More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene OEOE_0427 on replicon NC_008528
Organism: Oenococcus oeni PSU-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009513  Lreu_1444  DNA ligase, NAD-dependent  59.47 
 
 		 680 aa  830    Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0179686  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0286  NAD-dependent DNA ligase LigA  49.77 
 
 		 669 aa  645    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0271  NAD-dependent DNA ligase LigA  49.7 
 
 		 670 aa  657    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0427  NAD-dependent DNA ligase  100 
 
 		 684 aa  1410    Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1515  NAD-dependent DNA ligase  55.54 
 
 		 668 aa  741    Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  0.872196 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0568  NAD-dependent DNA ligase  61.46 
 
 		 680 aa  869    Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0352  NAD-dependent DNA ligase LigA  48.64 
 
 		 669 aa  632  1e-180  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4968  NAD-dependent DNA ligase LigA  48.49 
 
 		 669 aa  629  1e-179  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0472  NAD-dependent DNA ligase LigA  49.57 
 
 		 686 aa  630  1e-179  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1513  NAD-dependent DNA ligase LigA  50.23 
 
 		 648 aa  628  1e-179  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0292  NAD-dependent DNA ligase LigA  48.19 
 
 		 669 aa  626  1e-178  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0276  NAD-dependent DNA ligase LigA  48.19 
 
 		 669 aa  626  1e-178  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0279  NAD-dependent DNA ligase LigA  48.19 
 
 		 669 aa  626  1e-178  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0306  NAD-dependent DNA ligase LigA  48.19 
 
 		 669 aa  626  1e-178  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0337  NAD-dependent DNA ligase LigA  48.19 
 
 		 669 aa  625  1e-178  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0378  NAD-dependent DNA ligase LigA  48.04 
 
 		 669 aa  626  1e-178  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0335  NAD-dependent DNA ligase LigA  48.04 
 
 		 669 aa  624  1e-177  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0287  NAD-dependent DNA ligase LigA  48.19 
 
 		 669 aa  625  1e-177  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1993  DNA ligase, NAD-dependent  46.69 
 
 		 667 aa  619  1e-176  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1147  NAD-dependent DNA ligase LigA  46.73 
 
 		 670 aa  619  1e-176  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1959  DNA ligase, NAD-dependent  46.69 
 
 		 667 aa  619  1e-176  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1442  DNA ligase, NAD-dependent  46.61 
 
 		 665 aa  617  1e-175  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.474438  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0683  DNA ligase, NAD-dependent  45.99 
 
 		 684 aa  613  9.999999999999999e-175  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.992096  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0850  NAD-dependent DNA ligase LigA  48.02 
 
 		 652 aa  594  1e-168  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0763  DNA ligase, NAD-dependent  46.17 
 
 		 677 aa  582  1e-164  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.0000192603  normal  0.836157 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1094  DNA ligase, NAD-dependent  44.18 
 
 		 672 aa  573  1.0000000000000001e-162  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.878392  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2346  DNA ligase, NAD-dependent  44.51 
 
 		 670 aa  566  1e-160  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0890  DNA ligase, NAD-dependent  43.76 
 
 		 670 aa  561  1e-158  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0462  DNA ligase, NAD-dependent  44.46 
 
 		 663 aa  560  1e-158  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1035  DNA ligase, NAD-dependent  43.87 
 
 		 663 aa  559  1e-158  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1517  DNA ligase, NAD-dependent  44.01 
 
 		 659 aa  558  1e-157  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000611736  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1117  DNA ligase, NAD-dependent  43.37 
 
 		 673 aa  556  1e-157  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.62969  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1617  DNA ligase, NAD-dependent  44.68 
 
 		 672 aa  556  1e-157  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.755766  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0538  DNA ligase, NAD-dependent  45.04 
 
 		 662 aa  555  1e-156  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1618  DNA ligase, NAD-dependent  44.74 
 
 		 673 aa  553  1e-156  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.00000164842  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1336  DNA ligase, NAD-dependent  43.77 
 
