More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_0390 on replicon NC_012850
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009636  Smed_2320  alpha amylase catalytic region  60.59 
 
 		 547 aa  683    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.80263 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2833  alpha amylase catalytic region  59.41 
 
 		 548 aa  672    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.518671  normal  0.538121 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0788  alpha-glucosidase  74.13 
 
 		 550 aa  868    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0390  alpha amylase catalytic region  100 
 
 		 550 aa  1142    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.622906  normal  0.263526 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1949  alpha amylase protein  64.55 
 
 		 553 aa  705    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.342567  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3304  alpha amylase, catalytic region  64.76 
 
 		 550 aa  745    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.251779  normal  0.854548 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3300  alpha-glucosidase  60.51 
 
 		 555 aa  674    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3102  alpha amylase catalytic region  62.13 
 
 		 548 aa  666    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.355967  normal  0.289712 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0295  alpha amylase catalytic region  74 
 
 		 551 aa  850    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0358  alpha amylase catalytic region  97.09 
 
 		 550 aa  1112    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.404275 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1649  alpha-glucosidase  66.41 
 
 		 552 aa  716    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.856905  hitchhiker  0.000000195123 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0261  alpha amylase  56.26 
 
 		 537 aa  629  1e-179  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0601  alpha-glucosidase  55.22 
 
 		 540 aa  622  1e-177  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.642438 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4341  alpha amylase catalytic region  54.24 
 
 		 539 aa  612  9.999999999999999e-175  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0984  alpha amylase family protein  53.6 
 
 		 538 aa  608  1e-173  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3325  alpha amylase catalytic region  53.72 
 
 		 556 aa  608  1e-173  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0029  alpha amylase, catalytic region  55.43 
 
 		 536 aa  607  9.999999999999999e-173  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2088  alpha amylase catalytic region  55.49 
 
 		 541 aa  601  1e-170  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.800572  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1889  alpha amylase, catalytic region  52.51 
 
 		 541 aa  600  1e-170  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1370  alpha amylase domain-containing protein  55.06 
 
 		 536 aa  596  1e-169  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2209  alpha amylase, catalytic region  53.07 
 
 		 540 aa  596  1e-169  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0039  alpha amylase, catalytic region  55.24 
 
 		 536 aa  596  1e-169  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2213  oligo-1,6-glucosidase  52.23 
 
 		 540 aa  592  1e-168  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0021  alpha amylase catalytic region  56.91 
 
 		 530 aa  592  1e-168  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.193993  normal  0.266827 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2133  alpha amylase, catalytic region  52.51 
 
 		 540 aa  592  1e-168  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1017  alpha amylase catalytic region  53.83 
 
 		 537 aa  593  1e-168  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.487933  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2039  alpha amylase catalytic region  52.33 
 
 		 540 aa  589  1e-167  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.535933  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2311  alpha amylase, catalytic region  52.14 
 
 		 540 aa  590  1e-167  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.679266  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3326  alpha amylase catalytic region  52.36 
 
 		 547 aa  587  1e-166  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2086  alpha amylase catalytic region  52.33 
 
 		 540 aa  586  1e-166  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2299  alpha amylase catalytic region  52.14 
 
 		 540 aa  587  1e-166  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.495294  normal  0.823743 
 
 
-
 
NC_009035  Sbal_4573  hypothetical protein  51.96 
 
 		 540 aa  585  1.0000000000000001e-165  Shewanella baltica OS155  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2287  alpha amylase catalytic region  51.96 
 
 		 540 aa  585  1.0000000000000001e-165  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1788  alpha amylase, catalytic region  50.46 
 
 		 544 aa  579  1e-164  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.606639  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1662  alpha amylase, catalytic region  52.58 
 
 		 544 aa  581  1e-164  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.723863  normal  0.697753 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2620  alpha amylase catalytic region  52.97 
 
 		 560 aa  577  1.0000000000000001e-163  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2210  alpha amylase catalytic region  49.01 
 
 		 586 aa  573  1.0000000000000001e-162  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.408019  hitchhiker  0.00161183 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3112  alpha amylase protein  52.03 
 
 		 535 aa  563  1.0000000000000001e-159  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.364914  normal  0.605124 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3128  alpha amylase, catalytic region  54 
 
 		 542 aa  557  1e-157  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.209805  normal  0.0115348 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2028  alpha amylase, catalytic region  50.89 
 
 		 557 aa  555  1e-156  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0416  alpha amylase catalytic region  51.18 
 
 		 557 aa  543  1e-153  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2736  alpha amylase, catalytic region  50.88 
 
 		 543 aa  527  1e-148  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.70509  normal  0.436177 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4089  alpha amylase catalytic region  52.07 
 
 		 540 aa  524  1e-147  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2954  alpha amylase catalytic region  47.05 
 
 		 549 aa  512  1e-144  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0067439 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0184  alpha amylase, catalytic region  50.2 
 
 		 547 aa  514  1e-144  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.341726  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1891  alpha amylase, catalytic region  48.36 
 
 		 544 aa  511  1e-143  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.687574  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0835  alpha amylase catalytic region  42.13 
 
 		 549 aa  424  1e-117  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4891  alpha amylase, catalytic region  42.51 
 
 		 538 aa  412  1e-114  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4274  alpha amylase catalytic region  43.14 
 
 		 529 aa  402  1e-111  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0107  alpha amylase catalytic region  40.08 
 
 		 543 aa  400  9.999999999999999e-111  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0636933  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5242  alpha amylase catalytic region  43.17 
 
