More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene P9303_19291 on replicon NC_008820
Organism: Prochlorococcus marinus str. MIT 9303



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008820  P9303_19291  hypothetical protein  100 
 
 
479 aa  945    Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.533116 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_19271  hypothetical protein  80.43 
 
 
693 aa  559  1e-158  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.381808 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_25041  hypothetical protein  60.82 
 
 
574 aa  452  1.0000000000000001e-126  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_25071  hypothetical protein  56.59 
 
 
615 aa  415  9.999999999999999e-116  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_25101  hypothetical protein  61.39 
 
 
669 aa  370  1e-101  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_02081  hypothetical protein  50.96 
 
 
102 aa  89  2e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0249  putative calcium binding hemolysin protein  40.35 
 
 
1499 aa  77.4  0.0000000000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.74922  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1662  hemolysin-type calcium-binding region  36.81 
 
 
260 aa  76.3  0.000000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_21531  hypothetical protein  63.49 
 
 
70 aa  73.6  0.000000000008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.385195 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0246  putative calcium binding hemolysin protein  42.34 
 
 
1156 aa  72.8  0.00000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.383795  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5002  hemolysin-type calcium-binding region  35.66 
 
 
1532 aa  69.3  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0763111  normal  0.53255 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0986  Hemolysin-type calcium binding domain protein  39.74 
 
 
4798 aa  69.3  0.0000000001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5158  hemolysin-type calcium-binding region  42.06 
 
 
1534 aa  68.6  0.0000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.316127  normal  0.475522 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0168  surface adhesion protein, putative  48.86 
 
 
8682 aa  68.2  0.0000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.810778 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0188  hypothetical protein  48.86 
 
 
9030 aa  68.2  0.0000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.0220008 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3548  glycoside hydrolase family 16  35.77 
 
 
486 aa  66.6  0.0000000008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0186  hypothetical protein  45.45 
 
 
6753 aa  65.9  0.000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.306412 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5716  CHRD domain containing protein  36.47 
 
 
460 aa  65.5  0.000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1905  putative outer membrane adhesin like proteiin  41.67 
 
 
1963 aa  64.7  0.000000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.849124 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0133  von Willebrand factor, type A  48.15 
 
 
5218 aa  64.7  0.000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.809343 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2786  hemolysin-type calcium-binding region  37.01 
 
 
518 aa  64.7  0.000000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.248121  n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_4929  hemolysin-type calcium-binding region  38.81 
 
 
2097 aa  64.7  0.000000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3408  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  50 
 
 
547 aa  64.7  0.000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.230394 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3467  hemolysin-type calcium-binding region  40.68 
 
 
1175 aa  64.3  0.000000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1697  endonuclease/exonuclease/phosphatase  44.09 
 
 
1795 aa  63.9  0.000000007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3509  hemolysin-type calcium-binding region, RTX  38.13 
 
 
202 aa  63.5  0.000000008  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3154  hemolysin-type calcium-binding region  38.13 
 
 
202 aa  63.5  0.000000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.0996816 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6816  Hemolysin-type calcium-binding region  40.17 
 
 
526 aa  63.5  0.000000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4162  outer membrane adhesin like proteiin  45 
 
 
4687 aa  63.5  0.000000009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4079  sulfate ABC transporter, periplasmic sulfate-binding protein  41.96 
 
 
485 aa  63.2  0.00000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.237943  normal  0.0279439 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3539  hemolysin-type calcium-binding region, RTX  45.65 
 
 
556 aa  62.8  0.00000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.223263  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2124  hemolysin-type calcium-binding region  35.1 
 
 
946 aa  62.8  0.00000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0514  RTX toxins and related Ca2+-binding protein  41.07 
 
 
1279 aa  63.2  0.00000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1441  Ig family protein  50.7 
 
 
2245 aa  62  0.00000002  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.195412  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5959  outer membrane adhesin like proteiin  47.44 
 
 
2567 aa  62  0.00000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.33422  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5060  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  46.25 
 
 
5962 aa  62.4  0.00000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.943676 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3182  putative outer membrane adhesin like proteiin  45.65 
 
 
2678 aa  62  0.00000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0484  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  43.37 
 
 
2668 aa  61.2  0.00000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0275  Hemolysin-type calcium-binding region  37.72 
 
 
206 aa  62  0.00000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4728  endonuclease/exonuclease/phosphatase  36.29 
 
 
2346 aa  61.2  0.00000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0122  hemolysin-type calcium-binding region  41.18 
 
 
534 aa  61.2  0.00000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.589398  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3615  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  46.43 
 
 
868 aa  61.2  0.00000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.705484  normal  0.0425486 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2424  glycoside hydrolase family protein  37.1 
 
 
467 aa  61.2  0.00000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.443188 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4004  hemolysin-type calcium-binding region  37.98 
 
 
424 aa  60.8  0.00000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0281  protein of unknown function DUF839  46.05 
 
 
686 aa  60.8  0.00000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2550  putative outer membrane adhesin like protein  53.33 
 
 
3598 aa  60.5  0.00000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8151  CHRD domain containing protein  40.2 
 
 
460 aa  60.5  0.00000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.159577  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2246  VCBS  45.24 
 
 
5769 aa  60.1  0.00000008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1701  5'-nucleotidase domain-containing protein  39.09 
 
 
980 aa  60.1  0.00000009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.507606  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1247  Hemolysin-type calcium-binding region  38.82 
 
 
965 aa  59.7  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007490  RSP_4242  hemolysin-type calcium-binding protein  28.63 
 
