More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpal_0935 on replicon NC_011004
Organism: Rhodopseudomonas palustris TIE-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011004  Rpal_0935  Endoribonuclease L-PSP  100 
 
 		 128 aa  261  3e-69  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0853  endoribonuclease L-PSP  85.94 
 
 		 129 aa  230  5e-60  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.287208 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4835  endoribonuclease L-PSP  83.59 
 
 		 129 aa  223  9e-58  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1346  hypothetical protein  81.25 
 
 		 129 aa  220  4e-57  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.703391 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4550  endoribonuclease L-PSP  84.38 
 
 		 128 aa  214  4e-55  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.326313  normal  0.946176 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3282  endoribonuclease L-PSP  62.3 
 
 		 126 aa  165  2e-40  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.925015  normal  0.517573 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0958  endoribonuclease L-PSP  60 
 
 		 127 aa  165  2.9999999999999998e-40  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.678542 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3029  endoribonuclease L-PSP  64.29 
 
 		 126 aa  164  5e-40  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.409696 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5244  Endoribonuclease L-PSP  62.3 
 
 		 130 aa  163  5.9999999999999996e-40  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.677365  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1223  YjgF family translation initiation inhibitor  61.98 
 
 		 124 aa  154  4e-37  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.871346  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2884  endoribonuclease L-PSP  61.16 
 
 		 124 aa  149  8.999999999999999e-36  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2660  endoribonuclease L-PSP  60.5 
 
 		 124 aa  147  4e-35  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.680061  normal  0.801183 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4381  endoribonuclease L-PSP  60.63 
 
 		 127 aa  147  4e-35  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.901954  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2263  endoribonuclease L-PSP  55.47 
 
 		 129 aa  147  6e-35  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.598957  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0012  endoribonuclease L-PSP  59.35 
 
 		 124 aa  142  1e-33  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3461  endoribonuclease L-PSP  56.56 
 
 		 125 aa  139  9.999999999999999e-33  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1528  endoribonuclease L-PSP  52.8 
 
 		 157 aa  135  2e-31  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.147223  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1925  Endoribonuclease L-PSP  46.88 
 
 		 127 aa  128  2.0000000000000002e-29  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1952  Endoribonuclease L-PSP  46.09 
 
 		 127 aa  128  3e-29  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3749  endoribonuclease L-PSP  49.19 
 
 		 137 aa  123  1e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0521312  normal  0.178037 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5545  Endoribonuclease L-PSP  47.58 
 
 		 126 aa  122  2e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4440  endoribonuclease L-PSP  47.54 
 
 		 142 aa  103  1e-21  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.286195  normal  0.317631 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2335  endoribonuclease L-PSP  41.94 
 
 		 127 aa  96.7  1e-19  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4692  endoribonuclease L-PSP  43.55 
 
 		 126 aa  95.1  3e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2408  hypothetical protein  43.55 
 
 		 128 aa  94  6e-19  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0314271  normal  0.0494567 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1524  endoribonuclease L-PSP  43.55 
 
 		 121 aa  93.2  1e-18  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.348757  normal  0.447397 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3231  Endoribonuclease L-PSP  40.87 
 
 		 130 aa  90.9  5e-18  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1985  aldo/keto reductase family protein  43.2 
 
 		 480 aa  89.4  1e-17  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.282882 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1454  endoribonuclease L-PSP  38.71 
 
 		 121 aa  89.7  1e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6374  endoribonuclease L-PSP  38.71 
 
 		 121 aa  89.7  1e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3942  endoribonuclease L-PSP  41.18 
 
 		 138 aa  87.4  6e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2942  endoribonuclease L-PSP  42.4 
 
 		 142 aa  87  7e-17  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.112129  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2891  Endoribonuclease L-PSP  40 
 
 		 132 aa  86.7  1e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0848604  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6914  endoribonuclease L-PSP  37.9 
 
 		 132 aa  86.7  1e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12719  hypothetical protein  39.02 
 
 		 142 aa  85.5  2e-16  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3991  Endoribonuclease L-PSP  37.7 
 
 		 129 aa  85.5  2e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.79301  normal  0.524999 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2172  endoribonuclease L-PSP  39.83 
 
 		 122 aa  85.9  2e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.219438  hitchhiker  0.00143266 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2229  endoribonuclease L-PSP  38.98 
 
 		 122 aa  85.1  3e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3052  endoribonuclease L-PSP  41.38 
 
 		 130 aa  84.7  3e-16  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.66028 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2183  endoribonuclease L-PSP  38.98 
 
 		 122 aa  85.1  3e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.130021  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1439  endoribonuclease L-PSP  38.84 
 
 		 135 aa  84  7e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.534154  normal  0.776942 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0460  endoribonuclease L-PSP  38.02 
 
 		 140 aa  83.6  9e-16  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2457  endoribonuclease L-PSP  40.98 
 
 		 133 aa  81.3  0.000000000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.408607 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1839  endoribonuclease L-PSP  37.01 
 
 		 140 aa  80.9  0.000000000000006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.246476 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3762  endoribonuclease L-PSP  38.02 
 
 		 140 aa  80.9  0.000000000000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.264778  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2669  Endoribonuclease L-PSP  34.68 
 
 		 133 aa  79  0.00000000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1591  endoribonuclease L-PSP  37.19 
 
 		 140 aa  79.3  0.00000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1302  endoribonuclease L-PSP  34.68 
 
 		 127 aa  79  0.00000000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0172337  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3517  endoribonuclease L-PSP  37.19 
 
 		 140 aa  78.2  0.00000000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0961471  normal  0.31713 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2914  hypothetical protein  36.36 
 
 		 135 aa  76.3  0.0000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0283719  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1710  endoribonuclease L-PSP  34.68 
 
