281 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmar_1447 on replicon NC_013501
Organism: Rhodothermus marinus DSM 4252



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013501  Rmar_1447  protein of unknown function UPF0102  100 
 
 		 127 aa  256  6e-68  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0037  hypothetical protein  46.15 
 
 		 127 aa  113  1.0000000000000001e-24  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1186  hypothetical protein  47.97 
 
 		 140 aa  112  2.0000000000000002e-24  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00400032  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0016  hypothetical protein  48.06 
 
 		 129 aa  109  1.0000000000000001e-23  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.197298  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0017  hypothetical protein  50 
 
 		 128 aa  107  7.000000000000001e-23  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000457371  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0650  hypothetical protein  47.54 
 
 		 128 aa  107  8.000000000000001e-23  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1992  hypothetical protein  46.51 
 
 		 129 aa  102  2e-21  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3756  hypothetical protein  43.09 
 
 		 127 aa  100  7e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00341379  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2881  hypothetical protein  46.22 
 
 		 146 aa  99.4  2e-20  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.696458 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2230  protein of unknown function UPF0102  43.44 
 
 		 127 aa  99.4  2e-20  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0169041  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0017  hypothetical protein  44.44 
 
 		 126 aa  97.8  4e-20  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.00052241  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0277  protein of unknown function UPF0102  42.5 
 
 		 120 aa  97.4  6e-20  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.107261  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1792  hypothetical protein  47.06 
 
 		 160 aa  96.3  1e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3424  hypothetical protein  40.65 
 
 		 125 aa  95.5  2e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3485  hypothetical protein  40.65 
 
 		 125 aa  94.7  3e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000340579 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3311  protein of unknown function UPF0102  45.3 
 
 		 134 aa  93.6  8e-19  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2019  protein of unknown function UPF0102  47.46 
 
 		 134 aa  93.6  8e-19  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.573307  normal  0.167847 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1376  protein of unknown function UPF0102  41.73 
 
 		 119 aa  92.8  1e-18  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000032081  normal  0.333882 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2217  hypothetical protein  45.83 
 
 		 123 aa  92  2e-18  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000089571  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3998  protein of unknown function UPF0102  42.62 
 
 		 139 aa  91.7  3e-18  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1475  endonuclease  44.26 
 
 		 115 aa  91.7  3e-18  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.733308  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2864  hypothetical protein  41.94 
 
 		 122 aa  90.9  5e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00415914  hitchhiker  0.000000500394 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3709  protein of unknown function UPF0102  38.66 
 
 		 119 aa  91.3  5e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1677  hypothetical protein  39.02 
 
 		 122 aa  90.5  7e-18  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.238653  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1959  hypothetical protein  37.4 
 
 		 122 aa  89.4  1e-17  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.142549  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1291  protein of unknown function UPF0102  40.5 
 
 		 115 aa  89.4  2e-17  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000677509  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07400  hypothetical protein  36.29 
 
 		 116 aa  88.2  3e-17  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5877  protein of unknown function UPF0102  40.68 
 
 		 117 aa  88.2  4e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.662779 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0460  protein of unknown function UPF0102  43.9 
 
 		 153 aa  87  7e-17  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0707  hypothetical protein  37.4 
 
 		 121 aa  86.3  1e-16  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1550  hypothetical protein  41.86 
 
 		 132 aa  86.7  1e-16  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.176091 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0676  hypothetical protein  37.3 
 
 		 167 aa  85.1  3e-16  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0552943  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2474  hypothetical protein  42.24 
 
 		 118 aa  85.1  3e-16  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0253334  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1703  hypothetical protein  38.28 
 
 		 123 aa  84.7  4e-16  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0781  hypothetical protein  36.36 
 
 		 121 aa  84  7e-16  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1530  hypothetical protein  36.36 
 
 		 118 aa  83.6  8e-16  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0048655  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2035  hypothetical protein  34.15 
 
 		 122 aa  83.2  0.000000000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.848509  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1093  endonuclease-like  40.35 
 
 		 202 aa  82.8  0.000000000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23670  predicted endonuclease related to Holliday junction resolvase  37.9 
 
 		 127 aa  83.2  0.000000000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.183487  normal  0.0867152 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_687  endonuclease  37.19 
 
 		 121 aa  83.6  0.000000000000001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10070  conserved hypothetical protein TIGR00252  40.83 
 
 		 153 aa  83.2  0.000000000000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0294595  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0016  hypothetical protein  43.65 
 
 		 127 aa  82  0.000000000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.204452  unclonable  0.000000883308 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2398  hypothetical protein  40.94 
 
 		 118 aa  82.4  0.000000000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.430013  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1217  hypothetical protein  37.9 
 
 		 123 aa  80.9  0.000000000000006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.266389  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09830  conserved hypothetical protein TIGR00252  39.5 
 
 		 125 aa  80.5  0.000000000000007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.351272  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0756  hypothetical protein  43.65 
 
 		 118 aa  80.1  0.000000000000009  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.477778  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0701  hypothetical protein  37.82 
 
 		 122 aa  79.3  0.00000000000001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4140  hypothetical protein  40.83 
 
 		 123 aa  79.3  0.00000000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1985  hypothetical protein  41.74 
 
 		 135 aa  79.3  0.00000000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0318406  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2213  hypothetical protein  40.52 
 
 		 132 aa  79.7  0.00000000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000124547 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2031  hypothetical protein  41.74 
 
