293 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpha266_0037 on replicon NC_008639
Organism: Chlorobium phaeobacteroides DSM 266



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008639  Cpha266_0037  hypothetical protein  100 
 
 		 127 aa  264  2.9999999999999995e-70  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0016  hypothetical protein  63.78 
 
 		 129 aa  165  2e-40  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.197298  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0017  hypothetical protein  57.72 
 
 		 128 aa  154  4e-37  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000457371  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0017  hypothetical protein  58.06 
 
 		 126 aa  145  2.0000000000000003e-34  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.00052241  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1992  hypothetical protein  50.83 
 
 		 129 aa  127  4.0000000000000003e-29  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0016  hypothetical protein  56.69 
 
 		 127 aa  119  1.9999999999999998e-26  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.204452  unclonable  0.000000883308 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1447  protein of unknown function UPF0102  46.15 
 
 		 127 aa  113  1.0000000000000001e-24  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0650  hypothetical protein  47.06 
 
 		 128 aa  103  6e-22  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0993  protein of unknown function UPF0102  41.27 
 
 		 129 aa  98.2  4e-20  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  hitchhiker  0.00109853  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2217  hypothetical protein  42.5 
 
 		 123 aa  96.7  9e-20  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000089571  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2230  protein of unknown function UPF0102  44.07 
 
 		 127 aa  95.5  2e-19  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0169041  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0701  hypothetical protein  41.94 
 
 		 122 aa  94.4  5e-19  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0277  protein of unknown function UPF0102  41.03 
 
 		 120 aa  94.4  5e-19  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.107261  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1186  hypothetical protein  40.32 
 
 		 140 aa  94  7e-19  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00400032  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1475  endonuclease  43.59 
 
 		 115 aa  93.6  9e-19  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.733308  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10070  conserved hypothetical protein TIGR00252  45.26 
 
 		 153 aa  93.2  1e-18  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0294595  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3756  hypothetical protein  43.9 
 
 		 127 aa  92.8  2e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00341379  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3709  protein of unknown function UPF0102  41.8 
 
 		 119 aa  92.8  2e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1406  protein of unknown function UPF0102  45.83 
 
 		 114 aa  92  3e-18  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2398  hypothetical protein  45.79 
 
 		 118 aa  91.3  4e-18  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.430013  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02085  hypothetical protein  40.17 
 
 		 119 aa  90.5  7e-18  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.997348  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2864  hypothetical protein  42.86 
 
 		 122 aa  90.1  8e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00415914  hitchhiker  0.000000500394 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0977  hypothetical protein  47.96 
 
 		 119 aa  89.4  2e-17  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.320606  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3311  protein of unknown function UPF0102  42.72 
 
 		 134 aa  89.4  2e-17  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3998  protein of unknown function UPF0102  44.9 
 
 		 139 aa  87.4  6e-17  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0720  hypothetical protein  41.46 
 
 		 126 aa  86.3  1e-16  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0341617  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1217  hypothetical protein  38.33 
 
 		 123 aa  85.5  2e-16  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.266389  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5877  protein of unknown function UPF0102  44.44 
 
 		 117 aa  85.9  2e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.662779 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2201  hypothetical protein  41.58 
 
 		 123 aa  85.5  2e-16  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0676  hypothetical protein  37.8 
 
 		 167 aa  85.1  3e-16  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0552943  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1703  hypothetical protein  40.98 
 
 		 123 aa  84.7  4e-16  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0460  protein of unknown function UPF0102  42.02 
 
 		 153 aa  83.6  7e-16  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2019  protein of unknown function UPF0102  37.6 
 
 		 134 aa  84  7e-16  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.573307  normal  0.167847 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0675  protein of unknown function UPF0102  40.16 
 
 		 165 aa  83.6  8e-16  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4036  protein of unknown function UPF0102  43.59 
 
 		 118 aa  83.6  9e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.261027  normal  0.0798574 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_07020  predicted endonuclease related to Holliday junction resolvase  45.19 
 
 		 186 aa  83.2  0.000000000000001  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.00114408  normal  0.507303 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07400  hypothetical protein  43.59 
 
 		 116 aa  83.2  0.000000000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1093  endonuclease-like  40.74 
 
 		 202 aa  82  0.000000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2298  hypothetical protein  41.07 
 
 		 123 aa  82.4  0.000000000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3424  hypothetical protein  40.32 
 
 		 125 aa  82  0.000000000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3485  hypothetical protein  40.65 
 
 		 125 aa  81.3  0.000000000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000340579 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1947  hypothetical protein  38.64 
 
 		 133 aa  81.6  0.000000000000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.439621  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0666  hypothetical protein  38.84 
 
 		 116 aa  80.9  0.000000000000005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0397911  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1959  hypothetical protein  41.32 
 
 		 122 aa  81.3  0.000000000000005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.142549  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0758  hypothetical protein  36.59 
 
 		 130 aa  81.3  0.000000000000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0195  hypothetical protein  40.43 
 
 		 119 aa  80.9  0.000000000000006  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.227376  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0181  hypothetical protein  41.28 
 
 		 136 aa  80.9  0.000000000000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.973166  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1218  protein of unknown function UPF0102  37.3 
 
 		 119 aa  80.9  0.000000000000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.648075  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0669  hypothetical protein  40.38 
 
 		 124 aa  80.5  0.000000000000008  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1291  protein of unknown function UPF0102  40.62 
 
