267 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcE24377A_3630 on replicon NC_009801
Organism: Escherichia coli E24377A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009801  EcE24377A_3630  hypothetical protein  100 
 
 
131 aa  270  4.0000000000000004e-72  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3443  hypothetical protein  97.71 
 
 
131 aa  267  4e-71  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03015  hypothetical protein  96.95 
 
 
131 aa  266  5e-71  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0557  protein of unknown function UPF0102  96.95 
 
 
131 aa  266  5e-71  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02966  hypothetical protein  96.95 
 
 
131 aa  266  5e-71  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4467  hypothetical protein  98.47 
 
 
131 aa  267  5e-71  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0550  hypothetical protein  96.95 
 
 
131 aa  266  5e-71  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3624  hypothetical protein  98.47 
 
 
131 aa  265  2e-70  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3523  hypothetical protein  81.68 
 
 
131 aa  228  2e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.578592  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3560  hypothetical protein  81.68 
 
 
131 aa  228  2e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3454  hypothetical protein  81.68 
 
 
131 aa  228  2e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3620  hypothetical protein  81.68 
 
 
131 aa  228  2e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3452  hypothetical protein  80.92 
 
 
131 aa  226  9e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3585  hypothetical protein  70.23 
 
 
131 aa  204  3e-52  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.186326 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3340  hypothetical protein  97.75 
 
 
89 aa  184  5e-46  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4337  hypothetical protein  60 
 
 
117 aa  142  2e-33  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.977576  normal  0.214034 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3783  hypothetical protein  59.65 
 
 
118 aa  141  3e-33  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00882109  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0307  hypothetical protein  59.65 
 
 
118 aa  138  3e-32  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.432671  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0313  hypothetical protein  58.77 
 
 
118 aa  137  6e-32  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.674161  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3625  hypothetical protein  63.46 
 
 
113 aa  134  4e-31  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0474  hypothetical protein  58.26 
 
 
117 aa  131  3e-30  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1121  hypothetical protein  58.26 
 
 
117 aa  131  3e-30  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0538  hypothetical protein  58.26 
 
 
117 aa  131  3e-30  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.670141  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0739  hypothetical protein  46.15 
 
 
120 aa  110  6e-24  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.235623  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0756  hypothetical protein  50.86 
 
 
118 aa  107  7.000000000000001e-23  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.477778  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0197  hypothetical protein  48.33 
 
 
137 aa  107  7.000000000000001e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.404878  unclonable  0.00000000000559374 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2103  hypothetical protein  52.17 
 
 
121 aa  107  8.000000000000001e-23  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.374615  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00890  hypothetical protein  42.37 
 
 
122 aa  106  9.000000000000001e-23  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3391  hypothetical protein  51.24 
 
 
128 aa  104  4e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04380  hypothetical protein  49.56 
 
 
122 aa  103  9e-22  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0216  hypothetical protein  51.33 
 
 
142 aa  102  1e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.0192793 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3148  hypothetical protein  51.75 
 
 
160 aa  102  2e-21  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0202  hypothetical protein  51.33 
 
 
142 aa  102  2e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004502  endonuclease  39.83 
 
 
122 aa  102  2e-21  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00000161677  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0041  hypothetical protein  50.42 
 
 
160 aa  101  3e-21  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3819  hypothetical protein  49.59 
 
 
144 aa  100  5e-21  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.213422  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1674  hypothetical protein  49.14 
 
 
121 aa  100  6e-21  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1748  hypothetical protein  49.14 
 
 
121 aa  100  6e-21  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3900  hypothetical protein  49.59 
 
 
144 aa  100  6e-21  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2801  hypothetical protein  50.42 
 
 
160 aa  100  9e-21  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.135805  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2283  hypothetical protein  46.09 
 
 
113 aa  99.8  1e-20  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.567685 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0271  hypothetical protein  50.44 
 
 
142 aa  99.8  1e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0679864 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0024  hypothetical protein  49.59 
 
 
144 aa  99.8  1e-20  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.308699  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1742  hypothetical protein  49.59 
 
 
144 aa  99.8  1e-20  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3176  hypothetical protein  49.59 
 
 
144 aa  99.8  1e-20  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0112  hypothetical protein  40.68 
 
 
122 aa  98.2  3e-20  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2816  hypothetical protein  49.56 
 
 
142 aa  97.8  4e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0290  hypothetical protein  49.56 
 
 
158 aa  97.8  4e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4433  hypothetical protein  40.16 
 
 
129 aa  95.9  2e-19  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.875795  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3463  hypothetical protein  45.83 
 
 
125 aa  95.9  2e-19  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4313  hypothetical protein  44 
 
