273 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nwi_0116 on replicon NC_007406
Organism: Nitrobacter winogradskyi Nb-255



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007406  Nwi_0116  hypothetical protein  100 
 
 		 118 aa  234  3e-61  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.185512 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0146  hypothetical protein  88.89 
 
 		 135 aa  205  1e-52  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0320  hypothetical protein  82.76 
 
 		 135 aa  192  2e-48  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0181  hypothetical protein  79.49 
 
 		 136 aa  190  5e-48  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.973166  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0420  hypothetical protein  78.45 
 
 		 128 aa  185  2e-46  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0400  hypothetical protein  75.86 
 
 		 131 aa  183  9e-46  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0325  hypothetical protein  66.38 
 
 		 130 aa  150  5.9999999999999996e-36  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.493012  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3545  hypothetical protein  50 
 
 		 122 aa  106  1e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0187  hypothetical protein  47.83 
 
 		 125 aa  103  1e-21  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1042  hypothetical protein  45.22 
 
 		 122 aa  97.4  5e-20  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0556279  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3586  hypothetical protein  50 
 
 		 133 aa  96.7  9e-20  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0178  hypothetical protein  47.79 
 
 		 126 aa  95.1  3e-19  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.647134  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4010  hypothetical protein  46.43 
 
 		 124 aa  92.4  2e-18  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.571569  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0439  hypothetical protein  52.34 
 
 		 128 aa  91.7  3e-18  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.111388  normal  0.465101 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0406  hypothetical protein  52.34 
 
 		 128 aa  91.7  4e-18  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.442549 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0353  hypothetical protein  45.28 
 
 		 128 aa  90.1  1e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0021  hypothetical protein  49.06 
 
 		 133 aa  88.2  3e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0577391 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0339  hypothetical protein  51.85 
 
 		 127 aa  87.4  5e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0692015  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0293  protein of unknown function UPF0102  44.74 
 
 		 124 aa  87.8  5e-17  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.210059 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0024  hypothetical protein  50 
 
 		 129 aa  86.7  1e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0228023  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3496  hypothetical protein  47.17 
 
 		 125 aa  85.5  2e-16  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.215369 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4331  hypothetical protein  45.61 
 
 		 122 aa  85.9  2e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.84486 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0175  hypothetical protein  46.85 
 
 		 139 aa  81.3  0.000000000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.361745 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0189  protein of unknown function UPF0102  42.86 
 
 		 127 aa  80.9  0.000000000000006  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.452343  normal  0.48907 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4594  hypothetical protein  47.57 
 
 		 122 aa  80.5  0.000000000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.042758 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2398  hypothetical protein  41.82 
 
 		 118 aa  80.5  0.000000000000007  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.430013  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_3014  hypothetical protein  42.45 
 
 		 127 aa  79.3  0.00000000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3692  hypothetical protein  47.66 
 
 		 125 aa  77.8  0.00000000000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.598845  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2230  protein of unknown function UPF0102  45.69 
 
 		 127 aa  77.8  0.00000000000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0169041  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0037  hypothetical protein  39.45 
 
 		 127 aa  76.3  0.0000000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1291  protein of unknown function UPF0102  40.37 
 
 		 115 aa  73.9  0.0000000000008  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000677509  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0017  hypothetical protein  41.67 
 
 		 128 aa  72.8  0.000000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000457371  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1413  hypothetical protein  33.33 
 
 		 112 aa  72.4  0.000000000002  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0474  hypothetical protein  49.46 
 
 		 125 aa  72.4  0.000000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2298  hypothetical protein  38.39 
 
 		 123 aa  71.6  0.000000000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1703  hypothetical protein  40 
 
 		 123 aa  71.6  0.000000000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0017  hypothetical protein  45.26 
 
 		 126 aa  70.9  0.000000000005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.00052241  normal  1 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0093  hypothetical protein  33.98 
 
 		 122 aa  68.9  0.00000000002  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.560974  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2217  hypothetical protein  42.24 
 
 		 123 aa  68.2  0.00000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000089571  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0170  protein of unknown function UPF0102  34.69 
 
 		 108 aa  68.2  0.00000000004  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.633607  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0262  hypothetical protein  40.82 
 
 		 116 aa  68.2  0.00000000004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.605183  normal  0.332641 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0572  hypothetical protein  38.94 
 
 		 118 aa  67.4  0.00000000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.421068  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2261  hypothetical protein  43.16 
 
 		 128 aa  67  0.00000000008  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1695  hypothetical protein  35.45 
 
 		 120 aa  67  0.00000000009  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0294  hypothetical protein  32.18 
 
 		 112 aa  67  0.00000000009  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1959  hypothetical protein  36.56 
 
 		 122 aa  66.2  0.0000000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.142549  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2938  hypothetical protein  38.53 
 
 		 129 aa  65.5  0.0000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.703285  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1901  formate dehydrogenase H large subunit  29.59 
 
 		 109 aa  65.1  0.0000000003  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3998  protein of unknown function UPF0102  44.21 
 
 		 139 aa  65.1  0.0000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0503  hypothetical protein  37.84 
 
