More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daud_0666 on replicon NC_010424
Organism: Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010424  Daud_0666  hypothetical protein  100 
 
 		 116 aa  230  6e-60  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0397911  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1406  protein of unknown function UPF0102  52.78 
 
 		 114 aa  117  7e-26  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1218  protein of unknown function UPF0102  47.86 
 
 		 119 aa  112  2.0000000000000002e-24  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.648075  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2035  hypothetical protein  45 
 
 		 122 aa  111  3e-24  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.848509  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2864  hypothetical protein  47.46 
 
 		 122 aa  110  9e-24  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00415914  hitchhiker  0.000000500394 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0977  hypothetical protein  42.86 
 
 		 119 aa  103  6e-22  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.320606  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1530  hypothetical protein  37.29 
 
 		 118 aa  99.4  1e-20  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0048655  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1703  hypothetical protein  39.17 
 
 		 123 aa  97.8  4e-20  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13130  hypothetical protein  45.38 
 
 		 120 aa  97.4  5e-20  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3740  protein of unknown function UPF0102  45.19 
 
 		 121 aa  97.4  6e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000086697  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0650  hypothetical protein  44.35 
 
 		 128 aa  96.3  1e-19  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3998  protein of unknown function UPF0102  48.7 
 
 		 139 aa  96.3  1e-19  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09830  conserved hypothetical protein TIGR00252  43.59 
 
 		 125 aa  95.1  3e-19  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.351272  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0701  hypothetical protein  41.96 
 
 		 122 aa  95.1  3e-19  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3756  hypothetical protein  41.88 
 
 		 127 aa  94.4  5e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00341379  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2217  hypothetical protein  45.13 
 
 		 123 aa  92.8  1e-18  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000089571  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1985  hypothetical protein  45.61 
 
 		 135 aa  93.2  1e-18  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0318406  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2031  hypothetical protein  45.61 
 
 		 135 aa  93.2  1e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.474175  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1910  hypothetical protein  54.31 
 
 		 134 aa  92.4  2e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.179028  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1550  hypothetical protein  43.65 
 
 		 132 aa  92.4  2e-18  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.176091 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1156  hypothetical protein  47.83 
 
 		 118 aa  92  2e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0160558  normal  0.0576877 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1969  hypothetical protein  53.45 
 
 		 133 aa  92  3e-18  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  decreased coverage  0.00399816  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2054  hypothetical protein  53.45 
 
 		 133 aa  92  3e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.595954  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1965  hypothetical protein  44.74 
 
 		 135 aa  90.9  5e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.52969 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0017  hypothetical protein  42.98 
 
 		 128 aa  90.9  5e-18  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000457371  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1992  hypothetical protein  45.69 
 
 		 129 aa  90.1  9e-18  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0756  hypothetical protein  47.46 
 
 		 118 aa  89.4  1e-17  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.477778  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4114  hypothetical protein  44.44 
 
 		 123 aa  89.4  1e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3248  hypothetical protein  44.64 
 
 		 124 aa  89.7  1e-17  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.852323  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10070  conserved hypothetical protein TIGR00252  47.37 
 
 		 153 aa  88.6  2e-17  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0294595  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2283  hypothetical protein  48.21 
 
 		 113 aa  89  2e-17  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.567685 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0277  protein of unknown function UPF0102  36.61 
 
 		 120 aa  89  2e-17  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.107261  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2398  hypothetical protein  46.46 
 
 		 118 aa  88.6  3e-17  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.430013  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57490  hypothetical protein  46.9 
 
 		 125 aa  88.6  3e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2230  protein of unknown function UPF0102  43.59 
 
 		 127 aa  87.8  4e-17  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0169041  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1406  protein of unknown function UPF0102  45.26 
 
 		 173 aa  87.8  4e-17  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.000418677  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3424  hypothetical protein  43.36 
 
 		 125 aa  87.8  4e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3485  hypothetical protein  43.36 
 
 		 125 aa  88.2  4e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000340579 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1475  endonuclease  44.92 
 
 		 115 aa  87.4  6e-17  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.733308  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2474  hypothetical protein  44.64 
 
 		 118 aa  87.4  6e-17  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0253334  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07400  hypothetical protein  38.14 
 
 		 116 aa  87  8e-17  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0503  hypothetical protein  45.45 
 
 		 120 aa  86.3  1e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.451178 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0758  hypothetical protein  39.67 
 
 		 130 aa  86.3  1e-16  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0993  protein of unknown function UPF0102  43.59 
 
 		 129 aa  86.7  1e-16  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  hitchhiker  0.00109853  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4420  hypothetical protein  43.44 
 
 		 128 aa  85.5  2e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.149236  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10390  predicted endonuclease related to Holliday junction resolvase  46.53 
 
 		 167 aa  85.5  2e-16  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.0000139118  unclonable  0.000000000910029 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3004  hypothetical protein  54.35 
 
 		 95 aa  85.9  2e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.350262  normal  0.587814 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3046  hypothetical protein  54.35 
 
 		 95 aa  85.9  2e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.339629  normal  0.794955 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1228  hypothetical protein  42.61 
 
 		 119 aa  85.1  3e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.74821  normal  0.260342 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12912  hypothetical protein  47.12 
 
 		 141 aa  85.1  3e-16  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0199208  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4996  hypothetical protein  45.13 
 
