274 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TBFG_12912 on replicon NC_009565
Organism: Mycobacterium tuberculosis F11



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009565  TBFG_12912  hypothetical protein  100 
 
 
141 aa  281  2.0000000000000002e-75  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0199208  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1985  hypothetical protein  65.67 
 
 
135 aa  172  9.999999999999999e-43  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0318406  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2031  hypothetical protein  65.67 
 
 
135 aa  172  9.999999999999999e-43  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.474175  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1965  hypothetical protein  64.93 
 
 
135 aa  171  3.9999999999999995e-42  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.52969 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4140  hypothetical protein  64.52 
 
 
123 aa  164  4e-40  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2202  hypothetical protein  64.75 
 
 
121 aa  156  8e-38  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.474644  normal  0.174288 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09830  conserved hypothetical protein TIGR00252  50 
 
 
125 aa  107  4.0000000000000004e-23  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.351272  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2095  protein of unknown function UPF0102  44.86 
 
 
137 aa  100  1e-20  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3998  protein of unknown function UPF0102  47.66 
 
 
139 aa  99  2e-20  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0992  hypothetical protein  55.1 
 
 
117 aa  98.6  2e-20  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.528214  normal  0.0951104 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1836  hypothetical protein  54.08 
 
 
117 aa  97.8  4e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0316841 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2864  hypothetical protein  46.02 
 
 
122 aa  95.5  2e-19  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00415914  hitchhiker  0.000000500394 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3413  protein of unknown function UPF0102  46.4 
 
 
124 aa  95.5  2e-19  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23670  predicted endonuclease related to Holliday junction resolvase  46.77 
 
 
127 aa  95.1  3e-19  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.183487  normal  0.0867152 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1228  hypothetical protein  45.22 
 
 
119 aa  92.4  2e-18  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.74821  normal  0.260342 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3123  protein of unknown function UPF0102  50 
 
 
121 aa  89.4  1e-17  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0308676  normal  0.107591 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1703  hypothetical protein  40.19 
 
 
123 aa  89  2e-17  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10070  conserved hypothetical protein TIGR00252  49.52 
 
 
153 aa  89  2e-17  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0294595  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2474  hypothetical protein  43.59 
 
 
118 aa  89.4  2e-17  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0253334  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1175  protein of unknown function UPF0102  46.49 
 
 
122 aa  87  7e-17  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1156  hypothetical protein  47.96 
 
 
118 aa  85.1  3e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0160558  normal  0.0576877 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0666  hypothetical protein  47.12 
 
 
116 aa  85.1  3e-16  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0397911  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1550  hypothetical protein  43.44 
 
 
132 aa  84.7  4e-16  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.176091 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0669  hypothetical protein  48.6 
 
 
124 aa  84.3  5e-16  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2213  hypothetical protein  43.97 
 
 
132 aa  84.3  5e-16  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000124547 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0993  protein of unknown function UPF0102  44.72 
 
 
129 aa  84  6e-16  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  hitchhiker  0.00109853  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1641  protein of unknown function UPF0102  47.27 
 
 
122 aa  82.8  0.000000000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0797113  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0676  hypothetical protein  43.24 
 
 
167 aa  82.4  0.000000000000002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0552943  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3248  hypothetical protein  42.74 
 
 
124 aa  80.9  0.000000000000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.852323  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1186  hypothetical protein  42.71 
 
 
140 aa  80.5  0.000000000000007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00400032  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2035  hypothetical protein  37.4 
 
 
122 aa  80.1  0.000000000000009  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.848509  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1530  hypothetical protein  30.84 
 
 
118 aa  79.7  0.00000000000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0048655  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13130  hypothetical protein  42.48 
 
 
120 aa  79  0.00000000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1272  protein of unknown function UPF0102  37.61 
 
 
125 aa  78.2  0.00000000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3756  hypothetical protein  39.47 
 
 
127 aa  78.2  0.00000000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00341379  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0650  hypothetical protein  41.07 
 
 
128 aa  77.4  0.00000000000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0977  hypothetical protein  36.94 
 
 
119 aa  77  0.00000000000008  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.320606  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1407  protein of unknown function UPF0102  43.22 
 
 
122 aa  76.6  0.00000000000009  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.993674  normal  0.0549137 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1475  endonuclease  41 
 
 
115 aa  77  0.00000000000009  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.733308  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0932  hypothetical protein  42.59 
 
 
123 aa  76.6  0.0000000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1792  hypothetical protein  40.88 
 
 
160 aa  76.6  0.0000000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1447  protein of unknown function UPF0102  38.66 
 
 
127 aa  76.3  0.0000000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5917  protein of unknown function UPF0102  39.66 
 
 
117 aa  76.6  0.0000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00245822  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1218  protein of unknown function UPF0102  38.14 
 
 
119 aa  75.9  0.0000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.648075  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4524  hypothetical protein  41.67 
 
 
123 aa  75.9  0.0000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0145  hypothetical protein  37.9 
 
 
124 aa  75.5  0.0000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0280805  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4400  hypothetical protein  41.67 
 
 
123 aa  75.5  0.0000000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.147019 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2230  protein of unknown function UPF0102  38.94 
 
 
127 aa  75.1  0.0000000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0169041  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3740  protein of unknown function UPF0102  35 
 
