160 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PA14_55860 on replicon NC_008463
Organism: Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008463  PA14_55860  hypothetical protein  100 
 
 		 303 aa  591  1e-168  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4867  hypothetical protein  93.4 
 
 		 303 aa  503  1e-141  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.234691  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4855  hypothetical protein  49.57 
 
 		 294 aa  209  5e-53  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4395  type II secretion system protein  47.83 
 
 		 294 aa  203  3e-51  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0844  type II secretion system protein  46.29 
 
 		 295 aa  186  4e-46  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0644  type II secretion system protein  49.78 
 
 		 296 aa  182  8.000000000000001e-45  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.807912  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2158  type II secretion system protein  47.9 
 
 		 312 aa  153  2.9999999999999998e-36  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.507846  normal  0.0329173 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1638  type II secretion system protein  34.48 
 
 		 300 aa  147  2.0000000000000003e-34  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.786377  normal  0.203569 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2794  putative tight adherence TadC related transmembrane protein  38.63 
 
 		 337 aa  121  9.999999999999999e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.637104  normal  0.388946 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1657  type II secretion system protein  37.34 
 
 		 336 aa  112  6e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.374218 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1728  type II secretion system protein  31.17 
 
 		 330 aa  112  9e-24  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000109718 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1447  type II secretion system protein  32.38 
 
 		 330 aa  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.411469  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS02590  putative tight adherence TadC related transmembrane protein  33.19 
 
 		 326 aa  107  2e-22  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2068  type II secretion system protein  30.77 
 
 		 334 aa  105  1e-21  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.807622  normal  0.674601 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1045  type II secretion system protein  32.62 
 
 		 321 aa  103  2e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1525  type II secretion system protein  32.62 
 
 		 332 aa  104  2e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.623315  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4362  type II secretion system protein  29.2 
 
 		 329 aa  103  3e-21  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.653734  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4252  type II secretion system protein  29.2 
 
 		 329 aa  103  3e-21  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.960786  normal  0.358405 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1772  type II secretion system protein  33.48 
 
 		 340 aa  103  3e-21  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.233431  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1286  hypothetical protein  33.77 
 
 		 336 aa  103  4e-21  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.220204  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1946  hypothetical protein  33.77 
 
 		 336 aa  103  4e-21  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.0000366161  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1774  type II secretion system protein  33.77 
 
 		 336 aa  103  4e-21  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.162167  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0121  hypothetical protein  33.77 
 
 		 336 aa  103  4e-21  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00162648  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1793  type II secretion system protein  33.77 
 
 		 336 aa  103  4e-21  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.105995  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1044  type II secretion system protein  33.77 
 
 		 336 aa  103  4e-21  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1407  type II secretion system protein  32.16 
 
 		 337 aa  102  6e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1501  type II secretion system protein  32.19 
 
 		 332 aa  102  7e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000000870782 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2538  hypothetical protein  33.33 
 
 		 373 aa  101  1e-20  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4449  type II secretion system protein  32.75 
 
 		 319 aa  100  3e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4665  Flp pilus assembly protein TadC  33.46 
 
 		 332 aa  96.3  5e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.502777  decreased coverage  0.000679832 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5413  type II secretion system protein  27.68 
 
 		 344 aa  94.7  2e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0382729  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1661  type II secretion system protein  34.87 
 
 		 297 aa  92.4  9e-18  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.146099  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2322  type II secretion system protein  31.69 
 
 		 312 aa  89.7  5e-17  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2700  tight adherence protein TadC  31.69 
 
 		 312 aa  89.7  5e-17  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2325  type II secretion system protein  30.67 
 
 		 311 aa  88.2  1e-16  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3510  type II secretion system protein  26.91 
 
 		 297 aa  86.7  5e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.426579  normal  0.148834 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0074  type II secretion system protein  27.16 
 
 		 315 aa  85.9  7e-16  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.557722  normal  0.8398 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002651  type II/IV secretion system protein TadC associated with Flp pilus assembly  25.64 
 
 		 313 aa  80.9  0.00000000000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2021  type II secretion system protein  26.78 
 
 		 320 aa  77  0.0000000000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.477325  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0650  putative tight adherence TadC-related transmembrane protein  28.57 
 
 		 315 aa  76.3  0.0000000000007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.640477  normal  0.167986 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0639  type II secretion system protein  26.64 
 
 		 323 aa  75.9  0.0000000000008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.297778 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1916  type II secretion system protein  24.17 
 
 		 312 aa  75.5  0.000000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.141806  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7193  putative Flp pilus assembly protein TadC  29.57 
 
 		 324 aa  74.7  0.000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.202721  normal  0.456008 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0793  TadC protein  29.07 
 
 		 315 aa  73.9  0.000000000003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2364  putative putative tight adherence TadC-like transmembrane protein  27.39 
 
 		 321 aa  72.8  0.000000000007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00226483  normal  0.0303282 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2276  hypothetical protein  28.26 
 
 		 296 aa  71.6  0.00000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3658  type II secretion system protein, transmembrane  27.94 
 
 		 369 aa  71.6  0.00000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2649  type II secretion system protein  25.91 
 
 		 323 aa  71.2  0.00000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5490  type II secretion system protein  28.4 
 