 
140 aa  95.9  2e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3135  hypothetical protein  45.83 
 
 
125 aa  95.9  2e-19  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0405  hypothetical protein  46.49 
 
 
154 aa  95.1  3e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3146  sigma-54 factor  50 
 
 
118 aa  94.7  4e-19  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2201  hypothetical protein  47.01 
 
 
123 aa  94.4  4e-19  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0123  hypothetical protein  46.9 
 
 
156 aa  94  6e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2655  hypothetical protein  44.95 
 
 
123 aa  93.6  8e-19  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0271  hypothetical protein  44.27 
 
 
153 aa  92.4  2e-18  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0503  hypothetical protein  47.37 
 
 
120 aa  91.7  3e-18  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.451178 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3265  hypothetical protein  49.53 
 
 
130 aa  91.3  4e-18  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1934  hypothetical protein  41.07 
 
 
120 aa  90.5  6e-18  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.547856  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0259  hypothetical protein  41.07 
 
 
120 aa  90.5  6e-18  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0184  hypothetical protein  44.8 
 
 
123 aa  89.4  1e-17  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1324  hypothetical protein  40.6 
 
 
124 aa  89.4  2e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.294844  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3873  hypothetical protein  44.92 
 
 
128 aa  89  2e-17  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0932  hypothetical protein  40.83 
 
 
123 aa  89  2e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3355  hypothetical protein  44.04 
 
 
108 aa  89  2e-17  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4400  hypothetical protein  40.68 
 
 
123 aa  88.2  3e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.147019 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0251  hypothetical protein  40.18 
 
 
112 aa  87.8  4e-17  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4524  hypothetical protein  40.68 
 
 
123 aa  88.2  4e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0589  hypothetical protein  43.75 
 
 
131 aa  87.8  4e-17  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.424556  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2488  protein of unknown function UPF0102  41.53 
 
 
123 aa  87.4  6e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0776001  normal  0.272437 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4114  hypothetical protein  42.86 
 
 
123 aa  87  7e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0355  hypothetical protein  40.17 
 
 
124 aa  87  7e-17  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0315  protein of unknown function UPF0102  45.38 
 
 
121 aa  87  7e-17  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000225244 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0142  conserved hypothetical protein TIGR00252  45.38 
 
 
121 aa  87  7e-17  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1176  hypothetical protein  40.16 
 
 
122 aa  87  7e-17  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.108145 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1695  hypothetical protein  40 
 
 
120 aa  86.7  1e-16  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0195  hypothetical protein  44.54 
 
 
119 aa  85.9  1e-16  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.227376  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0226  hypothetical protein  40.91 
 
 
114 aa  85.5  2e-16  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.113401  normal  0.113585 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0351  hypothetical protein  36.21 
 
 
117 aa  85.1  3e-16  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0502533  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0910  hypothetical protein  45.37 
 
 
119 aa  84.3  6e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.21322  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0497  hypothetical protein  40.85 
 
 
142 aa  84  6e-16  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4188  hypothetical protein  43.48 
 
 
108 aa  84  7e-16  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3990  hypothetical protein  43.48 
 
 
108 aa  84  7e-16  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4100  hypothetical protein  43.48 
 
 
108 aa  84  7e-16  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4070  hypothetical protein  43.48 
 
 
108 aa  84  7e-16  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4420  hypothetical protein  41.73 
 
 
128 aa  83.6  8e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.149236  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp3065  hypothetical protein  38.26 
 
 
118 aa  83.6  9e-16  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3693  hypothetical protein  42.59 
 
 
108 aa  83.6  9e-16  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.678912  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3766  hypothetical protein  41.46 
 
 
122 aa  82.8  0.000000000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.969308  normal  0.0430921 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0299  hypothetical protein  39.81 
 
 
108 aa  82.4  0.000000000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0391  hypothetical protein  40.71 
 
 
149 aa  82.4  0.000000000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.0487377 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4685  hypothetical protein  40.71 
 
 
120 aa  81.6  0.000000000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.0484178 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3881  hypothetical protein  40.74 
 
 
108 aa  80.9  0.000000000000006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.114446 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0388  hypothetical protein  40.37 
 
 
108 aa  80.5  0.000000000000007  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.597532  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13130  hypothetical protein  41.28 
 
 
120 aa  79.7  0.00000000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3685  hypothetical protein  40.74 
 
 
108 aa  79.3  0.00000000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0260  hypothetical protein  39.81 
 
 
108 aa  79.3  0.00000000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4818  protein of unknown function UPF0102  43.44 
 
 
123 aa  79.3  0.00000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>