More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SYO3AOP1_0546 on replicon NC_010730
Organism: Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010730  SYO3AOP1_0546  hypothetical protein  100 
 
 		 115 aa  228  2e-59  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.672576  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2298  hypothetical protein  42.86 
 
 		 123 aa  89.7  1e-17  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1218  protein of unknown function UPF0102  44.64 
 
 		 119 aa  84.3  5e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.648075  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0465  hypothetical protein  45.71 
 
 		 113 aa  84.3  6e-16  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1475  endonuclease  39.09 
 
 		 115 aa  83.2  0.000000000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.733308  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1291  protein of unknown function UPF0102  41.59 
 
 		 115 aa  82.4  0.000000000000002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000677509  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1985  hypothetical protein  37.61 
 
 		 135 aa  81.3  0.000000000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0318406  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2031  hypothetical protein  37.61 
 
 		 135 aa  81.3  0.000000000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.474175  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07400  hypothetical protein  42.24 
 
 		 116 aa  80.9  0.000000000000005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2488  protein of unknown function UPF0102  31.82 
 
 		 123 aa  80.5  0.000000000000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0776001  normal  0.272437 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3585  hypothetical protein  39.13 
 
 		 131 aa  80.5  0.000000000000008  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.186326 
 
 
-
 
NC_006368  lpp3065  hypothetical protein  40.54 
 
 		 118 aa  79.7  0.00000000000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1965  hypothetical protein  36.7 
 
 		 135 aa  79.3  0.00000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.52969 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3463  hypothetical protein  35.4 
 
 		 125 aa  79  0.00000000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4140  hypothetical protein  35.14 
 
 		 123 aa  79  0.00000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1156  hypothetical protein  35.64 
 
 		 118 aa  79  0.00000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0160558  normal  0.0576877 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1639  protein of unknown function UPF0102  40.57 
 
 		 110 aa  79.3  0.00000000000002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0756  hypothetical protein  35.4 
 
 		 118 aa  78.6  0.00000000000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.477778  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3135  hypothetical protein  35.4 
 
 		 125 aa  78.6  0.00000000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0503  hypothetical protein  39.13 
 
 		 120 aa  78.2  0.00000000000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.451178 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1093  endonuclease-like  34.04 
 
 		 202 aa  77.8  0.00000000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2655  hypothetical protein  40.35 
 
 		 123 aa  78.2  0.00000000000004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2019  protein of unknown function UPF0102  33.93 
 
 		 134 aa  77.8  0.00000000000004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.573307  normal  0.167847 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0650  hypothetical protein  36.7 
 
 		 128 aa  77.8  0.00000000000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00890  hypothetical protein  40.87 
 
 		 122 aa  77.8  0.00000000000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3740  protein of unknown function UPF0102  38.54 
 
 		 121 aa  77.8  0.00000000000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000086697  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3265  hypothetical protein  35.19 
 
 		 130 aa  77.4  0.00000000000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2230  protein of unknown function UPF0102  39.47 
 
 		 127 aa  77.4  0.00000000000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0169041  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2864  hypothetical protein  39.81 
 
 		 122 aa  77.4  0.00000000000007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00415914  hitchhiker  0.000000500394 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3053  protein of unknown function UPF0102  38.18 
 
 		 111 aa  77  0.00000000000007  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2202  hypothetical protein  33 
 
 		 121 aa  77  0.00000000000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.474644  normal  0.174288 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2213  protein of unknown function UPF0102  38.14 
 
 		 118 aa  76.6  0.0000000000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.19652 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2103  hypothetical protein  33.33 
 
 		 121 aa  76.6  0.0000000000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.374615  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2095  protein of unknown function UPF0102  34.74 
 
 		 137 aa  76.3  0.0000000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0226  hypothetical protein  34.58 
 
 		 114 aa  76.6  0.0000000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.113401  normal  0.113585 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2398  hypothetical protein  40.71 
 
 		 118 aa  76.6  0.0000000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.430013  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0629  hypothetical protein  38.32 
 
 		 122 aa  76.3  0.0000000000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0993  protein of unknown function UPF0102  34.02 
 
 		 129 aa  75.5  0.0000000000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  hitchhiker  0.00109853  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1406  protein of unknown function UPF0102  37.07 
 
 		 114 aa  75.5  0.0000000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1447  protein of unknown function UPF0102  36.29 
 
 		 127 aa  76.3  0.0000000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1677  hypothetical protein  38.1 
 
 		 122 aa  75.5  0.0000000000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.238653  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1228  hypothetical protein  32.43 
 
 		 119 aa  75.9  0.0000000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.74821  normal  0.260342 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1324  hypothetical protein  35.04 
 
 		 124 aa  75.1  0.0000000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.294844  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3756  hypothetical protein  40.57 
 
 		 127 aa  75.5  0.0000000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00341379  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4524  hypothetical protein  35.04 
 
 		 123 aa  75.5  0.0000000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4400  hypothetical protein  35.04 
 
 		 123 aa  74.7  0.0000000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.147019 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004502  endonuclease  39.13 
 
 		 122 aa  74.7  0.0000000000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00000161677  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1186  hypothetical protein  35.83 
 
