244 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnap_2398 on replicon NC_008781
Organism: Polaromonas naphthalenivorans CJ2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008781  Pnap_2398  TPR repeat-containing protein  100 
 
 		 287 aa  587  1e-167  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1523  Tfp pilus assembly protein PilF-like protein  51.89 
 
 		 202 aa  179  4e-44  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.546002  normal  0.0791762 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4146  tetratricopeptide TPR_2  44.69 
 
 		 203 aa  143  3e-33  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.631366  normal  0.0399426 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0157  TPR repeat-containing protein  31.25 
 
 		 465 aa  70.1  0.00000000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3569  tetratricopeptide TPR_2  26.71 
 
 		 314 aa  66.6  0.0000000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0913  TPR repeat-containing protein  26.75 
 
 		 280 aa  63.9  0.000000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.249159  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3062  hypothetical protein  27.22 
 
 		 391 aa  63.5  0.000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.386129 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0280  TPR domain-containing protein  26.89 
 
 		 1013 aa  62.8  0.000000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.416311 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1312  TPR repeat-containing protein  27.98 
 
 		 1069 aa  61.6  0.00000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.530092  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1172  TPR repeat-containing protein  27.98 
 
 		 4079 aa  61.2  0.00000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1300  TPR repeat-containing protein  26.25 
 
 		 878 aa  60.8  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1811  TPR repeat-containing protein  24.63 
 
 		 523 aa  60.1  0.00000004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1328  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  28.57 
 
 		 810 aa  60.1  0.00000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.929548  normal  0.0143336 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3643  TPR domain-containing protein  24.37 
 
 		 1979 aa  59.3  0.00000008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3015  TPR domain-containing protein  30.46 
 
 		 626 aa  58.9  0.00000008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0943  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  30.34 
 
 		 196 aa  59.3  0.00000008  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.104926  normal  0.485023 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0955  tetratricopeptide TPR_2  25.14 
 
 		 635 aa  58.9  0.00000009  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.750671 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2906  TPR repeat-containing protein  30.46 
 
 		 614 aa  58.9  0.00000009  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0475913  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1361  TPR repeat-containing protein  25.12 
 
 		 1276 aa  58.5  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2967  TPR repeat-containing protein  30.46 
 
 		 614 aa  58.9  0.0000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1827  TPR repeat-containing protein  27.01 
 
 		 761 aa  57.8  0.0000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0460239  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3209  tetratricopeptide repeat-containing protein  26.51 
 
 		 743 aa  57  0.0000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2893  O-linked N-acetylglucosamine transferase  27.61 
 
 		 397 aa  57  0.0000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.272299 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2369  TPR repeat-containing protein  33.33 
 
 		 639 aa  57.4  0.0000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.319986  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3996  tetratricopeptide TPR_2  23.46 
 
 		 1694 aa  57.4  0.0000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.271204  normal  0.601264 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1552  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  26.44 
 
 		 707 aa  56.6  0.0000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0225548 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1619  TPR domain-containing protein  31.03 
 
 		 626 aa  57  0.0000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0978258  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1840  TPR repeat-containing protein  26.72 
 
 		 3560 aa  56.6  0.0000005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2604  TPR repeat-containing protein  27.13 
 
 		 927 aa  56.6  0.0000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.010408  normal  0.426767 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0987  TPR repeat-containing protein  33.33 
 
 		 611 aa  56.6  0.0000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.384547  normal  0.0740288 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24101  hypothetical protein  25.45 
 
 		 725 aa  56.2  0.0000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0177  TPR repeat-containing protein  29.89 
 
 		 614 aa  56.2  0.0000006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0453  TPR domain-containing protein  29.89 
 
 		 626 aa  56.2  0.0000006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.311085  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3507  protein prenyltransferase, alpha subunit  27.91 
 
 		 1007 aa  56.2  0.0000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.223985 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4611  TPR domain-containing protein  28.19 
 
 		 615 aa  56.2  0.0000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.100536 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0970  TPR domain-containing protein  29.89 
 
 		 614 aa  56.2  0.0000006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2599  TPR domain-containing protein  29.89 
 
 		 614 aa  56.2  0.0000006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0734298  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2941  hypothetical protein  27.67 
 
 		 560 aa  56.2  0.0000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.000171884  normal  0.0147454 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1202  TPR repeat-containing protein  30.06 
 
 		 251 aa  56.2  0.0000007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0896861 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0698  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  26.92 
 
 		 784 aa  55.8  0.0000007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2853  TPR repeat-containing protein  26.09 
 
 		 3172 aa  55.8  0.0000008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3102  TPR repeat-containing protein  28.39 
 
 		 313 aa  55.8  0.0000009  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000142669  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0384  TPR repeat-containing protein  27.63 
 
 		 279 aa  55.8  0.0000009  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.890218  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0904  TPR repeat-containing protein  33.33 
 
 		 612 aa  55.5  0.000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.587904  normal  0.769196 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2934  tetratricopeptide TPR_2  27.2 
 
 		 135 aa  55.1  0.000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.000000970662  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4726  serine/threonine protein kinase with TPR repeats  25.23 
 
 		 730 aa  54.7  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1065  TPR repeat-containing protein  26.49 
 
 		 740 aa  54.7  0.000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.761998  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0637  TPR repeat-containing protein  30.25 
 
 		 4489 aa  54.3  0.000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0892  TPR repeat-containing protein  33.33 
 
 		 636 aa  54.7  0.000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.647896  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0060  TPR repeat-containing protein  25.6 
 
