More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_0109 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013061  Phep_0109  OmpA/MotB domain protein  100 
 
 		 585 aa  1212    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.012333  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5272  OmpA/MotB domain protein  47.19 
 
 		 613 aa  545  1e-154  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00153444  normal  0.0517848 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5752  OmpA/MotB domain protein  32.55 
 
 		 677 aa  301  3e-80  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.219859  normal  0.716064 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3973  OmpA/MotB domain-containing protein  29.62 
 
 		 642 aa  232  1e-59  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1311  OmpA/MotB domain protein  34.13 
 
 		 757 aa  211  3e-53  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.191554  normal  0.469378 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3584  OmpA/MotB domain protein  32.74 
 
 		 798 aa  195  2e-48  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.302775  normal  0.682864 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13643  OmpA family protein  26.67 
 
 		 665 aa  193  8e-48  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.830628  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2275  OmpA/MotB domain-containing protein  33.71 
 
 		 712 aa  192  2e-47  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2198  OmpA/MotB domain protein  30.14 
 
 		 594 aa  189  2e-46  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.00000013848  decreased coverage  0.000000000020207 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4540  OmpA/MotB domain-containing protein  27.15 
 
 		 643 aa  186  8e-46  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04495  OmpA family protein  33.72 
 
 		 626 aa  186  1.0000000000000001e-45  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.30865  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3950  OmpA/MotB domain-containing protein  26.33 
 
 		 653 aa  183  9.000000000000001e-45  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1058  OmpA family protein  27.18 
 
 		 672 aa  181  2.9999999999999997e-44  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.0880702 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1699  OmpA/MotB domain protein  26.93 
 
 		 650 aa  179  8e-44  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1700  OmpA/MotB domain protein  27.49 
 
 		 660 aa  176  1.9999999999999998e-42  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1647  OmpA/MotB domain-containing protein  30.9 
 
 		 666 aa  174  3.9999999999999995e-42  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1741  OmpA/MotB domain protein  30.49 
 
 		 586 aa  172  1e-41  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2183  OmpA/MotB domain protein  30.21 
 
 		 778 aa  171  3e-41  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.480779  normal  0.0613811 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3476  OmpA/MotB domain-containing protein  28.25 
 
 		 645 aa  171  3e-41  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.41488  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0125  outer membrane protein, peptidoglycan-associated lipoprotein  27.57 
 
 		 656 aa  160  6e-38  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.40578 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4945  OmpA/MotB domain protein  31.39 
 
 		 813 aa  160  7e-38  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4338  OmpA/MotB domain protein  29.86 
 
 		 648 aa  157  4e-37  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.553848 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3744  OmpA/MotB domain protein  25.96 
 
 		 679 aa  155  1e-36  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  decreased coverage  0.000811796  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0595  outer membrane protein A  27.46 
 
 		 734 aa  155  2e-36  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.00808098  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5203  OmpA/MotB domain protein  28.6 
 
 		 668 aa  149  1.0000000000000001e-34  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.543853  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3625  WD40 domain protein beta Propeller  27.22 
 
 		 471 aa  146  1e-33  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.13359  hitchhiker  0.000473153 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01035  OmpA family protein  25.61 
 
 		 630 aa  146  1e-33  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1710  OmpA family peptidoglycan-associated lipoprotein  27.26 
 
 		 640 aa  143  7e-33  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.00224676  normal  0.770798 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0482  OmpA family outer membrane protein  26.39 
 
 		 620 aa  136  9e-31  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.83961  normal  0.790259 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1561  OmpA family outer membrane protein  29.55 
 
 		 641 aa  132  2.0000000000000002e-29  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.322672  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2715  peptidoglycan-associated lipoprotein  25.98 
 
 		 673 aa  130  8.000000000000001e-29  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0234601  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0547  OmpA/MotB domain protein  26.75 
 
 		 671 aa  127  4.0000000000000003e-28  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1796  outer membrane protein 3a  31.68 
 