 		 140 aa  74.7  0.0000000000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00400032  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1530  hypothetical protein  38.14 
 
 		 118 aa  74.7  0.0000000000004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0048655  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3485  hypothetical protein  40.71 
 
 		 125 aa  74.3  0.0000000000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000340579 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1217  hypothetical protein  39.66 
 
 		 123 aa  74.3  0.0000000000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.266389  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3523  hypothetical protein  35.65 
 
 		 131 aa  74.3  0.0000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.578592  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3620  hypothetical protein  35.65 
 
 		 131 aa  74.3  0.0000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3560  hypothetical protein  35.65 
 
 		 131 aa  74.3  0.0000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3454  hypothetical protein  35.65 
 
 		 131 aa  74.3  0.0000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0144  hypothetical protein  41 
 
 		 112 aa  73.9  0.0000000000007  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3783  hypothetical protein  33.33 
 
 		 118 aa  73.9  0.0000000000007  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00882109  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0184  hypothetical protein  41 
 
 		 112 aa  73.9  0.0000000000007  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.805797  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2007  hypothetical protein  38.38 
 
 		 124 aa  72.8  0.000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.63182  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12912  hypothetical protein  32.04 
 
 		 141 aa  73.2  0.000000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0199208  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02085  hypothetical protein  42.86 
 
 		 119 aa  73.2  0.000000000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.997348  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1703  hypothetical protein  39.02 
 
 		 123 aa  73.2  0.000000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3452  hypothetical protein  35.65 
 
 		 131 aa  72.8  0.000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1959  hypothetical protein  37.14 
 
 		 122 aa  73.6  0.000000000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.142549  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0277  protein of unknown function UPF0102  36.45 
 
 		 120 aa  73.2  0.000000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.107261  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0163  hypothetical protein  40 
 
 		 112 aa  73.6  0.000000000001  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5877  protein of unknown function UPF0102  38.05 
 
 		 117 aa  72.8  0.000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.662779 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0315  protein of unknown function UPF0102  39.8 
 
 		 121 aa  72.8  0.000000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000225244 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0932  hypothetical protein  34.19 
 
 		 123 aa  72.8  0.000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3443  hypothetical protein  35.45 
 
 		 131 aa  72.4  0.000000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0977  hypothetical protein  46.53 
 
 		 119 aa  72  0.000000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.320606  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3424  hypothetical protein  39.82 
 
 		 125 aa  72.4  0.000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0142  conserved hypothetical protein TIGR00252  39.8 
 
 		 121 aa  72.8  0.000000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03015  hypothetical protein  34.55 
 
 		 131 aa  72  0.000000000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0557  protein of unknown function UPF0102  34.55 
 
 		 131 aa  72  0.000000000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02966  hypothetical protein  34.55 
 
 		 131 aa  72  0.000000000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0550  hypothetical protein  34.55 
 
 		 131 aa  72  0.000000000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5917  protein of unknown function UPF0102  38.54 
 
 		 117 aa  71.6  0.000000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00245822  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0313  hypothetical protein  32.48 
 
 		 118 aa  71.6  0.000000000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.674161  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1695  hypothetical protein  34.91 
 
 		 120 aa  71.2  0.000000000004  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3630  hypothetical protein  35.14 
 
 		 131 aa  71.2  0.000000000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0460  protein of unknown function UPF0102  30.97 
 
 		 153 aa  70.9  0.000000000005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1376  protein of unknown function UPF0102  38.66 
 
 		 119 aa  71.2  0.000000000005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000032081  normal  0.333882 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0589  hypothetical protein  30.77 
 
 		 131 aa  71.2  0.000000000005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.424556  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3709  protein of unknown function UPF0102  34.82 
 
 		 119 aa  71.2  0.000000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3624  hypothetical protein  35.45 
 
 		 131 aa  70.9  0.000000000006  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1901  formate dehydrogenase H large subunit  38.1 
 
 		 109 aa  70.9  0.000000000006  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0676  hypothetical protein  32.77 
 
 		 167 aa  70.9  0.000000000006  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0552943  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0355  hypothetical protein  35.65 
 
 		 124 aa  70.5  0.000000000007  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2217  hypothetical protein  32.74 
 
 		 123 aa  70.5  0.000000000007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000089571  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3265  hypothetical protein  36.04 
 
 		 127 aa  70.5  0.000000000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0988  hypothetical protein  37 
 
 		 120 aa  70.5  0.000000000008  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.659164 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4100  hypothetical protein  36.79 
 
 		 108 aa  70.5  0.000000000008  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4188  hypothetical protein  36.79 
 
 		 108 aa  70.5  0.000000000008  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4070  hypothetical protein  36.79 
 
 		 108 aa  70.5  0.000000000008  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10070  conserved hypothetical protein TIGR00252  31.3 
 
 		 153 aa  70.5  0.000000000008  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0294595  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0112  hypothetical protein  32.48 
 
 		 122 aa  70.1  0.000000000008  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3990  hypothetical protein  36.79 
 
 		 108 aa  70.5  0.000000000008  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3391  hypothetical protein  35.51 
 
 		 128 aa  70.1  0.000000000009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1723  hypothetical protein  37.89 
 
 		 123 aa  69.7  0.00000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.471951 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>