277 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC8801_3870 on replicon NC_011726
Organism: Cyanothece sp. PCC 8801



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013161  Cyan8802_3919  protein of unknown function UPF0102  100 
 
 
144 aa  300  5.000000000000001e-81  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  decreased coverage  0.0000143067  normal  0.216721 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3870  protein of unknown function UPF0102  100 
 
 
144 aa  300  5.000000000000001e-81  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1324  protein of unknown function UPF0102  56.08 
 
 
148 aa  174  5e-43  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0733  hypothetical protein  47.17 
 
 
180 aa  140  5e-33  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.646389 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5237  protein of unknown function UPF0102  48.73 
 
 
164 aa  139  9.999999999999999e-33  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4800  hypothetical protein  44.14 
 
 
151 aa  117  4.9999999999999996e-26  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0312  hypothetical protein  41.73 
 
 
142 aa  94.4  5e-19  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1291  protein of unknown function UPF0102  43.88 
 
 
115 aa  79.3  0.00000000000001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000677509  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1218  protein of unknown function UPF0102  40.95 
 
 
119 aa  79.3  0.00000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.648075  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0320  hypothetical protein  38.46 
 
 
135 aa  74.7  0.0000000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3586  hypothetical protein  36.19 
 
 
133 aa  73.9  0.0000000000008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0497  hypothetical protein  44.68 
 
 
142 aa  73.6  0.0000000000008  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0181  hypothetical protein  39.42 
 
 
136 aa  72.4  0.000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.973166  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0420  hypothetical protein  39.42 
 
 
128 aa  72.4  0.000000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4524  hypothetical protein  36.94 
 
 
123 aa  72  0.000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1959  hypothetical protein  36.27 
 
 
122 aa  72  0.000000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.142549  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1186  hypothetical protein  38 
 
 
140 aa  72.4  0.000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00400032  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13130  hypothetical protein  37.07 
 
 
120 aa  72.4  0.000000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0355  hypothetical protein  34.29 
 
 
124 aa  71.2  0.000000000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0932  hypothetical protein  36.94 
 
 
123 aa  71.2  0.000000000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1695  hypothetical protein  39.29 
 
 
120 aa  70.9  0.000000000006  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1908  hypothetical protein  32.79 
 
 
173 aa  70.5  0.000000000007  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000000102604  hitchhiker  0.00425538 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1324  hypothetical protein  36.04 
 
 
124 aa  70.5  0.000000000008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.294844  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET0781  hypothetical protein  36.44 
 
 
121 aa  70.1  0.000000000009  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0400  hypothetical protein  38.46 
 
 
131 aa  69.7  0.00000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3463  hypothetical protein  38.1 
 
 
125 aa  69.7  0.00000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2007  hypothetical protein  37.25 
 
 
124 aa  69.7  0.00000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.63182  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0707  hypothetical protein  34.75 
 
 
121 aa  70.1  0.00000000001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3135  hypothetical protein  38.1 
 
 
125 aa  69.7  0.00000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_687  endonuclease  36.44 
 
 
121 aa  70.1  0.00000000001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2864  hypothetical protein  39.22 
 
 
122 aa  68.6  0.00000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00415914  hitchhiker  0.000000500394 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3311  protein of unknown function UPF0102  41 
 
 
134 aa  68.9  0.00000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4400  hypothetical protein  36.04 
 
 
123 aa  69.3  0.00000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.147019 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1677  hypothetical protein  35.29 
 
 
122 aa  69.3  0.00000000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.238653  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1703  hypothetical protein  38.14 
 
 
123 aa  68.2  0.00000000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1406  protein of unknown function UPF0102  44 
 
 
114 aa  68.6  0.00000000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1407  protein of unknown function UPF0102  36.7 
 
 
122 aa  67.8  0.00000000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.993674  normal  0.0549137 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1723  hypothetical protein  34.48 
 
 
123 aa  67.8  0.00000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.471951 
 
 
-
 
NC_006368  lpp3065  hypothetical protein  33.65 
 
 
118 aa  67.4  0.00000000006  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1447  protein of unknown function UPF0102  40.18 
 
 
127 aa  67  0.00000000008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0325  hypothetical protein  38.46 
 
 
130 aa  67  0.00000000008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.493012  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1156  hypothetical protein  37.86 
 
 
118 aa  67  0.00000000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0160558  normal  0.0576877 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0977  hypothetical protein  37.25 
 
 
119 aa  66.6  0.0000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.320606  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0146  hypothetical protein  35.58 
 
 
135 aa  66.6  0.0000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2303  hypothetical protein  33.64 
 
 
130 aa  65.9  0.0000000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0306992  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2398  hypothetical protein  38.61 
 
 
118 aa  65.9  0.0000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.430013  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0017  hypothetical protein  37.37 
 
 
126 aa  65.5  0.0000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.00052241  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3146  sigma-54 factor  38.78 
 
 
118 aa  65.5  0.0000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2298  hypothetical protein  38.78 
 
 
123 aa  65.1  0.0000000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1406  protein of unknown function UPF0102  34.51 
 
 
173 aa  64.7  0.0000000004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.000418677  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4420  hypothetical protein  35.35 
 
