252 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CA2559_02085 on replicon NC_014230
Organism: Croceibacter atlanticus HTCC2559



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014230  CA2559_02085  hypothetical protein  100 
 
 		 119 aa  243  8e-64  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.997348  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1217  hypothetical protein  56.1 
 
 		 123 aa  138  1.9999999999999998e-32  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.266389  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2025  hypothetical protein  52.94 
 
 		 119 aa  127  7.000000000000001e-29  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5877  protein of unknown function UPF0102  47.41 
 
 		 117 aa  108  2.0000000000000002e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.662779 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3709  protein of unknown function UPF0102  41.88 
 
 		 119 aa  100  6e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0277  protein of unknown function UPF0102  46.61 
 
 		 120 aa  100  8e-21  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.107261  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0701  hypothetical protein  43.48 
 
 		 122 aa  95.1  3e-19  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0037  hypothetical protein  40.17 
 
 		 127 aa  90.5  7e-18  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0017  hypothetical protein  42.37 
 
 		 128 aa  90.1  8e-18  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000457371  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0016  hypothetical protein  39.17 
 
 		 129 aa  89.7  1e-17  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.197298  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0017  hypothetical protein  38.33 
 
 		 126 aa  88.2  3e-17  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.00052241  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1992  hypothetical protein  35.59 
 
 		 129 aa  82.8  0.000000000000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3756  hypothetical protein  40.17 
 
 		 127 aa  81.6  0.000000000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00341379  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2864  hypothetical protein  39.83 
 
 		 122 aa  81.3  0.000000000000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00415914  hitchhiker  0.000000500394 
 
 
-
 
NC_002950  PG1874  hypothetical protein  33.9 
 
 		 135 aa  80.9  0.000000000000006  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1175  protein of unknown function UPF0102  32.2 
 
 		 122 aa  79.7  0.00000000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0993  protein of unknown function UPF0102  36.13 
 
 		 129 aa  79.7  0.00000000000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  hitchhiker  0.00109853  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07400  hypothetical protein  42.86 
 
 		 116 aa  79.3  0.00000000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1475  endonuclease  38.6 
 
 		 115 aa  78.2  0.00000000000004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.733308  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3485  hypothetical protein  41.03 
 
 		 125 aa  77.4  0.00000000000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000340579 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3248  hypothetical protein  38.68 
 
 		 124 aa  77  0.00000000000007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.852323  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1291  protein of unknown function UPF0102  36.75 
 
 		 115 aa  76.3  0.0000000000001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000677509  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1376  protein of unknown function UPF0102  38.94 
 
 		 119 aa  76.6  0.0000000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000032081  normal  0.333882 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3424  hypothetical protein  40.17 
 
 		 125 aa  75.9  0.0000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1530  hypothetical protein  39.66 
 
 		 118 aa  75.9  0.0000000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0048655  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0465  hypothetical protein  39.29 
 
 		 113 aa  75.9  0.0000000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1550  hypothetical protein  38.52 
 
 		 132 aa  75.9  0.0000000000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.176091 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0351  hypothetical protein  36.94 
 
 		 117 aa  75.1  0.0000000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0502533  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2019  protein of unknown function UPF0102  32.76 
 
 		 134 aa  74.3  0.0000000000005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.573307  normal  0.167847 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0720  hypothetical protein  41.6 
 
 		 126 aa  73.9  0.0000000000006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0341617  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1447  protein of unknown function UPF0102  37.5 
 
 		 127 aa  73.9  0.0000000000007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1792  hypothetical protein  33.62 
 
 		 160 aa  73.9  0.0000000000007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0669  hypothetical protein  38.38 
 
 		 124 aa  73.6  0.0000000000008  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3998  protein of unknown function UPF0102  38.6 
 
 		 139 aa  73.6  0.0000000000008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0299  hypothetical protein  37.27 
 
 		 108 aa  73.6  0.0000000000009  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0546  hypothetical protein  42.86 
 
 		 115 aa  73.2  0.000000000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.672576  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2213  hypothetical protein  35.65 
 
 		 132 aa  72.8  0.000000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000124547 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1156  hypothetical protein  36.44 
 
 		 118 aa  72.8  0.000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0160558  normal  0.0576877 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1406  protein of unknown function UPF0102  41 
 
 		 173 aa  72.8  0.000000000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.000418677  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0650  hypothetical protein  38.14 
 
 		 128 aa  72.8  0.000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3985  hypothetical protein  32.2 
 
 		 143 aa  72.8  0.000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.889068  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3685  hypothetical protein  38.18 
 
 		 108 aa  72  0.000000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_11140  predicted endonuclease related to Holliday junction resolvase  33.04 
 
 		 120 aa  72.4  0.000000000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0330886  normal  0.323386 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3311  protein of unknown function UPF0102  39.47 
 
 		 134 aa  71.6  0.000000000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1407  protein of unknown function UPF0102  33.33 
 
 		 122 aa  72  0.000000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.993674  normal  0.0549137 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3693  hypothetical protein  39.09 
 
 		 108 aa  72  0.000000000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.678912  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1218  protein of unknown function UPF0102  38.39 
 
 		 119 aa  71.2  0.000000000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.648075  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0666  hypothetical protein  35.71 
 
 		 116 aa  71.2  0.000000000004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0397911  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1186  hypothetical protein  38.05 
 
 		 140 aa  71.6  0.000000000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00400032  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0758  hypothetical protein  40.71 
 