 		 324 aa  71.2  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6776  type II secretion system protein  28.4 
 
 		 324 aa  71.2  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.710361  normal  0.399772 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6364  type II secretion system protein  28.4 
 
 		 324 aa  71.2  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3093  type II secretion system protein  27.83 
 
 		 319 aa  70.9  0.00000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1318  type II secretion system protein  27.83 
 
 		 319 aa  70.1  0.00000000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2968  type II secretion system protein  27.83 
 
 		 319 aa  70.1  0.00000000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4188  type II secretion system protein  25.19 
 
 		 328 aa  69.7  0.00000000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1754  Flp pilus assembly protein TadC  25.5 
 
 		 326 aa  68.9  0.0000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0728  type II secretion system protein  28.34 
 
 		 333 aa  67.8  0.0000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.552842  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0374  type II secretion system protein F  26.54 
 
 		 292 aa  66.6  0.0000000005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.249846  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0296  type II secretion system protein  24.1 
 
 		 325 aa  64.3  0.000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0806  type II secretion system protein  23.42 
 
 		 316 aa  64.3  0.000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1107  type II secretion system protein  27.19 
 
 		 323 aa  64.7  0.000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.107682  normal  0.160043 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2047  type II secretion system protein  30.17 
 
 		 318 aa  65.1  0.000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0677944  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0653  TadC protein  23.53 
 
 		 313 aa  63.9  0.000000003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.179736 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0992  type II secretion system protein  25 
 
 		 326 aa  63.9  0.000000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.236675  normal  0.765371 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2557  type II secretion system protein  26.88 
 
 		 314 aa  63.9  0.000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.59617  normal  0.347898 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0543  type II secretion system protein  25.8 
 
 		 313 aa  63.9  0.000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0603407  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3011  type II secretion system protein  29.06 
 
 		 319 aa  63.9  0.000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2016  type II secretion system protein  28 
 
 		 307 aa  63.9  0.000000004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0386  type II secretion system protein  23.29 
 
 		 325 aa  63.2  0.000000005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0300  type II secretion system protein  24.79 
 
 		 323 aa  63.2  0.000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6300  type II secretion system protein  27.8 
 
 		 323 aa  62.8  0.000000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.923016 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2118  type II secretion system protein  29.95 
 
 		 310 aa  62.4  0.000000009  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.128736  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1903  putative Flp pilus assembly protein TadC  25.13 
 
 		 326 aa  61.6  0.00000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0926452  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0552  type II secretion system protein  25.13 
 
 		 326 aa  61.6  0.00000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2736  type II secretion system protein  27.47 
 
 		 326 aa  62.4  0.00000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2694  type II secretion system protein  25.57 
 
 		 320 aa  60.5  0.00000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1754  type II secretion system protein  26.34 
 
 		 295 aa  60.5  0.00000004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00143607  normal  0.105402 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1779  type II secretion system protein  22.54 
 
 		 324 aa  59.7  0.00000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.708691  normal  0.127788 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3525  type II secretion system protein  23.6 
 
 		 324 aa  60.1  0.00000005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.359223  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1276  type II secretion system protein  29.17 
 
 		 311 aa  59.7  0.00000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2698  type II secretion system protein  26.8 
 
 		 302 aa  59.3  0.00000007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2379  type II secretion system protein  23.51 
 
 		 321 aa  59.3  0.00000008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.306938  normal  0.924554 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1530  type II secretion system protein  25.91 
 
 		 301 aa  58.9  0.00000009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0586  type II secretion system protein  28.25 
 
 		 320 aa  58.9  0.0000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.180812  normal  0.546922 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0424  type II secretion system protein  23.11 
 
 		 331 aa  58.5  0.0000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.628499  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0672  type II secretion system protein  25.6 
 
 		 319 aa  58.5  0.0000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.139102  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3357  type II secretion system protein  25.32 
 
 		 327 aa  58.5  0.0000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6004  type II secretion system protein  26.64 
 
 		 324 aa  58.5  0.0000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1125  type II secretion system protein  24.22 
 
 		 347 aa  58.2  0.0000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.394553  normal  0.522315 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1723  type II secretion system protein  22.26 
 
 		 296 aa  57.4  0.0000003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1813  type II secretion system protein  23.35 
 
 		 426 aa  57.4  0.0000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  decreased coverage  0.00328504  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4205  type II secretion system protein  23.74 
 
 		 324 aa  57  0.0000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.125721  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4619  type II secretion system protein  22.61 
 
 		 318 aa  57.8  0.0000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.340215 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7036  putative pilus assembly protein  24.78 
 
 		 324 aa  57.4  0.0000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.452255 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3796  type II secretion system protein  26.17 
 
 		 325 aa  57.4  0.0000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.472243  normal  0.57339 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3795  type II secretion system protein  26.9 
 
 		 321 aa  57  0.0000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0212  component of type IV pilus  25.29 
 
 		 326 aa  56.6  0.0000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0900  Type II secretion system F domain protein  25.6 
 
 		 319 aa  56.6  0.0000005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1517  hypothetical protein  22.71 
 
 		 320 aa  56.2  0.0000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.205257  normal  0.198842 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1124  type II secretion system protein  26.9 
 
 		 331 aa  56.2  0.0000007  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0315206  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>