96 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_1338 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009523  RoseRS_1338  TPR repeat-containing protein  100 
 
 		 260 aa  488  1e-137  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.960839 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1625  TPR repeat-containing protein  63.08 
 
 		 260 aa  225  7e-58  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.816292 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1087  TPR repeat-containing protein  32.7 
 
 		 808 aa  55.5  0.0000009  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2869  tetratricopeptide TPR_2  34.34 
 
 		 780 aa  53.9  0.000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2155  TPR repeat-containing protein  32.14 
 
 		 147 aa  53.9  0.000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.000000155032  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4560  TPR repeat-containing protein  27.92 
 
 		 292 aa  54.7  0.000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.13118  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0238  TPR repeat-containing protein  34.34 
 
 		 780 aa  53.9  0.000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0105  TPR repeat-containing protein  36.7 
 
 		 689 aa  52.8  0.000005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00688221 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2716  TPR domain/sulfotransferase domain protein  33.77 
 
 		 762 aa  52.8  0.000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2338  sulfotransferase  33.77 
 
 		 762 aa  52.8  0.000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.355943  normal  0.127881 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03573  tetratricopeptide repeat family  35.58 
 
 		 690 aa  52.4  0.000007  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.432087  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_20571  SAM-binding motif-containing protein  26.01 
 
 		 780 aa  52  0.00001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.183834 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1370  hypothetical protein  35.48 
 
 		 690 aa  50.8  0.00002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24101  hypothetical protein  28.69 
 
 		 725 aa  50.8  0.00002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0959  TPR repeat-containing protein  36.7 
 
 		 199 aa  51.2  0.00002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1300  TPR repeat-containing protein  28.29 
 
 		 878 aa  50.1  0.00003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0911  tetratricopeptide TPR_4  25.65 
 
 		 875 aa  50.4  0.00003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.379762  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1492  glycosyl transferase family protein  23.84 
 
 		 1737 aa  50.1  0.00003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.315595  normal  0.552274 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24081  hypothetical protein  27.84 
 
 		 764 aa  50.4  0.00003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24071  hypothetical protein  27.27 
 
 		 622 aa  50.1  0.00004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1304  TPR repeat-containing protein  34.41 
 
 		 690 aa  49.7  0.00005  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.107632  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1875  TPR repeat-containing protein  38.46 
 
 		 201 aa  49.7  0.00005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2213  sulfotransferase  42.53 
 
 		 656 aa  49.3  0.00006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0454  MJ0042 family finger-like protein  40.52 
 
 		 1163 aa  48.5  0.0001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.75357  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0453  MJ0042 family finger-like protein  40.52 
 
 		 1144 aa  48.5  0.0001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.13216  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0220  TPR repeat-containing protein  36.89 
 
 		 779 aa  48.1  0.0001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.991207  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1509  TPR domain-containing protein  32.61 
 
 		 699 aa  48.1  0.0001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  unclonable  0.000367862  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0481  TPR repeat-containing protein  23.31 
 
 		 3145 aa  48.1  0.0001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.948354 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2032  TPR repeat-containing protein  29.9 
 
 		 883 aa  48.5  0.0001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.192732  normal  0.125101 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2499  PEP-CTERM system TPR-repeat lipoprotein  35.92 
 
 		 935 aa  47.8  0.0002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  decreased coverage  0.00842249  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0917  TPR repeat-containing protein  31.82 
 
 		 566 aa  47.4  0.0002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00563549 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4945  TPR repeat-containing protein  25 
 
 		 750 aa  47.4  0.0003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0427  TPR repeat-containing protein  32.28 
 
 		 273 aa  47.4  0.0003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.609361  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2369  TPR repeat-containing protein  42.86 
 
 		 639 aa  47  0.0003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.319986  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1619  TPR domain-containing protein  35.76 
 
 		 626 aa  46.6  0.0004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0978258  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0336  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  26.73 
 
 		 557 aa  46.6  0.0004  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000572448  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4770  sulfotransferase  25.23 
 
 		 887 aa  45.8  0.0006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.185793 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2413  TPR repeat-containing protein  32.41 
 
 		 593 aa  45.8  0.0006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2450  tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  33.66 
 
 		 150 aa  45.8  0.0006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1288  sulfotransferase  34.86 
 
 		 636 aa  45.8  0.0007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.494721  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1328  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  27.81 
 
 		 810 aa  45.8  0.0007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.929548  normal  0.0143336 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0959  hypothetical protein  36.78 
 
 		 620 aa  45.8  0.0007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.868556 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4040  TPR domain-containing protein  33.33 
 
 		 540 aa  45.4  0.0008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.186285 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3028  TPR repeat-containing protein  36.78 
 
 		 620 aa  45.4  0.0008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.985806  normal  0.0142271 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2201  TPR repeat-containing protein  43.9 
 
 		 556 aa  45.4  0.0008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.805282  normal  0.800144 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1767  Tetratricopeptide TPR_4  32.38 
 
 		 150 aa  45.4  0.0009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00416182 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0200  TPR repeat-containing protein  28.07 
 
 		 505 aa  44.7  0.001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1006  tetratricopeptide TPR_4  38.2 
 
