More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene P9303_25101 on replicon NC_008820
Organism: Prochlorococcus marinus str. MIT 9303



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008820  P9303_25101  hypothetical protein  100 
 
 
669 aa  1301    Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_25041  hypothetical protein  56.35 
 
 
574 aa  461  9.999999999999999e-129  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_25071  hypothetical protein  51.42 
 
 
615 aa  457  1e-127  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_19271  hypothetical protein  46.1 
 
 
693 aa  443  1e-123  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.381808 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_19291  hypothetical protein  56.72 
 
 
479 aa  394  1e-108  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.533116 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_02081  hypothetical protein  54.26 
 
 
102 aa  115  2.0000000000000002e-24  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_21531  hypothetical protein  76.92 
 
 
70 aa  97.4  7e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.385195 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_00951  hypothetical protein  39.82 
 
 
373 aa  75.1  0.000000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.139227 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3664  hemolysin-type calcium-binding region  33.16 
 
 
678 aa  72.4  0.00000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.157401  normal  0.209171 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4162  outer membrane adhesin like proteiin  46.94 
 
 
4687 aa  69.3  0.0000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4317  RTX toxin, putative  39.81 
 
 
2768 aa  68.2  0.0000000005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0803  5'-nucleotidase  49.41 
 
 
2667 aa  67.8  0.0000000007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3182  putative outer membrane adhesin like proteiin  38.52 
 
 
2678 aa  67  0.000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0249  putative calcium binding hemolysin protein  41.44 
 
 
1499 aa  66.2  0.000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.74922  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0186  hypothetical protein  45.88 
 
 
6753 aa  65.9  0.000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.306412 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3548  glycoside hydrolase family 16  42.86 
 
 
486 aa  65.5  0.000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3615  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  51.81 
 
 
868 aa  65.1  0.000000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.705484  normal  0.0425486 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3539  hemolysin-type calcium-binding region, RTX  39.34 
 
 
556 aa  65.1  0.000000005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.223263  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2370  Ig family protein  38.98 
 
 
2954 aa  64.7  0.000000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0168  surface adhesion protein, putative  42.99 
 
 
8682 aa  63.9  0.000000009  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.810778 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0188  hypothetical protein  42.99 
 
 
9030 aa  63.9  0.000000009  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.0220008 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3216  hypothetical protein  35.66 
 
 
595 aa  63.9  0.000000009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  decreased coverage  0.00990527  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0246  putative calcium binding hemolysin protein  39.64 
 
 
1156 aa  63.5  0.00000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.383795  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0133  von Willebrand factor, type A  45.78 
 
 
5218 aa  63.9  0.00000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.809343 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51250  Secreted bifunctional mannuronan C-5 epimerase/alginate lyase  50 
 
 
856 aa  63.2  0.00000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2124  hemolysin-type calcium-binding region  34.67 
 
 
946 aa  63.2  0.00000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1662  hemolysin-type calcium-binding region  36.14 
 
 
260 aa  62.4  0.00000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0986  Hemolysin-type calcium binding domain protein  35.71 
 
 
4798 aa  62  0.00000004  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2993  Hemolysin-type calcium-binding region  42.42 
 
 
507 aa  61.6  0.00000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1696  metallophosphoesterase  40.2 
 
 
2105 aa  62  0.00000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3258  putative outer membrane adhesin like protein  44.16 
 
 
4214 aa  61.2  0.00000005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.523735 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0275  Hemolysin-type calcium-binding region  35.04 
 
 
206 aa  61.6  0.00000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_5032  hemolysin-type calcium-binding region  36.57 
 
 
387 aa  61.2  0.00000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.867375 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0384  putative outer membrane adhesin like protein  46.67 
 
 
5442 aa  61.2  0.00000006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4192  hemolysin-type calcium-binding region  40.78 
 
 
1287 aa  60.8  0.00000008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.055815  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0491  outer membrane adhesin like proteiin  38.46 
 
 
7149 aa  60.5  0.00000009  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3435  hemolysin-type calcium-binding region  43.56 
 
 
219 aa  60.5  0.00000009  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.489484  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3089  hemolysin-type calcium-binding region:haemolysin-type calcium binding related  42.11 
 
 
2689 aa  60.1  0.0000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.470754 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2165  glycoside hydrolase family protein  35.07 
 
 
475 aa  60.1  0.0000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.669505  normal  0.045019 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2246  VCBS  47.5 
 
 
5769 aa  60.5  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4079  sulfate ABC transporter, periplasmic sulfate-binding protein  41.07 
 
 
485 aa  60.1  0.0000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.237943  normal  0.0279439 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0514  RTX toxins and related Ca2+-binding protein  37.12 
 
 
1279 aa  60.5  0.0000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3576  hemolysin-type calcium-binding region  42.7 
 
 
547 aa  60.1  0.0000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.996068  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0793  hemolysin-type calcium-binding region  40 
 
 
795 aa  60.1  0.0000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.873812  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0484  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  36.22 
 
 
2668 aa  60.5  0.0000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4084  mannuronan C-5-epimerase, putative  40 
 
 
1610 aa  59.3  0.0000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.202459  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0379  VCBS  42.68 
 
 
7284 aa  59.7  0.0000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.943155 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1215  type 1 secretion target domain protein  47.5 
 
 
2542 aa  59.7  0.0000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1349  hemolysin-type calcium-binding region  37.72 
 
 
744 aa  59.7  0.0000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.156878  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0568  hemolysin-type calcium-binding region  34.88 
 
