More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC7424_4610 on replicon NC_011729
Organism: Cyanothece sp. PCC 7424



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011729  PCC7424_4610  ribonuclease II  100 
 
 		 635 aa  1319    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.715919 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2599  ribonuclease II  35.6 
 
 		 615 aa  347  3e-94  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.169398 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4448  ribonuclease II  30.83 
 
 		 617 aa  157  4e-37  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.345616 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0207  ribonuclease R  28.26 
 
 		 710 aa  143  9.999999999999999e-33  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0205  ribonuclease R  28.26 
 
 		 710 aa  142  9.999999999999999e-33  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1686  ribonuclease R  30.41 
 
 		 818 aa  135  3e-30  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.133651 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1292  ribonuclease R  28.74 
 
 		 751 aa  135  3e-30  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000149292  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1502  ribonuclease R  28.74 
 
 		 751 aa  134  3.9999999999999996e-30  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.211368  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2663  VacB/RNase II family 3'-5' exoribonuclease  30.73 
 
 		 833 aa  134  5e-30  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0424  VacB and RNase II family 3'-5' exoribonuclease  30.32 
 
 		 665 aa  133  7.999999999999999e-30  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.18374  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1019  ribonuclease R  29.78 
 
 		 694 aa  132  3e-29  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  decreased coverage  0.000000144778  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1200  ribonuclease R  31.11 
 
 		 751 aa  130  5.0000000000000004e-29  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2972  3'-5' exoribonuclease, VacB and RNase II:ribonuclease R  30 
 
 		 805 aa  130  8.000000000000001e-29  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2010  ribonuclease R  26.59 
 
 		 709 aa  130  8.000000000000001e-29  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000000115062  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2700  ribonuclease R  28.54 
 
 		 796 aa  130  1.0000000000000001e-28  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.749256  normal  0.419976 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1522  ribonuclease R  29.59 
 
 		 827 aa  129  2.0000000000000002e-28  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.351431  normal  0.0857248 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4688  3'-5' exoribonuclease, VacB and RNase II/ribonuclease R  29.59 
 
 		 828 aa  129  2.0000000000000002e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00492754  normal  0.623158 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1066  ribonuclease R  29.59 
 
 		 827 aa  129  2.0000000000000002e-28  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.152985  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf396  VacB-like exoribonuclease II  27.49 
 
 		 718 aa  129  2.0000000000000002e-28  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1546  ribonuclease R  29.59 
 
 		 827 aa  129  2.0000000000000002e-28  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0569328  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2136  ribonuclease R  27.61 
 
 		 714 aa  128  3e-28  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.101446  normal  0.136172 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1425  ribonuclease R  27.14 
 
 		 752 aa  127  4.0000000000000003e-28  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2152  exoribonuclease RNase R  28.35 
 
 		 720 aa  127  7e-28  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0145  ribonuclease R  29.01 
 
 		 838 aa  126  1e-27  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0667377  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1263  ribonuclease R  29.01 
 
 		 812 aa  126  1e-27  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1970  ribonuclease R  29.01 
 
 		 896 aa  126  1e-27  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1798  ribonuclease R  29.01 
 
 		 838 aa  126  1e-27  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0807236  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1747  ribonuclease R  29.01 
 
 		 896 aa  126  1e-27  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.906345  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1816  ribonuclease R  29.01 
 
 		 886 aa  126  1e-27  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1021  ribonuclease R  29.01 
 
 		 838 aa  126  1e-27  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.204339  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1468  ribonuclease R  29.32 
 
 		 817 aa  125  2e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.136516  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3067  exoribonuclease II  28.99 
 
 		 808 aa  125  2e-27  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.802811  normal  0.171629 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1976  ribonuclease R  29.88 
 
 		 746 aa  125  2e-27  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.00374672  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1447  ribonuclease R  29.32 
 
 		 817 aa  125  2e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1983  exoribonuclease II  29.7 
 
 		 744 aa  125  3e-27  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0944364 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0181  ribonuclease R  27.27 
 
 		 766 aa  125  3e-27  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.129563  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1513  ribonuclease R  29.02 
 
 		 704 aa  124  5e-27  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0815616  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2438  ribonuclease R  27.59 
 
 		 719 aa  124  6e-27  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2855  ribonuclease R  28.4 
 
 		 733 aa  124  6e-27  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.180659 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2955  ribonuclease R  28.46 
 
 		 762 aa  124  7e-27  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000417995  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0580  ribonuclease R  28.79 
 
 		 758 aa  123  9e-27  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000000747077 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2519  ribonuclease R  29.01 
 
 		 895 aa  123  9.999999999999999e-27  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  decreased coverage  0.00000714577  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1911  ribonuclease R  28.12 
 
 		 770 aa  123  9.999999999999999e-27  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0605  VacB/RNase II family exoribonuclease  28.25 
 
 		 783 aa  122  1.9999999999999998e-26  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2988  ribonuclease R  28.7 
 
 		 771 aa  122  3e-26  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.216479 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0774  ribonuclease R  27.74 
 
 		 886 aa  122  3e-26  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.223929 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3672  ribonuclease R  28.66 
 
 		 787 aa  121  3e-26  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.330393  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3378  ribonuclease R  29.09 
 
 		 1055 aa  122  3e-26  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0711  VacB and RNase II family 3'-5' exoribonuclease  29.04 
 
 		 619 aa  121  3e-26  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1228  exoribonuclease RNase R  28.57 
 