 		 668 aa  548  1e-155  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2013  DNA ligase, NAD-dependent  45.85 
 
 		 666 aa  549  1e-155  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2948  DNA ligase, NAD-dependent  43.62 
 
 		 668 aa  546  1e-154  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1305  DNA ligase, NAD-dependent  43.45 
 
 		 672 aa  546  1e-154  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.617786  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0712  DNA ligase, NAD-dependent  42.64 
 
 		 668 aa  548  1e-154  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2728  NAD-dependent DNA ligase C4-type  42.71 
 
 		 671 aa  545  1e-153  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02300  DNA ligase, NAD-dependent  43.03 
 
 		 670 aa  540  9.999999999999999e-153  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  0.000000000000139643  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl160  DNA ligase, polydeoxyribonucleotide synthase NAD+  44.43 
 
 		 666 aa  536  1e-151  Mesoplasma florum L1  Bacteria  decreased coverage  0.0025564  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0182  DNA ligase, NAD-dependent  42.96 
 
 		 681 aa  536  1e-151  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0369  DNA ligase (NAD(+))  44.14 
 
 		 661 aa  536  1e-151  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2883  DNA ligase, NAD-dependent  42.71 
 
 		 678 aa  532  1e-150  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.745192 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1428  DNA ligase, NAD-dependent  41.79 
 
 		 694 aa  531  1e-149  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0176599  normal  0.198216 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1886  NAD-dependent DNA ligase  42.61 
 
 		 711 aa  526  1e-148  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0136067  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0681  DNA ligase, NAD-dependent  42.64 
 
 		 673 aa  525  1e-147  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.295891  normal  0.841285 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0824  DNA ligase, NAD-dependent  42.3 
 
 		 688 aa  521  1e-146  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0847  DNA ligase, NAD-dependent  42.3 
 
 		 688 aa  521  1e-146  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1560  DNA ligase, NAD-dependent  42.62 
 
 		 691 aa  518  1.0000000000000001e-145  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.436833  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2588  DNA ligase, NAD-dependent  42.62 
 
 		 691 aa  516  1.0000000000000001e-145  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.245296  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_26670  DNA ligase, NAD-dependent  41.5 
 
 		 708 aa  516  1.0000000000000001e-145  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.000046682  normal  0.968488 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2442  DNA ligase, NAD-dependent  42.62 
 
 		 691 aa  517  1.0000000000000001e-145  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.414068  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1511  DNA ligase, NAD-dependent  41.11 
 
 		 662 aa  516  1.0000000000000001e-145  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0217425  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2022  DNA ligase, NAD-dependent  42.71 
 
 		 691 aa  518  1.0000000000000001e-145  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1334  DNA ligase, NAD-dependent  42.62 
 
 		 691 aa  518  1.0000000000000001e-145  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.538237  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2499  DNA ligase, NAD-dependent  42.62 
 
 		 691 aa  517  1.0000000000000001e-145  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1343  DNA ligase, NAD-dependent  43.14 
 
 		 683 aa  516  1.0000000000000001e-145  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.584756  normal  0.20338 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1428  DNA ligase, NAD-dependent  42.07 
 
 		 721 aa  516  1.0000000000000001e-145  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00223913 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0327  DNA ligase, NAD-dependent  39.94 
 
 		 685 aa  518  1.0000000000000001e-145  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3249  DNA ligase, NAD-dependent  42.62 
 
 		 691 aa  518  1.0000000000000001e-145  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1252  DNA ligase, NAD-dependent  43.22 
 
 		 691 aa  516  1.0000000000000001e-145  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0258025  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2062  DNA ligase, NAD-dependent  42.62 
 
 		 691 aa  518  1.0000000000000001e-145  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.631088  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1926  DNA ligase, NAD-dependent  42.5 
 
 		 691 aa  513  1e-144  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.55791  normal  0.279266 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0277  NAD-dependent DNA ligase LigA  42.26 
 