 		 121 aa  76.3  0.0000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1773  Endoribonuclease L-PSP  37.93 
 
 		 118 aa  75.5  0.0000000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00826992  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1345  Endoribonuclease L-PSP  31.75 
 
 		 126 aa  75.5  0.0000000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000129455 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5323  Endoribonuclease L-PSP  34.96 
 
 		 131 aa  75.1  0.0000000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.154114  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5724  Endoribonuclease L-PSP  34.71 
 
 		 131 aa  73.9  0.0000000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2605  endoribonuclease L-PSP  41.67 
 
 		 126 aa  73.2  0.000000000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.615726  normal  0.989955 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3167  endoribonuclease L-PSP  35.54 
 
 		 140 aa  73.6  0.000000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.552067  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3085  Endoribonuclease L-PSP  36.97 
 
 		 129 aa  73.2  0.000000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000387773  hitchhiker  0.0000202811 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0282  Endoribonuclease L-PSP  33.6 
 
 		 128 aa  72.4  0.000000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0662893  normal  0.101063 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2374  endoribonuclease L-PSP  39.2 
 
 		 132 aa  72  0.000000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1821  endoribonuclease L-PSP  34.75 
 
 		 132 aa  72  0.000000000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.589735 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1663  Endoribonuclease L-PSP  38.32 
 
 		 140 aa  71.2  0.000000000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.526711  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0871  putative endoribonuclease L-PSP  37.39 
 
 		 150 aa  70.9  0.000000000006  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0915568  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03180  conserved hypothetical protein  37.5 
 
 		 500 aa  70.5  0.000000000007  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.305497  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3876  Endoribonuclease L-PSP  33.87 
 
 		 127 aa  70.1  0.000000000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.873675  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2343  putative endoribonuclease L-PSP  34.15 
 
 		 143 aa  68.9  0.00000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.435007  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0614  putative endoribonuclease L-PSP  33.61 
 
 		 127 aa  69.3  0.00000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4534  endoribonuclease L-PSP  33.33 
 
 		 128 aa  68.9  0.00000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.71514  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1855  endoribonuclease L-PSP  36.11 
 
 		 141 aa  68.2  0.00000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.570502  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0150  endoribonuclease L-PSP  32.03 
 
 		 126 aa  68.6  0.00000000003  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000335683  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0144  putative endoribonuclease L-PSP  35.43 
 
 		 126 aa  67.8  0.00000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00510728  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1726  endoribonuclease L-PSP  36.36 
 
 		 126 aa  67.4  0.00000000006  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.622366 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0135  endoribonuclease L-PSP, putative  31.45 
 
 		 126 aa  67  0.00000000008  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.00324378  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1670  endoribonuclease L-PSP  34.4 
 
 		 131 aa  66.2  0.0000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.518746  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0382  endoribonuclease L-PSP  36.15 
 
 		 133 aa  66.6  0.0000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.395966  normal  0.101256 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2280  endoribonuclease L-PSP  34.75 
 
 		 132 aa  66.2  0.0000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0919  endoribonuclease L-PSP  34.4 
 
 		 126 aa  66.2  0.0000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.13854 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0376  Endoribonuclease L-PSP  35.51 
 
 		 149 aa  65.9  0.0000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0109  endoribonuclease L-PSP  34.92 
 
 		 140 aa  65.1  0.0000000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.748315  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0443  endoribonuclease L-PSP  35.85 
 
 		 139 aa  65.1  0.0000000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3374  endoribonuclease L-PSP  29.13 
 
 		 126 aa  65.1  0.0000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.066634 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3169  endoribonuclease L-PSP  36 
 
 		 130 aa  64.7  0.0000000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  hitchhiker  0.00329207  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1847  endoribonuclease L-PSP, putative  33.6 
 
 		 126 aa  64.7  0.0000000004  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4466  endoribonuclease L-PSP  35.04 
 
 		 134 aa  64.7  0.0000000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.136863 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6129  endoribonuclease L-PSP  33.94 
 
 		 117 aa  64.3  0.0000000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.409916  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4894  endoribonuclease L-PSP  31.5 
 
 		 134 aa  63.9  0.0000000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.657922  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2689  endoribonuclease L-PSP  34.92 
 
 		 130 aa  63.9  0.0000000006  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1171  endoribonuclease L-PSP  32.48 
 
 		 136 aa  63.9  0.0000000007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.468535  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2006  YjgF-like protein  34.71 
 
 		 126 aa  63.9  0.0000000008  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.011339 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3623  endoribonuclease L-PSP  32.2 
 
 		 131 aa  63.9  0.0000000008  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.450254 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1433  Endoribonuclease L-PSP  32.17 
 
 		 132 aa  63.5  0.000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.652248  normal  0.596243 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1940  putative endoribonuclease L-PSP  32.03 
 
 		 128 aa  63.2  0.000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.049388  hitchhiker  0.000000582392 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0518  putative endoribonuclease L-PSP  30.33 
 
 		 126 aa  63.2  0.000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.0000619405  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1982  Endoribonuclease L-PSP  32.67 
 
 		 119 aa  63.2  0.000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.619306  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2388  endoribonuclease L-PSP  35.85 
 
 		 145 aa  63.2  0.000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0531  putative endoribonuclease L-PSP  30.33 
 
 		 126 aa  63.2  0.000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000228568  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3456  endoribonuclease L-PSP  34.31 
 
 		 138 aa  62.8  0.000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.962591  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9111  endoribonuclease L-PSP  34.21 
 
 		 140 aa  62.4  0.000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0412  putative endoribonuclease L-PSP  31.15 
 
 		 127 aa  62.4  0.000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0351  endoribonuclease L-PSP  33.63 
 
 		 132 aa  62.4  0.000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.000170484  normal  0.265808 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>