 		 871 aa  120  4.9999999999999996e-26  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.00057752  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2270  exoribonuclease II  27.57 
 
 		 656 aa  120  4.9999999999999996e-26  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0115056  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5873  ribonuclease R  29.91 
 
 		 825 aa  120  4.9999999999999996e-26  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0973  ribonuclease R  27.71 
 
 		 737 aa  120  6e-26  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1009  Exoribonuclease II  30.29 
 
 		 581 aa  120  7e-26  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0967775  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3671  ribonuclease R  27.64 
 
 		 705 aa  120  7e-26  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0988555  normal  0.127593 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0752  ribonuclease R  29.81 
 
 		 794 aa  120  7.999999999999999e-26  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1962  ribonuclease R  26.32 
 
 		 791 aa  120  7.999999999999999e-26  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.197804  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0765  ribonuclease R  26.62 
 
 		 795 aa  120  7.999999999999999e-26  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.429506  normal  0.51814 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2108  ribonuclease R  28.29 
 
 		 716 aa  120  9e-26  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0218671  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5232  ribonuclease R  27.7 
 
 		 806 aa  119  9.999999999999999e-26  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2072  RNAse R  28.42 
 
 		 870 aa  119  9.999999999999999e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.927626  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5278  ribonuclease R  27.7 
 
 		 806 aa  120  9.999999999999999e-26  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000124073  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1953  VacB/RNase II family 3'-5' exoribonuclease  29.34 
 
 		 735 aa  119  9.999999999999999e-26  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.223171  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3355  ribonuclease R  30.26 
 
 		 829 aa  119  9.999999999999999e-26  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.334074  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2237  ribonuclease R  28.7 
 
 		 770 aa  120  9.999999999999999e-26  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0146  ribonuclease R  27.62 
 
 		 757 aa  119  1.9999999999999998e-25  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.234188  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3572  ribonuclease R  29.14 
 
 		 773 aa  119  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.923698  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1232  ribonuclease R  28.66 
 
 		 736 aa  119  1.9999999999999998e-25  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03463  ribonuclease R  28.28 
 
 		 805 aa  119  1.9999999999999998e-25  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1342  exoribonuclease R  28.61 
 
 		 667 aa  119  1.9999999999999998e-25  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0844  ribonuclease R  27.89 
 
 		 681 aa  118  3e-25  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.360488  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1192  ribonuclease R  28.66 
 
 		 749 aa  118  3e-25  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1626  ribonuclease R  29.02 
 
 		 840 aa  118  3e-25  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0588631  normal  0.0102881 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2866  ribonuclease R  28.66 
 
 		 716 aa  118  3e-25  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0172601  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0448  exoribonuclease II  28.18 
 
 		 666 aa  118  3e-25  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0154818  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0770  ribonuclease R  27.59 
 
 		 708 aa  118  3.9999999999999997e-25  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.246847  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0659  ribonuclease R  27.88 
 
 		 842 aa  118  3.9999999999999997e-25  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0830  ribonuclease R  27.33 
 
 		 742 aa  117  5e-25  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1604  RNAse R  29.97 
 
 		 535 aa  117  5e-25  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0268007  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4921  ribonuclease R  27.64 
 
 		 814 aa  117  5e-25  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.411267  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4956  ribonuclease R  27.41 
 
 		 808 aa  117  6e-25  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.744879  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1707  ribonuclease R  28.06 
 
 		 833 aa  117  6e-25  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.497255  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1164  ribonuclease R  27.52 
 
 		 848 aa  117  6e-25  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.284134  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5334  ribonuclease R  27.41 
 
 		 808 aa  117  6e-25  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000223572  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2540  3'-5' exoribonuclease, VacB and RNase II  28.06 
 
 		 833 aa  117  6e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0548982  normal  0.714199 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5214  ribonuclease R  27.41 
 
 		 806 aa  117  6e-25  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.69895 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5243  ribonuclease R  27.41 
 
 		 808 aa  117  6e-25  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5709  ribonuclease R  27.41 
 
 		 812 aa  117  6.9999999999999995e-25  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0120471  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0737  ribonuclease R  28.07 
 
 		 852 aa  117  6.9999999999999995e-25  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.428134  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4808  ribonuclease R (RNase R)  27.41 
 
 		 804 aa  117  6.9999999999999995e-25  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000493308  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4818  ribonuclease R (RNase R)  27.41 
 
 		 810 aa  117  6.9999999999999995e-25  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.174115  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2247  ribonuclease R  29.02 
 
 		 788 aa  117  6.9999999999999995e-25  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.165281  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1319  hypothetical protein  29.65 
 
 		 718 aa  117  6.9999999999999995e-25  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.815351 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1353  ribonuclease R  28.39 
 
 		 722 aa  117  6.9999999999999995e-25  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00219332  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1697  ribonuclease R  27.3 
 
 		 817 aa  117  6.9999999999999995e-25  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.892677 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1482  VacB/Rnb family exoribonuclease  28.49 
 
 		 801 aa  117  7.999999999999999e-25  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.0098629  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6672  ribonuclease R  28.25 
 
 		 762 aa  117  7.999999999999999e-25  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.594925 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0570  ribonuclease R  27.42 
 
 		 783 aa  117  8.999999999999998e-25  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.864395  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0450  VacB/RNase II family exoribonuclease  26.42 
 
 		 792 aa  116  1.0000000000000001e-24  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4951  ribonuclease R  29.38 
 
 		 865 aa  116  1.0000000000000001e-24  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.408138 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>