More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rru_A2752 on replicon NC_007643
Organism: Rhodospirillum rubrum ATCC 11170



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007643  Rru_A2752  Signal transduction histidine kinase  100 
 
 		 374 aa  755    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.25637  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2534  signal transduction histidine kinase  53.89 
 
 		 356 aa  368  1e-100  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1476  signal transduction histidine kinase  53.17 
 
 		 357 aa  338  7e-92  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0180149 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1063  signal transduction histidine kinase  50.58 
 
 		 358 aa  328  1.0000000000000001e-88  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0212102 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6722  signal transduction histidine kinase  49.71 
 
 		 364 aa  315  9.999999999999999e-85  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.16203  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3762  signal transduction histidine kinase  45.54 
 
 		 353 aa  254  2.0000000000000002e-66  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1193  sensory transduction regulatory protein  44.62 
 
 		 391 aa  244  1.9999999999999999e-63  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2946  signal transduction histidine kinase  43.38 
 
 		 349 aa  233  4.0000000000000004e-60  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.341682  normal  0.680161 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0772  signal transduction histidine kinase  43.25 
 
 		 371 aa  224  2e-57  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4106  signal transduction histidine kinase  35.01 
 
 		 453 aa  168  1e-40  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0707076  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1636  two component sensor kinase  32.95 
 
 		 342 aa  163  4.0000000000000004e-39  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.264656  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1628  sensor histidine protein kinase  36.48 
 
 		 332 aa  155  1e-36  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.560713  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1432  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  44.03 
 
 		 676 aa  139  6e-32  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.00629905  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5005  signal transduction histidine kinase  34.13 
 
 		 334 aa  133  5e-30  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.6624  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3338  hypothetical protein  32.69 
 
 		 333 aa  132  1.0000000000000001e-29  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.815822  normal  0.18159 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4135  putative PAS/PAC sensor protein  51.16 
 
 		 650 aa  129  9.000000000000001e-29  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.479739  hitchhiker  0.00000143987 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0327  putative PAS/PAC sensor protein  52.14 
 
 		 1008 aa  126  5e-28  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2460  MCP methyltransferase/methylesterase, CheR/CheB with PAS/PAC sensor  47.41 
 
 		 971 aa  125  9e-28  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3010  signal transduction histidine kinase  37.44 
 
 		 488 aa  123  4e-27  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0663481  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2313  Fis family transcriptional regulator  44.52 
 
 		 510 aa  122  9.999999999999999e-27  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3371  putative PAS/PAC sensor protein  38.53 
 
 		 649 aa  121  1.9999999999999998e-26  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00785192 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2376  signal transduction histidine kinase with CheB and CheR activity  28.9 
 
 		 1407 aa  119  9e-26  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1518  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  44.12 
 
 		 769 aa  118  1.9999999999999998e-25  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0314  Signal transduction histidine kinase (STHK) with CheB and CheR activity  40.12 
 
 		 1399 aa  117  3e-25  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4325  Signal transduction histidine kinase  33.48 
 
 		 1654 aa  117  3e-25  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6718  signal transduction histidine kinase  36.68 
 
 		 387 aa  117  3e-25  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0742813  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1953  signal transduction histidine kinase  37.96 
 
 		 382 aa  117  3.9999999999999997e-25  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1989  MCP methyltransferase, CheR-type with PAS/PAC sensor  46.88 
 
 		 1110 aa  117  3.9999999999999997e-25  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.175442  normal  0.013335 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2118  signal transduction histidine kinase  30.38 
 
 		 572 aa  117  3.9999999999999997e-25  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0299  two component sensor histidine kinase  32 
 
 		 1239 aa  114  3e-24  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.669336  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2710  hypothetical protein  34.72 
 
 		 744 aa  114  3e-24  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4873  histidine kinase dimerisation/phosphoacceptor  37.74 
 
 		 348 aa  113  7.000000000000001e-24  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.541831  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3192  multi-sensor signal transduction histidine kinase  38.22 
 
 		 864 aa  112  1.0000000000000001e-23  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0309229 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5358  signal transduction histidine kinase  38.5 
 
 		 348 aa  112  1.0000000000000001e-23  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0298  signal transduction histidine kinase  36.54 
 
 		 349 aa  112  1.0000000000000001e-23  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.228007  hitchhiker  0.00285782 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5414  signal transduction histidine kinase  36.79 
 
 		 348 aa  110  3e-23  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3735  signal transduction histidine kinase  31.8 
 
 		 1183 aa  109  7.000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.709518  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1972  signal transduction histidine kinase  32.41 
 
 		 815 aa  108  1e-22  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000691031  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0440  signal transduction histidine kinase  32.17 
 
 		 1093 aa  107  2e-22  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.790224  normal  0.127185 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1812  signal transduction histidine kinase  33.33 
 
 		 1390 aa  108  2e-22  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.155927 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3899  signal transduction histidine kinase  31.11 
 
 		 613 aa  107  3e-22  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.796516 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2872  signal transduction histidine kinase  37.75 
 
 		 362 aa  107  5e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.401413  normal  0.23232 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0429  signal transduction histidine kinase  31.88 
 
 		 1093 aa  106  8e-22  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3509  signal transduction histidine kinase  32.48 
 
 		 439 aa  105  9e-22  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.2468 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3728  signal transduction histidine kinase  35.94 
 
 		 406 aa  105  1e-21  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.979777  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2687  signal transduction histidine kinase  33.17 
 
 		 215 aa  105  1e-21  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.693771  normal  0.196612 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2336  signal transduction histidine kinase  31.43 
 
 		 3706 aa  105  1e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1002  signal transduction histidine kinase  28.74 
 