 		 679 aa  513  1e-144  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2044  DNA ligase, NAD-dependent  42.35 
 
 		 691 aa  514  1e-144  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0996  DNA ligase, NAD-dependent  41.25 
 
 		 668 aa  513  1e-144  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6053  DNA ligase, NAD-dependent  42.5 
 
 		 746 aa  513  1e-144  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.255704  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004153  DNA ligase  40.47 
 
 		 690 aa  514  1e-144  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0490058  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2024  DNA ligase, NAD-dependent  42.35 
 
 		 691 aa  513  1e-144  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1455  DNA ligase, NAD-dependent  43.62 
 
 		 671 aa  512  1e-143  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0313  NAD-dependent DNA ligase LigA  41.26 
 
 		 676 aa  511  1e-143  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2213  DNA ligase, NAD-dependent  41.48 
 
 		 671 aa  509  1e-143  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000618814  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1239  DNA ligase, NAD-dependent  40.98 
 
 		 672 aa  511  1e-143  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00267622  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1522  NAD-dependent DNA ligase  42.18 
 
 		 673 aa  511  1e-143  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2057  DNA ligase, NAD-dependent  42.5 
 
 		 691 aa  511  1e-143  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.258192  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5334  DNA ligase (NAD+)  42.21 
 
 		 691 aa  508  9.999999999999999e-143  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.373441  normal  0.204139 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2461  DNA ligase, NAD-dependent  41.92 
 
 		 688 aa  507  9.999999999999999e-143  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0455112  hitchhiker  0.000280706 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1167  DNA ligase, NAD-dependent  42.79 
 
 		 678 aa  506  9.999999999999999e-143  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.140803  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2698  DNA ligase, NAD-dependent  42.09 
 
 		 674 aa  506  9.999999999999999e-143  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0503  DNA ligase, NAD-dependent  43.01 
 
 		 671 aa  506  9.999999999999999e-143  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.720163  normal  0.76832 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0655  DNA ligase, NAD-dependent  41.88 
 
 		 670 aa  508  9.999999999999999e-143  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3418  DNA ligase, NAD-dependent  41.78 
 
 		 674 aa  502  1e-141  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1559  DNA ligase, NAD-dependent  41.45 
 
 		 662 aa  502  1e-141  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0638727  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1676  NAD-dependent DNA ligase  41.92 
 
 		 688 aa  504  1e-141  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.194979  normal  0.0666248 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2927  DNA ligase, NAD-dependent  41.52 
 
 		 683 aa  505  1e-141  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000591487  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0810  DNA ligase, NAD-dependent  40.57 
 
 		 673 aa  501  1e-140  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0592  DNA ligase, NAD-dependent  39.1 
 
 		 669 aa  501  1e-140  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3499  DNA ligase, NAD-dependent  42.63 
 
 		 700 aa  499  1e-140  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0569727 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1516  DNA ligase (NAD(+))  40.24 
 
 		 681 aa  499  1e-140  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.0000678531  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0947  DNA ligase, NAD-dependent  39.14 
 
 		 675 aa  497  1e-139  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1062  NAD-dependent DNA ligase  40.95 
 
 		 716 aa  498  1e-139  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.759691  normal  0.781607 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3660  DNA ligase, NAD-dependent  41.32 
 
 		 681 aa  497  1e-139  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0589668  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2514  DNA ligase, NAD-dependent  40.56 
 
 		 670 aa  496  1e-139  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00116351  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_18071  NAD-dependent DNA ligase LigA  40.93 
 
 		 697 aa  498  1e-139  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.113319  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2316  NAD-dependent DNA ligase LigA  39.13 
 
 		 774 aa  496  1e-139  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.444372  normal  0.080689 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1575  DNA ligase, NAD-dependent  40.44 
 
 		 690 aa  496  1e-139  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0209027  unclonable  0.0000429666 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2744  NAD-dependent DNA ligase LigA  41.38 
 
 		 670 aa  496  1e-139  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000000148607  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>