 		 903 aa  121  3.9999999999999996e-26  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.446296  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1705  OmpA/MotB domain protein  45.05 
 
 		 340 aa  120  9.999999999999999e-26  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.597429  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6933  OmpA/MotB domain protein  28.95 
 
 		 630 aa  119  9.999999999999999e-26  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.453004 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2606  outer membrane peptidoglycan-associated protein  27.19 
 
 		 710 aa  120  9.999999999999999e-26  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2141  outer membrane protein  26.92 
 
 		 510 aa  119  1.9999999999999998e-25  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.496848  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2066  OmpA/MotB domain protein  28.57 
 
 		 631 aa  117  7.999999999999999e-25  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0885806  normal  0.200128 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1585  OmpA family outer membrane protein  29 
 
 		 517 aa  111  4.0000000000000004e-23  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.167386  normal  0.202036 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2993  outer membrane protein  25.17 
 
 		 712 aa  110  5e-23  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1325  hypothetical protein  25.61 
 
 		 656 aa  107  4e-22  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.532479 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2714  outer membrane protein  29.74 
 
 		 648 aa  107  8e-22  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.882447  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1558  outer membrane protein  26.98 
 
 		 519 aa  106  9e-22  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.335417  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4115  OmpA/MotB domain protein  29.18 
 
 		 525 aa  106  1e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08086  hypothetical protein  43.64 
 
 		 366 aa  105  2e-21  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1781  OmpA/MotB domain protein  34.05 
 
 		 658 aa  105  3e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.973049 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2008  outer membrane protein  29.55 
 
 		 509 aa  104  5e-21  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.206588  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2185  outer membrane protein  29.32 
 
 		 694 aa  103  1e-20  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.138653 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0217  outer membrane protein, porin F precursor  28.35 
 
 		 669 aa  101  4e-20  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.440167 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0087  OmpA/MotB domain protein  26.94 
 
 		 638 aa  94.4  6e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.706049 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4274  OmpA/MotB domain protein  51.9 
 
 		 568 aa  93.6  1e-17  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.24355  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1713  outer membrane protein  36.45 
 
 		 631 aa  93.2  1e-17  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0180372  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3735  outer membrane protein  26.11 
 
 		 670 aa  91.7  4e-17  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3868  OmpA/MotB domain protein  41.23 
 
 		 412 aa  90.5  8e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5600  OmpA/MotB domain protein  39.82 
 
 		 537 aa  89.7  1e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.372086  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0046  OmpA/MotB domain protein  38.26 
 
 		 432 aa  84.3  0.000000000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.970824  normal  0.132697 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5477  OmpA/MotB domain protein  36.61 
 
 		 637 aa  81.6  0.00000000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.650705  normal  0.203536 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1932  outer membrane protein  32.35 
 
 		 424 aa  82  0.00000000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.259358 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4812  OmpA/MotB domain protein  37.01 
 
 		 1755 aa  81.6  0.00000000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1811  OmpA/MotB domain-containing protein  31.17 
 
 		 322 aa  79.7  0.0000000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  unclonable  0.000000000728339  normal  0.835393 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0187  peptidoglycan-associated outer membrane protein  38.55 
 
 		 239 aa  79.3  0.0000000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.281065  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3770  OmpA/MotB domain-containing protein  30.13 
 
 		 440 aa  78.6  0.0000000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1995  OmpA/MotB domain-containing protein  38.1 
 
 		 388 aa  76.6  0.000000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.00000000205838  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2532  OmpA/MotB  37.39 
 
 		 319 aa  76.3  0.000000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  unclonable  0.0000000000651702  n/a   
 
 
 
NC_007492  Pfl01_1221  OmpA/MotB  33.94 
 
 		 240 aa  75.5  0.000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4033  OmpA/MotB domain protein  36.61 
 
 		 374 aa  76.3  0.000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.659004  normal  0.277798 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4205  OmpA/MotB domain protein  36.28 
 
 		 427 aa  75.9  0.000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1698  Outer membrane protein and related peptidoglycan-associated (lipo)proteins-like  34.48 
 