 
1544 aa  59.3  0.0000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1874  Hemolysin-type calcium-binding region  38.61 
 
 
4334 aa  59.3  0.0000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2593  periplasmic protein TonB links inner and outer membranes-like  43.18 
 
 
1197 aa  59.3  0.0000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0238559  normal  0.0624657 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2704  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase, cyclophilin type  41.3 
 
 
453 aa  59.3  0.0000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0626056 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1215  type 1 secretion target domain protein  45.16 
 
 
2542 aa  59.3  0.0000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3871  RTX toxins and related Ca2+-binding protein-like protein  38.13 
 
 
1164 aa  59.3  0.0000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.318671  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4317  RTX toxin, putative  38.89 
 
 
2768 aa  58.9  0.0000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3089  hemolysin-type calcium-binding region:haemolysin-type calcium binding related  43.04 
 
 
2689 aa  59.3  0.0000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.470754 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1114  hemolysin-type calcium-binding toxin  43.9 
 
 
280 aa  59.3  0.0000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.437868  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0158  Hemolysin-type calcium-binding protein  46.05 
 
 
1145 aa  58.9  0.0000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06446  hypothetical protein  49.33 
 
 
959 aa  58.9  0.0000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3885  RTX cytolytic toxin protein A  39.45 
 
 
1394 aa  58.9  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4711  putative secreted calcium-binding protein  37.29 
 
 
219 aa  58.5  0.0000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.779916  normal  0.14825 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2993  Hemolysin-type calcium-binding region  34.09 
 
 
507 aa  58.9  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3664  hemolysin-type calcium-binding region  31.54 
 
 
678 aa  58.9  0.0000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.157401  normal  0.209171 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4754  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  42.35 
 
 
3427 aa  58.9  0.0000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3872  hemolysin-type calcium-binding region  39.45 
 
 
1895 aa  58.5  0.0000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.308786  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4084  mannuronan C-5-epimerase, putative  37.36 
 
 
1610 aa  58.5  0.0000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.202459  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0803  5'-nucleotidase  37.5 
 
 
2667 aa  58.5  0.0000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4191  hemolysin-type calcium-binding region  41.67 
 
 
982 aa  58.2  0.0000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.735923  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1936  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  40.91 
 
 
1016 aa  58.2  0.0000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0382  putative outer membrane adhesin like proteiin  40.7 
 
 
5839 aa  58.5  0.0000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3265  Ig family protein  45.65 
 
 
3209 aa  57.8  0.0000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.594871  decreased coverage  0.00759247 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06445  bifunctional hemolysin-adenylate cyclase  49.33 
 
 
860 aa  57.8  0.0000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2165  glycoside hydrolase family protein  35.56 
 
 
475 aa  58.2  0.0000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.669505  normal  0.045019 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4582  Hemolysin-type calcium-binding region  41.1 
 
 
639 aa  58.2  0.0000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.518219 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_00951  hypothetical protein  34.09 
 
 
373 aa  57.8  0.0000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.139227 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3591  putative outer membrane adhesin like proteiin  36.36 
 
 
4220 aa  57.4  0.0000005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0805  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  39.47 
 
 
1236 aa  57.4  0.0000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5060  hemolysin-type calcium-binding region  37.04 
 
 
396 aa  57.8  0.0000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2335  hemolysin-type calcium-binding region  49.25 
 
 
2198 aa  57.8  0.0000005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3216  hypothetical protein  33.55 
 
 
595 aa  57.4  0.0000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  decreased coverage  0.00990527  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3878  lipase  39.62 
 
 
709 aa  57.4  0.0000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0292806 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51170  Secreted mannuronan C-5 epimerase  40.22 
 
 
1839 aa  57.4  0.0000006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3060  von Willebrand factor type A  42.86 
 
 
4678 aa  57.4  0.0000006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2160  Hemolysin-type calcium-binding region  38.18 
 
 
3954 aa  57.4  0.0000006  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3521  hypothetical protein  48.81 
 
 
161 aa  57.4  0.0000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0357588  normal  0.598556 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0477  NHL repeat-containing protein  43.42 
 
 
525 aa  57.4  0.0000006  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.176502 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0591  FG-GAP  44.74 
 
 
813 aa  57.4  0.0000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.41506  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2776  hemolysin-type calcium-binding toxin  42.68 
 
 
280 aa  57.4  0.0000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.784877 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1242  Hemolysin-type calcium-binding region  38.16 
 
 
1400 aa  57  0.0000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1592  hemolysin-type calcium binding domain-containing protein  38.52 
 
 
1789 aa  57  0.0000007  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0424  hemolysin-type calcium-binding region  41.76 
 
 
1017 aa  57  0.0000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.316008  normal  0.221114 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2034  RTX toxins and related Ca2+-binding protein  38.21 
 
 
1363 aa  57  0.0000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.055815  normal  0.277467 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33710  Secreted mannuronan C5-epimerase  38.68 
 
 
998 aa  57  0.0000008  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0513  hypothetical protein  34.81 
 
 
475 aa  56.6  0.0000008  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0419  hemolysin-type calcium-binding region  42.7 
 
 
1022 aa  57  0.0000008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2319  FG-GAP repeat-containing protein  47.76 
 
 
2807 aa  57  0.0000008  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3435  hemolysin-type calcium-binding region  42.31 
 
 
219 aa  57  0.0000008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.489484  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4186  hypothetical protein  33.06 
 
 
760 aa  56.6  0.0000009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.394785 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>