 
411 aa  59.7  0.0000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.294597  hitchhiker  0.0000308959 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5060  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  41.05 
 
 
5962 aa  59.7  0.0000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.943676 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3591  putative outer membrane adhesin like proteiin  39.33 
 
 
4220 aa  59.7  0.0000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1952  triacylglycerol lipase  44.87 
 
 
622 aa  59.3  0.0000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2424  glycoside hydrolase family protein  36.7 
 
 
467 aa  59.7  0.0000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.443188 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1701  5'-nucleotidase domain-containing protein  39.82 
 
 
980 aa  59.7  0.0000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.507606  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2786  hemolysin-type calcium-binding region  37.5 
 
 
518 aa  59.3  0.0000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.248121  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0477  NHL repeat-containing protein  45.33 
 
 
525 aa  58.9  0.0000003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.176502 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5158  hemolysin-type calcium-binding region  33.1 
 
 
1534 aa  58.9  0.0000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.316127  normal  0.475522 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0513  hypothetical protein  34.33 
 
 
475 aa  58.9  0.0000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1562  RTX toxins and related Ca2+-binding proteins-like  33.12 
 
 
769 aa  58.9  0.0000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.618227  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0281  protein of unknown function DUF839  41.57 
 
 
686 aa  58.9  0.0000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3521  hypothetical protein  39.81 
 
 
161 aa  58.9  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0357588  normal  0.598556 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2034  RTX toxins and related Ca2+-binding protein  40.18 
 
 
1363 aa  58.5  0.0000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.055815  normal  0.277467 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1874  Hemolysin-type calcium-binding region  42.34 
 
 
4334 aa  58.9  0.0000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5002  hemolysin-type calcium-binding region  32.64 
 
 
1532 aa  58.5  0.0000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0763111  normal  0.53255 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1648  hemolysin-type calcium binding protein  54.55 
 
 
940 aa  58.5  0.0000004  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0627  peptidase M10, serralysin-like protein  35.62 
 
 
606 aa  58.5  0.0000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4191  hemolysin-type calcium-binding region  42.67 
 
 
982 aa  58.5  0.0000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.735923  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4754  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  41 
 
 
3427 aa  58.5  0.0000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0382  putative outer membrane adhesin like proteiin  40 
 
 
5839 aa  58.5  0.0000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0583  putative Ig  50.79 
 
 
1055 aa  58.2  0.0000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4728  endonuclease/exonuclease/phosphatase  37.62 
 
 
2346 aa  58.2  0.0000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3872  hemolysin-type calcium-binding region  40.54 
 
 
1895 aa  58.2  0.0000005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.308786  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1592  hemolysin-type calcium binding domain-containing protein  36.13 
 
 
1789 aa  58.2  0.0000005  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5716  CHRD domain containing protein  35.78 
 
 
460 aa  58.2  0.0000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1710  hemolysin-type calcium-binding region  39.09 
 
 
1582 aa  57.8  0.0000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51190  Secreted mannuronan C-5 epimerase  45.24 
 
 
1403 aa  57.8  0.0000006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.156968  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1441  Ig family protein  41.05 
 
 
2245 aa  57.8  0.0000007  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.195412  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0424  hemolysin-type calcium-binding region  44.87 
 
 
1017 aa  57.4  0.0000008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.316008  normal  0.221114 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06446  hypothetical protein  48.28 
 
 
959 aa  57.4  0.0000008  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_49350  hypothetical protein  49.25 
 
 
889 aa  57.4  0.0000008  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0314  putative outer membrane adhesin like proteiin  46.67 
 
 
1553 aa  57.4  0.0000009  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0526571  normal 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8151  CHRD domain containing protein  35.2 
 
 
460 aa  57  0.000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.159577  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_12801  hypothetical protein  41.24 
 
 
339 aa  57  0.000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.103012 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1622  putative hemolysin precursor  48.05 
 
 
504 aa  57  0.000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.0615311 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1697  endonuclease/exonuclease/phosphatase  37.38 
 
 
1795 aa  57  0.000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1566  outer membrane adhesin like proteiin  37.5 
 
 
1712 aa  56.6  0.000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.6196  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2490  hemolysin-type calcium-binding protein  41.67 
 
 
833 aa  56.6  0.000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0747804  normal  0.0246403 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3766  hemolysin-type calcium-binding protein  44.12 
 
 
1166 aa  57  0.000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.234003  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0384  hypothetical protein  54.72 
 
 
4285 aa  56.6  0.000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0419  hemolysin-type calcium-binding region  44.87 
 
 
1022 aa  57  0.000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0591  FG-GAP  40.38 
 
 
813 aa  56.6  0.000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.41506  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2204  peptidase M23  35.96 
 
 
999 aa  57  0.000001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2298  hemolysin-type calcium binding protein  36.28 
 
 
1480 aa  57  0.000001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.880239  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0313  putative outer membrane adhesin like proteiin  52.31 
 
 
4836 aa  57  0.000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.971398 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3060  von Willebrand factor type A  43.75 
 
 
4678 aa  57.4  0.000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1795  Allergen V5/Tpx-1 family protein  34.44 
 
 
421 aa  57  0.000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.797719 
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3695  proprotein convertase P  39.25 
 
 
2911 aa  56.2  0.000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.523637 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2690  hemolysin-type calcium-binding region  47.14 
 
 
767 aa  56.2  0.000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.969151  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0791  heme peroxidase  40.96 
 
 
2950 aa  56.2  0.000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>