More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rxyl_1347 on replicon NC_008148
Organism: Rubrobacter xylanophilus DSM 9941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008148  Rxyl_1347  polysaccharide deacetylase  100 
 
 		 196 aa  378  1e-104  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0921833  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06440  polysaccharide deacetylase  32.76 
 
 		 405 aa  117  7.999999999999999e-26  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.467697  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2266  sporulation polysaccharide deacetylase PdaB  35.08 
 
 		 241 aa  117  9.999999999999999e-26  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.33444  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3304  sporulation polysaccharide deacetylase PdaB  34.97 
 
 		 241 aa  114  7.999999999999999e-25  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3410  polysaccharide deacetylase  32.98 
 
 		 213 aa  113  1.0000000000000001e-24  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.76502  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3371  polysaccharide deacetylase  32.98 
 
 		 213 aa  113  1.0000000000000001e-24  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3679  polysaccharide deacetylase  32.98 
 
 		 213 aa  113  1.0000000000000001e-24  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3321  polysaccharide deacetylase  32.98 
 
 		 213 aa  113  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3629  putative polysaccharide deacetylase  32.98 
 
 		 241 aa  113  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.197208 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3726  putative polysaccharide deacetylase  33.51 
 
 		 220 aa  113  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.577927  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1591  putative polysaccharide deacetylase  33.51 
 
 		 241 aa  111  6e-24  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0184011 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1069  polysaccharide deacetylase  31.52 
 
 		 247 aa  110  1.0000000000000001e-23  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.364826  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0123  polysaccharide deacetylase  37.77 
 
 		 352 aa  110  2.0000000000000002e-23  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3637  polysaccharide deacetylase, putative  32.98 
 
 		 244 aa  109  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3642  putative polysaccharide deacetylase  32.98 
 
 		 217 aa  109  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0824  polysaccharide deacetylase family protein  38.46 
 
 		 417 aa  109  3e-23  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00745261  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0397  polysaccharide deacetylase  34.4 
 
 		 1154 aa  108  5e-23  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.553625 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3117  polysaccharide deacetylase  37.25 
 
 		 387 aa  108  7.000000000000001e-23  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0342085  normal  0.78437 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1449  polysaccharide deacetylase family sporulation protein PdaB  31.96 
 
 		 251 aa  107  1e-22  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0970  polysaccharide deacetylase  30.41 
 
 		 479 aa  105  6e-22  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.064586  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1185  polysaccharide deacetylase  32.8 
 
 		 244 aa  102  3e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000000223866  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0771  polysaccharide deacetylase  32.16 
 
 		 299 aa  102  4e-21  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2297  polysaccharide deacetylase  38.67 
 
 		 542 aa  101  6e-21  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2057  polysaccharide deacetylase  42.48 
 
 		 252 aa  101  6e-21  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.129437  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_959  glycosyl transferase  31.35 
 
 		 479 aa  101  8e-21  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1372  polysaccharide deacetylase  28.73 
 
 		 264 aa  101  9e-21  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1912  polysaccharide deacetylase  35.57 
 
 		 232 aa  100  1e-20  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0255  polysaccharide deacetylase  35.29 
 
 		 199 aa  100  1e-20  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1373  polysaccharide deacetylase  40.26 
 
 		 267 aa  100  1e-20  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00379023 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0991  polysaccharide deacetylase family protein  28.12 
 
 		 244 aa  99.8  2e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0797  polysaccharide deacetylase  32.37 
 
 		 301 aa  99.8  2e-20  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0108437  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2712  polysaccharide deacetylase  29.32 
 
 		 204 aa  99.4  3e-20  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0951  polysaccharide deacetylase  39.47 
 
 		 409 aa  99.4  3e-20  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0651013  normal  0.44667 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5514  polysaccharide deacetylase  43.72 
 
 		 252 aa  98.2  6e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.77719  normal  0.916687 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1295  polysaccharide deacetylase  31.32 
 
 		 305 aa  97.8  8e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0475838  normal  0.758896 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2251  polysaccharide deacetylase  30.82 
 
 		 291 aa  98.2  8e-20  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.284926  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0739  polysaccharide deacetylase  32.14 
 
 		 324 aa  97.8  9e-20  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.000000774609  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1147  polysaccharide deacetylase  37.56 
 
 		 267 aa  97.4  1e-19  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00801217  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0647  polysaccharide deacetylase  35.95 
 
 		 204 aa  97.4  1e-19  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3452  chitin deacetylase  32.9 
 
 		 373 aa  97.4  1e-19  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.203782  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3069  polysaccharide deacetylase  31.58 
 
 		 465 aa  97.1  1e-19  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1917  polysaccharide deacetylase  38.31 
 
 		 250 aa  96.3  3e-19  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1800  polysaccharide deacetylase  29.28 
 
 		 372 aa  94.7  7e-19  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.358756  normal  0.150786 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1500  polysaccharide deacetylase  30.65 
 
 		 320 aa  93.6  1e-18  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.101957  normal  0.04925 
 
 
-
 
NC_002936  DET1141  glycosyl transferase/polysaccharide deacetylase family protein  29.19 
 
 		 481 aa  93.2  2e-18  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.226715  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3023  polysaccharide deacetylase  30.19 
 
 		 1120 aa  93.2  2e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5401  polysaccharide deacetylase  35 
 
 		 413 aa  92.8  3e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3302  polysaccharide deacetylase  40.26 
 
 		 272 aa  92.8  3e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.229858  normal  0.446106 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4749  polysaccharide deacetylase  28.79 
 
