290 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPC_0320 on replicon NC_007925
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB18



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007925  RPC_0320  hypothetical protein  100 
 
 		 135 aa  263  5.999999999999999e-70  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0181  hypothetical protein  78.52 
 
 		 136 aa  212  1.9999999999999998e-54  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.973166  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0420  hypothetical protein  82.11 
 
 		 128 aa  205  2e-52  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0146  hypothetical protein  85 
 
 		 135 aa  204  3e-52  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0400  hypothetical protein  74.81 
 
 		 131 aa  202  1e-51  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0116  hypothetical protein  82.76 
 
 		 118 aa  192  2e-48  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.185512 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0325  hypothetical protein  66.67 
 
 		 130 aa  170  5.999999999999999e-42  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.493012  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0187  hypothetical protein  52.14 
 
 		 125 aa  114  5e-25  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3586  hypothetical protein  55.36 
 
 		 133 aa  111  4.0000000000000004e-24  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0178  hypothetical protein  52.14 
 
 		 126 aa  108  3e-23  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.647134  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3545  hypothetical protein  49.56 
 
 		 122 aa  103  6e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1042  hypothetical protein  47.01 
 
 		 122 aa  101  3e-21  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0556279  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0353  hypothetical protein  44.88 
 
 		 128 aa  98.6  3e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0439  hypothetical protein  56.07 
 
 		 128 aa  98.2  3e-20  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.111388  normal  0.465101 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0339  hypothetical protein  54.13 
 
 		 127 aa  97.8  4e-20  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0692015  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0406  hypothetical protein  55.14 
 
 		 128 aa  95.5  2e-19  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.442549 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4010  hypothetical protein  47.83 
 
 		 124 aa  95.1  3e-19  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.571569  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3496  hypothetical protein  48.18 
 
 		 125 aa  94  6e-19  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.215369 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0293  protein of unknown function UPF0102  45.3 
 
 		 124 aa  90.5  8e-18  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.210059 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4331  hypothetical protein  46.02 
 
 		 122 aa  89.7  1e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.84486 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_3014  hypothetical protein  47.17 
 
 		 127 aa  87.8  4e-17  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0024  hypothetical protein  50.41 
 
 		 129 aa  86.3  1e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0228023  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0021  hypothetical protein  50 
 
 		 133 aa  82.4  0.000000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0577391 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2938  hypothetical protein  42.74 
 
 		 129 aa  80.1  0.000000000000009  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.703285  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3692  hypothetical protein  46.73 
 
 		 125 aa  79.7  0.00000000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.598845  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0175  hypothetical protein  43.9 
 
 		 139 aa  80.1  0.00000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.361745 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1291  protein of unknown function UPF0102  41.28 
 
 		 115 aa  79.3  0.00000000000002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000677509  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0474  hypothetical protein  54.84 
 
 		 125 aa  79  0.00000000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2398  hypothetical protein  39.29 
 
 		 118 aa  78.2  0.00000000000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.430013  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4594  hypothetical protein  46.6 
 
 		 122 aa  77.8  0.00000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.042758 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0189  protein of unknown function UPF0102  40.18 
 
 		 127 aa  77.4  0.00000000000005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.452343  normal  0.48907 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0037  hypothetical protein  38.53 
 
 		 127 aa  77.4  0.00000000000006  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2230  protein of unknown function UPF0102  44.07 
 
 		 127 aa  76.3  0.0000000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0169041  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5237  protein of unknown function UPF0102  36.36 
 
 		 164 aa  76.6  0.0000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3870  protein of unknown function UPF0102  38.46 
 
 		 144 aa  74.7  0.0000000000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3919  protein of unknown function UPF0102  38.46 
 
 		 144 aa  74.7  0.0000000000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  decreased coverage  0.0000143067  normal  0.216721 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0503  hypothetical protein  42.57 
 
 		 120 aa  73.2  0.000000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.451178 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1703  hypothetical protein  36.84 
 
 		 123 aa  72.8  0.000000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0497  hypothetical protein  43 
 
 		 142 aa  72.4  0.000000000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1695  hypothetical protein  36.61 
 
 		 120 aa  71.6  0.000000000004  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0733  hypothetical protein  34.86 
 
 		 180 aa  71.2  0.000000000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.646389 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0170  protein of unknown function UPF0102  33.33 
 
 		 108 aa  70.9  0.000000000006  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.633607  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3485  hypothetical protein  37.7 
 
 		 125 aa  70.9  0.000000000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000340579 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1723  hypothetical protein  41.03 
 
 		 123 aa  70.1  0.00000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.471951 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0093  hypothetical protein  30.43 
 
 		 122 aa  69.7  0.00000000001  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.560974  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0262  hypothetical protein  43.62 
 
 		 116 aa  70.1  0.00000000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.605183  normal  0.332641 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0294  hypothetical protein  31.91 
 
 		 112 aa  69.7  0.00000000001  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1186  hypothetical protein  38.35 
 
 		 140 aa  69.7  0.00000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00400032  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3998  protein of unknown function UPF0102  39.13 
 
 		 139 aa  68.9  0.00000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1413  hypothetical protein  30.43 
 