 		 135 aa  79.3  0.00000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.474175  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0231  protein of unknown function UPF0102  40 
 
 		 121 aa  78.6  0.00000000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.819406  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1695  hypothetical protein  34.4 
 
 		 120 aa  78.2  0.00000000000003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3123  protein of unknown function UPF0102  41.67 
 
 		 121 aa  78.6  0.00000000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0308676  normal  0.107591 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0977  hypothetical protein  37.01 
 
 		 119 aa  78.2  0.00000000000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.320606  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1965  hypothetical protein  40.87 
 
 		 135 aa  78.2  0.00000000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.52969 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10390  predicted endonuclease related to Holliday junction resolvase  35.43 
 
 		 167 aa  77.8  0.00000000000005  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.0000139118  unclonable  0.000000000910029 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0259  hypothetical protein  38.68 
 
 		 120 aa  77.4  0.00000000000006  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1175  protein of unknown function UPF0102  40.83 
 
 		 122 aa  77.4  0.00000000000006  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1934  hypothetical protein  38.68 
 
 		 120 aa  77.4  0.00000000000006  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.547856  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2095  protein of unknown function UPF0102  38.05 
 
 		 137 aa  77  0.00000000000009  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_11140  predicted endonuclease related to Holliday junction resolvase  38.84 
 
 		 120 aa  77  0.00000000000009  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0330886  normal  0.323386 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12912  hypothetical protein  38.66 
 
 		 141 aa  76.3  0.0000000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0199208  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0629  hypothetical protein  34.45 
 
 		 122 aa  76.6  0.0000000000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13130  hypothetical protein  38.4 
 
 		 120 aa  76.3  0.0000000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2202  hypothetical protein  38.79 
 
 		 121 aa  76.3  0.0000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.474644  normal  0.174288 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1272  protein of unknown function UPF0102  32.03 
 
 		 125 aa  75.9  0.0000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0675  protein of unknown function UPF0102  35.71 
 
 		 165 aa  75.5  0.0000000000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0546  hypothetical protein  36.29 
 
 		 115 aa  76.3  0.0000000000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.672576  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2298  hypothetical protein  37.19 
 
 		 123 aa  75.9  0.0000000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1406  protein of unknown function UPF0102  42.24 
 
 		 114 aa  75.1  0.0000000000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0993  protein of unknown function UPF0102  38.76 
 
 		 129 aa  75.1  0.0000000000003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  hitchhiker  0.00109853  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2148  hypothetical protein  43.22 
 
 		 134 aa  75.1  0.0000000000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1218  protein of unknown function UPF0102  36 
 
 		 119 aa  74.7  0.0000000000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.648075  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0720  hypothetical protein  38.76 
 
 		 126 aa  73.9  0.0000000000006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0341617  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02085  hypothetical protein  37.5 
 
 		 119 aa  73.9  0.0000000000007  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.997348  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3463  hypothetical protein  41.6 
 
 		 125 aa  72.8  0.000000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1910  hypothetical protein  42.15 
 
 		 134 aa  72.8  0.000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.179028  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0758  hypothetical protein  35.16 
 
 		 130 aa  73.2  0.000000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3135  hypothetical protein  41.6 
 
 		 125 aa  72.8  0.000000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2103  hypothetical protein  41.46 
 
 		 121 aa  72  0.000000000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.374615  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2054  hypothetical protein  42.31 
 
 		 133 aa  71.6  0.000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.595954  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1969  hypothetical protein  42.31 
 
 		 133 aa  71.6  0.000000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  decreased coverage  0.00399816  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2303  hypothetical protein  30.08 
 
 		 130 aa  71.6  0.000000000004  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0306992  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0666  hypothetical protein  39.2 
 
 		 116 aa  71.2  0.000000000004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0397911  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57490  hypothetical protein  33.87 
 
 		 125 aa  70.9  0.000000000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3265  hypothetical protein  43.1 
 
 		 130 aa  70.9  0.000000000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4996  hypothetical protein  32.8 
 
 		 125 aa  70.5  0.000000000008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.608406  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0145  hypothetical protein  35.71 
 
 		 124 aa  70.5  0.000000000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0280805  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3413  protein of unknown function UPF0102  38.4 
 
 		 124 aa  70.5  0.000000000008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2201  hypothetical protein  40 
 
 		 123 aa  69.7  0.00000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp3065  hypothetical protein  32.54 
 
 		 118 aa  68.9  0.00000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1228  hypothetical protein  35.25 
 
 		 119 aa  68.9  0.00000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.74821  normal  0.260342 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0465  hypothetical protein  40.59 
 
 		 113 aa  69.3  0.00000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5917  protein of unknown function UPF0102  35.29 
 
 		 117 aa  68.9  0.00000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00245822  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3586  hypothetical protein  38.33 
 
 		 118 aa  68.6  0.00000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4036  protein of unknown function UPF0102  38.66 
 
 		 118 aa  68.6  0.00000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.261027  normal  0.0798574 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1478  protein of unknown function UPF0102  43.18 
 
 		 118 aa  68.2  0.00000000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.10043  normal  0.036198 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1212  protein of unknown function UPF0102  38.28 
 
 		 121 aa  67.8  0.00000000005  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0195  hypothetical protein  36.29 
 
 		 119 aa  67.4  0.00000000006  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.227376  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>