 		 240 aa  92.8  3e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0757693 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2787  polysaccharide deacetylase  33.99 
 
 		 404 aa  92.4  3e-18  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4179  polysaccharide deacetylase  41.18 
 
 		 266 aa  92.4  4e-18  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0200  polysaccharide deacetylase  29.49 
 
 		 240 aa  92.4  4e-18  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6185  polysaccharide deacetylase  36.88 
 
 		 217 aa  92  5e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.307071  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2047  polysaccharide deacetylase, putative  29.35 
 
 		 275 aa  92  5e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0303096  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2673  polysaccharide deacetylase  32.68 
 
 		 413 aa  92  5e-18  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0653115  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0652  polysaccharide deacetylase  28.57 
 
 		 302 aa  91.7  6e-18  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.249248  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1257  polysaccharide deacetylase  38.85 
 
 		 235 aa  91.7  7e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1638  polysaccharide deacetylase  25.14 
 
 		 238 aa  91.3  9e-18  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2833  polysaccharide deacetylase  36.54 
 
 		 227 aa  90.9  1e-17  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.163356  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3879  polysaccharide deacetylase  39.49 
 
 		 289 aa  90.9  1e-17  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1829  polysaccharide deacetylase  29.89 
 
 		 276 aa  90.5  1e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00572259  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1541  polysaccharide deacetylase  39.23 
 
 		 280 aa  90.1  2e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0577624  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2417  polysaccharide deacetylase  39.23 
 
 		 280 aa  90.1  2e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.108367  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3361  putative polysaccharide deacetylase  29.71 
 
 		 275 aa  90.1  2e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.342746  hitchhiker  0.00000000000000743733 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1551  polysaccharide deacetylase  34.64 
 
 		 243 aa  89.4  3e-17  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2068  putative polysaccharide deacetylase  28.65 
 
 		 275 aa  89.4  3e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000383766  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3051  polysaccharide deacetylase  30.26 
 
 		 264 aa  89.4  3e-17  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1031  polysaccharide deacetylase  34.42 
 
 		 430 aa  89.7  3e-17  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.90284  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1987  polysaccharide deacetylase  32.9 
 
 		 256 aa  89  4e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1185  polysaccharide deacetylase  38.22 
 
 		 409 aa  89  4e-17  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD0720  polysaccharide deacetylase, putative  26.32 
 
 		 279 aa  88.6  6e-17  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.178637  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1821  polysaccharide deacetylase  29.19 
 
 		 275 aa  88.6  6e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7722  polysaccharide deacetylase  33.53 
 
 		 232 aa  88.2  6e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.47977  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1795  polysaccharide deacetylase  29.19 
 
 		 275 aa  88.6  6e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.532229  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1778  polysaccharide deacetylase  29.19 
 
 		 275 aa  88.2  6e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1961  polysaccharide deacetylase  29.19 
 
 		 275 aa  88.6  6e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0210689  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1966  putative polysaccharide deacetylase  30.68 
 
 		 275 aa  87.8  8e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.060186  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0040  polysaccharide deacetylase  26.67 
 
 		 258 aa  87.8  8e-17  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000142029 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2404  polysaccharide deacetylase  26 
 
 		 221 aa  87.8  8e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.256857  normal  0.336364 
 
 
-
 
NC_006691  CNF01800  chitin deacetylase, putative  29.82 
 
 		 470 aa  87  1e-16  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.61842  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0110  polysaccharide deacetylase  31.64 
 
 		 344 aa  87  1e-16  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.00000000182672  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1998  putative polysaccharide deacetylase  28.65 
 
 		 275 aa  87  1e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.26029e-43 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1037  polysaccharide deacetylase  42.6 
 
 		 269 aa  87.8  1e-16  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.0742911 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1878  polysaccharide deacetylase family protein  26.47 
 
 		 261 aa  87.4  1e-16  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.0000000117322  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1081  polysaccharide deacetylase  33.12 
 
 		 242 aa  87  1e-16  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2705  polysaccharide deacetylase  34.24 
 
 		 242 aa  87.4  1e-16  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.117989  normal  0.421806 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5206  polysaccharide deacetylase  36.36 
 
 		 259 aa  86.7  2e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0262209  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2675  polysaccharide deacetylase  38.61 
 
 		 280 aa  86.7  2e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0615547  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0295  endo-1,4-beta-xylanase D  33.99 
 
 		 373 aa  87  2e-16  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0385637  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0920  polysaccharide deacetylase family protein  35.64 
 
 		 270 aa  85.9  3e-16  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2167  polysaccharide deacetylase family protein  26.47 
 
 		 258 aa  86.3  3e-16  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.0000111858  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0292  polysaccharide deacetylase  31.77 
 
 		 317 aa  85.9  4e-16  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.858762 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4706  polysaccharide deacetylase  38.99 
 
 		 286 aa  85.5  5e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0236101 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3928  polysaccharide deacetylase  37.16 
 
 		 289 aa  85.5  5e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.284883  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1446  polysaccharide deacetylase  39.23 
 
 		 280 aa  85.1  6e-16  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.781341  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0113  polysaccharide deacetylase  37.02 
 
 		 503 aa  85.1  6e-16  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2751  transmembrane protein  35.03 
 
 		 283 aa  85.1  6e-16  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26930  glycosyl transferase  32.68 
 
 		 1099 aa  84.7  8e-16  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.938513 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3218  polysaccharide deacetylase  36.54 
 
 		 465 aa  84.7  8e-16  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.578565  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0643  polysaccharide deacetylase  28.12 
 
 		 425 aa  84.7  8e-16  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>