 		 120 aa  64.7  0.0000000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.451178 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3298  hypothetical protein  38.54 
 
 		 124 aa  64.7  0.0000000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.861672  normal  0.570212 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1509  hypothetical protein  30.09 
 
 		 133 aa  64.7  0.0000000004  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0216  hypothetical protein  29.91 
 
 		 112 aa  64.3  0.0000000005  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1723  hypothetical protein  37.39 
 
 		 123 aa  64.3  0.0000000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.471951 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0016  hypothetical protein  41.05 
 
 		 129 aa  63.9  0.0000000007  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.197298  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0733  hypothetical protein  34.86 
 
 		 180 aa  63.9  0.0000000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.646389 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0497  hypothetical protein  37.86 
 
 		 142 aa  63.9  0.0000000008  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0700  protein of unknown function UPF0102  38.05 
 
 		 172 aa  62.8  0.000000001  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  unclonable  0.00000000202877  hitchhiker  0.000000354886 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0977  hypothetical protein  36.08 
 
 		 119 aa  63.2  0.000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.320606  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1677  hypothetical protein  36.84 
 
 		 122 aa  63.5  0.000000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.238653  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1186  hypothetical protein  39.32 
 
 		 140 aa  62.8  0.000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00400032  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07400  hypothetical protein  35.14 
 
 		 116 aa  63.2  0.000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3485  hypothetical protein  38.05 
 
 		 125 aa  63.2  0.000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000340579 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2007  hypothetical protein  40.62 
 
 		 124 aa  62.8  0.000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.63182  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3870  protein of unknown function UPF0102  34.62 
 
 		 144 aa  62.4  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3919  protein of unknown function UPF0102  34.62 
 
 		 144 aa  62.4  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  decreased coverage  0.0000143067  normal  0.216721 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5237  protein of unknown function UPF0102  32.32 
 
 		 164 aa  62.4  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0546  hypothetical protein  31.73 
 
 		 115 aa  62.8  0.000000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.672576  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0057  hypothetical protein  29.06 
 
 		 122 aa  62  0.000000003  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0702  hypothetical protein  29.47 
 
 		 112 aa  61.6  0.000000003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.254087  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3355  hypothetical protein  43.37 
 
 		 108 aa  61.6  0.000000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0144  hypothetical protein  31.71 
 
 		 112 aa  61.6  0.000000004  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0163  hypothetical protein  30.49 
 
 		 112 aa  61.2  0.000000004  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1530  hypothetical protein  33.33 
 
 		 118 aa  61.2  0.000000004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0048655  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0184  hypothetical protein  31.71 
 
 		 112 aa  61.6  0.000000004  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.805797  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2103  hypothetical protein  42.53 
 
 		 121 aa  61.6  0.000000004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.374615  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0629  hypothetical protein  31.58 
 
 		 122 aa  61.2  0.000000005  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1475  endonuclease  37.84 
 
 		 115 aa  61.2  0.000000005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.733308  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2303  hypothetical protein  33.33 
 
 		 130 aa  60.8  0.000000006  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0306992  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2083  hypothetical protein  42.16 
 
 		 104 aa  60.8  0.000000006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3146  sigma-54 factor  35.64 
 
 		 118 aa  60.8  0.000000006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_687  endonuclease  39.53 
 
 		 121 aa  60.5  0.000000007  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0650  hypothetical protein  42.37 
 
 		 128 aa  60.5  0.000000008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3424  hypothetical protein  37.17 
 
 		 125 aa  59.7  0.00000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1228  hypothetical protein  38.94 
 
 		 119 aa  59.7  0.00000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.74821  normal  0.260342 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0112  hypothetical protein  34.31 
 
 		 122 aa  59.7  0.00000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0465  hypothetical protein  31.48 
 
 		 113 aa  60.1  0.00000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1324  protein of unknown function UPF0102  32.35 
 
 		 148 aa  60.1  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0781  hypothetical protein  37.21 
 
 		 121 aa  58.5  0.00000003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2213  protein of unknown function UPF0102  36.46 
 
 		 118 aa  58.2  0.00000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.19652 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1093  endonuclease-like  37.5 
 
 		 202 aa  58.5  0.00000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1062  hypothetical protein  39.67 
 
 		 138 aa  58.2  0.00000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.340253 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0930  hypothetical protein  39 
 
 		 123 aa  58.9  0.00000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.930588  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4800  hypothetical protein  33.02 
 
 		 151 aa  58.2  0.00000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1992  hypothetical protein  41.94 
 
 		 129 aa  58.2  0.00000004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0900  hypothetical protein  39.29 
 
 		 100 aa  58.2  0.00000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.813892 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0449  hypothetical protein  34.57 
 
 		 124 aa  58.2  0.00000004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.283123  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0307  hypothetical protein  36.89 
 
 		 118 aa  57.8  0.00000004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.432671  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0355  hypothetical protein  33.64 
 
 		 124 aa  57.8  0.00000005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0464  hypothetical protein  32.29 
 
 		 116 aa  57.8  0.00000005  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>