83 
 
 		 770 aa  622  1e-177  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0368823  normal  0.695275 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1625  vault protein inter-alpha-trypsin subunit  46.47 
 
 		 722 aa  600  1e-170  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.466384  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1793  vault protein inter-alpha-trypsin subunit  45.31 
 
 		 776 aa  559  1e-158  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.216106  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2003  inter-alpha-trypsin inhibitor domain-containing protein  38.57 
 
 		 753 aa  420  1e-116  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0804312  normal  0.260211 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2295  vault protein inter-alpha-trypsin subunit  38.17 
 
 		 755 aa  410  1e-113  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0122  inter-alpha-trypsin inhibitor domain-containing protein  36.46 
 
 		 763 aa  403  1e-111  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2998  Vault protein inter-alpha-trypsin domain protein  38.26 
 
 		 791 aa  400  9.999999999999999e-111  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.337723  normal  0.523415 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2150  vault protein inter-alpha-trypsin subunit  38.47 
 
 		 740 aa  397  1e-109  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.270447 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3922  vault protein inter-alpha-trypsin  35.66 
 
 		 701 aa  394  1e-108  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0664  hypothetical protein  37.75 
 
 		 755 aa  387  1e-106  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.101783 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2738  Vault protein inter-alpha-trypsin domain protein  36.99 
 
 		 794 aa  383  1e-105  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.67824  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3684  vault protein inter-alpha-trypsin subunit  36.22 
 
 		 712 aa  382  1e-104  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009672  Oant_4846  cell wall anchor domain-containing protein  36.63 
 
 		 750 aa  379  1e-104  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.818339  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5132  cell wall anchor domain-containing protein  37.2 
 
 		 761 aa  379  1e-103  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.137427 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1395  LPXTG-motif cell wall anchor domain protein  35.75 
 
 		 723 aa  361  2e-98  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.670427  normal  0.959342 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1400  vault protein inter-alpha-trypsin subunit  37.07 
 
 		 732 aa  351  3e-95  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0242423 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1675  Vault protein inter-alpha-trypsin domain protein  37.05 
 
 		 738 aa  349  1e-94  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.461102 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5519  LPXTG-motif cell wall anchor domain protein  36.55 
 
 		 725 aa  341  2.9999999999999998e-92  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3379  von Willebrand factor type A domain-containing protein  32.11 
 
 		 786 aa  332  2e-89  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.976356  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5161  vault protein inter-alpha-trypsin subunit  37.29 
 
 		 729 aa  318  2e-85  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.997936  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1352  von Willebrand factor, type A  31.86 
 
 		 819 aa  293  6e-78  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0364534  normal  0.0483698 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4136  vault protein inter-alpha-trypsin subunit  32.41 
 
 		 1362 aa  293  7e-78  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00332177 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0140  hypothetical protein  31.08 
 
 		 711 aa  274  4.0000000000000004e-72  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0386904  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1325  vault protein inter-alpha-trypsin subunit  29.89 
 
 		 812 aa  249  1e-64  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.000380778  hitchhiker  0.00814208 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0028  vault protein inter-alpha-trypsin subunit  29.21 
 
 		 701 aa  249  1e-64  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.880979  normal  0.680993 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1994  Vault protein inter-alpha-trypsin domain protein  30.26 
 
 		 671 aa  247  6e-64  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.204714  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2742  hypothetical protein  29.39 
 
 		 774 aa  240  5.999999999999999e-62  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.603837  normal  0.495762 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0022  Vault protein inter-alpha-trypsin domain protein  28.68 
 
 		 691 aa  240  6.999999999999999e-62  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.112667  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4460  Vault protein inter-alpha-trypsin domain protein  34.34 
 
 		 1033 aa  235  2.0000000000000002e-60  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.743014  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1318  vault protein inter-alpha-trypsin domain-containing protein  28.86 
 
 		 796 aa  233  1e-59  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.287979 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4515  Vault protein inter-alpha-trypsin domain protein  29.49 
 
 		 795 aa  222  1.9999999999999999e-56  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2383  Vault protein inter-alpha-trypsin domain-containing protein  28.42 
 
 		 831 aa  217  7e-55  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.151834  hitchhiker  0.00156967 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2070  hypothetical protein  29.77 
 
 		 776 aa  216  1.9999999999999998e-54  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.849669  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1710  von Willebrand factor type A  27.21 
 
 		 840 aa  156  2e-36  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2129  von Willebrand factor type A  25.89 
 
 		 833 aa  147  8.000000000000001e-34  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2332  von Willebrand factor type A  29.8 
 
 		 775 aa  147  1e-33  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.161725 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3108  von Willebrand factor type A (vWA) domain-containing protein  21.92 
 
 		 713 aa  114  9e-24  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.0355813 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3690  vault protein inter-alpha-trypsin subunit  23.06 
 
 		 680 aa  107  8e-22  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4211  von Willebrand factor type A  28.02 
 
 		 415 aa  89.7  2e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.290242  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05364  von Willebrand domain protein (AFU_orthologue; AFUA_4G01160)  31.18 
 
 		 1109 aa  80.9  0.00000000000008  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.520514 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1806  vault protein inter-alpha-trypsin subunit  23.87 
 