 		 115 aa  80.5  0.000000000000008  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000677509  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2881  hypothetical protein  33.33 
 
 		 146 aa  80.1  0.000000000000009  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.696458 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0146  hypothetical protein  39.45 
 
 		 135 aa  79  0.00000000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0465  hypothetical protein  44.68 
 
 		 113 aa  79  0.00000000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1677  hypothetical protein  42.15 
 
 		 122 aa  79  0.00000000000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.238653  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2095  protein of unknown function UPF0102  40 
 
 		 137 aa  79.3  0.00000000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0781  hypothetical protein  40.43 
 
 		 121 aa  78.6  0.00000000000003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2054  hypothetical protein  35.25 
 
 		 133 aa  77.4  0.00000000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.595954  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0231  protein of unknown function UPF0102  37.11 
 
 		 121 aa  77.8  0.00000000000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.819406  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1969  hypothetical protein  35.25 
 
 		 133 aa  77.4  0.00000000000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  decreased coverage  0.00399816  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2148  hypothetical protein  40.34 
 
 		 134 aa  77.8  0.00000000000005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0320  hypothetical protein  38.53 
 
 		 135 aa  77.4  0.00000000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_687  endonuclease  41.49 
 
 		 121 aa  77.4  0.00000000000006  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0420  hypothetical protein  39.09 
 
 		 128 aa  77  0.00000000000009  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0756  hypothetical protein  39.36 
 
 		 118 aa  76.3  0.0000000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.477778  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0116  hypothetical protein  39.45 
 
 		 118 aa  76.3  0.0000000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.185512 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0259  hypothetical protein  37.86 
 
 		 120 aa  76.3  0.0000000000001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1934  hypothetical protein  37.86 
 
 		 120 aa  76.3  0.0000000000001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.547856  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0355  hypothetical protein  38.33 
 
 		 124 aa  75.9  0.0000000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0629  hypothetical protein  41.75 
 
 		 122 aa  75.9  0.0000000000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09830  conserved hypothetical protein TIGR00252  43.16 
 
 		 125 aa  76.3  0.0000000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.351272  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1530  hypothetical protein  36.75 
 
 		 118 aa  75.9  0.0000000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0048655  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0112  hypothetical protein  38.54 
 
 		 122 aa  76.3  0.0000000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0315  protein of unknown function UPF0102  40.78 
 
 		 121 aa  74.7  0.0000000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000225244 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1910  hypothetical protein  35 
 
 		 134 aa  74.7  0.0000000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.179028  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0707  hypothetical protein  39.56 
 
 		 121 aa  74.7  0.0000000000004  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0142  conserved hypothetical protein TIGR00252  40.78 
 
 		 121 aa  74.7  0.0000000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0992  hypothetical protein  41.05 
 
 		 117 aa  74.3  0.0000000000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.528214  normal  0.0951104 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0503  hypothetical protein  38.3 
 
 		 120 aa  74.3  0.0000000000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.451178 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0400  hypothetical protein  37.27 
 
 		 131 aa  74.3  0.0000000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1792  hypothetical protein  37.61 
 
 		 160 aa  74.3  0.0000000000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1272  protein of unknown function UPF0102  38.38 
 
 		 125 aa  73.9  0.0000000000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0325  hypothetical protein  36.7 
 
 		 130 aa  74.3  0.0000000000006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.493012  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1175  protein of unknown function UPF0102  36.36 
 
 		 122 aa  73.9  0.0000000000006  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1376  protein of unknown function UPF0102  40.68 
 
 		 119 aa  73.6  0.0000000000009  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000032081  normal  0.333882 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10390  predicted endonuclease related to Holliday junction resolvase  41.18 
 
 		 167 aa  72.8  0.000000000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.0000139118  unclonable  0.000000000910029 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3766  hypothetical protein  39.22 
 
 		 122 aa  73.2  0.000000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.969308  normal  0.0430921 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1406  protein of unknown function UPF0102  38.14 
 
 		 173 aa  72.4  0.000000000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.000418677  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23670  predicted endonuclease related to Holliday junction resolvase  29.92 
 
 		 127 aa  72  0.000000000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.183487  normal  0.0867152 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0145  hypothetical protein  36.8 
 
 		 124 aa  71.6  0.000000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0280805  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1723  hypothetical protein  33.33 
 
 		 123 aa  71.6  0.000000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.471951 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2474  hypothetical protein  41.84 
 
 		 118 aa  71.6  0.000000000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0253334  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1176  hypothetical protein  41.84 
 
 		 122 aa  71.2  0.000000000004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.108145 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1550  hypothetical protein  36.84 
 
 		 132 aa  70.9  0.000000000007  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.176091 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2532  protein of unknown function UPF0102  38.54 
 
 		 118 aa  70.5  0.000000000008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.388001 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2025  hypothetical protein  35.04 
 
 		 119 aa  70.1  0.00000000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2202  hypothetical protein  34.29 
 
 		 121 aa  69.3  0.00000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.474644  normal  0.174288 
 
 
-
 
NC_004310  BR0178  hypothetical protein  36.84 
 
 		 126 aa  68.6  0.00000000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.647134  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3740  protein of unknown function UPF0102  37.84 
 
 		 121 aa  68.6  0.00000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000086697  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3265  hypothetical protein  40 
 
 		 127 aa  68.2  0.00000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3985  hypothetical protein  33.65 
 
 		 143 aa  68.2  0.00000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.889068  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>