 
121 aa  75.1  0.0000000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000086697  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1093  endonuclease-like  36.72 
 
 
202 aa  74.7  0.0000000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2193  hypothetical protein  48.15 
 
 
207 aa  74.7  0.0000000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.1725  normal  0.994481 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1324  hypothetical protein  41.67 
 
 
124 aa  74.3  0.0000000000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.294844  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0184  hypothetical protein  41.41 
 
 
123 aa  74.3  0.0000000000005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4114  hypothetical protein  39.13 
 
 
123 aa  74.3  0.0000000000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0277  protein of unknown function UPF0102  37.38 
 
 
120 aa  74.3  0.0000000000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.107261  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00890  hypothetical protein  38.74 
 
 
122 aa  74.3  0.0000000000006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1992  hypothetical protein  41.03 
 
 
129 aa  73.6  0.0000000000009  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3586  hypothetical protein  49.47 
 
 
118 aa  73.2  0.000000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1478  protein of unknown function UPF0102  46.43 
 
 
118 aa  72.8  0.000000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.10043  normal  0.036198 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004502  endonuclease  38.1 
 
 
122 aa  72.8  0.000000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00000161677  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0546  hypothetical protein  32.04 
 
 
115 aa  73.2  0.000000000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.672576  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07400  hypothetical protein  40.38 
 
 
116 aa  72  0.000000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1521  protein of unknown function UPF0102  37.96 
 
 
157 aa  72  0.000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0637187  normal  0.0119716 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0017  hypothetical protein  39.09 
 
 
126 aa  72.4  0.000000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.00052241  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4420  hypothetical protein  42.06 
 
 
128 aa  72  0.000000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.149236  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3694  hypothetical protein  34.21 
 
 
114 aa  70.9  0.000000000006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3424  hypothetical protein  40.21 
 
 
125 aa  70.5  0.000000000007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3485  hypothetical protein  40.21 
 
 
125 aa  70.5  0.000000000007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000340579 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2217  hypothetical protein  39.67 
 
 
123 aa  70.5  0.000000000007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000089571  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0017  hypothetical protein  40.57 
 
 
128 aa  70.5  0.000000000008  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000457371  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0553  protein of unknown function UPF0102  43.75 
 
 
118 aa  68.9  0.00000000002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.156898 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1320  hypothetical protein  43.97 
 
 
121 aa  68.9  0.00000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0016  hypothetical protein  37.84 
 
 
129 aa  68.6  0.00000000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.197298  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2488  protein of unknown function UPF0102  39.42 
 
 
123 aa  68.2  0.00000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0776001  normal  0.272437 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3311  protein of unknown function UPF0102  40.62 
 
 
134 aa  68.2  0.00000000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57490  hypothetical protein  40.52 
 
 
125 aa  67.8  0.00000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2103  hypothetical protein  43.88 
 
 
121 aa  67.8  0.00000000005  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.374615  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3463  hypothetical protein  43.43 
 
 
125 aa  67.8  0.00000000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0460  protein of unknown function UPF0102  38.68 
 
 
153 aa  67.4  0.00000000006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0720  hypothetical protein  37.37 
 
 
126 aa  67.4  0.00000000006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0341617  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4996  hypothetical protein  39.66 
 
 
125 aa  67.4  0.00000000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.608406  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_11140  predicted endonuclease related to Holliday junction resolvase  42.99 
 
 
120 aa  67  0.00000000007  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0330886  normal  0.323386 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0589  hypothetical protein  40 
 
 
131 aa  67  0.00000000008  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.424556  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0142  conserved hypothetical protein TIGR00252  41.24 
 
 
121 aa  67  0.00000000008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0315  protein of unknown function UPF0102  41.24 
 
 
121 aa  67  0.00000000008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000225244 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3675  protein of unknown function UPF0102  40 
 
 
122 aa  67  0.00000000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.344366 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4433  hypothetical protein  32.73 
 
 
129 aa  66.2  0.0000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.875795  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2395  hypothetical protein  36.17 
 
 
127 aa  66.2  0.0000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.615386  normal  0.0739869 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0756  hypothetical protein  41.18 
 
 
118 aa  66.6  0.0000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.477778  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3135  hypothetical protein  42.42 
 
 
125 aa  66.2  0.0000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4685  hypothetical protein  36.89 
 
 
120 aa  66.2  0.0000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.0484178 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10390  predicted endonuclease related to Holliday junction resolvase  36.97 
 
 
167 aa  66.6  0.0000000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.0000139118  unclonable  0.000000000910029 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0629  hypothetical protein  32.67 
 
 
122 aa  66.2  0.0000000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2532  protein of unknown function UPF0102  45.3 
 
 
118 aa  65.5  0.0000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.388001 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1406  protein of unknown function UPF0102  36.52 
 
 
114 aa  65.5  0.0000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1406  protein of unknown function UPF0102  41.41 
 
 
173 aa  66.2  0.0000000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.000418677  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0231  protein of unknown function UPF0102  40.62 
 
 
121 aa  65.5  0.0000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.819406  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0037  hypothetical protein  38.38 
 
 
127 aa  65.1  0.0000000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0910  hypothetical protein  41.41 
 
 
119 aa  64.3  0.0000000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.21322  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0758  hypothetical protein  39.22 
 
 
130 aa  64.3  0.0000000006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>