 		 338 aa  76.6  0.000000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.825295  normal  0.327255 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3119  von Willebrand factor type A  30.39 
 
 		 393 aa  72.8  0.00000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0264  von Willebrand factor type A  28.26 
 
 		 418 aa  72.4  0.00000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0262  von Willebrand factor type A  28.26 
 
 		 418 aa  72.4  0.00000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0755  von Willebrand factor type A  28.12 
 
 		 418 aa  71.2  0.00000000007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.802956 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2244  von Willebrand factor, type A  28.32 
 
 		 416 aa  68.6  0.0000000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0785649  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2951  von Willebrand factor type A  23.61 
 
 		 418 aa  66.6  0.000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7173  von Willebrand factor type A  26.37 
 
 		 462 aa  67  0.000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00690211  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2768  von Willebrand factor, type A  26.58 
 
 		 412 aa  67.4  0.000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.271285  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3275  von Willebrand factor type A  28.76 
 
 		 419 aa  67  0.000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.112036 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4043  von Willebrand factor type A  24.06 
 
 		 423 aa  65.5  0.000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1307  von Willebrand factor, type A  26.32 
 
 		 418 aa  64.7  0.000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2394  von Willebrand factor type A  24.89 
 
 		 412 aa  64.3  0.000000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1843  von Willebrand factor, type A  26.48 
 
 		 420 aa  63.2  0.00000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.122736  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5207  von Willebrand factor type A  27.41 
 
 		 412 aa  62.8  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000146018 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4210  von Willebrand factor type A  24.51 
 
 		 421 aa  62.4  0.00000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.466753  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2162  von Willebrand factor type A  31.01 
 
 		 425 aa  62  0.00000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.314741  hitchhiker  0.000328198 
 
 
-
 
NC_011685  PHATRDRAFT_54892  predicted protein  37.19 
 
 		 523 aa  62  0.00000004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0723  von Willebrand factor type A  24.68 
 
 		 419 aa  61.6  0.00000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0959383  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1463  von Willebrand factor, type A  31.65 
 
 		 425 aa  61.2  0.00000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.197313  normal  0.691375 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2191  von Willebrand factor type A  25.4 
 
 		 546 aa  60.8  0.00000009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3732  von Willebrand factor type A  30.05 
 
 		 418 aa  60.5  0.0000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.285175  normal  0.068193 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0477  von Willebrand factor, type A  24.5 
 
 		 571 aa  59.3  0.0000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2426  von Willebrand factor type A domain-containing protein  26.44 
 
 		 588 aa  59.7  0.0000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1387  von Willebrand factor type A  25.96 
 
 		 575 aa  59.3  0.0000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.336718  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1308  von Willebrand factor, type A  25.24 
 
 		 427 aa  58.9  0.0000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1244  von Willebrand factor, type A  23.08 
 
 		 412 aa  58.9  0.0000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.427731  normal  0.129489 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2419  von Willebrand factor type A domain-containing protein  25.96 
 
 		 575 aa  59.3  0.0000003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.433183  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4506  von Willebrand factor type A  28.85 
 
 		 698 aa  58.9  0.0000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.407878  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3644  von Willebrand factor type A  29.05 
 
 		 589 aa  58.5  0.0000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3424  von Willebrand factor type A  27.75 
 
 		 592 aa  57.8  0.0000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.236212 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6113  von Willebrand factor type A  27.32 
 
 		 430 aa  57  0.000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3380  von Willebrand factor, type A  25.86 
 
 		 459 aa  57  0.000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.178617  hitchhiker  0.00546751 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1359  von Willebrand factor, type A  24.87 
 
 		 570 aa  56.2  0.000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00054034  normal  0.0176573 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0300  von Willebrand factor type A  25.26 
 
 		 842 aa  56.6  0.000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2950  von Willebrand factor type A  25.37 
 
 		 426 aa  55.5  0.000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3203  von Willebrand factor type A  27.6 
 
 		 421 aa  55.1  0.000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.231871  normal  0.719364 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6419  von Willebrand factor type A  27.83 
 
 		 706 aa  54.3  0.000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.803942 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3163  von Willebrand factor type A  23.78 
 
 		 550 aa  53.5  0.00001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.181499  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2571  Ig domain protein group 2 domain protein  31.08 
 
 		 942 aa  52.8  0.00002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0183  von Willebrand factor, type A  25 
 
 		 563 aa  53.1  0.00002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.174598  normal  0.439463 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_17360  uncharacterized protein containing a von Willebrand factor type A (vWA) domain  27.8 
 
 		 629 aa  52.8  0.00002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.390594  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2141  von Willebrand factor type A  26.89 
 
 		 610 aa  52.8  0.00002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4090  hypothetical protein  23.5 
 
 		 602 aa  53.1  0.00002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0826588 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2704  von Willebrand factor, type A  26.14 
 
 		 851 aa  52.4  0.00004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1972  von Willebrand factor type A  25.31 
 
 		 847 aa  52  0.00004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.865773 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3319  von Willebrand factor type A  28.1 
 
 		 640 aa  52  0.00004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.041713  hitchhiker  0.00219291 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1807  hypothetical protein  26.11 
 
 		 382 aa  51.6  0.00005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.342612 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0155  von Willebrand factor type A  26.52 
 
 		 500 aa  51.2  0.00006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0565906 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>