 		 562 aa  53.9  0.000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2791  TPR repeat-containing protein  30.77 
 
 		 243 aa  54.3  0.000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.185879 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0823  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  25.93 
 
 		 296 aa  53.9  0.000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0401477 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0481  TPR repeat-containing protein  26.81 
 
 		 3145 aa  53.9  0.000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.948354 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0529  Methyltransferase type 11  25.95 
 
 		 444 aa  53.5  0.000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1984  TPR repeat-containing protein  30.36 
 
 		 221 aa  53.5  0.000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.758199  normal  0.548252 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0549  TPR repeat-containing protein  32.18 
 
 		 635 aa  53.5  0.000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1028  TPR repeat-containing protein  32.18 
 
 		 635 aa  53.5  0.000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.608823  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1841  TPR repeat-containing protein  25.97 
 
 		 3035 aa  53.5  0.000004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0011  hypothetical protein  21.62 
 
 		 1138 aa  53.1  0.000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.41301  normal  0.0644501 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4141  TPR repeat-containing protein  32.18 
 
 		 637 aa  53.1  0.000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.780051  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4768  sulfotransferase  28.36 
 
 		 676 aa  53.1  0.000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.260339  normal  0.153237 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2328  TPR repeat-containing protein  27.44 
 
 		 363 aa  52.8  0.000006  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.759887 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0424  TPR repeat-containing protein  35.06 
 
 		 313 aa  52.4  0.000008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.446862  normal  0.0100173 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1516  tetratricopeptide repeat family protein  27.96 
 
 		 561 aa  52.4  0.000009  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3028  TPR repeat-containing protein  27.88 
 
 		 620 aa  52.4  0.000009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.985806  normal  0.0142271 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2403  tetratricopeptide TPR_4  27.92 
 
 		 267 aa  52  0.00001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.0000143988  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0661  TPR repeat-containing methyltransferase  27.96 
 
 		 561 aa  52.4  0.00001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.25847  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1492  glycosyl transferase family protein  26.45 
 
 		 1737 aa  52  0.00001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.315595  normal  0.552274 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4508  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  25.77 
 
 		 836 aa  51.6  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.885776 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0087  TPR repeat-containing protein  26.45 
 
 		 366 aa  51.6  0.00001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3295  TPR repeat-containing protein  27.78 
 
 		 311 aa  51.6  0.00002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5385  TPR repeat-containing protein  33.64 
 
 		 251 aa  51.2  0.00002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.493574  normal  0.361812 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0099  TPR repeat-containing protein  24.14 
 
 		 243 aa  50.8  0.00002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1793  TPR repeat-containing protein  27.17 
 
 		 213 aa  51.6  0.00002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2098  TPR repeat-containing protein  33.64 
 
 		 221 aa  51.6  0.00002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.359765  normal  0.445544 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7855  TPR domain-containing protein  27.71 
 
 		 648 aa  51.6  0.00002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.126864 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0191  TPR repeat-containing protein  23.17 
 
 		 250 aa  51.2  0.00002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.641193  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2953  TPR repeat-containing protein  23.95 
 
 		 711 aa  50.8  0.00002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0781794 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1622  TPR repeat-containing protein  29.69 
 
 		 254 aa  51.2  0.00002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1755  TPR repeat-containing protein  27.23 
 
 		 265 aa  50.4  0.00003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.0000044478  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1957  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  27.22 
 
 		 375 aa  50.4  0.00003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5998  tetratricopeptide TPR_2  33.64 
 
 		 251 aa  50.8  0.00003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2114  TPR repeat-containing protein  33.98 
 
 		 251 aa  50.8  0.00003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2079  TPR repeat-containing protein  33.64 
 
 		 251 aa  50.8  0.00003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.592897  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2895  O-linked N-acetylglucosamine transferase  24.8 
 
 		 292 aa  50.4  0.00004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0140366 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2005  TPR repeat-containing protein  24.16 
 
 		 512 aa  50.1  0.00004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.915591 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4159  TPR repeat-containing protein  22.08 
 
 		 467 aa  50.4  0.00004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00004642 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1606  tetratricopeptide TPR_2  22.3 
 
 		 240 aa  50.4  0.00004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.799027 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3352  TPR repeat-containing protein  29 
 
 		 404 aa  50.1  0.00004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00000220615  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0461  TPR repeat-containing protein  31.54 
 
 		 627 aa  49.7  0.00005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.999909  normal  0.380381 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1616  TPR repeat-containing protein  26.23 
 
 		 544 aa  49.7  0.00006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.797217  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2461  hypothetical protein  25.31 
 
 		 398 aa  49.3  0.00007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.125521  normal  0.0258605 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0641  TPR repeat-containing protein  25.42 
 
 		 1094 aa  49.3  0.00007  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.230386  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0959  hypothetical protein  27.88 
 
 		 620 aa  49.3  0.00007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.868556 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1636  TPR repeat-containing protein  27.54 
 
 		 968 aa  49.3  0.00007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.992619 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_20571  SAM-binding motif-containing protein  27.46 
 
 		 780 aa  49.3  0.00008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.183834 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0487  TPR repeat-containing protein  25.75 
 
 		 566 aa  48.5  0.0001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.679539 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2975  TPR repeat-containing protein  29.55 
 
 		 716 aa  48.5  0.0001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0511  TPR repeat-containing protein  30.37 
 
 		 581 aa  48.5  0.0001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2045  tetratricopeptide TPR_2  26.89 
 
 		 199 aa  48.5  0.0001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  unclonable  0.00000000000222916  normal  0.0184394 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>