244 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CFF8240_0294 on replicon NC_008599
Organism: Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008599  CFF8240_0294  hypothetical protein  100 
 
 		 112 aa  223  9e-58  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0216  hypothetical protein  61.26 
 
 		 112 aa  144  6e-34  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1413  hypothetical protein  54.46 
 
 		 112 aa  132  1.9999999999999998e-30  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0144  hypothetical protein  57.14 
 
 		 112 aa  130  5e-30  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0184  hypothetical protein  57.14 
 
 		 112 aa  130  5e-30  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.805797  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0163  hypothetical protein  55.36 
 
 		 112 aa  128  3e-29  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1143  hypothetical protein  53.1 
 
 		 113 aa  121  3e-27  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0170  protein of unknown function UPF0102  47.17 
 
 		 108 aa  101  3e-21  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.633607  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1901  formate dehydrogenase H large subunit  40 
 
 		 109 aa  79  0.00000000000002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2025  hypothetical protein  40.38 
 
 		 119 aa  72  0.000000000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1509  hypothetical protein  43.81 
 
 		 133 aa  72  0.000000000003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0320  hypothetical protein  31.91 
 
 		 135 aa  69.7  0.00000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0146  hypothetical protein  31.68 
 
 		 135 aa  69.3  0.00000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1218  protein of unknown function UPF0102  34.21 
 
 		 119 aa  69.3  0.00000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.648075  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0116  hypothetical protein  32.18 
 
 		 118 aa  67  0.00000000009  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.185512 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5237  protein of unknown function UPF0102  33.66 
 
 		 164 aa  66.6  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0181  hypothetical protein  32.67 
 
 		 136 aa  66.6  0.0000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.973166  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1406  protein of unknown function UPF0102  32.65 
 
 		 114 aa  65.9  0.0000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0695  hypothetical protein  30 
 
 		 108 aa  65.5  0.0000000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000229548  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0671  hypothetical protein  30 
 
 		 108 aa  65.5  0.0000000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000156143  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1350  protein of unknown function UPF0102  32.43 
 
 		 118 aa  65.1  0.0000000003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1475  endonuclease  33.98 
 
 		 115 aa  64.3  0.0000000006  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.733308  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1677  hypothetical protein  40.4 
 
 		 122 aa  63.5  0.0000000009  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.238653  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0184  hypothetical protein  25.22 
 
 		 123 aa  63.2  0.000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0420  hypothetical protein  34.21 
 
 		 128 aa  63.2  0.000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2007  hypothetical protein  30.1 
 
 		 124 aa  62  0.000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.63182  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1959  hypothetical protein  38.38 
 
 		 122 aa  62  0.000000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.142549  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0017  hypothetical protein  36.63 
 
 		 128 aa  62  0.000000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000457371  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0400  hypothetical protein  26.26 
 
 		 131 aa  61.2  0.000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4252  hypothetical protein  31.73 
 
 		 117 aa  60.8  0.000000005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000137469 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0325  hypothetical protein  30.3 
 
 		 130 aa  60.8  0.000000006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.493012  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2488  protein of unknown function UPF0102  27.78 
 
 		 123 aa  59.7  0.00000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0776001  normal  0.272437 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2217  hypothetical protein  33.33 
 
 		 123 aa  58.9  0.00000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000089571  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3919  protein of unknown function UPF0102  30.61 
 
 		 144 aa  58.9  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  decreased coverage  0.0000143067  normal  0.216721 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3053  protein of unknown function UPF0102  35.58 
 
 		 111 aa  58.9  0.00000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3870  protein of unknown function UPF0102  30.61 
 
 		 144 aa  58.9  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3146  sigma-54 factor  30.19 
 
 		 118 aa  58.5  0.00000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0546  hypothetical protein  35.64 
 
 		 115 aa  58.9  0.00000003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.672576  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004502  endonuclease  35 
 
 		 122 aa  58.2  0.00000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00000161677  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2464  hypothetical protein  30.19 
 
 		 123 aa  58.5  0.00000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.164658  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1723  hypothetical protein  27.19 
 
 		 123 aa  58.5  0.00000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.471951 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2230  protein of unknown function UPF0102  38.04 
 
 		 127 aa  58.2  0.00000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0169041  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0702  hypothetical protein  34.38 
 
 		 112 aa  58.2  0.00000004  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.254087  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1530  hypothetical protein  39.08 
 
 		 118 aa  57.8  0.00000004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0048655  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_07020  predicted endonuclease related to Holliday junction resolvase  45.1 
 
 		 186 aa  58.2  0.00000004  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.00114408  normal  0.507303 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0669  hypothetical protein  43.14 
 
 		 124 aa  57.8  0.00000005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00890  hypothetical protein  31.36 
 
 		 122 aa  57.8  0.00000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1217  hypothetical protein  37.14 
 
 		 123 aa  57.8  0.00000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.266389  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1291  protein of unknown function UPF0102  30.56 
 
 		 115 aa  57.4  0.00000006  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000677509  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0037  hypothetical protein  33.98 
 