 		 130 aa  71.2  0.000000000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1228  hypothetical protein  37.82 
 
 		 119 aa  71.2  0.000000000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.74821  normal  0.260342 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2298  hypothetical protein  38.14 
 
 		 123 aa  70.9  0.000000000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0260  hypothetical protein  37.27 
 
 		 108 aa  70.9  0.000000000006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3990  hypothetical protein  35.45 
 
 		 108 aa  69.7  0.00000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2881  hypothetical protein  34.82 
 
 		 146 aa  69.7  0.00000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.696458 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4188  hypothetical protein  35.45 
 
 		 108 aa  69.7  0.00000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4070  hypothetical protein  35.45 
 
 		 108 aa  69.7  0.00000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3881  hypothetical protein  36.36 
 
 		 108 aa  69.3  0.00000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.114446 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4100  hypothetical protein  35.45 
 
 		 108 aa  69.7  0.00000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2217  hypothetical protein  37.39 
 
 		 123 aa  68.9  0.00000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000089571  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2054  hypothetical protein  35.45 
 
 		 133 aa  69.3  0.00000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.595954  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1969  hypothetical protein  35.45 
 
 		 133 aa  69.3  0.00000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  decreased coverage  0.00399816  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3740  protein of unknown function UPF0102  37.27 
 
 		 121 aa  69.3  0.00000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000086697  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2532  protein of unknown function UPF0102  34.21 
 
 		 118 aa  68.6  0.00000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.388001 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10070  conserved hypothetical protein TIGR00252  37.27 
 
 		 153 aa  68.2  0.00000000004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0294595  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1641  protein of unknown function UPF0102  31.3 
 
 		 122 aa  68.2  0.00000000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0797113  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1959  hypothetical protein  37.25 
 
 		 122 aa  68.2  0.00000000004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.142549  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1910  hypothetical protein  36.04 
 
 		 134 aa  67.8  0.00000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.179028  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1320  hypothetical protein  38.14 
 
 		 121 aa  67.8  0.00000000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1947  hypothetical protein  32.69 
 
 		 133 aa  67.4  0.00000000006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.439621  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1272  protein of unknown function UPF0102  35.34 
 
 		 125 aa  67.4  0.00000000007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2474  hypothetical protein  34.21 
 
 		 118 aa  67  0.00000000008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0253334  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2095  protein of unknown function UPF0102  30.3 
 
 		 137 aa  67  0.00000000009  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0016  hypothetical protein  41.67 
 
 		 127 aa  67  0.00000000009  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.204452  unclonable  0.000000883308 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0629  hypothetical protein  35.29 
 
 		 122 aa  66.2  0.0000000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4036  protein of unknown function UPF0102  36.67 
 
 		 118 aa  66.6  0.0000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.261027  normal  0.0798574 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1406  protein of unknown function UPF0102  32.38 
 
 		 114 aa  66.2  0.0000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0226  hypothetical protein  32.17 
 
 		 114 aa  66.2  0.0000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.113401  normal  0.113585 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1836  hypothetical protein  35.64 
 
 		 117 aa  66.2  0.0000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0316841 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0977  hypothetical protein  41.03 
 
 		 119 aa  65.9  0.0000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.320606  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1478  protein of unknown function UPF0102  33.33 
 
 		 118 aa  65.5  0.0000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.10043  normal  0.036198 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0272  hypothetical protein  34.41 
 
 		 108 aa  65.9  0.0000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000000600044  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0992  hypothetical protein  35.64 
 
 		 117 aa  65.9  0.0000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.528214  normal  0.0951104 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1677  hypothetical protein  37.86 
 
 		 122 aa  65.1  0.0000000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.238653  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0707  hypothetical protein  32.46 
 
 		 121 aa  64.7  0.0000000004  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3123  protein of unknown function UPF0102  32.23 
 
 		 121 aa  64.3  0.0000000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0308676  normal  0.107591 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3135  hypothetical protein  33.33 
 
 		 125 aa  64.3  0.0000000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3463  hypothetical protein  33.33 
 
 		 125 aa  63.9  0.0000000006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_09240  Holliday junction resolvase-like endonuclease  33.02 
 
 		 139 aa  63.9  0.0000000007  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0928499  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0251  hypothetical protein  33.62 
 
 		 112 aa  63.9  0.0000000008  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0781  hypothetical protein  30.17 
 
 		 121 aa  63.5  0.0000000009  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0355  hypothetical protein  28.21 
 
 		 124 aa  62.8  0.000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_687  endonuclease  31.9 
 
 		 121 aa  63.2  0.000000001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1703  hypothetical protein  34.75 
 
 		 123 aa  63.2  0.000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23670  predicted endonuclease related to Holliday junction resolvase  28.85 
 
 		 127 aa  63.2  0.000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.183487  normal  0.0867152 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0676  hypothetical protein  32.17 
 
 		 167 aa  63.5  0.000000001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0552943  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_07020  predicted endonuclease related to Holliday junction resolvase  36.89 
 
 		 186 aa  62.4  0.000000002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.00114408  normal  0.507303 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3413  protein of unknown function UPF0102  31.86 
 
 		 124 aa  62.4  0.000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4252  hypothetical protein  33.33 
 
 		 117 aa  62.4  0.000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000137469 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09830  conserved hypothetical protein TIGR00252  34.82 
 
 		 125 aa  61.6  0.000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.351272  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>