 		 112 aa  68.2  0.00000000003  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0017  hypothetical protein  42.11 
 
 		 126 aa  68.6  0.00000000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.00052241  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0017  hypothetical protein  37.61 
 
 		 128 aa  68.2  0.00000000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000457371  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2261  hypothetical protein  42.86 
 
 		 128 aa  68.6  0.00000000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0216  hypothetical protein  28.87 
 
 		 112 aa  68.6  0.00000000003  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0016  hypothetical protein  40 
 
 		 129 aa  67.8  0.00000000004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.197298  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3424  hypothetical protein  36.89 
 
 		 125 aa  67.4  0.00000000007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2298  hypothetical protein  37.5 
 
 		 123 aa  67  0.00000000009  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1062  hypothetical protein  39.23 
 
 		 138 aa  66.6  0.0000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.340253 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0465  hypothetical protein  34.58 
 
 		 113 aa  66.6  0.0000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1475  endonuclease  39.64 
 
 		 115 aa  66.6  0.0000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.733308  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1509  hypothetical protein  27.83 
 
 		 133 aa  66.6  0.0000000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0650  hypothetical protein  43.36 
 
 		 128 aa  65.9  0.0000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5877  protein of unknown function UPF0102  34.51 
 
 		 117 aa  65.9  0.0000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.662779 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1093  endonuclease-like  37.38 
 
 		 202 aa  65.5  0.0000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1901  formate dehydrogenase H large subunit  30.61 
 
 		 109 aa  65.9  0.0000000002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3355  hypothetical protein  44 
 
 		 108 aa  65.9  0.0000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0572  hypothetical protein  37.93 
 
 		 118 aa  65.9  0.0000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.421068  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2054  hypothetical protein  40.2 
 
 		 133 aa  65.1  0.0000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.595954  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1969  hypothetical protein  40.2 
 
 		 133 aa  65.1  0.0000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  decreased coverage  0.00399816  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0271  hypothetical protein  39.71 
 
 		 153 aa  65.1  0.0000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2217  hypothetical protein  36.84 
 
 		 123 aa  64.7  0.0000000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000089571  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3298  hypothetical protein  37.27 
 
 		 124 aa  64.7  0.0000000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.861672  normal  0.570212 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_687  endonuclease  37.89 
 
 		 121 aa  64.3  0.0000000005  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1992  hypothetical protein  44.09 
 
 		 129 aa  63.9  0.0000000006  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0756  hypothetical protein  38.39 
 
 		 118 aa  63.9  0.0000000008  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.477778  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2103  hypothetical protein  43.18 
 
 		 121 aa  63.9  0.0000000008  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.374615  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2213  protein of unknown function UPF0102  35.14 
 
 		 118 aa  62.8  0.000000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.19652 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0666  hypothetical protein  41.59 
 
 		 116 aa  63.2  0.000000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0397911  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3146  sigma-54 factor  40.21 
 
 		 118 aa  63.2  0.000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2019  protein of unknown function UPF0102  40.17 
 
 		 134 aa  63.2  0.000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.573307  normal  0.167847 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07400  hypothetical protein  33.33 
 
 		 116 aa  62.8  0.000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0702  hypothetical protein  27.62 
 
 		 112 aa  62.8  0.000000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.254087  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0315  protein of unknown function UPF0102  37.23 
 
 		 121 aa  62  0.000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000225244 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3440  protein of unknown function UPF0102  41.41 
 
 		 150 aa  61.6  0.000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.745172  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0355  hypothetical protein  38.78 
 
 		 124 aa  61.6  0.000000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0546  hypothetical protein  31.43 
 
 		 115 aa  62  0.000000003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.672576  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0142  conserved hypothetical protein TIGR00252  37.23 
 
 		 121 aa  62  0.000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp3065  hypothetical protein  32.14 
 
 		 118 aa  61.2  0.000000004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2198  hypothetical protein  37 
 
 		 172 aa  61.6  0.000000004  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  hitchhiker  0.00219221  decreased coverage  0.00807275 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1376  protein of unknown function UPF0102  33.63 
 
 		 119 aa  61.2  0.000000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000032081  normal  0.333882 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3265  hypothetical protein  43.01 
 
 		 130 aa  61.2  0.000000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1792  hypothetical protein  35.83 
 
 		 160 aa  60.8  0.000000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0630  hypothetical protein  41.74 
 
 		 144 aa  60.8  0.000000005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4524  hypothetical protein  35.79 
 
 		 123 aa  60.8  0.000000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3311  protein of unknown function UPF0102  41.98 
 
 		 134 aa  60.8  0.000000006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2864  hypothetical protein  38.39 
 
 		 122 aa  60.8  0.000000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00415914  hitchhiker  0.000000500394 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1910  hypothetical protein  38.24 
 
 		 134 aa  60.8  0.000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.179028  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0391  hypothetical protein  41.18 
 
 		 149 aa  60.8  0.000000006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.0487377 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1959  hypothetical protein  32.26 
 
 		 122 aa  60.8  0.000000006  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.142549  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0629  hypothetical protein  33.9 
 
 		 122 aa  60.8  0.000000006  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>