 		 127 aa  57.8  0.00000006  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10070  conserved hypothetical protein TIGR00252  31.25 
 
 		 153 aa  57  0.00000008  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0294595  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp3065  hypothetical protein  33.33 
 
 		 118 aa  57  0.00000009  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0666  hypothetical protein  34.02 
 
 		 116 aa  57  0.00000009  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0397911  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0112  hypothetical protein  32.98 
 
 		 122 aa  57  0.00000009  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0977  hypothetical protein  51.79 
 
 		 119 aa  57  0.00000009  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.320606  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1992  hypothetical protein  34.78 
 
 		 129 aa  56.6  0.0000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1093  endonuclease-like  27.66 
 
 		 202 aa  56.6  0.0000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2398  hypothetical protein  30.84 
 
 		 118 aa  56.6  0.0000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.430013  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0930  hypothetical protein  29.7 
 
 		 123 aa  56.2  0.0000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.930588  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1639  protein of unknown function UPF0102  33.98 
 
 		 110 aa  56.6  0.0000001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3248  hypothetical protein  31.31 
 
 		 124 aa  56.2  0.0000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.852323  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1965  hypothetical protein  28.71 
 
 		 135 aa  56.6  0.0000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.52969 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1406  protein of unknown function UPF0102  30.48 
 
 		 173 aa  56.6  0.0000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.000418677  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0299  hypothetical protein  27.45 
 
 		 108 aa  55.5  0.0000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2864  hypothetical protein  37.25 
 
 		 122 aa  55.8  0.0000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00415914  hitchhiker  0.000000500394 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3430  hypothetical protein  26.67 
 
 		 134 aa  55.8  0.0000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.157474  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3709  protein of unknown function UPF0102  34.38 
 
 		 119 aa  56.2  0.0000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0226  hypothetical protein  29.81 
 
 		 114 aa  56.2  0.0000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.113401  normal  0.113585 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1836  hypothetical protein  31.63 
 
 		 117 aa  55.8  0.0000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0316841 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2298  hypothetical protein  30.56 
 
 		 123 aa  55.1  0.0000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0650  hypothetical protein  32.29 
 
 		 128 aa  54.7  0.0000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4188  hypothetical protein  29.41 
 
 		 108 aa  55.1  0.0000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0503  hypothetical protein  30.48 
 
 		 120 aa  54.7  0.0000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.451178 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3990  hypothetical protein  29.41 
 
 		 108 aa  55.1  0.0000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2201  hypothetical protein  27.96 
 
 		 123 aa  54.7  0.0000004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1985  hypothetical protein  28.71 
 
 		 135 aa  55.1  0.0000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0318406  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3311  protein of unknown function UPF0102  32.95 
 
 		 134 aa  54.7  0.0000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2031  hypothetical protein  28.71 
 
 		 135 aa  55.1  0.0000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.474175  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0017  hypothetical protein  31.37 
 
 		 126 aa  54.7  0.0000004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.00052241  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4100  hypothetical protein  29.41 
 
 		 108 aa  55.1  0.0000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4070  hypothetical protein  29.41 
 
 		 108 aa  55.1  0.0000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4433  hypothetical protein  32.71 
 
 		 129 aa  54.3  0.0000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.875795  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09830  conserved hypothetical protein TIGR00252  32.35 
 
 		 125 aa  54.3  0.0000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.351272  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2881  hypothetical protein  28.72 
 
 		 146 aa  54.3  0.0000005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.696458 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3485  hypothetical protein  34.86 
 
 		 125 aa  54.7  0.0000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000340579 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1156  hypothetical protein  47.17 
 
 		 118 aa  54.3  0.0000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0160558  normal  0.0576877 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1703  hypothetical protein  40.43 
 
 		 123 aa  54.3  0.0000006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3998  protein of unknown function UPF0102  42.86 
 
 		 139 aa  53.9  0.0000008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2474  hypothetical protein  28.32 
 
 		 118 aa  53.9  0.0000008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0253334  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0992  hypothetical protein  32.38 
 
 		 117 aa  53.5  0.0000009  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.528214  normal  0.0951104 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0231  protein of unknown function UPF0102  24.21 
 
 		 121 aa  53.5  0.0000009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.819406  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3685  hypothetical protein  28.43 
 
 		 108 aa  53.5  0.0000009  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3424  hypothetical protein  33.94 
 
 		 125 aa  53.1  0.000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0178  hypothetical protein  24.74 
 
 		 126 aa  52.8  0.000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.647134  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0733  hypothetical protein  32.22 
 
 		 180 aa  53.5  0.000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.646389 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0260  hypothetical protein  27.45 
 
 		 108 aa  53.1  0.000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0315  protein of unknown function UPF0102  29.89 
 
 		 121 aa  53.5  0.000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000225244 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0993  protein of unknown function UPF0102  39.06 
 
 		 129 aa  53.1  0.000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  hitchhiker  0.00109853  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_687  endonuclease  30.28 
 
 		 121 aa  53.1  0.000001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0142  conserved hypothetical protein TIGR00252  29.89 
 
 		 121 aa  53.5  0.000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>