 		 211 aa  75.1  0.000000000003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  unclonable  0.0000000000014556  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3747  OmpA/MotB family outer membrane protein  36.28 
 
 		 542 aa  74.7  0.000000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.598443  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3804  OmpA/MotB domain protein  35.4 
 
 		 543 aa  74.7  0.000000000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2738  OmpA/MotB domain protein  31.93 
 
 		 241 aa  74.7  0.000000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00260572  hitchhiker  0.0000108242 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2377  outer membrane protein/peptidoglycan-associated (lipo)proteins  36.51 
 
 		 427 aa  74.3  0.000000000006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  3.07612e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0313  OmpA/MotB domain-containing protein  34.71 
 
 		 537 aa  73.9  0.000000000007  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0125359  hitchhiker  0.00574347 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1397  OmpA/MotB  32.14 
 
 		 176 aa  73.9  0.000000000008  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2084  WD40 domain protein beta Propeller  38.73 
 
 		 293 aa  73.6  0.000000000009  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.243995 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3888  OmpA/MotB domain protein  35.4 
 
 		 544 aa  73.6  0.000000000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.457406  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1731  OmpA/MotB domain protein  31.39 
 
 		 623 aa  73.6  0.000000000009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.134193  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0800  OmpA/MotB domain protein  34.78 
 
 		 362 aa  73.2  0.00000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.193954  normal  0.0761778 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3118  OmpA/MotB domain-containing protein  40 
 
 		 242 aa  73.2  0.00000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0113937 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0958  OmpA/MotB domain-containing protein  39.09 
 
 		 243 aa  72.4  0.00000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0810  OmpA domain-containing protein  37.38 
 
 		 466 aa  72.8  0.00000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.716109  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4286  OmpA/MotB domain protein  32.09 
 
 		 540 aa  72.8  0.00000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.451181  normal  0.14038 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2795  outer membrane protein  33.93 
 
 		 266 aa  72.8  0.00000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1452  cysteine-rich repeat protein  35.78 
 
 		 1793 aa  72.4  0.00000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0416  outer membrane protein  35.04 
 
 		 1313 aa  72.8  0.00000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.541208  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03195  Thrombospondin type 3 repeat:OmpA/MotB  35.45 
 
 		 478 aa  72  0.00000000003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.889374  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4592  OmpA/MotB domain-containing protein  34.15 
 
 		 296 aa  72  0.00000000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2974  peptidoglycan-associated lipoprotein  33.64 
 
 		 190 aa  72  0.00000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.113547  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3279  OmpA/MotB domain-containing protein  37.5 
 
 		 219 aa  71.2  0.00000000005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.209932  normal  0.606856 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3949  OmpA/MotB family outer membrane protein  31.53 
 
 		 407 aa  71.2  0.00000000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.243665  normal  0.26275 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4460  peptidoglycan-associated lipoprotein  34.86 
 
 		 168 aa  70.9  0.00000000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.298566  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004183  outer membrane protein A precursor  35.85 
 
 		 320 aa  70.9  0.00000000006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02820  hypothetical protein  35.45 
 
 		 263 aa  70.9  0.00000000006  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02523  OmpA family outer membrane protein  33.91 
 
 		 365 aa  70.9  0.00000000007  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.654383  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3101  OmpA/MotB  33.03 
 
 		 230 aa  70.5  0.00000000007  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.282577  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0393  OmpA/MotB domain protein  34.82 
 
 		 399 aa  70.5  0.00000000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4643  OmpA/MotB domain protein  36.04 
 
 		 361 aa  70.1  0.0000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  unclonable  0.000000000815983  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1572  OmpA/MotB  39.45 
 
 		 212 aa  69.7  0.0000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  decreased coverage  0.00161285  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1796  OmpA/MotB  37.84 
 
 		 214 aa  69.7  0.0000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0221039  unclonable  0.00000303101 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3482  OmpA/MotB family outer membrane protein  34.23 
 
 		 217 aa  69.7  0.0000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000000110424  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>