 		 441 aa  45.1  0.001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1987  TPR domain-containing protein  26.5 
 
 		 864 aa  45.1  0.001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.944233  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2942  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  25.17 
 
 		 632 aa  45.1  0.001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0425  zinc finger/thioredoxin putative  39.66 
 
 		 1139 aa  45.1  0.001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3210  TPR domain-containing protein  33.96 
 
 		 781 aa  45.1  0.001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1006  TPR repeat-containing protein  36.96 
 
 		 359 aa  44.7  0.001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.476893  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2231  TPR repeat-containing protein  33.02 
 
 		 265 aa  45.1  0.001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00000000660918  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1093  TPR repeat-containing protein  28.86 
 
 		 681 aa  45.4  0.001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.353622  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4144  Zinc finger-domain-containing protein  38.32 
 
 		 1124 aa  43.9  0.002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000494225 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2993  TPR repeat-containing protein  43.94 
 
 		 789 aa  44.3  0.002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00312978 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0722  TPR repeat-containing protein  31.79 
 
 		 615 aa  44.3  0.002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.434562 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2321  TPR repeat-containing protein  34.88 
 
 		 475 aa  44.3  0.002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.084712  decreased coverage  0.00212856 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0955  TPR repeat-containing protein  28.46 
 
 		 637 aa  44.7  0.002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2491  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  30.77 
 
 		 689 aa  43.5  0.003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3015  TPR domain-containing protein  35.71 
 
 		 626 aa  43.5  0.003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2906  TPR repeat-containing protein  35.71 
 
 		 614 aa  43.5  0.003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0475913  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2967  TPR repeat-containing protein  35.71 
 
 		 614 aa  43.5  0.003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3120  TPR repeat-containing protein  32.56 
 
 		 767 aa  43.9  0.003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1166  TPR domain-containing protein  29.35 
 
 		 266 aa  43.5  0.003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.194624  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1220  TPR repeat-containing protein  26.36 
 
 		 609 aa  43.5  0.003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.00113386  hitchhiker  0.00622178 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2756  Spermine synthase  35.97 
 
 		 1078 aa  43.1  0.004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3268  TPR repeat-containing protein  26.88 
 
 		 441 aa  43.1  0.004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0825  TPR repeat-containing protein  28.26 
 
 		 739 aa  43.1  0.004  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.423694  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2853  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  26.88 
 
 		 441 aa  43.1  0.004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.0260503 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4728  TPR repeat-containing protein  30.58 
 
 		 718 aa  43.1  0.004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.346608 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_14411  Flp pilus assembly protein TadD  30.17 
 
 		 594 aa  43.5  0.004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00033533 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1657  TPR repeat-containing protein  26.03 
 
 		 594 aa  43.1  0.004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0658919  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00731  hypothetical protein  25.3 
 
 		 816 aa  43.1  0.004  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.456129 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4768  sulfotransferase  21.82 
 
 		 676 aa  43.1  0.004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.260339  normal  0.153237 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0904  TPR repeat-containing protein  40.48 
 
 		 612 aa  43.1  0.004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.587904  normal  0.769196 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1753  TPR repeat-containing protein  28.5 
 
 		 366 aa  43.1  0.005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3735  TPR repeat-containing protein  31.08 
 
 		 707 aa  43.1  0.005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_19711  hypothetical protein  26.74 
 
 		 865 aa  42.7  0.005  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.372007  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2604  TPR repeat-containing protein  21.32 
 
 		 927 aa  42.7  0.005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.010408  normal  0.426767 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3236  tetratricopeptide TPR_4  33.75 
 
 		 514 aa  43.1  0.005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.789976  normal  0.265917 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2045  tetratricopeptide TPR_2  29.58 
 
 		 199 aa  43.1  0.005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  unclonable  0.00000000000222916  normal  0.0184394 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0705  tetratricopeptide TPR_2  31.34 
 
 		 924 aa  42.7  0.005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1350  TPR repeat-containing protein  48.21 
 
 		 766 aa  42.7  0.006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3340  TPR repeat-containing protein  30.17 
 
 		 828 aa  42.7  0.006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.710571 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4282  TPR repeat-containing protein  31.88 
 
 		 715 aa  42.7  0.006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2985  sulfotransferase  27.66 
 
 		 1077 aa  42.7  0.006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0912  TPR repeat-containing protein  26.35 
 
 		 748 aa  42.7  0.006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.795031  hitchhiker  0.00626987 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1518  TPR repeat-containing protein  23.97 
 
 		 597 aa  42.7  0.006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00971618 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2992  TPR repeat-containing protein  31.33 
 
 		 824 aa  42.7  0.006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000746825 
 
 
-
 
NC_011682  PHATRDRAFT_47622  predicted protein  28.85 
 
 		 765 aa  42.4  0.007  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24171  hypothetical protein  29.63 
 
 		 733 aa  42.4  0.007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0275  TPR repeat-containing protein  20.59 
 
 		 587 aa  42.4  0.007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_00381  hypothetical protein  29.45 
 
 		 437 aa  42.4  0.007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3925  TPR repeat-containing protein  33.78 
 
 		 1180 aa  42.4  0.008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>