 		 538 aa  399  9.999999999999999e-111  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5528  alpha amylase catalytic region  41.49 
 
 		 545 aa  399  9.999999999999999e-111  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.283745  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0921  alpha amylase  40.27 
 
 		 568 aa  396  1e-109  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0194055 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0672  alpha amylase, catalytic region  42.55 
 
 		 533 aa  397  1e-109  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.227468 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1969  alpha amylase catalytic region  42.19 
 
 		 536 aa  395  1e-109  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.786718  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0307  alpha amylase catalytic subunit  43.16 
 
 		 525 aa  394  1e-108  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5769  alpha amylase catalytic region  41.13 
 
 		 535 aa  393  1e-108  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1475  alpha amylase catalytic region  40.86 
 
 		 553 aa  393  1e-108  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0810  alpha amylase, catalytic region  43.45 
 
 		 540 aa  395  1e-108  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.553058  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3687  alpha amylase, catalytic region  41.72 
 
 		 540 aa  393  1e-108  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5268  alpha amylase catalytic region  43.55 
 
 		 540 aa  389  1e-107  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1931  alpha amylase, catalytic region  42.86 
 
 		 541 aa  389  1e-107  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.126366  normal  0.0171494 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0917  alpha amylase, catalytic region  43.15 
 
 		 542 aa  389  1e-107  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0356  alpha amylase, catalytic region  39.56 
 
 		 564 aa  390  1e-107  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.171609  normal  0.628947 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3077  alpha amylase catalytic region  43.31 
 
 		 535 aa  385  1e-106  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0346516 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3863  alpha amylase catalytic region  42.44 
 
 		 541 aa  387  1e-106  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  decreased coverage  0.00249861  normal  0.684332 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0777  alpha amylase catalytic region  41.43 
 
 		 532 aa  382  1e-105  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.876516  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2303  alpha amylase catalytic region  45.35 
 
 		 448 aa  379  1e-104  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.190789 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5238  alpha amylase catalytic region  41.48 
 
 		 524 aa  380  1e-104  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0394755 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1595  alpha amylase catalytic region  42.72 
 
 		 528 aa  375  1e-103  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0451037 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0226  alpha amylase catalytic region  42.21 
 
 		 537 aa  377  1e-103  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.547651 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0942  oligo-1,6-glucosidase, putative  39.18 
 
 		 539 aa  367  1e-100  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3898  alpha amylase catalytic region  42.14 
 
 		 526 aa  366  1e-100  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.237178 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3169  alpha amylase, catalytic region  40.67 
 
 		 530 aa  363  4e-99  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1988  alpha amylase catalytic region  41.51 
 
 		 546 aa  357  1.9999999999999998e-97  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2294  Alpha amylase, catalytic region  41.44 
 
 		 542 aa  355  8.999999999999999e-97  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.960991  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2048  alpha amylase catalytic region  38.69 
 
 		 572 aa  347  3e-94  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.105277  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3310  alpha amylase, catalytic region  38.58 
 
 		 575 aa  346  6e-94  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3323  alpha amylase catalytic region  37.87 
 
 		 570 aa  343  2.9999999999999997e-93  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4167  alpha amylase catalytic region  37.08 
 
 		 574 aa  344  2.9999999999999997e-93  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.718668  hitchhiker  0.00459901 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7974  alpha amylase catalytic region  37.48 
 
 		 547 aa  340  4e-92  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3104  trehalose-6-phosphate hydrolase  41.27 
 
 		 515 aa  339  7e-92  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0986221  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1739  alpha amylase catalytic region  40.27 
 
 		 550 aa  337  3.9999999999999995e-91  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000285446  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0526  alpha amylase catalytic region  36.57 
 
 		 562 aa  336  7e-91  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2302  alpha amylase catalytic region  38.69 
 
 		 518 aa  333  3e-90  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1621  alpha,alpha-phosphotrehalase  35.45 
 
 		 563 aa  333  7.000000000000001e-90  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.459004  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0601  alpha amylase catalytic region  36.98 
 
 		 554 aa  331  2e-89  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000199149  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0775  alpha amylase, catalytic region  40.66 
 
 		 534 aa  331  2e-89  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2519  alpha amylase  35.56 
 
 		 582 aa  330  4e-89  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.252753 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1251  Alpha amylase, catalytic region  35.44 
 
 		 561 aa  328  1.0000000000000001e-88  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_08990  glycosidase  40.98 
 
 		 570 aa  329  1.0000000000000001e-88  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.134217  normal  0.0194138 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1070  alpha-glucosidase  35.28 
 
 		 551 aa  328  2.0000000000000001e-88  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.297332  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0354  alpha amylase catalytic region  36.8 
 
 		 554 aa  328  2.0000000000000001e-88  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0165  alpha amylase catalytic region  36.14 
 
 		 557 aa  327  2.0000000000000001e-88  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000167663  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0695  alpha amylase catalytic region  40.25 
 
 		 533 aa  327  3e-88  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.497083 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1564  alpha-D-1,4-glucosidase  35.51 
 
 		 549 aa  326  6e-88  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1595  alpha-D-1,4-glucosidase  35.51 
 
 		 549 aa  326  6e-88  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1532  alpha amylase catalytic region  40.31 
 
 		 532 aa  326  7e-88  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1154  alpha amylase catalytic region  35.94 
 
 		 577 aa  325  9e-88  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.144841  decreased coverage  0.0000326761 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1497  glycosidase  37.48 
 
 		 606 aa  325  1e-87  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.990687  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>