 		 125 aa  85.5  3e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.608406  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2395  hypothetical protein  43.75 
 
 		 127 aa  84.3  5e-16  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.615386  normal  0.0739869 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1272  protein of unknown function UPF0102  37.84 
 
 		 125 aa  84.3  5e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2202  hypothetical protein  42.48 
 
 		 121 aa  84  6e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.474644  normal  0.174288 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0184  hypothetical protein  47.57 
 
 		 123 aa  83.6  8e-16  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp3065  hypothetical protein  38.05 
 
 		 118 aa  83.6  9e-16  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4337  hypothetical protein  44.44 
 
 		 117 aa  83.6  9e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.977576  normal  0.214034 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2213  hypothetical protein  43.36 
 
 		 132 aa  82.8  0.000000000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000124547 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0988  hypothetical protein  51.69 
 
 		 120 aa  82.4  0.000000000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.659164 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3311  protein of unknown function UPF0102  43.88 
 
 		 134 aa  82.4  0.000000000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1376  protein of unknown function UPF0102  40 
 
 		 119 aa  82.4  0.000000000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000032081  normal  0.333882 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1959  hypothetical protein  38.05 
 
 		 122 aa  82  0.000000000000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.142549  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0037  hypothetical protein  38.84 
 
 		 127 aa  80.9  0.000000000000005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004502  endonuclease  45.36 
 
 		 122 aa  80.5  0.000000000000006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00000161677  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0195  hypothetical protein  46.61 
 
 		 119 aa  80.9  0.000000000000006  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.227376  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0355  hypothetical protein  47.37 
 
 		 124 aa  80.5  0.000000000000007  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0016  hypothetical protein  42.62 
 
 		 129 aa  80.1  0.000000000000009  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.197298  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2298  hypothetical protein  41.38 
 
 		 123 aa  79.3  0.00000000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0992  hypothetical protein  46.32 
 
 		 117 aa  80.1  0.00000000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.528214  normal  0.0951104 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3123  protein of unknown function UPF0102  45.69 
 
 		 121 aa  79.3  0.00000000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0308676  normal  0.107591 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23670  predicted endonuclease related to Holliday junction resolvase  39.83 
 
 		 127 aa  79.7  0.00000000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.183487  normal  0.0867152 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1324  hypothetical protein  45.83 
 
 		 124 aa  79  0.00000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.294844  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4685  hypothetical protein  44.21 
 
 		 120 aa  79  0.00000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0484178 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0460  protein of unknown function UPF0102  38.94 
 
 		 153 aa  79  0.00000000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4524  hypothetical protein  45.83 
 
 		 123 aa  78.6  0.00000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1677  hypothetical protein  37.17 
 
 		 122 aa  79.3  0.00000000000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.238653  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3355  hypothetical protein  45.05 
 
 		 108 aa  79  0.00000000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0910  hypothetical protein  41.23 
 
 		 119 aa  78.6  0.00000000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.21322  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3709  protein of unknown function UPF0102  38.39 
 
 		 119 aa  78.2  0.00000000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_07020  predicted endonuclease related to Holliday junction resolvase  40.62 
 
 		 186 aa  78.2  0.00000000000003  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.00114408  normal  0.507303 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4400  hypothetical protein  45.83 
 
 		 123 aa  78.6  0.00000000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.147019 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0720  hypothetical protein  35.25 
 
 		 126 aa  78.6  0.00000000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0341617  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0538  hypothetical protein  43.33 
 
 		 117 aa  77.8  0.00000000000004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.670141  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1121  hypothetical protein  43.33 
 
 		 117 aa  77.8  0.00000000000004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0142  conserved hypothetical protein TIGR00252  43.12 
 
 		 121 aa  78.2  0.00000000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0017  hypothetical protein  41.03 
 
 		 126 aa  78.2  0.00000000000004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.00052241  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4140  hypothetical protein  44.35 
 
 		 123 aa  78.2  0.00000000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0474  hypothetical protein  43.33 
 
 		 117 aa  77.8  0.00000000000004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0315  protein of unknown function UPF0102  43.12 
 
 		 121 aa  78.2  0.00000000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000225244 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5877  protein of unknown function UPF0102  35.14 
 
 		 117 aa  77.8  0.00000000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.662779 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2488  protein of unknown function UPF0102  47.42 
 
 		 123 aa  77.8  0.00000000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0776001  normal  0.272437 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1186  hypothetical protein  38.66 
 
 		 140 aa  77.4  0.00000000000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00400032  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1176  hypothetical protein  41.94 
 
 		 122 aa  77.4  0.00000000000006  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.108145 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0669  hypothetical protein  43.3 
 
 		 124 aa  77  0.00000000000007  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2019  protein of unknown function UPF0102  43.75 
 
 		 134 aa  77  0.00000000000009  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.573307  normal  0.167847 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0259  hypothetical protein  42.72 
 
 		 120 aa  76.6  0.0000000000001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1639  hypothetical protein  46.61 
 
 		 136 aa  76.6  0.0000000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.106195 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1934  hypothetical protein  42.72 
 
 		 120 aa  76.6  0.0000000000001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.547856  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00890  hypothetical protein  42.27 
 
 		 122 aa  75.9  0.0000000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2103  hypothetical protein  48.91 
 
 		 121 aa  75.5  0.0000000000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.374615  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>