 		 932 aa  104  2e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.353608  normal  0.0662086 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4431  signal transduction histidine kinase  31.28 
 
 		 767 aa  104  2e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.222195  normal  0.392293 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3009  hypothetical protein  30.83 
 
 		 783 aa  105  2e-21  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2096  signal transduction histidine kinase  36.06 
 
 		 526 aa  105  2e-21  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.0713574 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3102  signal transduction histidine kinase with CheB and CheR activity  42.15 
 
 		 1418 aa  105  2e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2784  signal transduction histidine kinase  36.54 
 
 		 354 aa  105  2e-21  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4562  multi-sensor signal transduction histidine kinase  37.17 
 
 		 874 aa  105  2e-21  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0865092  normal  0.846022 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2150  signal transduction histidine kinase  33.48 
 
 		 945 aa  104  3e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0079  signal transduction histidine kinase  34.47 
 
 		 909 aa  104  3e-21  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.130581 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4219  signal transduction histidine kinase  36.18 
 
 		 362 aa  104  3e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1723  signal transduction histidine kinase  30.49 
 
 		 764 aa  103  7e-21  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0986  signal transduction histidine kinase  30.51 
 
 		 872 aa  102  9e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.544559  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3723  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.5 
 
 		 871 aa  102  9e-21  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.086011 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4449  multi-sensor signal transduction histidine kinase  35.26 
 
 		 875 aa  102  1e-20  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4331  signal transduction histidine kinase  30 
 
 		 545 aa  102  1e-20  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.364366 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0515  signal transduction histidine kinase  32.09 
 
 		 416 aa  102  1e-20  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.498763  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0913  multisensor signal transduction histidine kinase  31.94 
 
 		 991 aa  102  1e-20  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.650855  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2234  signal transduction histidine kinase  33.01 
 
 		 1676 aa  100  3e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.900765 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1756  Signal transduction histidine kinase  34.93 
 
 		 362 aa  100  3e-20  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.38054  normal  0.143124 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3640  MCP methyltransferase, CheR-type with PAS/PAC sensor  33.33 
 
 		 1303 aa  100  3e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.581797 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4081  histidine kinase dimerisation/phosphoacceptor  34.74 
 
 		 895 aa  100  3e-20  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.628066  normal  0.498394 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1806  signal transduction histidine kinase  28.92 
 
 		 681 aa  100  3e-20  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.286721 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1370  signal transduction histidine kinase  31.46 
 
 		 1560 aa  100  6e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.71177  normal  0.70667 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4852  signal transduction histidine kinase  34.04 
 
 		 746 aa  99.8  7e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0325493 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4526  histidine kinase dimerisation/phosphoacceptor  35.9 
 
 		 381 aa  99.8  7e-20  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.315667 
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5451  signal transduction histidine kinase  31.78 
 
 		 547 aa  99.8  8e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.915879  normal  0.94618 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3023  signal transduction histidine kinase  34.33 
 
 		 361 aa  99.4  9e-20  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.183877  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3038  signal transduction histidine kinase  28.27 
 
 		 878 aa  99.4  9e-20  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2428  signal transduction histidine kinase  34.33 
 
 		 360 aa  99.4  9e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.391955  decreased coverage  0.00462713 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4986  signal transduction histidine kinase  35.9 
 
 		 381 aa  99.4  9e-20  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.196103 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1364  signal transduction histidine kinase  33.18 
 
 		 382 aa  98.2  2e-19  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00521592 
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5298  signal transduction histidine kinase  34.54 
 
 		 732 aa  97.4  3e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3796  signal transduction histidine kinase  34.76 
 
 		 500 aa  97.8  3e-19  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2636  signal transduction histidine kinase  31.9 
 
 		 1051 aa  97.8  3e-19  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2165  signal transduction histidine kinase  34.8 
 
 		 358 aa  97.4  4e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.594902 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2638  signal transduction histidine kinase  35.78 
 
 		 1246 aa  97.1  4e-19  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.406251  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2024  signal transduction histidine kinase  33.33 
 
 		 497 aa  97.1  5e-19  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.149212  normal  0.406004 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0148  Signal transduction histidine kinase  35.03 
 
 		 350 aa  97.1  5e-19  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.332902  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5039  signal transduction histidine kinase  35.9 
 
 		 381 aa  96.7  5e-19  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1781  signal transduction histidine kinase  35.03 
 
 		 350 aa  97.1  5e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2710  signal transduction histidine kinase  33.66 
 
 		 363 aa  97.1  5e-19  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.304131  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2192  signal transduction histidine kinase  35.32 
 
 		 362 aa  96.7  6e-19  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4137  signal transduction histidine kinase  30.88 
 
 		 912 aa  95.9  9e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5952  signal transduction histidine kinase  36.18 
 
 		 355 aa  95.9  9e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.113414 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1008  signal transduction histidine kinase  35.62 
 
 		 347 aa  96.3  9e-19  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.681685  normal  0.906099 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0815  hypothetical protein  26.86 
 
 		 918 aa  95.9  1e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1666  sensory transduction histidine kinase  25.54 
 
 		 945 aa  95.5  1e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.515191  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4563  signal transduction histidine kinase  30.41 
 
 		 771 aa  95.1  2e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.633448 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2424  signal transduction histidine kinase  34.31 
 
 		 354 aa  94.7  2e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.790198 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3447  hypothetical protein  28.73 
 
 		 1210 aa  95.1  2e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00320271  normal  0.0786508 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4301  signal transduction histidine kinase  31.1 
 
 		 2693 aa  94.7  2e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3538  hypothetical protein  26.99 
 
 		 754 aa  94.4  3e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0655709  normal  0.940328 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0384  two component sensor kinase  35.24 
 
 		 344 aa  94.4  3e-18  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>