 
128 aa  63.9  0.0000000007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.149236  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3756  hypothetical protein  37 
 
 
127 aa  63.9  0.0000000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00341379  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0700  protein of unknown function UPF0102  38.24 
 
 
172 aa  63.5  0.0000000009  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  unclonable  0.00000000202877  hitchhiker  0.000000354886 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10390  predicted endonuclease related to Holliday junction resolvase  38.32 
 
 
167 aa  62.8  0.000000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.0000139118  unclonable  0.000000000910029 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1641  protein of unknown function UPF0102  40.78 
 
 
122 aa  63.2  0.000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0797113  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0675  protein of unknown function UPF0102  34.69 
 
 
165 aa  63.2  0.000000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1965  hypothetical protein  40.96 
 
 
135 aa  63.2  0.000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.52969 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1985  hypothetical protein  40.96 
 
 
135 aa  62.8  0.000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0318406  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1550  hypothetical protein  36.28 
 
 
132 aa  62.8  0.000000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.176091 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2031  hypothetical protein  40.96 
 
 
135 aa  62.8  0.000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.474175  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0546  hypothetical protein  37.37 
 
 
115 aa  62.4  0.000000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.672576  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0503  hypothetical protein  36.27 
 
 
120 aa  62.8  0.000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.451178 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0116  hypothetical protein  34.62 
 
 
118 aa  62.4  0.000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.185512 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4685  hypothetical protein  37.37 
 
 
120 aa  62  0.000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.0484178 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0259  hypothetical protein  31.09 
 
 
120 aa  62  0.000000002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1934  hypothetical protein  31.09 
 
 
120 aa  62  0.000000002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.547856  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0650  hypothetical protein  36.79 
 
 
128 aa  62  0.000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3424  hypothetical protein  34.17 
 
 
125 aa  61.6  0.000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2283  hypothetical protein  34.86 
 
 
113 aa  61.6  0.000000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.567685 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2198  hypothetical protein  29.1 
 
 
172 aa  62  0.000000003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  hitchhiker  0.00219221  decreased coverage  0.00807275 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3485  hypothetical protein  32.5 
 
 
125 aa  62  0.000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000340579 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2532  protein of unknown function UPF0102  48.15 
 
 
118 aa  61.2  0.000000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.388001 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1093  endonuclease-like  36.61 
 
 
202 aa  61.2  0.000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0720  hypothetical protein  41.24 
 
 
126 aa  61.6  0.000000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0341617  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2488  protein of unknown function UPF0102  36.46 
 
 
123 aa  61.6  0.000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0776001  normal  0.272437 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3265  hypothetical protein  38.71 
 
 
130 aa  61.2  0.000000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4114  hypothetical protein  35.79 
 
 
123 aa  61.2  0.000000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2019  protein of unknown function UPF0102  39.8 
 
 
134 aa  60.8  0.000000005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.573307  normal  0.167847 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57490  hypothetical protein  36.75 
 
 
125 aa  60.8  0.000000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3586  hypothetical protein  40.59 
 
 
118 aa  60.5  0.000000007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0910  hypothetical protein  35.19 
 
 
119 aa  60.5  0.000000007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.21322  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2881  hypothetical protein  39 
 
 
146 aa  60.5  0.000000008  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.696458 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3740  protein of unknown function UPF0102  34.21 
 
 
121 aa  60.1  0.000000009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000086697  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1272  protein of unknown function UPF0102  33.88 
 
 
125 aa  60.1  0.000000009  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0756  hypothetical protein  36.84 
 
 
118 aa  60.1  0.00000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.477778  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0093  hypothetical protein  29.92 
 
 
122 aa  60.1  0.00000001  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.560974  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0930  hypothetical protein  35.42 
 
 
123 aa  59.7  0.00000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.930588  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2230  protein of unknown function UPF0102  33.88 
 
 
127 aa  59.7  0.00000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0169041  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2035  hypothetical protein  32.08 
 
 
122 aa  60.1  0.00000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.848509  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4996  hypothetical protein  35.9 
 
 
125 aa  58.9  0.00000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.608406  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1992  hypothetical protein  40 
 
 
129 aa  58.9  0.00000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0142  conserved hypothetical protein TIGR00252  35.24 
 
 
121 aa  59.3  0.00000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0315  protein of unknown function UPF0102  35.24 
 
 
121 aa  59.3  0.00000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000225244 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0294  hypothetical protein  30.61 
 
 
112 aa  58.9  0.00000002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0639  conserved hypothetical protein TIGR00252  35.09 
 
 
182 aa  59.3  0.00000002  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.372666 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0630  hypothetical protein  37.62 
 
 
144 aa  59.3  0.00000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12912  hypothetical protein  41.18 
 
 
141 aa  58.5  0.00000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0199208  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5917  protein of unknown function UPF0102  35.42 
 
 
117 aa  58.5  0.00000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00245822  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0037  hypothetical protein  35.04 
 
 
127 aa  58.2  0.00000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1478  protein of unknown function UPF0102  38.82 
 
 
118 aa  58.5  0.00000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.10043  normal  0.036198 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>